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竹子捕光叶绿素a/b结合蛋白基因全长的克隆和序列分析 被引量:14
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作者 高志民 李雪平 +1 位作者 彭镇华 岳永德 《林业科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2007年第3期34-38,共5页
采用RT-PCR技术与RACE技术,从绿竹中克隆到捕光叶绿素a/b结合蛋白基因全长eDNA,命名为cab-BO1(GenBank登记号:EF061137)。该基因长1102bp,从第64—861bp含有1个开放阅读框,编码265个氨基酸。cab-BO1编码的氨基酸中第64-232位包... 采用RT-PCR技术与RACE技术,从绿竹中克隆到捕光叶绿素a/b结合蛋白基因全长eDNA,命名为cab-BO1(GenBank登记号:EF061137)。该基因长1102bp,从第64—861bp含有1个开放阅读框,编码265个氨基酸。cab-BO1编码的氨基酸中第64-232位包括典型的捕光叶绿素a/b结合蛋白功能域,第9—11位为蛋白激酶c的磷酸化位点,第27~52位为泛素结构功能域信号,第55~58位为酪氨酸激酶(CK2)磷酸化位点O序列相似性分析结果表明:cab-BO1 DNA序列和编码的氨基酸序列与玉米、小果野蕉、小麦、水稻等的cab基因及其氨基酸序列的相似性分别在85%和89%以上,显示了cab家族基因在进化过程中的保守性。 展开更多
关键词 绿竹 叶绿素a/b结合蛋白基因(cab) 基因克隆 序列分析
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毛竹捕光叶绿素a/b结合蛋白基因cab-PhE1的克隆与表达分析 被引量:15
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作者 高志民 刘成 +1 位作者 刘颖丽 彭镇华 《林业科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2009年第3期145-149,共5页
The light harvesting chlorophyll a/b-binding protein is one of key proteins in the transformation from light energy to chemical energy. An open reading frame coding precursor protein of cab gene was cloned from the fi... The light harvesting chlorophyll a/b-binding protein is one of key proteins in the transformation from light energy to chemical energy. An open reading frame coding precursor protein of cab gene was cloned from the first strand of bamboo cDNA through RT-PCR methods,and named as cab-PhE1 (cab gene 1 from Phyllostachys edulis EF207229). The sequence analysis showed that the deduced polypeptide was highly homologous to some other CAB proteins from monocotyledon,and the gene belonged to lhcb2 family. Tissue specific expression showed that cab-PhE1 expressed higher in leaf than sheath and stem. The prokaryotic expression vector of cab-PhE1 gene encoding the mature protein was constructed by subcloning the fragment into pET-23 a and was expressed in Escherichia coli induced by IPTG. The molecular weight of the induced protein was about 28 ku,approximate to that of the mature protein. This work is a key to the further research on in vitro reconstitution of light-harvesting Chl a/b complexes. 展开更多
关键词 毛竹 捕光叶绿素a/b结合蛋白基因 组织特异性表达 原核表达
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水稻(Oryza sativa L·)捕光叶绿素a/b结合蛋白基因全长cDNA的克隆和特性分析 被引量:23
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作者 向太和 王利琳 庞基良 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第9期1227-1232,共6页
