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植物bZIP转录因子的研究进展 被引量:41
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作者 杨颖 高世庆 +4 位作者 唐益苗 冶晓芳 王永波 刘美英 赵昌平 《麦类作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第4期730-737,共8页
碱性亮氨酸拉链(Basic leucine zipper,bZIP)转录因子是真核生物转录因子中分布最广泛、最保守的一类蛋白。目前,在拟南芥基因组、豆科植物基因组、水稻基因组中发现大量的bZIP转录因子。本文围绕植物bZIP转录因子的最新研究进展,按照... 碱性亮氨酸拉链(Basic leucine zipper,bZIP)转录因子是真核生物转录因子中分布最广泛、最保守的一类蛋白。目前,在拟南芥基因组、豆科植物基因组、水稻基因组中发现大量的bZIP转录因子。本文围绕植物bZIP转录因子的最新研究进展,按照其不同亚家族的结构和功能进行了综述。根据植物bZIP转录因子结构的差异,可以将其划分为10个亚族:A、B、C、D、E、F、G、HI、、S亚族。这些不同家族的bZIP转录因子成员广泛参与种子贮藏基因的表达、植物的生长发育、光信号转导、病害防御、生物和非生物胁迫应答以及ABA的敏感性等各种信号的反应。 展开更多
关键词 植物 bzip转录因子 种类 结构特点 功能
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玉米A亚族bZIP转录因子基因ZmbZIP81的克隆、表达与功能分析 被引量:9
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作者 王策 杨艳歌 +3 位作者 吕维涛 周春菊 孙冬梅 邓馨 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第9期1549-1556,共8页
碱性亮氨酸拉链(basic leucine zipper,bZIP)蛋白是真核生物所特有的一类转录因子,对于植物在逆境下的基因表达调控具有重要作用。为丰富对玉米bZIP转录因子功能的认识,本研究以从玉米中克隆到的一个A亚族bZIP转录因子编码基因ZmbZIP81... 碱性亮氨酸拉链(basic leucine zipper,bZIP)蛋白是真核生物所特有的一类转录因子,对于植物在逆境下的基因表达调控具有重要作用。为丰富对玉米bZIP转录因子功能的认识,本研究以从玉米中克隆到的一个A亚族bZIP转录因子编码基因ZmbZIP81为对象展开。ZmbZIP81基因位于玉米第6染色体,编码区全长2492 bp,由4个外显子和3个内含子组成,编码蛋白含254个氨基酸。研究表明ZmbZIP81基因表达受外源ABA、NaCl和干旱胁迫诱导。过表达该基因的拟南芥植物表现出ABA不敏感和NaCl胁迫抗性增强的表型,推测ZmbZIP81可能作为ABA信号途径的负调控因子参与植物抗逆基因表达调控网络。 展开更多
关键词 玉米 bzip转录因子 A亚族 ABA 逆境胁迫
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甘蓝型油菜低温诱导下的bZIP转录因子挖掘及聚类分析 被引量:5
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作者 杜春芳 刘春晴 +5 位作者 咸拴狮 范建春 胡恺宁 李萌 涂金星 傅廷栋 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第1期153-161,共9页
植物响应低温胁迫的过程是一个复杂的网络过程,涉及众多转录因子的调控。本文通过对低温胁迫下的甘蓝型油菜转录组数据进行生物信息学分析,获得108个序列编码bZIP转录因子。经过序列比对、染色体定位和聚类分析,发现这些转录因子定位在1... 植物响应低温胁迫的过程是一个复杂的网络过程,涉及众多转录因子的调控。本文通过对低温胁迫下的甘蓝型油菜转录组数据进行生物信息学分析,获得108个序列编码bZIP转录因子。经过序列比对、染色体定位和聚类分析,发现这些转录因子定位在19条染色体上,在抗寒过程中表现动态变化;同时发现这些转录因子在A亚族、C亚族、I亚族、G亚族、S亚族中聚集最多,B亚族和D亚族中很少聚集;取4个在所有胁迫阶段皆表现差异的基因进行定量分析,发现其调控变化与测序分析的变化趋势相同,不仅证明了测序数据的可靠性,而且证明甘蓝型油菜bZIP转录因子对低温胁迫的响应是一个动态的调控过程。 展开更多
