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抑制剂Benzamidine与胰岛素作用机制的分子动力学和结合自由能计算研究
被引量：
2
1
作者
王青
梁志强
+3 位作者
王伟
伊长虹
李洪云
赵娟
《原子与分子物理学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第5期951-956,共6页
氢键和极性相互作用在抑制剂-蛋白结合专一性识别过程中起到重要作用.抑制剂Benzamidine(BEN)与胰岛素trypsin相互作用机制的阐明有助于胰岛素高效抑制剂的研发.本文采用分子动力学模拟和MM-PBSA(molecular mechanics-Poisson Boltzmann...
氢键和极性相互作用在抑制剂-蛋白结合专一性识别过程中起到重要作用.抑制剂Benzamidine(BEN)与胰岛素trypsin相互作用机制的阐明有助于胰岛素高效抑制剂的研发.本文采用分子动力学模拟和MM-PBSA(molecular mechanics-Poisson Boltzmann surface area)从原子层次上研究BEN与胰岛素的结合模式.结果表明抑制剂BEN的脒基不仅与Asp189的羰基产生静电相互作用,而且与残基Ser190和Gly214形成氢键相互作用.基于残基能量分解的计算表明抑制剂的苯基与残基His58,Cys191,Gln192,Trp211,Gly212和Cys215形成有利于抑制剂结合的疏水性相互作用.期望当前的研究能为胰岛素有效抑制剂的研发提供重要的理论指导.
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关键词
胰岛素trypsin
分子动力学
结合自由能
抑制剂
benzamidine
.
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职称材料
题名
抑制剂Benzamidine与胰岛素作用机制的分子动力学和结合自由能计算研究
被引量：
2
1
作者
王青
梁志强
王伟
伊长虹
李洪云
赵娟
机构
山东交通学院理学院
出处
《原子与分子物理学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第5期951-956,共6页
基金
国家自然科学基金(11504206
11274206)
山东省高等学校科技计划项目(J14LJ07)
文摘
氢键和极性相互作用在抑制剂-蛋白结合专一性识别过程中起到重要作用.抑制剂Benzamidine(BEN)与胰岛素trypsin相互作用机制的阐明有助于胰岛素高效抑制剂的研发.本文采用分子动力学模拟和MM-PBSA(molecular mechanics-Poisson Boltzmann surface area)从原子层次上研究BEN与胰岛素的结合模式.结果表明抑制剂BEN的脒基不仅与Asp189的羰基产生静电相互作用,而且与残基Ser190和Gly214形成氢键相互作用.基于残基能量分解的计算表明抑制剂的苯基与残基His58,Cys191,Gln192,Trp211,Gly212和Cys215形成有利于抑制剂结合的疏水性相互作用.期望当前的研究能为胰岛素有效抑制剂的研发提供重要的理论指导.
关键词
胰岛素trypsin
分子动力学
结合自由能
抑制剂
benzamidine
.
Keywords
Trypsin
Molecular dynamics simulations
Binding free energy
Inhibitor
benzamidine
分类号
Q641.12 [生物学—生物物理学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
抑制剂Benzamidine与胰岛素作用机制的分子动力学和结合自由能计算研究
王青
梁志强
王伟
伊长虹
李洪云
赵娟
《原子与分子物理学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016
2
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