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人tPA信号肽和Yersinia pestis保护性抗原F1-V融合基因的构建及其免疫效果观察 被引量:3
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作者 韩岳 王希良 +3 位作者 董梅 邢丽 赵光宇 刘秀华 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第10期811-816,共6页
为获得含有鼠疫F1和V抗原编码基因,以及人tPA信号肽基因的重组质粒tPA-pVAX1/F1-V,测定其诱导特异性免疫应答的能力,用PCR扩增鼠疫菌F1和V编码基因,分别与pGEM-T连接测序.构建pVAX1/F1-V融合重组质粒,PCR扩增tPA信号肽片段,并将其插入到... 为获得含有鼠疫F1和V抗原编码基因,以及人tPA信号肽基因的重组质粒tPA-pVAX1/F1-V,测定其诱导特异性免疫应答的能力,用PCR扩增鼠疫菌F1和V编码基因,分别与pGEM-T连接测序.构建pVAX1/F1-V融合重组质粒,PCR扩增tPA信号肽片段,并将其插入到F1-V的上游,构建tPA-pVAX1/F1-V融合重组质粒;转染COS-7细胞,Western印迹法鉴定目的蛋白的表达,重组质粒tPA-pVAX1/F1-V加GM-CSF佐剂免疫BALB/c小鼠,观察免疫效果.400个LD50强毒鼠疫菌皮下攻毒观察保护率.结果表明,tPA-pVAX1/F1-V在COS-7细胞中表达;免疫鼠体内产生特异性抗体;抗体亚型分析、细胞因子等指标的测定表明,所构建DNA疫苗以诱发Th1型免疫为主;(攻毒保护率达90%.结果提示,已成功构建F1-V融合蛋白真核表达载体tPA-pVAX1/F1-V,它具有诱导特异性细胞免疫和体液免疫应答的能力,对强毒鼠疫菌皮下攻毒有一定的保护效力,为鼠疫菌新型疫苗研制奠定了基础. 展开更多
关键词 鼠疫杆菌 F1-V抗原 基因融合双价疫苗 tPA信号肽
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Isolation and Pathogenicity Analyses on Yersinia enterocolitica from Pelteobagrus vachelli
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作者 Zhao Jing Wang Li 《Journal of Northeast Agricultural University(English Edition)》 CAS 2015年第2期29-35,F0003,共8页
Yersinia enterocolitica is an important zoonotic pathogen that can induce disease outbreaks in a wide host range. Strain YER6022 was isolated from Pelteobagrus vachelli and identified using bacterial morphology and 16... Yersinia enterocolitica is an important zoonotic pathogen that can induce disease outbreaks in a wide host range. Strain YER6022 was isolated from Pelteobagrus vachelli and identified using bacterial morphology and 16S rDNA sequence analysis. Five virulence factors were detected, then artificial infection experiment and histopathological method were carried out. These results showed that strain YER6022 was one of Y. enterocolitica family