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白菜型冬油菜铜锌超氧化物歧化酶(Cu/Zn-SOD)基因的克隆及其在低温条件下的表达 被引量:28
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作者 曾秀存 刘自刚 +7 位作者 史鹏辉 许耀照 孙佳 方彦 杨刚 武军艳 孔德晶 孙万仓 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第4期636-643,共8页
超氧化物歧化酶(SOD)是一种逆境条件下清除细胞内活性氧的关键酶,而铜锌超氧化物歧化酶(Cu/Zn-SOD)是该酶系中最主要的活性氧清除剂,与植物的抗逆性关系密切。本研究根据已发表的十字花科植物Cu/Zn-SOD基因的编码区设计引物,采用RT-PCR... 超氧化物歧化酶(SOD)是一种逆境条件下清除细胞内活性氧的关键酶,而铜锌超氧化物歧化酶(Cu/Zn-SOD)是该酶系中最主要的活性氧清除剂,与植物的抗逆性关系密切。本研究根据已发表的十字花科植物Cu/Zn-SOD基因的编码区设计引物,采用RT-PCR克隆超强抗寒冬油菜陇油7号Cu/Zn-SOD的cDNA序列,该基因全长459 bp。生物信息学分析表明,该基因与甘蓝型油菜(Brassica napus)Cu/Zn-SOD基因同源性高达99%,编码1个亲水性稳定蛋白,无跨膜结构域和信号肽,具有胞质Cu/Zn-SOD超基因家族特有的序列特征和保守结构区域。半定量RT-PCR以及SOD酶活性分析表明,低温诱导条件下Cu/Zn-SOD基因差异表达,在白菜型冬油菜适应低温胁迫过程中发挥重要作用。超强抗寒冬油菜陇油6号品种低温诱导蛋白的SDS-PAGE分析以及蛋白串联质谱技术鉴定表明,Cu/Zn-SOD是受低温诱导表达的抗逆基因。 展开更多
关键词 白菜型冬油菜 CU zn—sod基因克隆 低温 表达分析 sod活性 低温诱导蛋白
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特异种质烟草HZNH的Fe-SOD基因的克隆与表达 被引量:9
2
作者 高健 许晓风 陈学平 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第6期840-845,共6页
A new Fe-SOD gene from a native Chinese tobacco germplasm namely HZNH has been successfully cloned and expressed. Full-length cDNA sequences of the Fe-SOD gene was obtained by employing the 5′ and 3′end RACE method ... A new Fe-SOD gene from a native Chinese tobacco germplasm namely HZNH has been successfully cloned and expressed. Full-length cDNA sequences of the Fe-SOD gene was obtained by employing the 5′ and 3′end RACE method from the HZNH′s cDNA library. The full sequence was 1145 bp in length, including 170 bp of 5′untranslated region, 288 bp of 3′untranslated region and 687 bp of coding region. The coding region encoded a peptide of 228 amino acid residues, in which there was a signal peptide with 26 amino acids and a mature peptide of 202 amino acids. The full-length cDNA sequence was compared with all other reported plants’ Fe-SOD genes’. The result of Blast analysis showed that they