关键词 甘蓝型油菜 低温 bzip转录因子 挖掘 聚类分析
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条锈菌诱导的小麦bZIP转录因子基因的克隆及表达分析 被引量:4
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作者 张毅 夏宁 +3 位作者 张岗 郭军 黄丽丽 康振生 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第7期1221-1225,共5页
采用电子克隆和RT-PCR方法,从条锈菌诱导的小麦品种水源11的cDNA中分离到一个编码bZIP转录因子基因的cDNA序列,暂被命名为TabZIP。TabZIP包含一个完整的1071bp的开放阅读框,编码356个氨基酸,具有典型的bZIP保守结构域;与水稻、玉米、拟... 采用电子克隆和RT-PCR方法,从条锈菌诱导的小麦品种水源11的cDNA中分离到一个编码bZIP转录因子基因的cDNA序列,暂被命名为TabZIP。TabZIP包含一个完整的1071bp的开放阅读框,编码356个氨基酸,具有典型的bZIP保守结构域;与水稻、玉米、拟南芥等植物bZIP蛋白的氨基酸序列相似性较高;TabZIP基因在小麦根中的表达量丰富,而在茎和叶中表达量很小;在小麦与条锈菌非亲和组合中,TabZIP基因高水平表达,而在亲和组合中没有明显的变化;防卫相关激素乙烯、茉莉酸也可诱导该基因的快速上调表达,表明TabZIP可能通过乙烯、茉莉酸信号途径介导小麦对条锈病的防御反应。 展开更多
关键词 小麦 条锈菌 bzip转录因子 电子克隆 基因表达
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陆地棉bZIP转录因子响应非生物胁迫表达谱分析 被引量:4
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作者 李月 许朋斐 +4 位作者 刘超 代培红 葛杰 曲延英 刘晓东 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第3期562-569,共8页
低温、干旱和高盐是影响棉花生长发育和产量的重要限制因素。b ZIP转录因子在植物非生物胁迫反应中起重要作用。本研究利用生物信息学的方法从陆地棉中鉴定了24个b ZIP转录因子基因,命名为Ghb ZIP1~Ghb ZIP24。系统进化树分析表明,这24... 低温、干旱和高盐是影响棉花生长发育和产量的重要限制因素。b ZIP转录因子在植物非生物胁迫反应中起重要作用。本研究利用生物信息学的方法从陆地棉中鉴定了24个b ZIP转录因子基因,命名为Ghb ZIP1~Ghb ZIP24。系统进化树分析表明,这24个家族成员主要聚集在A、B、C、D、E、G、I、S这8类亚家族。通过RT-PCR的方法分析了棉花(Gossypium hirsutum L.)Ghb ZIPs基因在高盐(200 mmol/L Na Cl)、干旱、4℃低温等非生物胁迫处理下的表达模式。结果表明,19个基因响应高盐胁迫、11个基因对干旱胁迫有应答反应,15个基因有冷胁迫应答。此外,有4个基因(Ghb ZIP4、Ghb ZIP7、Ghb ZIP21和Ghb ZIP23)在3种处理下均有应答反应。以上研究结果表明,Ghb ZIPs在陆地棉的非生物胁迫适应过程中可能具有重要的作用。本研究为进一步探索棉花b ZIP转录因子在抗逆反应中的重要作用和利用基因操作手段提高棉花抗逆性提供了重要信息。 展开更多
关键词 棉花 bzip转录因子 非生物胁迫 RT-PCR 表达分析
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bZIP转录因子在植物激素介导的抗病抗逆途径中的作用 被引量:4
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作者 李冬月 原文霞 +4 位作者 郑超 王栩鸣 周洁 严成其 陈剑平 《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2017年第1期168-175,共8页