members. In addition, ail, ystb, virF, yadA and HPIint were dectected. In artificial infection experiment, with 80% mortality and 100% morbidity, injected Pelteobagrus vachellis showed red swollen of the anus, abdomen swelling and fim bleeding. There existed serious hyperaemia and edema in kidney, spleen, intestine and liver at the light microscope. Ultrastructural observation indicated that mitochondria of the liver, kidney, spleen and intestine swelled and mitochondrial cristae broke. The data had further shed light on its pathogenicity in Pelteobagrus vachelli. It would benefit for further studies on pathogenesis ofPelteobagrus vachelli infected with Y. enterocolitica. 展开更多
关键词 yersinia enterocolitica ISOLATION PATHOGENICITY Pelteobagrus vachelli
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北京市某区腹泻患者感染小肠结肠炎耶尔森菌病原特征分析
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作者 刘雨薇 王海瑞 +6 位作者 张彦春 李首飞 王洛桐 王苗 闫爱霞 李颖 张茂俊 《中国人兽共患病学报》 北大核心 2025年第6期609-616,共8页
目的对北京市某区监测腹泻患者的粪便标本进行小肠结肠炎耶尔森菌(Yersinia enterocolitica,Ye)分离培养并对分离菌株进行病原特征分析,为Ye感染的防治提供基础数据。方法收集2019年1月至2024年6月期间北京市某区腹泻患者信息和粪便标... 目的对北京市某区监测腹泻患者的粪便标本进行小肠结肠炎耶尔森菌(Yersinia enterocolitica,Ye)分离培养并对分离菌株进行病原特征分析,为Ye感染的防治提供基础数据。方法收集2019年1月至2024年6月期间北京市某区腹泻患者信息和粪便标本。对粪便标本进行基于荧光PCR初筛下的增菌培养;对分离株完成菌种鉴定及抗生素敏感性检测。通过荧光PCR以及全基因组测序进行菌株的毒力基因分布及其它遗传特征分析。结果1439例腹泻患者共分离到Ye菌株11株,检出率为0.76%(11/1439)。加上既往1例阳性患者,12例Ye阳性患者年龄介于6~41岁;患者粪便性状构成比为水样便66.67%(8/12)、稀便33.33%(4/12);患者出现恶心、呕吐、发热的频率分别为41.67%(5/12)、41.67%(5/12)、8.33%(1/12)。12株Ye对TET、AMP和NAL三种抗生素的耐药率分别为50.00%(6/12)、33.33%(4/12)和25.00%(3/12),1株Ye菌为多重耐药菌株,耐药谱为ETP+MEM+TET+CIP+NAL+AMP。5种Ye毒力基因荧光PCR检测结果显示2株Ye为ystA+/ystB-型(ystA+/ystB-/ail+/yadA+/virF+),10株Ye为ystA-/ystB+型(ystA-/ystB+/ail-/yadA-/virF-)。基于基因组序列的VFDB数据库比对分析发现12株YE共预测出106个毒力基因和12种毒力基因谱,所有菌株均普遍携带11个关键毒力基因,包括黏附、入侵、蛋白酶及鞭毛运动相关基因。仅在2株ystA+/ystB-Ye预测到含有与TTSS分泌系统、ABC转运蛋白功能紧密关联的遗传元件。结论腹泻病例粪便分离培养ystA-/ystB+型Ye存在漏检的可能,粪便增菌液荧光PCR筛查对ystA-/ystB+型Ye分离率提升具有重要意义;腹泻病例分离Ye呈现遗传特征多样性,且含有多种类型毒力基因。 展开更多
