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题名驴血清α1酸性糖蛋白生物信息学分析与纯化鉴定研究
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作者
费雅麒
汤驰
邓亮
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机构
沈阳农业大学畜牧兽医学院
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出处
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2021年第8期2705-2712,共8页
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基金
国家自然科学基金青年项目(31501952)
辽宁省科技厅省级科技特派团项目(2018103049)
辽宁省教育厅基本科研业务费服务地方项目(LSNFW201904)。
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文摘
研究旨在对驴α1酸性糖蛋白(alpha-1-acid glycoprotein,α1-AGP)进行生物信息学预测和分析,并建立一种高效提纯驴α1-AGP的方法。通过生物信息学在线软件分析驴α1-AGP的基本理化性质,并对其二、三级结构进行预测分析;用阳离子层析-凝胶过滤层析联用的方法对其进行纯化,经SDS-PAGE后用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(matrix-assisted laser desorption ionization-time offlight mass spectrometry,MALDI-TOF-MS)进行鉴定。结果显示,驴α1-AGP由201个氨基酸组成,理论等电点(pI)为4.99,有5个潜在N-糖基化位点,亲水性总平均值(GRAVY)为-0.386;二级结构中α-螺旋和β-折叠有序出现,占比88.56%;利用GMQE值和QMEAN的z值验证三级结构预测所得模型在合理范围之内。阳离子交换层析-凝胶过滤层析纯化后得到50 mL蛋白液,SDS-PAGE后得到清晰蛋白条带,经MALDI-TOF-MS鉴定后于NCBI数据库检索,驴α1-AGP得分最高且远高于其他蛋白,证明驴α1-AGP为纯化后蛋白液中主要组分。本研究提出一种新的纯化鉴定驴α1-AGP方法,具有纯化率高、操作简便、所需样品少等优点,为驴α1-AGP的后续生物学研究和应用奠定了理论基础。
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关键词
驴
α1酸性糖蛋白(α1-agp)
生物信息学
纯化
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Keywords
donkey
alpha-1-acid glycoprotein(α1-agp)
bioinformatics
purification
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分类号
S822
[农业科学—畜牧学]
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