植物体内有一套复杂精细且交叉调控的激素信号网络,在植物应对不良环境胁迫的过程中起着至关重要的作用。bZIP转录因子作为基因表达的关键调控因子,在植物抗病抗逆相关基因的表达中行使着重要的功能。文章首先介绍了bZIP转录因子的结构... 植物体内有一套复杂精细且交叉调控的激素信号网络,在植物应对不良环境胁迫的过程中起着至关重要的作用。bZIP转录因子作为基因表达的关键调控因子,在植物抗病抗逆相关基因的表达中行使着重要的功能。文章首先介绍了bZIP转录因子的结构和功能,阐述了其在几种主要的激素抗性调控途径中的作用机理,之后对各种激素信号通路之间的交叉调控途径及其关键调控节点蛋白进行了概括,以期阐明植物激素介导的抗性调控网络,并为新的抗性相关基因的挖掘和利用提供理论依据。 展开更多
关键词 bzip转录因子 植物激素 抗病 抗逆 信号调控
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玉米bZIP转录因子ZmbZIP26的分子特征、亚细胞定位及响应非生物胁迫的表达分析 被引量:4
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作者 曹丽茹 马晨晨 +3 位作者 庞芸芸 叶飞宇 王振华 鲁晓民 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2023年第4期1-10,共10页
bZIP转录因子广泛存在于植物中,在调节植物生长发育和非生物胁迫应答中起着重要作用。为探究bZIP转录因子在玉米干旱胁迫响应中的功能,在玉米苗期干旱胁迫处理5 d和复水3 d时,利用转录组测序技术对转录因子基因的表达变化进行分析,筛选... bZIP转录因子广泛存在于植物中,在调节植物生长发育和非生物胁迫应答中起着重要作用。为探究bZIP转录因子在玉米干旱胁迫响应中的功能,在玉米苗期干旱胁迫处理5 d和复水3 d时,利用转录组测序技术对转录因子基因的表达变化进行分析,筛选到一个响应干旱和复水处理的bZIP转录因子(ZmbZIP26),共表达网络分析发现,ZmbZIP26处于网络调节的核心节点位置。ZmbZIP26基因含有558 bp的开放阅读框,编码185个氨基酸,属于亲水性蛋白。蛋白质进化树及保守序列分析发现,ZmbZIP26蛋白与高粱和芒草同源蛋白的同源性较高,而且在同一氨基酸位置上的保守基序相同。启动子顺式作用元件分析表明,ATG上游2000 bp区域内含有干旱响应元件、激素响应元件和光响应元件等。qRT-PCR分析发现,ZmbZIP26是组成型表达基因,在幼茎、雌穗和根中高表达,且ZmbZIP26基因积极响应干旱、高温、高盐、氮胁迫及恢复正常的过程,可能在植物的抗逆过程中发挥着重要作用。亚细胞定位分析发现,ZmbZIP26属于核蛋白,定位在细胞核上。蛋白质互作预测发现,ZmbZIP26可能与锌指蛋白、丝氨酸蛋白、钙依赖性蛋白、谷胱甘肽转移蛋白等互作构建了一张调控网络,协同调控玉米生长发育和胁迫应答过程。 展开更多
关键词 玉米 bzip转录因子 干旱-复水处理 非生物胁迫
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玉米D亚族bZIP转录因子基因的数据库挖掘、分析、克隆与表达 被引量:1
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作者 杨艳歌 吕维涛 +2 位作者 孙冬梅 凌毅 邓馨 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第12期2115-2122,共8页
碱性亮氨酸拉链(basic leucine zipper,bZIP)是真核生物特有的转录因子家族,在高等植物基因表达与调控中起重要作用。本文通过对玉米基因组数据库中收录的全长cDNA序列全基因组范围的bZIP分析,发现其中25个序列编码D亚族bZIP转录因子。... 碱性亮氨酸拉链(basic leucine zipper,bZIP)是真核生物特有的转录因子家族,在高等植物基因表达与调控中起重要作用。本文通过对玉米基因组数据库中收录的全长cDNA序列全基因组范围的bZIP分析,发现其中25个序列编码D亚族bZIP转录因子。针对这些序列进行生物信息学分析、染色体分布和直系同源组的分类分析,发现部分序列可能是由同一基因座编码,但不同方式剪切形成的。对部分基因克隆和测序发现了更多的剪切形式。定量检测其中3个基因在ABA和干旱胁迫条件下的表达发现,其中1个受ABA诱导,2个受ABA抑制,但均不受干旱胁迫影响。表明玉米中D亚族基因可能参与ABA响应。 展开更多
关键词 玉米 bzip转录因子 D亚族 数据库挖掘 基因表达
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bZIP转录因子在植物生长发育及非生物逆境响应的作用 被引量:21
