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肿瘤转移相关基因cDNA芯片的制备与应用 被引量：24
1
作者 孙青 丁彦青 +2 位作者 高雪芹 闫实 韩金祥 《第一军医大学学报》 CSCD 北大核心 2002年第12期1070-1075,共6页
目的建立制备肿瘤转移相关基因cDNA基因芯片的方法,并探讨其在肿瘤转移表达谱应用方面的意义。方法选择了399个已知转移相关基因克隆,经PCR扩增纯化后,以Cartesian Pixsys 5500芯片点样仪点布于多聚赖氨酸包被的玻片上;采用Cy3-dUTP和Cy... 目的建立制备肿瘤转移相关基因cDNA基因芯片的方法,并探讨其在肿瘤转移表达谱应用方面的意义。方法选择了399个已知转移相关基因克隆,经PCR扩增纯化后,以Cartesian Pixsys 5500芯片点样仪点布于多聚赖氨酸包被的玻片上;采用Cy3-dUTP和Cy5-dUTP双重荧光标记人大肠癌和肺癌细胞、正常组织、大肠癌和肺癌组织总RNA并与阵列进行杂交。结果经ScanArrayTM 4000共聚焦荧光扫描仪检测,图像背景均匀,信号清晰,效果满意。对大肠癌细胞系和组织标本及肺癌标本表达基因扫描结果行联合聚类分析发现:两种癌的基因表达大多数相同,仅少数有差别,有30种在两种转移癌中呈持续上调或下调的基因,包括运动因子基因、粘附分子、蛋白水解酶、癌基因、抑癌基因、抑制或促进凋亡基因以及诱导血管增生和信号转导的基因等。结论优化的cDNA基因芯片制备技术用于基因表达分析有较高的效率和可靠的实用性能。检测的肿瘤转移相关基因的表达在两种癌无明显差别,表明不同癌其浸润和转移的分子机制大致相同。 展开更多
关键词 肿瘤转移 生物信息学 肿瘤基因 cdna芯片 肠肿瘤 肺癌 基因表达谱
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cDNA微阵列结合聚类分析探讨大鼠心肌缺血-再灌诱导的基因表达谱改变 被引量：4
2
作者 袁灿 赵震宇 +3 位作者 刘瑛 吕青兰 王秋鹏 肖献忠 《中南大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2004年第3期252-256,共5页
目的 :探讨大鼠心肌缺血 再灌诱导的基因表达谱改变 ,为揭示心肌内源性保护的分子机制提供新的线索和思路。方法 :采用反复短时间结扎及松解左冠状动脉主支构建大鼠心肌缺血 再灌反应动物模型 ,运用含 4 0 97个大鼠基因点的cDNA芯片... 目的 :探讨大鼠心肌缺血 再灌诱导的基因表达谱改变 ,为揭示心肌内源性保护的分子机制提供新的线索和思路。方法 :采用反复短时间结扎及松解左冠状动脉主支构建大鼠心肌缺血 再灌反应动物模型 ,运用含 4 0 97个大鼠基因点的cDNA芯片检测大鼠心肌缺血 再灌处理后不同时间点 (1,3,6 ,12 ,2 4h)的基因表达情况 ,并采用SOM算法将具有相似表达模式的基因进行聚类。结果 :短时间缺血后再灌 1,3,6 ,12 ,2 4h分别有 75 ,779,2 0 5 ,15 5 ,16 6个基因表达发生改变。具有相同表达模式的基因被聚为 12类。结论 :心肌缺血 再灌可以诱导心肌的基因表达谱发生改变 ,具有相似表达模式的基因可能具有相似的功能或相似的表达调控机制。 展开更多
关键词 cdna微阵列 聚类分析 大鼠 心肌缺血 再灌诱导 基因表达谱 cdna芯片
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cDNA微阵列技术对肺鳞癌、肺腺癌基因表达谱的研究 被引量：1
3