根据捕光叶绿素a/b结合蛋白基因(cab)家族中的保守序列设计PCR引物,扩增出的约310bpcDNA小片段为分子杂交探针,对构建的水稻cDNA文库进行杂交筛选,并结合PCR分析确定阳性克隆中cDNA片段的大小。通过对插入的cDNA片段最长的阳性克... 根据捕光叶绿素a/b结合蛋白基因(cab)家族中的保守序列设计PCR引物,扩增出的约310bpcDNA小片段为分子杂交探针,对构建的水稻cDNA文库进行杂交筛选,并结合PCR分析确定阳性克隆中cDNA片段的大小。通过对插入的cDNA片段最长的阳性克隆进行测序分析验证,克隆了水稻中1个cab基因全长cDNA,命名为cab-n8(GenBank登记号:AY445626)。cab-n8长为1128bp,从第55bp开始至789bp含有1个开放阅读框和1个终止密码子,编码244个氨基酸(GenBank登记号为AAR19267.1);在3’端含有330bp的非编码区和Poly(A)18;在5’端有45bp的非编码区,在转录起始位点附近有TCA序列。通过序列分析,cab-n8编码的蛋白质在第54—216位包括典型的捕光叶绿素a/b结合蛋白功能域(chlorophll a/b binding domain);在第141—158位含有无名指结构功能域(ring finger structure domain),该位点可能与捕光叶绿素结合蛋白与叶绿素a/b的结合有关;在第194—231位含有甘油醛-3-磷酸脱氢酶C端功能域(C-terminal domain of glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase-like)。cab-n8编码的蛋白质预测的等电点和分子量分别为6.52和26955.80 Da。通过比较分析,cab-n8DNA序列(AY445626)和编码的氨基酸序列(AAR19267.1)与cab27DNA序列(AF094775.1)和编码的氨基酸序列(AAC67557.1)相似性最高,均为97%,显示cab家族基因在进化过程中是相当保守的。Northern blot分析表明,该基因在水稻叶和茎中表达没有差异,但光对其表达有明显的诱导促进作用。 展开更多
关键词 水稻 叶绿素a/b结合蛋白基因 基因克隆 分析
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石蒜捕光叶绿素a/b结合蛋白基因的克隆和序列分析 被引量:4
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作者 汪仁 李晓丹 +3 位作者 江玉梅 贺佳 彭峰 夏冰 《江苏农业科学》 CSCD 北大核心 2011年第2期42-44,共3页
根据捕光叶绿素a/b结合蛋白基因(Cab)家族中的保守序列设计PCR引物,扩增出的约350 bp cDNA小片段为分子杂交探针,对构建的石蒜全长cDNA文库进行杂交筛选,并结合PCR分析对阳性克隆进行测序分析验证,克隆了石蒜中1个Cab基因全长cDNA,命名... 根据捕光叶绿素a/b结合蛋白基因(Cab)家族中的保守序列设计PCR引物,扩增出的约350 bp cDNA小片段为分子杂交探针,对构建的石蒜全长cDNA文库进行杂交筛选,并结合PCR分析对阳性克隆进行测序分析验证,克隆了石蒜中1个Cab基因全长cDNA,命名为LrCab(GenBank登记号:GU362887)。LrCab长为1 073 bp,从第50 bp开始至847 bp含有1个开放阅读框和1个终止密码子,编码265个氨基酸。LrCab编码的蛋白质预测的等电点和分子量分别为5.14和28 010.00 u。通过比较分析,LrCabDNA序列(GU362887)和编码的氨基酸序列与其他种属的Cab基因编码氨基酸序列相似性很高,表明Cab家族基因在进化过程中保守性高。 展开更多
关键词 石蒜 叶绿素a/b结合蛋白基因 基因克隆 分析
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银杏叶绿素a/b结合蛋白基因(GbLhcb4)及其启动子克隆 被引量:4
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作者 王欢利 刘新亮 +2 位作者 郁万文 李广平 曹福亮 《中南林业科技大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第5期114-121,共8页
为了探究银杏中叶绿素a/b结合蛋白基因(Gb Lhcb4)的结构及其相关的转录调控元件,基于Roche454高通量测序获得的Gb Lhcb4基因片段,采用RACE技术分离得到该基因的c DNA序列,并通过染色体步移技术获得该基因启动子序列,结合生物信息学技术... 为了探究银杏中叶绿素a/b结合蛋白基因(Gb Lhcb4)的结构及其相关的转录调控元件,基于Roche454高通量测序获得的Gb Lhcb4基因片段,采用RACE技术分离得到该基因的c DNA序列,并通过染色体步移技术获得该基因启动子序列,结合生物信息学技术分析基因序列的特征、系统进化地位及启动子区域的转录调控元件。序列分析表明,Gb Lhcb4基因全长1 200 bp,含有一个834 bp开放阅读框,编码277个氨基酸,相对分子量为30.65 k D,等电点为5.17。同源分析表明,该基因编码蛋白与北美云杉Ps Lhcb4蛋白(Gen Bank登录号:ABK21281.1)相似性最高,为74.7%。启动子顺式作用元件预测表明,启动子区域包含多个光响应元件及逆境响应元件,同时还存在激素响应、组织特异性表达、细胞周期等相关调控元件。此研究分离得到银杏Gb Lhcb4基因及启动子序列,并进行了相关的生物信息学分析,为探究银杏Gb Lhcb4基因应答环境信号的转录调控机制提供了分子基础。 展开更多
关键词 银杏 叶绿素a/b结合蛋白基因 启动子分离 RACE技术
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马尾松捕光叶绿素a/b结合蛋白基因cab-Pm1的克隆与原核表达 被引量:5
