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PK-15细胞酵母双杂交三框cDNA文库构建及鉴定 被引量:8
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作者 李珣 陈思宇 +1 位作者 胡传活 王晓晔 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第5期726-730,共5页
【目的】构建PK-15细胞酵母双杂交三框eDNA文库,为深入研究猪伪狂犬病病毒(PRV)与宿主细胞间的相互作用机制打下基础。【方法】提取PK-15细胞总RNA,采用SMART和LD-PCR合成全长的双链cDNA(dscDNA),并对其进行均一化和SfiI酶切处... 【目的】构建PK-15细胞酵母双杂交三框eDNA文库,为深入研究猪伪狂犬病病毒(PRV)与宿主细胞间的相互作用机制打下基础。【方法】提取PK-15细胞总RNA,采用SMART和LD-PCR合成全长的双链cDNA(dscDNA),并对其进行均一化和SfiI酶切处理。,处理后的dscDNA分别连接3种阅读框pGADT7-SfiI载体,将连接产物转化至大肠杆菌BH5α构建三框cDNA初级文库,取三框cDNA初级文库进行混合扩增,通过滴度测定和PCR鉴定其库容量和基因重组率,最后收集文库细菌提取文库质粒。【结果】3种读码框cDNA文库的库容量分别为3.0×10^6,2.0×10^6和2.0×10^6CFU,文库实际扩增基数〉150万CFU;一号和三号读码框的基因重组率均为100%,二号读码框的基因重组率大于93%。cDNA文库外源基因插入片段长度在500~3000bp。cDNA文库质粒浓度约1.0mg/mL,质粒收获量约3.0mg。【结论】构建的PK-15细胞酵母双杂交三框cDNA文库具有较高的重组率和库容量,符合酵母双杂交筛选要求,可用于研究PRV与PK-15细胞间的相互作用机制。 展开更多
关键词 PK-15细胞 酵母双杂交 cdna文库 均一化 猪伪狂犬病病毒(PRV)
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鸡法氏囊B淋巴细胞三框cDNA表达文库的构建 被引量:1
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作者 高玉龙 刘伟 +4 位作者 高宏雷 邓小芸 李铁强 王笑梅 沈荣显 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第1期10-13,共4页
分离纯化3周龄SPF鸡法氏囊B淋巴细胞的mRNA,以5'端生物素标记的Oligo(dT)primer为引物反转录后连接3种读码框的Adapter,层析柱分级纯化,通过BP重组反应分别构建3种读码框的cDNA入门文库,平均滴度分别为1×105CFU/mL、1×105... 分离纯化3周龄SPF鸡法氏囊B淋巴细胞的mRNA,以5'端生物素标记的Oligo(dT)primer为引物反转录后连接3种读码框的Adapter,层析柱分级纯化,通过BP重组反应分别构建3种读码框的cDNA入门文库,平均滴度分别为1×105CFU/mL、1×105CFU/mL、1.2×105CFU/mL,文库总容量分别为1.2×106CFU、1.2×106CFU、1.5×106CFU,平均插入片段分别为1270bp、1190bp和1120bp,阳性重组率均为100%。将3种读码框的cDNA入门文库扩增后提取质粒,取等量的质粒通过LR重组反应将入门文库转换为三框表达文库,经测定平均滴度为1×105CFU/mL,文库总容量为1.2×106CFU,平均插入片段为1017bp,阳性重组率为100%。结果表明所构建的三框cDNA表达文库具有较高的重组率和较大的库容量,为进一步筛选鸡传染性法氏囊病病毒(IBDV)在法氏囊B淋巴细胞中的受体及研究细胞嗜性奠定了基础。 展开更多
关键词 cdna文库 cdna表达文库 法氏囊 B淋巴细胞 传染性法氏囊病毒(IBDV)
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硼毒害柑橘酵母单杂交文库构建及MIR397上游调控因子筛选
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作者 黄镜浩 林雄杰 +4 位作者 陈木兰 饶文华 和静怡 高芳銮 范国成 《福建农业学报》 北大核心 2025年第3期225-233,共9页
