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华北典型旱地小麦土壤amoA基因的PCR-RFLP分析
被引量：
4
1
作者
莫旭华
史荣久
+3 位作者
李慧
郑佳
王元芬
徐慧
《生态科学》
CSCD
2009年第1期49-55,共7页
通过构建氨氧化细菌（AOB）和氨氧化古菌（AOA）的氨氧化酶基因亚基A（amoA）克隆文库，并采用限制性片段长度多态性（Restriction Fragment Length Polymorphism，RFLP）技术分析了华北地区典型早地冬小麦土壤中amoA基因的多样性。采用...
通过构建氨氧化细菌（AOB）和氨氧化古菌（AOA）的氨氧化酶基因亚基A（amoA）克隆文库，并采用限制性片段长度多态性（Restriction Fragment Length Polymorphism，RFLP）技术分析了华北地区典型早地冬小麦土壤中amoA基因的多样性。采用MspI和AfaI两种限制性内切酶对amoA基因克隆文库中阳性克隆子进行双酶切后，共得到了18个氨氧化细菌的可操作分类单元（Operational Taxa Units，OTUs）和10个氨氧化古菌可操作分类单元（Operational Taxa Units，OTUs），其文库覆盖率分别达到92．9％和88．3％。氨氧化细菌的Shannon-Wiener指数、丰富度指数、均匀度指数均高于氨氧化古菌。通过对文库中amoA细菌测序分析，所有的序列都属于Nitrosospira cluster3。而在氨氧化古菌中存在着一个绝对优势种群，它占到克隆文库的80％，测序分析的结果表明，氨氧化古菌属于不可培养的泉古菌门。
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关键词
amoa克隆文库
RFLP分析
氨氧化细菌(AOB)
氨氧化古菌(AOA)
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题名
华北典型旱地小麦土壤amoA基因的PCR-RFLP分析
被引量：
4
1
作者
莫旭华
史荣久
李慧
郑佳
王元芬
徐慧
机构
中国科学院沈阳应用生态研究所
中国科学院研究生院
沈阳农业大学土地与环境学院
出处
《生态科学》
CSCD
2009年第1期49-55,共7页
基金
基金项目：中国科学院重要方向性项目（kzcx2-yw-204-2）
国家自然科学基金（30670390）
文摘
通过构建氨氧化细菌（AOB）和氨氧化古菌（AOA）的氨氧化酶基因亚基A（amoA）克隆文库，并采用限制性片段长度多态性（Restriction Fragment Length Polymorphism，RFLP）技术分析了华北地区典型早地冬小麦土壤中amoA基因的多样性。采用MspI和AfaI两种限制性内切酶对amoA基因克隆文库中阳性克隆子进行双酶切后，共得到了18个氨氧化细菌的可操作分类单元（Operational Taxa Units，OTUs）和10个氨氧化古菌可操作分类单元（Operational Taxa Units，OTUs），其文库覆盖率分别达到92．9％和88．3％。氨氧化细菌的Shannon-Wiener指数、丰富度指数、均匀度指数均高于氨氧化古菌。通过对文库中amoA细菌测序分析，所有的序列都属于Nitrosospira cluster3。而在氨氧化古菌中存在着一个绝对优势种群，它占到克隆文库的80％，测序分析的结果表明，氨氧化古菌属于不可培养的泉古菌门。
关键词
amoa克隆文库
RFLP分析
氨氧化细菌(AOB)
氨氧化古菌(AOA)
Keywords
amoa
clone library
RFLP analysis
ammonium-oxidising bacteria（AOB）
ammonium-oxidising archaea（AOA）
分类号
S154.36 [农业科学—土壤学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
华北典型旱地小麦土壤amoA基因的PCR-RFLP分析
莫旭华
史荣久
李慧
郑佳
王元芬
徐慧
《生态科学》
CSCD
2009
4
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