作者 欧阳取长 胡成平 +4 位作者 石林阶 梁清华 吴鄂生 杨红忠 潘频华 《湖南医科大学学报》 CSCD 北大核心 2003年第1期9-12,共4页
目的 :利用cDNA微阵列技术研究肺鳞癌、肺腺癌基因表达谱 ,并与肺炎性假瘤基因表达谱进行比较 ,筛选肺鳞癌、肺腺癌的差异表达基因 ,及肺鳞癌、肺腺癌的共同表达基因 ,为研究肺癌的分子机制及肺癌的早期诊断和治疗提供线索。方法 :用含 ... 目的 :利用cDNA微阵列技术研究肺鳞癌、肺腺癌基因表达谱 ,并与肺炎性假瘤基因表达谱进行比较 ,筛选肺鳞癌、肺腺癌的差异表达基因 ,及肺鳞癌、肺腺癌的共同表达基因 ,为研究肺癌的分子机制及肺癌的早期诊断和治疗提供线索。方法 :用含 4 0 96个基因的人基因表达谱芯片研究肺鳞癌、肺腺癌及肺炎性假瘤的基因表达谱。结果 :肺鳞癌差异表达基因 5 91个 ,其中筛选出在肺炎性假瘤中没有差异表达的基因 4 76个 ,上调的有 2 93个 ,下调的有 183个 ;肺腺癌差异表达基因 5 2 4个 ,其中在肺炎性假瘤中没有差异表达的基因 4 6 0个 ,上调的有 2 14个 ,下调有 2 4 6个 ;有113个基因在肺鳞癌与肺腺癌中均出现差异表达。结论 :肺鳞癌、肺腺癌存在不同的基因表达谱 ,筛选出的特异表达基因和共同表达基因为进一步研究肺癌的发生、发展和肺鳞癌与肺腺癌的分子特征提供了重要线索。 展开更多
关键词 cdna微阵列 基因表达谱 肺肿瘤 癌
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基因表达谱及其在人体肿瘤研究中的应用 被引量：4
4
作者 刘仲奇 田勇泉 《中南大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2004年第1期105-107,115,共4页
肿瘤发生是遗传、环境等多种致瘤因子共同作用的结果 ,经历了多个不同的发展阶段。每一阶段中机体机能的改变必然反应一系列基因功能的变化 ,构成机体在每一种机能状态时的特征性基因表达。要揭示肿瘤发生、发展的规律 ,最终找到攻克肿... 肿瘤发生是遗传、环境等多种致瘤因子共同作用的结果 ,经历了多个不同的发展阶段。每一阶段中机体机能的改变必然反应一系列基因功能的变化 ,构成机体在每一种机能状态时的特征性基因表达。要揭示肿瘤发生、发展的规律 ,最终找到攻克肿瘤的可靠途径 ,必须从研究肿瘤相关基因入手。基因芯片提供了一种大通量研究手段 ,通过基因芯片构建肿瘤相关基因表达谱 ,研究肿瘤相关基因在肿瘤发生、发展过程中的功能 ,就是找到了研究肿瘤发生、发展规律的金钥匙 ,为肿瘤病原、病因、病理学研究 ,各种肿瘤的临床诊断、治疗药物筛选、预后判断。 展开更多
关键词 基因表达谱 肿瘤 基因芯片 肿瘤相关基因 微阵列技术
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基因表达谱芯片在乙型肝炎肝硬化生物学信息的研究
5
作者 刘心亮 熊益群 +1 位作者 晏雪生 徐绍钢 《实用医学杂志》 CAS 2005年第13期1384-1385,共2页
目的:探索基因表达谱技术在肝硬化形成的分子生物学机制研究及其诊断方法研究的应用。方法:应用含8192个人体cDNA的微阵列芯片和来自外周血单核细胞的标记cDNA,分析慢性乙型肝炎、肝炎肝硬化各15例基因表达谱。通过GenePix4000B扫描芯... 目的:探索基因表达谱技术在肝硬化形成的分子生物学机制研究及其诊断方法研究的应用。方法:应用含8192个人体cDNA的微阵列芯片和来自外周血单核细胞的标记cDNA,分析慢性乙型肝炎、肝炎肝硬化各15例基因表达谱。通过GenePix4000B扫描芯片仪和ImaGene3.0软件分析Cy3、Cy5两种荧光信号的强度和比值。结果:在8192个基因中,2组中筛选出有差异的基因60个,占0.73%,其中主要是炎症、凋亡基因、细胞外基质蛋白基因、细胞生长调节基因,占71.6%。结论:基因表达谱技术可为乙型肝炎肝硬化形成的分子生物学机制及其诊断研究提供大量有益的生物学信息。 展开更多