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作者 刘慧洁 徐恒 +5 位作者 邱文怡 李晓芳 张华 朱英 李春寿 王良超 《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2019年第7期1205-1214,共10页
在植物的一生中,不同的基因被设定在不同的时期及部位精确地表达,或是在不同的环境条件下如高温、干旱等诱导表达,基因表达受转录因子的精确调控。植物碱性亮氨酸拉链(basic leucine zipper,bZIP)蛋白是一类重要的转录因子,其参与了植... 在植物的一生中,不同的基因被设定在不同的时期及部位精确地表达,或是在不同的环境条件下如高温、干旱等诱导表达,基因表达受转录因子的精确调控。植物碱性亮氨酸拉链(basic leucine zipper,bZIP)蛋白是一类重要的转录因子,其参与了植物从生长发育到胁迫响应的各种过程。植物生长转变及对胁迫做出响应会迅速地诱发自身大量基因的转录变化,这一过程称为转录重编程。bZIP转录因子就是引导这些转录重编程的转录因子中重要的一类。本文介绍了bZIP转录因子的结构、分类以及重要功能,综述了其在植物生长发育及非生物胁迫响应等过程中所起的关键作用,并就如何拓展完善bZIP转录因子功能研究作了展望。 展开更多
关键词 bzip转录因子 生长发育 非生物逆境 转录调控 蛋白互作
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白菜bZIP转录因子基因家族应答春化反应关键基因表达分析 被引量:6
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作者 马李广 张贺龙 +7 位作者 庞小可 王浩 李广 汪承刚 袁凌云 侯金锋 唐小燕 陈国户 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2022年第3期765-774,共10页
为研究白菜(Brassica rapa)碱性亮氨酸拉链(Basic leucine zipper,bZIP)转录因子家族基因(BrbZIP)的相关功能,通过生物信息学分析技术,鉴定全基因组的BrbZIP基因家族成员,并对其染色体分布、进化关系、表达模式及其应答春化反应等进行... 为研究白菜(Brassica rapa)碱性亮氨酸拉链(Basic leucine zipper,bZIP)转录因子家族基因(BrbZIP)的相关功能,通过生物信息学分析技术,鉴定全基因组的BrbZIP基因家族成员,并对其染色体分布、进化关系、表达模式及其应答春化反应等进行了分析。白菜bZIP转录因子基因家族共有118个成员,在染色体上不均等分布。白菜组织转录组分析结果显示,大部分BrbZIP基因在根、茎、叶、花及荚中均有较高的表达丰度,且具有组织表达特异性;春化反应转录组、荧光定量PCR及相关基因互作网络分析结果表明,白菜bZIP基因家族中应答春化反应相关基因上调与下调表达基因数量差异不大,相互之间存在复杂的互作网络,其中4个成员(Bra039631、Bra020620、Bra004550与Bra020471)是应答春化反应的中心节点。 展开更多
关键词 白菜 bzip转录因子 基因家族 春化反应 生物信息学分析
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毛竹bZIP转录因子的基因结构与进化分析 被引量:6
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作者 张庆波 胡尚连 +3 位作者 徐刚 曹颖 卢学琴 龙治坚 《森林与环境学报》 CSCD 北大核心 2016年第1期54-61,共8页
以毛竹基因组数据库中的107个编码b ZIP转录因子的基因为材料,对其进行系统发育分析,筛选得到了A、D和S亚族的b ZIP家族成员,并对其基因结构、适应性进化、与水稻基因对之间的进化分歧时间及蛋白质同源建模等进行生物信息学分析。结果表... 以毛竹基因组数据库中的107个编码b ZIP转录因子的基因为材料,对其进行系统发育分析,筛选得到了A、D和S亚族的b ZIP家族成员,并对其基因结构、适应性进化、与水稻基因对之间的进化分歧时间及蛋白质同源建模等进行生物信息学分析。结果表明,毛竹A、D和S亚族共有47个b ZIP家族成员,其中A亚族18个,D亚族16个,S亚族13个。基因结构分析表明,3个亚族中内含子数量为0-16个,而且D亚族基因的内含子—外显子组成比A亚族和S亚族更为复杂。适应性进化分析表明,3个亚族总体上处于净化选择压力之下;A、D和S亚族的平均进化分歧时间分别为279.0,265.6和202.9 Mya;47个毛竹b ZIP蛋白质主要以α-螺旋为主,且D亚族的三级结构比A和S亚族复杂。 展开更多