shared high homology(>80%) ,the highest one was to N. plumbaginifolia’s with the homology as high as 97.69%. This cDNA was constructed into the prokaryotic expression vector, pQE30a/FeSOD, and transformed into E.coli M15 which was induced with IPTG. SDS-PAGE showed that 27 kD proteins was expressed. The soluble proteins showed the Fe-SOD enzyme activities on PAGE-based isozyme spectrum indicating that this expressed soluble protein is indeed the Fe-SOD enzyme. 展开更多
关键词 sod基因 基因克隆 特异种质 超氧阴离子自由基 CUzn-sod MN-sod 超氧化物歧化酶 烟草 FE-sod 自身免疫疾病
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吴茱萸SOD基因片段克隆和SNP分析 被引量:6
3
作者 吴波 高丹 +2 位作者 潘超美 罗光明 张寿文 《江西农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第6期1206-1211,共6页
根据GenBank已报道的多种植物Cu/Zn-SOD基因和Mn/Fe-SOD基因的保守区域,分别设计了两对用于克隆10种吴茱萸属植物Cu/Zn-SOD基因和Mn/Fe-SOD基因核心片段的简并引物。试验所得的Cu/Zn-SOD基因片段长度为375 bp,Mn/Fe-SOD基因片段长度为42... 根据GenBank已报道的多种植物Cu/Zn-SOD基因和Mn/Fe-SOD基因的保守区域,分别设计了两对用于克隆10种吴茱萸属植物Cu/Zn-SOD基因和Mn/Fe-SOD基因核心片段的简并引物。试验所得的Cu/Zn-SOD基因片段长度为375 bp,Mn/Fe-SOD基因片段长度为429 bp,分别编码125个和143个氨基酸残基。使用DAM-BE和DNAStar5.0生物统计软件对序列进行同源性比对,10种吴茱萸属植物与其他多种植物的Cu/Zn-SOD基因核苷酸序列同源性大于74%,氨基酸序列同源性大于79%;Mn/Fe-SOD基因的核苷酸序列同源性大于78%,氨基酸序列同源性大于81%。在所克隆的Cu/Zn-SOD基因片段中有21个核苷酸SNPs位点,导致6个氨基酸位点变异,多态性频率为1SNP/17.9 bp,核苷酸和氨基酸变异度分别为5.6%和4.8%;在所克隆的Mn/Fe-SOD基因片段中有17个核苷酸SNPs位点,导致3个氨基酸位点变异,多态性频率为1SNP/25.2 bp,核苷酸和氨基酸变异度分别为4.0%和2.1%。采用Neighbour-Joining聚类法,对10种吴茱萸属植物的Cu/Zn-SOD基因片段的核苷酸序列进行聚类分析,构建了精确遗传聚类图谱。 展开更多
关键词 吴茱萸 sod 基因克隆 SNP
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转人Cu,Zn-SOD基因马铃薯的研究 被引量:8
4
作者 刘晓鹏 姜宁 +2 位作者 田阼茂 吕胜安 袁勤生 《华东理工大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2003年第3期255-258,共4页
采用 RT-PCR技术从人肝总 RNA中分离扩增了 490 bp的人铜锌超氧化物歧化酶(h Cu,Zn-SOD)基因的 c DNA序列 ,进行了序列测定 ,结果和文献报道的一致 ;构建了 Ca Mv3 5 S启动子驱动 h Cu,Zn-SOD基因的植物表达载体 PBICu SOD;用三亲交配... 采用 RT-PCR技术从人肝总 RNA中分离扩增了 490 bp的人铜锌超氧化物歧化酶(h Cu,Zn-SOD)基因的 c DNA序列 ,进行了序列测定 ,结果和文献报道的一致 ;构建了 Ca Mv3 5 S启动子驱动 h Cu,Zn-SOD基因的植物表达载体 PBICu SOD;用三亲交配法将重组质粒 PBICu SOD转化到农杆菌 LBA440 4,转化马铃薯得到转基因植株。PCR和 Southern-blot分析证明 ,h Cu,Zn-SOD基因已整合到马铃薯基因组中。Western blot分析表明 ,h Cu,Zn-SOD基因在转基因马铃薯植株中得到表达。用 NBT光还原法测定转基因马铃薯植株中的 SOD酶活力 ,叶的总酶活为1 0 66.6U/ g(湿重 ,下同 ) ,块茎的总酶活为 1 0 1 1 U/ g。 展开更多