关键词 小肠结肠炎耶尔森菌 腹泻 耐药 全基因组测序
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环青海湖地区鼠疫疫源地鼠疫菌单核苷酸多态性研究
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作者 李胜 靳娟 +7 位作者 何建 杨晓艳 柏吉祥 辛有全 张丽 张晓璐 杜文琪 李伟 《中国人兽共患病学报》 北大核心 2025年第6期592-596,共5页
目的基于鼠疫菌全基因组单核苷酸多态性分析,明确环青海湖地区鼠疫疫源地鼠疫菌分子特征,为该地区鼠疫菌的分子流行病学分析和溯源奠定基础。方法利用全基因组测序技术,获得环青海湖地区鼠疫自然疫源地84株代表性鼠疫菌株的全基因组序列... 目的基于鼠疫菌全基因组单核苷酸多态性分析,明确环青海湖地区鼠疫疫源地鼠疫菌分子特征,为该地区鼠疫菌的分子流行病学分析和溯源奠定基础。方法利用全基因组测序技术,获得环青海湖地区鼠疫自然疫源地84株代表性鼠疫菌株的全基因组序列,以NCBI数据库中的鼠疫菌及假结核耶尔森菌IP32953的全基因组序列为参考,比对2298个SNP位点并进行分析。结果1957—2020年,环青海湖地区鼠疫疫源地分离的84株代表性鼠疫菌株分为1.IN2和3.ANT1两个分支,其中1.IN2分支作为该地区鼠疫菌的特征种群遍及所有疫情流行年代;鼠疫菌SNP地区分布显示除乌兰县外其余5个县的鼠疫菌均位于1.IN2分支中;不同宿主SNP分布显示,除分离自喜马拉雅旱獭和狗体内的2株鼠疫菌位于3.ANT1分支外,其余均位于1.IN2分支中。结论环青海湖地区鼠疫疫源地鼠疫菌的SNP种群结构较为单一,基于鼠疫菌基因组单核苷酸多态性分析,可以为该地区鼠疫疫情的溯源和防控措施的制定提供科学依据。 展开更多
关键词 环青海湖地区 鼠疫疫源地 鼠疫菌 单核苷酸多态性
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假结核耶尔森氏菌T6SS效应蛋白TepC功能研究
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作者 瞿熠晨 郭呈昊 +5 位作者 赵依昕 史圆 邢照岩 宋莉 潘君风 沈锡辉 《西北农林科技大学学报(自然科学版)》 北大核心 2025年第5期47-55,共9页
【目的】研究模式病原细菌假结核耶尔森氏菌(Yersinia pseudotuberculosis)Ⅵ型分泌系统T6SS效应蛋白TepC对细菌生物膜形成的影响及其自身杀虫活性,为该效应蛋白的开发应用奠定基础。【方法】采用结晶紫染色法,观察假结核耶尔森氏菌野生... 【目的】研究模式病原细菌假结核耶尔森氏菌(Yersinia pseudotuberculosis)Ⅵ型分泌系统T6SS效应蛋白TepC对细菌生物膜形成的影响及其自身杀虫活性,为该效应蛋白的开发应用奠定基础。【方法】采用结晶紫染色法,观察假结核耶尔森氏菌野生型(WT)、ΔtepC突变体和ΔtepC(tepC)回补菌株的非生物表面生物膜形成情况,并对其进行定量和定性分析;以线虫模型进行生物表面的生物膜形成试验,研究TepC对假结核耶尔森氏菌生物膜形成能力的影响;以大蜡螟为模型,研究假结核耶尔森氏菌野生型和突变体对大蜡螟致病性的影响;以大蜡螟和棉铃虫为模型,研究纯化TepC蛋白的毒性作用;对大蜡螟脂肪体进行组织切片HE染色,研究TepC处理对大蜡螟脂肪体的影响;利用定量PCR方法研究假结核耶尔森氏菌野生型和tepC突变体感染对大蜡螟抗菌肽基因表达的影响;构建tepC转基因拟南芥,检测转基因拟南芥对甜菜夜蛾幼虫的毒性。【结果】TepC在假结核耶尔森氏菌生物膜形成过程中发挥重要作用,基因tepC的缺失导致假结核耶尔森氏菌在非生物表面和生物表面(线虫)的生物膜形成能力显著降低;TepC能影响假结核耶尔森氏菌对大蜡螟的致病性,注射假结核耶尔森氏菌野生型的大蜡螟存活率仅为36.7%,而注射ΔtepC突变体的大蜡螟存活率为70.0%,另外TepC蛋白对大蜡螟和棉铃虫均有毒性作用,具有广谱杀虫性;TepC处理导致大蜡螟脂肪体遭到破坏,其通过影响大蜡螟脂肪体发挥毒性作用;与接种假结核耶尔森氏菌ΔtepC突变体菌株相比,接种假结核耶尔森氏菌WT菌株的大蜡螟抗菌肽在6 h显著上调,表明TepC影响了大蜡螟的免疫防御功能,喂食tepC转基因拟南芥可以显著降低甜菜夜蛾幼虫的存活率。【结论】假结核耶尔森氏菌T6SS效应蛋白TepC不仅在细菌竞争中发挥作用,还具有杀虫功能,并能影响细菌生物膜的形成。 展开更多