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作者 王猛 曹福祥 龙绛雪 《林业科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2010年第9期172-177,共6页
光合作用是光合生物将光能转化为化学能,并同时将无机物转化成有机物贮存在生物体的过程。现已证明光合生物对光能的吸收、传递和转化都是在光合膜上具有一定的分子排列和空间构象的色素蛋白复合体上进行的(郁飞等,2001)。
关键词 马尾松 捕光叶绿素a/b结合蛋白基因 序列分析 原核表达
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刚毛柽柳光捕获叶绿素a/b结合蛋白基因Thcab1的克隆与分析 被引量:4
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作者 刘亚丽 张凯敏 高彩球 《东北林业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第2期52-56,共5页
通过对NaHCO3胁迫后刚毛柽柳(Tamarix hispida)7个转录组分析,鉴定获得了一个叶绿素a/b结合蛋白基因(命名为Thcab1)全长cDNA序列,该基因全长1 293 bp,编码区长822 bp,编码含273个氨基酸的蛋白质,编码蛋白的分子量为29.44 ku,理论等电点... 通过对NaHCO3胁迫后刚毛柽柳(Tamarix hispida)7个转录组分析,鉴定获得了一个叶绿素a/b结合蛋白基因(命名为Thcab1)全长cDNA序列,该基因全长1 293 bp,编码区长822 bp,编码含273个氨基酸的蛋白质,编码蛋白的分子量为29.44 ku,理论等电点为7.84,NaHCO3胁迫不同时间点转录组数据表明,Thcab1基因的表达主要表现为受盐碱胁迫抑制。为了研究该基因对NaCl胁迫不同时间的应答情况,采用实时定量RT-PCR技术分析刚毛柽柳在NaCl胁迫处理后不同时间、不同组织中基因的表达。结果表明,在刚毛柽柳根和叶中,NaCl胁迫24 h内Thcab1基因主要表现为上调表达。 展开更多
关键词 刚毛柽柳 叶绿素A b结合蛋白基因 盐胁迫
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杧果叶绿素a/b结合蛋白基因cDNA全长克隆及其序列分析 被引量:1
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作者 罗聪 蒋雅琴 +2 位作者 高美萍 陈虎 何新华 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第3期441-444,共4页
采用RT-PCR方法克隆得了杧果叶绿素a/b结合蛋白基因(Cab)cDNA全长序列,命名为Mcab(GenBankaccession No.FJ907952)。Mcab基因全长为915bp,编码264个氨基酸,推测蛋白质分子质量为28.19ku,等电点为5.35。同源性分析表明,Mcab基因在不同植... 采用RT-PCR方法克隆得了杧果叶绿素a/b结合蛋白基因(Cab)cDNA全长序列,命名为Mcab(GenBankaccession No.FJ907952)。Mcab基因全长为915bp,编码264个氨基酸,推测蛋白质分子质量为28.19ku,等电点为5.35。同源性分析表明,Mcab基因在不同植物中的一致性为72%~85%。实验分析表明,杧果Mcab基因编码的蛋白中第63~232位有一个捕光叶绿素a/b结合蛋白功能域,并且在木本植物中非常保守。亚细胞定位分析显示Mcab蛋白被定位于叶绿体,它所编码的蛋白质在绿色植物光合系统中起着重要作用。蛋白二级结构预测显示,Mcab蛋白有8个α-螺旋,5个β折叠区,21个β-转角。研究将有助于进一步了解杧果光合作用的分子机制。 展开更多
关键词 杧果 叶绿素a/b结合蛋白基因 克隆 序列分析
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毛竹cab-PhE11基因的克隆与序列分析 被引量:2
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作者 刘颖丽 高志民 彭镇华 《河北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第5期19-23,共5页
采用RT-PCR技术和RACE-PCR技术,从毛竹(Phyllostachys edulis)中分离了捕光叶绿素a/b结合蛋白基因cDNA编码区全长,命名为cab-PhE11(GenBank登记号:EU327783)。该基因全长1154 bp,编码区cDNA全长753 bp,编码250个氨基酸。生物信息学分析... 采用RT-PCR技术和RACE-PCR技术,从毛竹(Phyllostachys edulis)中分离了捕光叶绿素a/b结合蛋白基因cDNA编码区全长,命名为cab-PhE11(GenBank登记号:EU327783)。该基因全长1154 bp,编码区cDNA全长753 bp,编码250个氨基酸。生物信息学分析表明,在cab-PhE11编码的蛋白第62~239位包括典型的捕光叶绿素a/b结合蛋白功能域,还包含1个N-糖基化位点、1个酪氨酸激酶Ⅱ磷酸化位点、5个N-肉豆蔻酸化位点以及1个丙氨酸富集区。序列相似性分析结果表明,cab-PhE11编码的氨基酸序列与玉米、绿豆、拟南芥、烟草等的cab基因有较高的相似性,都在80%以上,该基因属于lhcb6类基因。 展开更多
关键词 毛竹 捕光叶绿素a/b结合蛋白基因 序列分析
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