关键词 sod hCu zn—sod 农杆菌 基因克隆
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油茶SOD基因片段克隆及序列分析 被引量:2
5
作者 郭春兰 张露 《草业科学》 CAS CSCD 北大核心 2012年第3期417-421,共5页
根据已报道的多种植物Cu/Zn-SOD和Mn/Fe-SOD基因的氨基酸序列的保守区域分别设计简并引物,以油茶(Camellia oleifera)叶片总RNA为模板,通过RT-PCR分别扩增得到一个375bp的Cu/Zn-SOD基因片段和一个429bp的Mn/Fe-SOD基因片段。将片段序列... 根据已报道的多种植物Cu/Zn-SOD和Mn/Fe-SOD基因的氨基酸序列的保守区域分别设计简并引物,以油茶(Camellia oleifera)叶片总RNA为模板,通过RT-PCR分别扩增得到一个375bp的Cu/Zn-SOD基因片段和一个429bp的Mn/Fe-SOD基因片段。将片段序列在NCBI网站上进行同源性比对,表明本研究克隆的结果均与多种植物的Cu/Zn-SOD和Mn/Fe-SOD基因存在亲缘关系,因而认为所克隆的基因片段就是油茶SOD基因;并运用DNAStar5.0软件分别进行序列分析,推导的氨基酸序列分别为125个残基和143个残基;具有所有植物SOD基因共有的保守区域;与多种植物Cu/Zn-SOD基因的核苷酸和氨基酸序列的同源性均分别在80%和84%以上,与其他植物的Mn/Fe-SOD基因的核苷酸和氨基酸序列的同源性都在84%和86%以上。 展开更多
关键词 油茶 sod 基因克隆 序列分析
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柑橘类植物SOD基因片段的克隆和SNP分析 被引量:3
6
作者 吴波 刘勇 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2010年第22期11719-11721,11724,共4页
[目的]对柑橘类植物遗传多样性进行精确分析研究。[方法]根据已报道的各种植物Mn/Fe-SOD基因的氨基酸序列上前后2个保守区设计1对简并引物,采用RT-PCR技术,分别从岭南沙田柚、柠檬等6种柑橘类植物中克隆得到长426bp的Mn/Fe-SOD基因片段... [目的]对柑橘类植物遗传多样性进行精确分析研究。[方法]根据已报道的各种植物Mn/Fe-SOD基因的氨基酸序列上前后2个保守区设计1对简并引物,采用RT-PCR技术,分别从岭南沙田柚、柠檬等6种柑橘类植物中克隆得到长426bp的Mn/Fe-SOD基因片段,并对所得序列进行了SNP分析。[结果]柑橘类植物核苷酸同源性高达97.2%,与其他植物Mn/Fe-SOD基因核苷酸序列的同源性都在77.7%以上;经过氨基酸序列推导,每个基因片段分别编码142个氨基酸,6个基因片段的氨基酸同源性为97.9%,与其他植物Mn/Fe-SOD基因的氨基酸序列同源性在79.0%以上。在Mn/Fe-SOD基因片段中有18个核苷酸位点存在SNPs,导致3个氨基酸位点发生变异,多态性频率为1SNP/23.7bp,核苷酸变异度为4.23%,氨基酸变异度为2.38%。[结论]该研究为丰富构建柑橘类植物基因图谱标记和抗逆性状的遗传标记奠定了基础。 展开更多
关键词 柑橘类植物 sod 基因克隆 SNP 序列分析
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西红柿CU/ZnSOD基因在大肠杆菌中高效表达的研究 被引量:2
7
作者 王宇光 郭建春 郑学勤 《热带作物学报》 CSCD 1995年第S1期83-88,共6页
