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马铃薯油菜素内酯信号激酶基因StBSKs的克隆与序列分析
1
作者
马杰
郑好
+5 位作者
周平
陈春艳
吴瑞
马维
宋雷
孙勃
《浙江农业学报》
CSCD
北大核心
2019年第8期1224-1230,共7页
油菜素内酯是一种参与调控植物生长发育和环境抗性的植物激素,BSKs是BR信号通路中重要的信号转导激酶。以马铃薯为试验材料,通过同源序列检索分析设计特异性引物,采用RT-PCR技术克隆得到BSK基因家族的7个基因,分别命名为StBSK 1、StBSK2...
油菜素内酯是一种参与调控植物生长发育和环境抗性的植物激素,BSKs是BR信号通路中重要的信号转导激酶。以马铃薯为试验材料,通过同源序列检索分析设计特异性引物,采用RT-PCR技术克隆得到BSK基因家族的7个基因,分别命名为StBSK 1、StBSK2、StBSK3、StBSK4、StBSK5、StBSK 6和StBSK 7。其CDS全长分别为1 497、1 479、1 464、1 461、1 476、1 476和1 476 bp,分别编码498、492、487、486、491、491和491个氨基酸。生物信息学分析表明,StBSKs蛋白的等电点为5.14~6.37,均呈弱酸性;这7个蛋白均无跨膜结构域和信号肽;氨基酸序列比对发现,StBSKs蛋白的氨基酸序列在N端存在较大差异。系统进化树分析发现,StBSKs蛋白与同科物种的亲缘关系更近。本研究结果丰富了对马铃薯油菜素内酯信号激酶StBSKs基因的认知,也为进一步深入研究StBSKs的基因功能奠定基础。
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关键词
马铃薯
油菜素内酯信号激酶
氨基酸序列
系统进化树
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职称材料
题名
马铃薯油菜素内酯信号激酶基因StBSKs的克隆与序列分析
1
作者
马杰
郑好
周平
陈春艳
吴瑞
马维
宋雷
孙勃
机构
四川农业大学园艺学院
毕节市农业科学研究所
出处
《浙江农业学报》
CSCD
北大核心
2019年第8期1224-1230,共7页
基金
贵州省科学技术基金重点项目(黔科合基础[2018]1402)
贵州省科学技术基金一般项目(黔科合基础[2016]1003)
中央补助地方科技基础条件专项基金(黔科合条中补地[2015]4003)
文摘
油菜素内酯是一种参与调控植物生长发育和环境抗性的植物激素,BSKs是BR信号通路中重要的信号转导激酶。以马铃薯为试验材料,通过同源序列检索分析设计特异性引物,采用RT-PCR技术克隆得到BSK基因家族的7个基因,分别命名为StBSK 1、StBSK2、StBSK3、StBSK4、StBSK5、StBSK 6和StBSK 7。其CDS全长分别为1 497、1 479、1 464、1 461、1 476、1 476和1 476 bp,分别编码498、492、487、486、491、491和491个氨基酸。生物信息学分析表明,StBSKs蛋白的等电点为5.14~6.37,均呈弱酸性;这7个蛋白均无跨膜结构域和信号肽;氨基酸序列比对发现,StBSKs蛋白的氨基酸序列在N端存在较大差异。系统进化树分析发现,StBSKs蛋白与同科物种的亲缘关系更近。本研究结果丰富了对马铃薯油菜素内酯信号激酶StBSKs基因的认知,也为进一步深入研究StBSKs的基因功能奠定基础。
关键词
马铃薯
油菜素内酯信号激酶
氨基酸序列
系统进化树
Keywords
Solanum tuberosum
brassinolide
signal
kinase
(
bsk
)
amino acid sequence
phylogenetic tree
分类号
S532 [农业科学—作物学]
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出处
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1
马铃薯油菜素内酯信号激酶基因StBSKs的克隆与序列分析
马杰
郑好
周平
陈春艳
吴瑞
马维
宋雷
孙勃
《浙江农业学报》
CSCD
北大核心
2019
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