关键词 毛竹 bzip转录因子 生物信息学分析
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单叶蔷薇bZIP转录因子家族鉴定与表达分析 被引量:6
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作者 孙彦琳 于超 +2 位作者 罗乐 潘会堂 张启翔 《西北农林科技大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2022年第6期82-92,共11页
【目的】筛选单叶蔷薇bZIP转录因子家族的成员,并研究其结构特点、共线性以及在不同器官中的表达模式,为进一步揭示该家族在单叶蔷薇生长发育及抗逆响应中的作用奠定基础。【方法】以采自新疆的单叶蔷薇叶片为试验材料,采用生物信息学方... 【目的】筛选单叶蔷薇bZIP转录因子家族的成员,并研究其结构特点、共线性以及在不同器官中的表达模式,为进一步揭示该家族在单叶蔷薇生长发育及抗逆响应中的作用奠定基础。【方法】以采自新疆的单叶蔷薇叶片为试验材料,采用生物信息学方法,对单叶蔷薇全基因组和转录组信息进行分析,包括理化性质、系统发育、基因结构、保守结构域、染色体位置、共线性和启动子分析,以及在根、茎、叶、花、果实中的表达模式。【结果】从单叶蔷薇全基因组中共鉴定出50个单叶蔷薇bZIP转录因子家族成员,其蛋白质长度为149~700个氨基酸,分子质量为17.14~75.47 ku,等电点4.42~10.72,其中49个成员位于细胞核上。根据拟南芥bZIP转录因子家族的分类,将单叶蔷薇bZIP转录因子家族分为12亚族(A-K和S亚族),其中包括1对串联重复和7对片段重复;单叶蔷薇bZIP多含有1~15个与非生物胁迫有关的顺式作用元件。单叶蔷薇bZIP转录因子家族基因在不同器官中均有表达,各成员的表达量存在差异,其中Rbe013649在花中特异性表达,Rbe006639、Rbe028637在根中特异性表达,Rbe004215、Rbe028400、Rbe002636、Rbe002635在果实中特异性表达,Rbe011331在叶片中特异性表达。【结论】单叶蔷薇bZIP转录因子家族基因可能广泛参与各器官生长发育,其中Rbe013649可能调控花青素的合成,Rbe006639可能在抗旱过程中起重要作用。 展开更多
关键词 单叶蔷薇 bzip转录因子家族 基因表达 生物信息学
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黄花蒿bZIP转录因子基因家族及光调控表达模式分析 被引量:12
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作者 王星文 吴端 +4 位作者 师玉华 张栋 丁丹丹 马婷玉 向丽 《世界科学技术-中医药现代化》 CSCD 北大核心 2021年第1期20-32,共13页
目的碱性亮氨酸拉链(basic leucine zipper,bZIP)是青高素生物合成途径中的重要调控因子,本研究利用生物信息学手段鉴定黄花蒿全基因组bZIP转录因子家族成员并对其在光调控下表达模式进行分析,为进一步探索AabZIP转录因子功能及其对青... 目的碱性亮氨酸拉链(basic leucine zipper,bZIP)是青高素生物合成途径中的重要调控因子,本研究利用生物信息学手段鉴定黄花蒿全基因组bZIP转录因子家族成员并对其在光调控下表达模式进行分析,为进一步探索AabZIP转录因子功能及其对青蒿素合成途径的调控机制提供参考依据。方法以BLAST、Hmmsearch程序及Pfam数据库对黄花蒿基因组中bZIP基因进行筛选及鉴定,MAGA7.0软件、GSDS2.0、meme、ExPASy等在线工具对AabZIP家族进化关系、基因结构、保守结构域、蛋白理化性质等生物学信息进行分析,利用TBtools软件分析AabZIP基因在光调控下基因特征。结果全基因组水平上共鉴定出78条AabZIP家族成员,基于拟南芥分组将其分为10个亚族和1个未分组成员(AabZIP78),其中S亚族数量最多,有22条(28.2%);AabZIP基因结构较为保守,78条AabZIP基因中发现14组同源基因序列,其中13对受到纯化选择影响;除AabZIP78与番茄bZIP保守基序一致外,其余序列均与拟南芥bZIP保守基序一致;不同光照胁迫下基因表达水平存在较大差异,其中A、G、H及S亚族中大部分成员在蓝光胁迫下高表达。结论AabZIP响应光调控并参与复杂的青蒿素代谢途径,本研究可为进一步深入研究黄花蒿中bZIP转录因子基因进化、功能及光调控响应机制等奠定基础。 展开更多