利用带有Trp启动子的大肠杆菌表达载体WCC8能有效地表达西红柿Cu/ZnSOD基因,该表达蛋白在菌体中具有活性,并在一定程度上抑制受体菌SOD基因的表达。据SDS-PAGE分析,表达SOD蛋白占茵体总蛋白20%左右... 利用带有Trp启动子的大肠杆菌表达载体WCC8能有效地表达西红柿Cu/ZnSOD基因,该表达蛋白在菌体中具有活性,并在一定程度上抑制受体菌SOD基因的表达。据SDS-PAGE分析,表达SOD蛋白占茵体总蛋白20%左右,其活性达3.0×105V/L发酵液。还利用NBT法对表达SOD蛋白的活性进行了研究。 展开更多
关键词 CU/zn sod基因 大肠杆菌 高效表达
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福州旗山野生蕉(Musa spp.,AB Group)试管苗Mn-SOD基因克隆及生物信息学分析 被引量:1
8
作者 张锐 赖钟雄 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2014年第11期2215-2222,共8页
以旗山野生蕉(Musa spp.,AB group)试管苗幼嫩叶片为材料,利用RT-PCR结合RACE技术克隆获得野生蕉试管苗Mn-SOD基因c DNA序列。结果表明:旗山野生蕉Mn-SOD的c DNA全长序列共831 bp,其中5′UTR为137 bp,3′UTR为151 bp,3′端含有17个poly... 以旗山野生蕉(Musa spp.,AB group)试管苗幼嫩叶片为材料,利用RT-PCR结合RACE技术克隆获得野生蕉试管苗Mn-SOD基因c DNA序列。结果表明:旗山野生蕉Mn-SOD的c DNA全长序列共831 bp,其中5′UTR为137 bp,3′UTR为151 bp,3′端含有17个poly(A)尾。开放阅读框(ORF)共有543个碱基组成,编码181个氨基酸。蛋白理化性质预测结果显示:Mn-SOD蛋白分子量为20 108.8 u,等电点7.92,属于碱性蛋白。 展开更多
关键词 旗山野生蕉(Musa spp. AB Group) 试管苗 基因克隆 Mn—sod基因 生物信息学分析
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桔小实蝇超氧化物歧化酶基因SOD3的克隆及表达分析
9
作者 申建梅 陈炳翰 +4 位作者 李森 廖泓之 柯智 柳建良 胡黎明 《环境昆虫学报》 CSCD 北大核心 2015年第4期767-772,共6页
采用反转录聚合酶链式反应(RT-PCR)和快速扩增c DNA末端(RACE)技术克隆桔小实蝇SOD3基因,并命名为Bdor SOD3。Bdor SOD3阅读框全长531 bp,编码176个氨基酸,第1-20位氨基酸为其信号肽区域;该蛋白序列与桔小实蝇的另外一种SOD蛋白AGE8977... 采用反转录聚合酶链式反应(RT-PCR)和快速扩增c DNA末端(RACE)技术克隆桔小实蝇SOD3基因,并命名为Bdor SOD3。Bdor SOD3阅读框全长531 bp,编码176个氨基酸,第1-20位氨基酸为其信号肽区域;该蛋白序列与桔小实蝇的另外一种SOD蛋白AGE89778.1序列的一致性最高,达98.7%;采用Swiss-model在线软件模拟构建Bdor SOD3蛋白的三维结构;采用半定量PCR方法,研究Bdor SOD3基因大肠杆菌诱导后的表达情况,结果表明,Bdor SOD3在处理与对照的24 h、48 h都有表达,但Bdor SOD3在处理后48 h表达量明显升高,结果暗示Bdor SOD3与桔小实蝇蛹对大肠杆菌的免疫机制有关。 展开更多
关键词 桔小实蝇 sod3 基因克隆 半定量PCR
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新西兰白兔SOD1基因编码区克隆及生物信息学分析
10
作者 邓小亮 马文康 +2 位作者 洪玮 付欣 谭茵 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2019年第8期2236-2245,共10页