【目的】以柑橘硼毒害响应关键基因MIR397为切入点筛选上游调控因子,以期为柑橘响应硼毒害的分子网络研究和定向品种改良提供理论参考。【方法】以雪柑(Citrus sinensis)和酸柚(C. grandis)为材料,采用SMART技术构建硼毒害处理叶片的均... 【目的】以柑橘硼毒害响应关键基因MIR397为切入点筛选上游调控因子,以期为柑橘响应硼毒害的分子网络研究和定向品种改良提供理论参考。【方法】以雪柑(Citrus sinensis)和酸柚(C. grandis)为材料,采用SMART技术构建硼毒害处理叶片的均一化酵母单杂交三框cDNA文库,以硼毒害响应关键基因MIR397启动子中的脱落酸响应元件(Abscisic Acid Response Element, ABRE)、胚乳发育元件(General Control Non-repressed Protein 4,GCN4)、 BoxII-like元件(BoxII-likeCis-actingElement,BoxII-like)和乙烯响应元件(EthyleneResponseElement,ERE)为诱饵筛选上游的调控因子。【结果】所建三框文库容量分别为1.5×10^(6)、1.5×10^(6)、1.6×10^(6) CFU,外源基因插入片段长度为500~4 000 bp,重组率为100%,初级文库96克隆测序冗余率为0%;cDNA三框表达文库滴度4×10^(9) CFU·mL^(-1),满足酵母单杂交cDNA文库构建要求。单杂交文库筛选结果获得23条表达序列标签(expressed sequence tag, EST),其中ABRE元件11条、GCN4元件3条、ERE元件9条;60.87%的EST序列与植物的生长发育、逆境响应、信号转导及转录调控相关,17.39%的EST与蛋白质翻译相关,其余被注释的EST为蛋白酶。Y1H点对点验证HAP3、BBX和EIN3与ERE元件存在互作。【结论】本研究通过酵母单杂交文库筛选得到3个与硼毒害响应关键基因MIR397启动子ERE元件存在互作的转录因子,为进一步研究柑橘响应硼毒害的分子网络奠定基础。 展开更多
关键词 柑橘 硼毒害 cdna三框文库 启动子 调控因子
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梨幼果FWL1膜系统酵母双杂交三框cDNA文库构建及互作蛋白的筛选 被引量:1
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作者 赛静忆 温玥 +1 位作者 郝志超 田嘉 《新疆农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2022年第8期1877-1888,共12页
【目的】筛选与FWL1互作的蛋白,为研究FWL1基因调节果实大小机理提供依据。【方法】以杜梨、库尔勒香梨、鸭梨、早美香为材料,提取4个梨品种果实细胞分裂关键时期的果肉组织混样RNA。构建梨幼果FWL1膜系统酵母双杂交三框cDNA文库,并鉴... 【目的】筛选与FWL1互作的蛋白,为研究FWL1基因调节果实大小机理提供依据。【方法】以杜梨、库尔勒香梨、鸭梨、早美香为材料,提取4个梨品种果实细胞分裂关键时期的果肉组织混样RNA。构建梨幼果FWL1膜系统酵母双杂交三框cDNA文库,并鉴定文库质量。构建诱饵载体并转化酵母菌,筛选与FWL1互作的蛋白,对初步筛选出的阳性酵母克隆进行测序并在NCBI中进行Blast比对,确定候选互作蛋白。【结果】文库库容约为3×10^(7) CFU,大于1×10^(7) CFU,平均插入片段大于1000 bp,阳性率为≥98%。诱饵载体无自激活功能,利用共转化方法,筛选出272个与FWL1互作的蛋白质。【结论】梨幼果膜系统酵母双杂交三框cDNA文库符合酵母双杂文库的基本条件,适用于后期筛选相互作用的蛋白。筛选出的272个互作蛋白在果实发育过程中表达不同,其中collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1和metallothionein-like protein可能与梨果实大小发育有关。 展开更多
关键词 果实大小 fw2.2 cdna文库 互作蛋白筛选
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