关键词 黄花蒿 bzip转录因子 光调控 表达分析
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紫花苜蓿bZIP转录因子MsbZIP1的克隆、表达特性和遗传转化分析 被引量:8
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作者 曹晓宇 王学敏 +4 位作者 郭继承 崔苗苗 张锦锦 刘佼佼 贺俊英 《草地学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第3期613-622,共10页
bZIP(Basic leucine zipper)是植物中一类非常重要的转录因子,参与植物从生长发育到抗性调控的多个生物学过程。为了了解紫花苜蓿(Medicago sativa)中bZIP转录因子的特性,解析紫花苜蓿MsbZIP1基因的生物学功能,从而阐述MsbZIP1基因响应... bZIP(Basic leucine zipper)是植物中一类非常重要的转录因子,参与植物从生长发育到抗性调控的多个生物学过程。为了了解紫花苜蓿(Medicago sativa)中bZIP转录因子的特性,解析紫花苜蓿MsbZIP1基因的生物学功能,从而阐述MsbZIP1基因响应紫花苜蓿抗逆调控机制,本研究利用RACE技术从紫花苜蓿中获得1个MsbZIP1基因的全长cDNA,该序列全长1176 bp,编码361个氨基酸,预测分子量为42.3 kD,等电点为6.5。分析发现,该蛋白含有bZIP家族典型的BRLZ碱性结构域和亮氨酸拉链,属于bZIP家族蛋白。进化树分析表明,该蛋白属于bZIP转录因子C亚族,与拟南芥(Arabidopsis thaliana)的AtbZIP63具有很高的同源性,推测可能具有与该类蛋白相似的功能。qRT-PCR分析表明,MsbZIP1基因对干旱、高盐、高温、低温,以及脱落酸(Abscisic acid,ABA)和生长素(Auxin,IAA)处理都有不同程度的响应,推测该基因可能参与调控紫花苜蓿多种非生物胁迫。本试验通过构建表达载体PCAMBIA3301-MsbZIP1,以农杆菌介导的花序浸染法转化拟南芥,经后代筛选、扩繁和分子检测,得到7株超表达的转基因拟南芥。本研究第一次分离了紫花苜蓿C亚族bZIP转录因子,初步确定紫花苜蓿MsbZIP1基因响应多种逆境胁迫的反应,并获得了阳性转基因材料,并为进一步探索该类转录因子在紫花苜蓿抗逆性调控中的作用奠定了基础。 展开更多
关键词 紫花苜蓿 bzip转录因子 克隆 表达 转化
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bZIP转录因子提高植物抗逆性研究新进展 被引量:5
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作者 郝红燕 桑慧彤 +2 位作者 吕山花 樊颖伦 李海云 《河南农业科学》 北大核心 2023年第4期1-8,共8页
植物遭遇逆境会受到伤害,利用基因工程技术提高植物抗逆性是一条快捷有效的途径。碱性亮氨酸拉链(bZIP)转录因子是高等植物中数目较多且相对保守的基因家族之一,在植物抵御低温、干旱、盐渍、病虫等生物和非生物胁迫过程中具有重要的调... 植物遭遇逆境会受到伤害,利用基因工程技术提高植物抗逆性是一条快捷有效的途径。碱性亮氨酸拉链(bZIP)转录因子是高等植物中数目较多且相对保守的基因家族之一,在植物抵御低温、干旱、盐渍、病虫等生物和非生物胁迫过程中具有重要的调控作用。综述了bZIP转录因子的结构、分类及其提高植物抗非生物胁迫(干旱、高温、低温、高盐、营养缺乏等)和生物胁迫的研究新进展,为bZIP转录因子的应用及植物抗逆遗传改良提供参考。 展开更多
关键词 bzip转录因子 植物抗逆性 基因工程 生物胁迫 非生物胁迫
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大豆胞囊线虫病抗性相关bZIP转录因子的生物信息学分析 被引量:3
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作者 姜海鹏 田力峥 +2 位作者 卜凡珊 赵雪 韩英鹏 《大豆科学》 CAS CSCD 北大核心 2020年第5期703-711,共9页