试验旨在克隆新西兰白兔SOD1基因CDS区并对其进行生物信息学分析。根据GenBank中穴兔SOD 1基因序列(登录号:NM_001082627.2)设计特异性引物,利用RT-PCR技术扩增并克隆新西兰白兔SOD 1基因完整的CDS区序列,测序鉴定后与其他物种进行同源... 试验旨在克隆新西兰白兔SOD1基因CDS区并对其进行生物信息学分析。根据GenBank中穴兔SOD 1基因序列(登录号:NM_001082627.2)设计特异性引物,利用RT-PCR技术扩增并克隆新西兰白兔SOD 1基因完整的CDS区序列,测序鉴定后与其他物种进行同源性比对并构建系统进化树,使用SOPMA、SWISS-MODEL、ExPASy、ProtParam等软件和在线工具对蛋白序列进行分析,并预测蛋白分子的亚细胞定位及互作网络。结果显示,新西兰白兔SOD 1基因CDS区长度为459 bp,A、T、C、G碱基含量分别为24.84%、18.95%、23.09%和33.12%,GC含量大于AT含量,编码153个氨基酸。同源性比对结果发现,新西兰白兔与穴兔、卷尾猴、人、黑猩猩、普通狨、骆驼、家犬、猕猴、野猪、小鼠的同源性分别为99.8%、85.2%、85.0%、84.7%、84.1%、83.9%、83.9%、83.7%、83.2%和81.3%。系统进化树结果显示,新西兰白兔和穴兔进化关系最近,并单独聚成一个分支。新西兰白兔SOD1蛋白分子质量为15.7 ku,理论等电点(pI)为5.86,分子式为C672H1084N200O221S5,不稳定指数为23.79,脂肪系数为78.89,平均亲水指数(GRAVY)为-0.276;属水溶性蛋白,无信号肽及跨膜区。SOD1蛋白包含5个潜在的磷酸化修饰位点和3个潜在的糖基化位点;在45-120位氨基酸处存在1个保守的活性中心;二级结构以无规则卷曲为主,占53.59%;三级结构建模显示蛋白易形成同源二聚体。亚细胞定位结果显示,细胞质、细胞核和线粒体分别占65.2%、26.1%和8.7%;SOD1蛋白在体内能与SOD2、PRDX1、PRDX3、PRDX4、DERL1等分子形成互作网络。本试验结果为进一步深入研究SOD 1基因的功能及探索其与相关疾病的关系提供了参考依据。 展开更多
关键词 新西兰白兔 sod1基因 克隆 生物信息学 预测
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耐碱Mn-SOD基因克隆与真核表达载体的构建
11
作者 陈红漫 马晶 +1 位作者 訾晓男 阚国仕 《江苏农业科学》 CSCD 北大核心 2008年第3期80-83,共4页
以高产耐碱Mn-SOD产生菌Bacillussp.110-2总DNA为模板,通过PCR扩增得到耐碱Mn-SOD基因,编码一个完整的开放阅读框,共202个氨基酸,含18个碱性氨基酸,包括12个赖氨酸和6个精氨酸。与地衣芽孢杆菌同源性为99%,与极端耐碱芽孢杆菌(Bacillus ... 以高产耐碱Mn-SOD产生菌Bacillussp.110-2总DNA为模板,通过PCR扩增得到耐碱Mn-SOD基因,编码一个完整的开放阅读框,共202个氨基酸,含18个碱性氨基酸,包括12个赖氨酸和6个精氨酸。与地衣芽孢杆菌同源性为99%,与极端耐碱芽孢杆菌(Bacillus halodurans)同源性为78.7%。克隆片段酶切后,插入到巴斯德毕赤酵母表达载体pPIC9K中,获得毕赤酵母真核表达载体pPIC9K-SOD。 展开更多
关键词 耐碱Mn—sod 基因克隆 真核表达载体构建
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节杆菌A. pascens DMDC12中SOD基因的克隆和序列分析
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作者 叶艳华 何冰芳 应汉杰 《微生物学杂志》 CAS CSCD 2008年第5期29-33,共5页
根据基因库中细菌SOD的基因保守序列和Arthrobacter pascens DMDC12的N-末端氨基酸序列设计引物,采用PCR技术,以A.pascens DMDC12基因组为模板,克隆了A.pascens DMDC12中Mn-SOD的567 bp的基因片段;再结合该基因片段和A.pascens DMDC12中... 根据基因库中细菌SOD的基因保守序列和Arthrobacter pascens DMDC12的N-末端氨基酸序列设计引物,采用PCR技术,以A.pascens DMDC12基因组为模板,克隆了A.pascens DMDC12中Mn-SOD的567 bp的基因片段;再结合该基因片段和A.pascens DMDC12中SOD的N-末端氨基酸序列的有关信息,设计包含该sod完整ORF区域的引物,成功扩增了A.pascens DMDC12中Mn-SOD的基因序列,新sod序列(sodAP)已提交Gen-Bank(收录号DQ779150)。利用生物学软件对该序列进行分析表明,该sodAP序列的ORF区域全长651 bp,编码216个氨基酸;该序列和Arthrobacter sp.FB24的SOD基因序列同源性为86%。 展开更多