关键词 乙型肝炎肝硬化 基因表达谱芯片 信息 外周血单核细胞 分子生物学机制 慢性乙型肝炎 生长调节基因 cdna 微阵列芯片 细胞外基质 诊断方法 机制研究 软件分析 凋亡基因 蛋白基因 诊断研究 光信号
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高低转移人大肠癌细胞系基因表达谱差异 被引量：5
6
作者 翁德胜 丁彦青 孙青 《第一军医大学学报》 CSCD 北大核心 2004年第3期256-259,共4页
目的用自制肿瘤转移相关基因cDNA微阵列研究人大肠癌高转移细胞系Lovo、SW620及低转移细胞系SW480、LS174T的基因表达谱差异,筛选与大肠癌转移相关的特异基因。方法分别提取4种大肠癌细胞系及对照的正常大肠上皮组织的mRNA,逆转录成cDN... 目的用自制肿瘤转移相关基因cDNA微阵列研究人大肠癌高转移细胞系Lovo、SW620及低转移细胞系SW480、LS174T的基因表达谱差异,筛选与大肠癌转移相关的特异基因。方法分别提取4种大肠癌细胞系及对照的正常大肠上皮组织的mRNA,逆转录成cDNA探针,经cy3和cy5标记后分别与含有399个肿瘤转移相关基因的微阵列杂交,用专用软件分析杂交信号强度。结果高转移细胞系与低转移细胞系的基因表达谱有显著差异,其中有104个基因的表达值有意义,包括上调基因44个、下调基因60个。结论大肠癌转移是由其发生过程中多个基因表达的复杂变化决定的,高转移细胞系与低转移细胞系比较存在差异的基因可能与高转移特性有关。 展开更多
关键词 大肠癌 基因表达谱 肿瘤转移 cdna微阵列
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基因表达谱证实p63是骨的巨细胞瘤的一种诊断性标记物 被引量：1
7
作者 Lee C H Espinosa I +1 位作者 Jensen K C 樊祥山(摘译) 《临床与实验病理学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2008年第3期368-368,共1页
关键词 原发性骨肿瘤 腱鞘巨细胞瘤 基因表达谱 标记物 诊断性 P63 cdna微阵列技术 动脉瘤样骨囊肿
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Myosin VI在人体不同癌组织中的差异表达及意义
8
作者 虞红珍 祝敏 +2 位作者 王豫 徐勤枝 周平坤 《中国病理生理杂志》 CAS CSCD 北大核心 2012年第6期969-973,共5页
目的:检测肌球蛋白VI(myosin VI)在人体不同癌组织中的表达差异及其临床意义,探讨myosinVI在肿瘤转移中的机制。方法:以19种人体不同癌组织及10种人肿瘤细胞株制成的cDNA多肿瘤谱阵列芯片(cancer profiling arrayⅡ)为研究材料,采用Nort... 目的:检测肌球蛋白VI(myosin VI)在人体不同癌组织中的表达差异及其临床意义,探讨myosinVI在肿瘤转移中的机制。方法:以19种人体不同癌组织及10种人肿瘤细胞株制成的cDNA多肿瘤谱阵列芯片(cancer profiling arrayⅡ)为研究材料,采用Northern杂交方法分析myosin VI的表达;根据阳性结果收集临床不同病理分级卵巢上皮肿瘤组织制成组织芯片,免疫组化法检测myosin VI的表达,以验证芯片结果的可靠性。