为分析大豆bZIP转录因子在大豆胞囊线虫病3号生理小种胁迫下的应答机制,促进大豆响应大豆胞囊线虫病3号生理小种胁迫机制的研究,本研究采用胞囊线虫病3号生理小种对抗线虫大豆品种东农L^-10进行胁迫,对转录组测序数据中与抗性相关的bZI... 为分析大豆bZIP转录因子在大豆胞囊线虫病3号生理小种胁迫下的应答机制,促进大豆响应大豆胞囊线虫病3号生理小种胁迫机制的研究,本研究采用胞囊线虫病3号生理小种对抗线虫大豆品种东农L^-10进行胁迫,对转录组测序数据中与抗性相关的bZIP转录因子进行在线生物信息学预测和分析。结果共获得18个与大豆胞囊线虫病3号生理小种相关的差异表达bZIP转录因子,不同bZIP转录因子之间的理化性质存在较大差异,大多数上调表达的bZIP转录因子为碱性等电点,而大多数下调表达的bZIP转录因子为酸性等电点;18个bZIP蛋白中含有多个丝氨酸(S)、苏氨酸(T)和酪氨酸(Y)磷酸化位点,其中丝氨酸(S)位点最多;亚细胞定位显示2个bZIP转录因子定位于叶绿体,其余均定位于细胞核,与转录因子调控下游基因的表达特性相一致;18个bZIP蛋白的系统进化树分为2大类群,其中上调表达的bZIP转录因子和下调表达的bZIP转录因子亲缘关系较远;bZIP基因家族的成员都含有数量不等的motif结构,且不同bZIP基因之间保守结构域的氨基酸存在变异;蛋白二级结构中以无规则卷曲和α-螺旋为主要构成元件;根据结构相似性,18个bZIP蛋白三级结构分为4类,不同bZIP转录因子三级结构的相似性暗示了功能上存在相似。 展开更多
关键词 大豆胞囊线虫病 3号生理小种 转录组测序 bzip转录因子 生物信息学
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调控油茶果生刺盘孢bZIP转录因子CfAp1的生物学功能 被引量:11
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作者 高亚兰 何苑皋 李河 《林业科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2020年第9期30-39,共10页
【目的】研究油茶炭疽病的主要流行致病菌果生刺盘孢菌b ZIP转录因子Cf Ap1的生物学功能,以期阐明果生刺盘孢菌致病的分子机制,为油茶炭疽病的防治提供理论依据。【方法】提取果生刺盘孢菌全基因组DNA,根据同源重组原理构建Cf AP1基因... 【目的】研究油茶炭疽病的主要流行致病菌果生刺盘孢菌b ZIP转录因子Cf Ap1的生物学功能,以期阐明果生刺盘孢菌致病的分子机制,为油茶炭疽病的防治提供理论依据。【方法】提取果生刺盘孢菌全基因组DNA,根据同源重组原理构建Cf AP1基因敲除载体片段,采用PEG介导法把该片段转化至果生刺盘孢菌野生型菌株的原生质体中,验证筛选突变体菌株;PCR扩增果生刺盘孢菌含有启动子的Cf AP1基因回补片段,构建回补载体p YF11::Cf AP1;采用PEG介导法把回补载体p YF11::Cf AP1转化至果生刺盘孢菌突变体菌株的原生质体中,获得回补菌株ΔCfap1/AP1。测定野生型菌株、突变体菌株ΔCfap1-8及基因回补菌株ΔCfap1/AP1在生长发育、附着胞形成、外界胁迫和致病力等生物学表型。【结果】果生刺盘孢菌中具有1个与灰色大角间座壳(稻瘟菌) b ZIP转录因子MoAp1直系同源的基因,命名为Cf AP1;该基因全长1 804 bp,编码566个氨基酸,该蛋白含有1个碱性亮氨酸链(b ZIP)结构域、2个PAP1结构域和2个未知功能的结构域;与野生型和回补菌株相比,突变体ΔCfap1-8生长速率没有明显影响,但气生菌丝显著减少;通过测量产孢量,发现突变体ΔCfap1-8的分生孢子显著减少;ΔCfap1-8在含2.5、5 mmol·L-1H2O2和0.7 mol·L-1Na Cl的PDA平板上菌丝生长受到明显抑制;致病力测试结果表明,果生刺盘孢菌基因敲除突变体ΔCfap1-8对无伤和有伤油茶叶片的致病力下降明显,与野生型和回补菌株的致病力差异显著;突变体分生孢子产生附着胞数量减少且膨压降低。【结论】转录因子Cf Ap1参与调控油茶果生刺盘孢菌的生长发育、产孢、致病力以及响应外界氧压胁迫和渗透压胁迫过程。 展开更多
关键词 油茶 果生刺盘孢菌 bzip转录因子 CfAp1 致病力
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蓝莓bZIP转录因子基因预测及其在根中表达分析 被引量:1