关键词 A.pascens DMDC12菌株 Mn—sod sodAP 基因克隆
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布鲁氏菌Cu/Zn-SOD基因的原核表达及其免疫原性分析 被引量:2
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作者 覃晓琳 乔祖健 +4 位作者 胡森 刘文兴 赵云 李继昌 步志高 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第4期317-320,共4页
为分析布鲁氏菌超氧化物歧化酶(Cu/Zn-SOD)蛋白的免疫原性,本研究将布鲁氏菌强毒株M28的Cu/Zn-SOD基因经PCR扩增并克隆至pET-32a(+)中进行重组表达和纯化。经western blot分析表明,重组蛋白SOD(rSOD)可以与布鲁氏菌自然感染血清发生特... 为分析布鲁氏菌超氧化物歧化酶(Cu/Zn-SOD)蛋白的免疫原性,本研究将布鲁氏菌强毒株M28的Cu/Zn-SOD基因经PCR扩增并克隆至pET-32a(+)中进行重组表达和纯化。经western blot分析表明,重组蛋白SOD(rSOD)可以与布鲁氏菌自然感染血清发生特异性反应。同时,以rSOD免疫BALB/c小鼠制备的多抗血清可以与布鲁氏菌疫苗株M5-90发生特异性反应;以rSOD为包被抗原进行间接ELISA检测,结果显示rSOD能够区分布鲁氏菌阳性血清和阴性血清。因此,rSOD蛋白具有良好的免疫原性和ELISA反应原性,为利用rSOD蛋白建立布鲁氏菌检测方法奠定基础。 展开更多
关键词 布鲁氏菌 Cu zn sod基因 原核表达 免疫原性
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“台农甜蜜桃”胚性愈伤组织SOD基因家族的克隆与序列分析 被引量:1
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作者 汤燕姗 赖钟雄 +1 位作者 赖呈纯 林玉玲 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2013年第10期1925-1934,共10页
以"台农甜蜜桃"胚性愈伤组织为材料,采用RT-PCR和RACE法,首次从台农甜蜜桃中克隆出较为完整的包括Fe-SOD、Mn-SOD、Cu/Zn-SOD 3类型20条的SOD基因家族的全长序列,各成员核酸长度范围在858~1 234bp之间,共编码4种不同的蛋白。... 以"台农甜蜜桃"胚性愈伤组织为材料,采用RT-PCR和RACE法,首次从台农甜蜜桃中克隆出较为完整的包括Fe-SOD、Mn-SOD、Cu/Zn-SOD 3类型20条的SOD基因家族的全长序列,各成员核酸长度范围在858~1 234bp之间,共编码4种不同的蛋白。生物学分析学分析表明,SOD家族蛋白均为稳定的跨膜蛋白,均含有SOD典型的保守结构域,且在进化上高度保守,但在磷酸化位点上各蛋白差异较大,且3′UTR及5′UTR均具有多态性,可能通过以丝氨酸为主的磷酸化方式,改变酶活性及蛋白构象来参与对桃生长发育的调控。 展开更多
关键词 sod基因家族 克隆 序列分析
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副结核分枝杆菌SOD基因的克隆与序列分析 被引量:4
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作者 曾凡利 胡玉庆 +2 位作者 徐凤宇 王春芳 姜秀云 《中国兽药杂志》 2008年第3期1-3,共3页
以副结核分枝杆菌C-2染色体DNA为模板,以SOD基因特异性引物进行PCR扩增,获得约620 bp的DNA片段。将PCR产物克隆至pGEM-T Vector中,通过α-互补法筛选和质粒酶切及序列分析鉴定,成功构建出重组质粒pGEM-T-SOD,为进一步研究SOD基因及其表... 以副结核分枝杆菌C-2染色体DNA为模板,以SOD基因特异性引物进行PCR扩增,获得约620 bp的DNA片段。将PCR产物克隆至pGEM-T Vector中,通过α-互补法筛选和质粒酶切及序列分析鉴定,成功构建出重组质粒pGEM-T-SOD,为进一步研究SOD基因及其表达产物的免疫生化特性奠定基础。 展开更多
关键词 副结核分枝杆菌 sod基因 克隆 序列分析