结果:19种人体不同癌组织及10种人肿瘤细胞株均表达myosin VI,其中卵巢癌和结肠癌组织高表达myosin VI,与正常配对卵巢和结肠组织表达丰度差异显著(P<0.01);免疫组化方法证实myosin VI在卵巢癌组织的表达率为100%(52/52),交界性上皮肿瘤表达率为81.3%(13/16),癌旁及囊腺瘤的表达率为10.4%(5/48),差异有统计学意义(P<0.05);且癌旁及囊腺瘤、交界性卵巢肿瘤和卵巢癌中myosin VI的表达呈逐渐增强趋势。结论:Myosin VI在人体不同癌组织特别是卵巢癌与配对的正常组织相比其mRNA和蛋白水平均异常高表达,提示myosin VI与恶性肿瘤特别是卵巢癌的发生、发展密切相关。 展开更多
关键词 cdna肿瘤谱阵列芯片 肌球蛋白VI 卵巢肿廇
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不同分化级别子宫内膜癌差异表达基因探讨 被引量：2
9
作者 蔡斌 David Hogg +4 位作者 路光中 刘玲 席晓薇 杨懿霞 万小平 《中国肿瘤临床》 CAS CSCD 北大核心 2007年第18期1033-1035,共3页
目的:探讨不同分化级别人子宫内膜癌组织基因表达谱差异,寻找高危子宫内膜癌的基因表达谱。方法:利用基因芯片分析32例不同分化子宫内膜癌间差异表达基因,并对基因表达谱进行层次聚类分析。结果:按分化对所有样本分组,筛选出差异表达基... 目的:探讨不同分化级别人子宫内膜癌组织基因表达谱差异,寻找高危子宫内膜癌的基因表达谱。方法:利用基因芯片分析32例不同分化子宫内膜癌间差异表达基因,并对基因表达谱进行层次聚类分析。结果:按分化对所有样本分组,筛选出差异表达基因33个(P<0.001)。根据33个差异表达基因进行层次聚类分析的结果与根据分化程度进行分类的相符率为91%。结论:对不同分化级别子宫内膜癌基因表达谱差异的研究可以发现与子宫内膜癌分化相关的基因;基因表达谱的聚类分析有助于识别高危子宫内膜癌。 展开更多
关键词 cdna微阵列 子宫内膜肿瘤 基因表达谱 层次聚类分析
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两株NIH-3T3细胞间的基因表达差异研究 被引量：1
10
作者 张娜 李勤喜 《厦门大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2005年第4期569-571,共3页
通过与细胞膜表面的受体TNFRⅠ结合,肿瘤坏死因子-α(TNF-α)可诱导凋亡或坏死.有两株NIH-3T3细胞在TNF刺激下分别存在两种死亡情况:NIH-3T3(R)为caspase依赖的凋亡;而NIH-3T3(S)的死亡则不依赖caspase.为了深入研究两株细胞在TNF-α诱... 通过与细胞膜表面的受体TNFRⅠ结合,肿瘤坏死因子-α(TNF-α)可诱导凋亡或坏死.有两株NIH-3T3细胞在TNF刺激下分别存在两种死亡情况:NIH-3T3(R)为caspase依赖的凋亡;而NIH-3T3(S)的死亡则不依赖caspase.为了深入研究两株细胞在TNF-α诱导下选择不同死亡方式的机理,本研究利用cDNA表达谱芯片对这两株细胞的基因表达差异性进行研究,筛选出差异表达的基因,利用逆转录PCR验证,从而鉴定出两个可能与细胞死亡相关的基因:calpain6和R IP3. 展开更多
关键词 基因表达差异 caspase 细胞间 肿瘤坏死因子-α TNF-α 逆转录PCR 3T3细胞 表达谱芯片 诱导凋亡 死亡方式 cdna 研究利用 差异表达 细胞死亡 膜表面 差异性 受体
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