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作者 安爽 刘金莲 +2 位作者 占晓慧 李永强 宗宇 《浙江农业科学》 2021年第10期1977-1983,共7页
利用生物信息学方法对蓝莓bZIP转录因子基因家族进行鉴定分析,分析基因家族的基本结构、保守域以及与拟南芥bZIP基因家族之间的同源进化关系。共鉴定到131个蓝莓bZIP转录因子基因,调取blastp和HMMER检索到的序列ID,根据ID人工去冗余,后... 利用生物信息学方法对蓝莓bZIP转录因子基因家族进行鉴定分析,分析基因家族的基本结构、保守域以及与拟南芥bZIP基因家族之间的同源进化关系。共鉴定到131个蓝莓bZIP转录因子基因,调取blastp和HMMER检索到的序列ID,根据ID人工去冗余,后进行CDD(conserve domain database)分析,保留特征结构域筛选得到31条基因序列。根据拟南芥的分类标准将其分为9个亚族,分别是A、B、C、D、E、G、I、K、S组,每组所含有的成员数目不等。根据R和RStudio软件进行热图制作,显示不同基因在蓝莓不同组织或是不同pH条件下表达模式有差异,分析热图明确B组、C组、D组、E组bZIP转录因子家族基因成员在蓝莓根系受土壤pH胁迫下起重要抗逆调控作用。 展开更多
关键词 蓝莓 bzip转录因子基因 表达模式 抗逆过程
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长足大竹象取食胁迫下慈竹bZIP转录因子的鉴定及生物信息学分析
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作者 张鑫月 蒋筱蝶 +2 位作者 李沅秋 罗朝兵 唐昊 《现代园艺》 2020年第19期21-24,共4页
植物b ZIP转录因子在多个生命过程中起着重要的调控功能。基于长足大竹象取食胁迫下慈竹笋转录组测序结果及bZIP转录因子系统进化树和基因表达模式的分析,鉴定出10个慈竹bZIP转录因子,并推测慈竹中的b ZIP转录因子(comp8738_seq0、comp1... 植物b ZIP转录因子在多个生命过程中起着重要的调控功能。基于长足大竹象取食胁迫下慈竹笋转录组测序结果及bZIP转录因子系统进化树和基因表达模式的分析,鉴定出10个慈竹bZIP转录因子,并推测慈竹中的b ZIP转录因子(comp8738_seq0、comp10711_seq0、comp4125_seq0)的过量表达可能通过调控细胞内内质网的应激反应来应对虫害的取食胁迫。 展开更多
关键词 慈竹 长足大竹象 bzip转录因子 生物学信息分析
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芒果bZIP转录因子基因的克隆、亚细胞定位及表达分析 被引量:3
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作者 李健 李曦 农艳丰 《江苏农业科学》 北大核心 2023年第21期29-36,共8页
碱性亮氨酸拉链(bZIP)转录因子在调控植物生长发育及抵抗非生物胁迫过程中具有重要作用。本研究通过RACE技术,获得了全长1 317 bp的芒果bZIP转录因子基因(MibZIP46)。系统进化树分析结果表明,MibZIP46与同样是漆树科的阿月浑子的bZIP亲... 碱性亮氨酸拉链(bZIP)转录因子在调控植物生长发育及抵抗非生物胁迫过程中具有重要作用。本研究通过RACE技术,获得了全长1 317 bp的芒果bZIP转录因子基因(MibZIP46)。系统进化树分析结果表明,MibZIP46与同样是漆树科的阿月浑子的bZIP亲缘关系最为接近,同源性最高,与甜橙的同源性次之。构建了原核表达重组质粒pCZN 1-MibZIP46,经0.2 mmol/L IPTG诱导,目的蛋白以包涵体的形式表达,经镍柱纯化,获得高纯度(90%)的目的蛋白并成功进行Western blotting鉴定;MibZIP46蛋白的亚细胞定位分析结果表明,融合的目的蛋白在烟草叶片细胞中定位于细胞核;实时荧光定量PCR分析结果表明,200 mmol/L NaCl、15%PEG和0.1 mmol/L ABA胁迫处理,均能不同程度诱导MibZIP46的表达。本研究为进一步挖掘利用芒果的抗逆相关基因提供了理论依据。 展开更多
关键词 芒果 碱性亮氨酸拉链(bzip)转录因子 基因克隆 基因表达 胁迫处理
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