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玉米ZmSOD基因克隆及其在干旱胁迫下的表达
16
作者 李玉华 赵振华 +3 位作者 吴征 白佳田 王烁莹 王同朝 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第7期1097-1106,共10页
为探讨超氧化物歧化酶(superoxide dismutase,SOD)基因在玉米抗逆反应中的作用,研究选用2个抗旱性有明显差别的玉米品种为试验材料,采用RT-PCR、实时荧光定量PCR(qRT-PCR)及二维凝胶电泳(2-DE)耦联的基质辅助激光解吸电离/飞行时间质谱(... 为探讨超氧化物歧化酶(superoxide dismutase,SOD)基因在玉米抗逆反应中的作用,研究选用2个抗旱性有明显差别的玉米品种为试验材料,采用RT-PCR、实时荧光定量PCR(qRT-PCR)及二维凝胶电泳(2-DE)耦联的基质辅助激光解吸电离/飞行时间质谱(MALDI-TOF)法,对ZmSOD基因的序列结构及其在干旱胁迫下的表达特性进行分析。结果表明:(1)从干旱敏感品种‘登海605’(DH605)和抗旱品种‘蠡玉35’(LY35)玉米叶片中分别成功克隆出ZmSOD1和ZmSOD2基因。DH605中ZmSOD1开放阅读框(ORF)全长456 bp,编码151个氨基酸,编码的蛋白等电点为5.76,分子量为15.05 kD。LY35中ZmSOD2 ORF全长459 bp,编码152个氨基酸,编码的蛋白等电点为5.65,分子量为15.11 kD;ZmSOD1和ZmSOD2是亲水性稳定蛋白,都含有Cu/Zn-SOD结构域,蛋白序列N端无信号肽及无跨膜结构域。同源性和系统进化分析表明,玉米ZmSOD和谷子Cu/Zn-SOD2的亲缘关系最近,相似性高达96.05%。(2)在干旱条件下,ZmSOD1在DH605中转录水平明显降低,LY35中ZmSOD2转录水平显著升高;2-DE耦联的质谱分析显示:ZmSOD1在DH605中表达量明显降低,LY35中ZmSOD2表达量无显著性变化,却检测到Mn-SOD蛋白表达量显著增加。(3)相关分析显示,干旱条件下,DH605叶片中ZmSOD1转录水平和其蛋白丰度及SOD酶活性呈极显著性正相关,LY35叶片中ZmSOD2转录水平与SOD酶活性呈显著性正相关。研究结果为进一步探索SOD基因在调节玉米抗性以及逆境胁迫应答过程中的作用机制提供了基础。 展开更多
关键词 玉米 Zmsod 基因克隆 表达分析 干旱胁迫 sod活性
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夏威夷椰子超氧化物歧化酶基因片段的克隆与序列分析 被引量:5
17
作者 韩闯 谢潮添 +3 位作者 游学明 云叶 钟然 杨盛昌 《厦门大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2005年第B06期167-170,共4页
以热带植物夏威夷椰子(Chamaedoreacostricana)基因组DNA为模板,根据SOD基因保守序列设计特异引物进行PCR扩增,得到特异基因片段.回收该基因片段,与pMD182T载体连接,并转化到感受态大肠杆菌ER2566细胞,获得Cu·ZnSOD基因片段的克隆... 以热带植物夏威夷椰子(Chamaedoreacostricana)基因组DNA为模板,根据SOD基因保守序列设计特异引物进行PCR扩增,得到特异基因片段.回收该基因片段,与pMD182T载体连接,并转化到感受态大肠杆菌ER2566细胞,获得Cu·ZnSOD基因片段的克隆.序列分析表明夏威夷椰子Cu·ZnSOD基因片段含3个外显子和3个内含子,编码64个氨基酸,与玉米、红薯和白杨相应氨基酸序列的同源性分别为82.81%,81.25%,81.25%和79.69%. 展开更多
关键词 夏威夷椰子 基因片段 超氧化物歧化酶 序列分析 克隆 基因组DNA PCR扩增 sod基因 氨基酸序列 热带植物 大肠杆菌 特异引物 序列设计 感受态 T载体 内含子 外显子 分析表 同源性 Cu 细胞
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耐辐射奇球菌超氧化物歧化酶基因的克隆与序列分析
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作者 吕星 邢瑞云 +1 位作者 路萍 郑晖 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2001年第3期406-409,共4页
By using a 453 bp length gene fragment of superoxide dismutase(SOD)as a probe,which was firstly amplified from Deinococcus radiodurans genomic DNA by PCR with degenerate oligonucleotide primers corresponding to the co... By using a 453 bp length gene fragment of superoxide dismutase(SOD)as a probe,which was firstly amplified from Deinococcus radiodurans genomic DNA by PCR with degenerate oligonucleotide primers corresponding to the conservative regions of known SODs,a putative SOD gene was identified from the database of D.radiodurans whole genome.Its 636 bp length open reading frame and 5′ and 3′ flanking sequence was determined.The conventional E.coli ribosomal and RNA polymerase binding sites were found upstream from SOD encoding region and an inverted repeat sequence downstream of the termination codon.The deduced 211 amino acid sequence of the structural gene showed a high similarity to other manganese and iron containing SODs in normally conserve regions. 展开更多
关键词 耐辐射奇球菌 sod 基因克隆 序列分析
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芝麻Cu/Zn超氧化物歧化酶基因的全基因组鉴定与分析
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作者 张文香 崔文宁 +1 位作者 高小宽 梁魁景 《农业与技术》 2023年第20期47-50,共4页
铜/锌超氧化物岐化酶(Cu/Zn-SOD)是植物体内非常重要的一种活性氧清除酶系统,本研究通过blast的方法,在芝麻全因组水平进行Cu/Zn-SOD的鉴定。结果显示,芝麻中含有4条Cu/Zn-SOD,分别命名为SiCSD1、SiCSD2、SiCSD3、SiCSD4。理化性质分析... 铜/锌超氧化物岐化酶(Cu/Zn-SOD)是植物体内非常重要的一种活性氧清除酶系统,本研究通过blast的方法,在芝麻全因组水平进行Cu/Zn-SOD的鉴定。结果显示,芝麻中含有4条Cu/Zn-SOD,分别命名为SiCSD1、SiCSD2、SiCSD3、SiCSD4。理化性质分析表明,4种蛋白质均为酸性蛋白质,除SiCSD3外,均为亲水蛋白。结构域分析发现,蛋白质均含有Cu/Zn-SOD特有的结构域和金属离子结合域,但都不具有跨膜结构和信号肽。亚细胞定位预测分析发现,SiCSD1-3均定位于叶绿体,SiCSD4除了叶绿体,也有可能定位于细胞质。进化树分析发现,SiCSD3与拟南芥AtCSD2聚为一支,SiCSD4与拟南芥AtCSD3聚为一支,SiCSD1和SiCSD2与烟草NpSODC、番茄SlSODC1和SlSODC2聚在一个大的分支。以上结果初步表明,SiCSD1-4具有Cu/Zn-SOD共同的理化性质,其序列的鉴定将为后续功能的研究打下基础。 展开更多
关键词 芝麻 Cu/zn超氧化物歧化酶 sod 基因 分析
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