关键词 假结核耶尔森氏菌 Ⅵ型分泌系统 杀虫蛋白 生物膜
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小肠结肠炎耶尔森菌irp2基因的克隆与表达
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作者 方娅琼 冯以勒 +8 位作者 马玉婷 冯春辉 赵猛 陆文凯 许文豪 李生强 马凯茹 冈林环树 张红见 《青海畜牧兽医杂志》 2025年第3期14-18,共5页
Irp2基因参与编码合成铁载体-耶尔森杆菌素(Ybt),是小肠结肠炎耶尔森菌强毒力岛的重要标志基因。为了探索小肠结肠炎耶尔森菌irp2基因的功能、免疫原性及强毒力岛的致病机制,本研究基于GenBank数据库中小肠结肠炎耶尔森菌的irp2基因序列... Irp2基因参与编码合成铁载体-耶尔森杆菌素(Ybt),是小肠结肠炎耶尔森菌强毒力岛的重要标志基因。为了探索小肠结肠炎耶尔森菌irp2基因的功能、免疫原性及强毒力岛的致病机制,本研究基于GenBank数据库中小肠结肠炎耶尔森菌的irp2基因序列,设计合成了一对特异性引物,以小肠结肠炎耶尔森菌ZDN6菌株为研究对象,通过PCR技术扩增获得413 bp的irp2基因片段,并进行了测序分析;随后将其克隆至pET28a(+)载体,转化入TOP10感受态细胞,通过限制性酶切和测序对重组质粒进行验证;然后将鉴定正确的重组质粒pET28a(+)-irp2导入BL21(DE)3菌株中,通过IPTG促使融合蛋白表达,SDS-PAGE和Western blot分析其表达水平。结果表明,pET28a(+)-irp2原核表达载体构建成功,并在大肠埃希菌BL21(DE)3中成功表达出irp2基因,该融合蛋白的大小约为15 kDa。研究结果可为后期高致病性小肠结肠炎耶尔森菌的筛选、鉴定以及强毒力岛的致病机制等研究奠定基础。 展开更多
关键词 小肠结肠炎耶尔森菌 irp2基因 克隆 原核表达
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41种中草药对3种鲟源病原菌的体外抑菌效果 被引量:16
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作者 杨移斌 曹海鹏 +4 位作者 夏永涛 杨婷 赵蕾 胡鲲 杨先乐 《淡水渔业》 CSCD 北大核心 2013年第4期80-84,共5页
采用平板打孔法在观察了弗氏柠檬酸杆菌(Citrobacter freundii)、鲁氏耶尔森氏菌(Yersinia ruckeri)、嗜水气单胞菌(Aeromonas hydrophila)等3种鲟源病原菌对41种中草药敏感性的基础上,进一步采用二倍稀释法测定了具有良好抑菌活性的中... 采用平板打孔法在观察了弗氏柠檬酸杆菌(Citrobacter freundii)、鲁氏耶尔森氏菌(Yersinia ruckeri)、嗜水气单胞菌(Aeromonas hydrophila)等3种鲟源病原菌对41种中草药敏感性的基础上,进一步采用二倍稀释法测定了具有良好抑菌活性的中草药对3种病原菌的最小抑菌浓度和最小杀菌浓度。实验结果表明,3种病原菌对乌梅、石榴皮、地榆、杞子等均高度敏感,对杜仲、柴胡、丹参、熟地黄等均中度敏感,对麦冬、当归、胖大海、玉竹均不敏感。此外,乌梅、石榴皮、地榆、杞子对3种病原菌的最小抑菌浓度和最小杀菌浓度分别为7.81 mg/mL和15.625 mg/mL、15.625 mg/mL和31.25 mg/mL、15.625 mg/mL和31.25 mg/mL以及15.625 mg/mL和31.25 mg/mL,而杜仲、柴胡、丹参、熟地黄等中度敏感中草药对3种病原菌的最小抑菌浓度和最小杀菌浓度均分别高于31.25 mg/mL和62.5 mg/mL。 展开更多
关键词 鲟(Acipenser sp.) 弗氏柠檬酸杆菌(Citrobacter freundii) 鲁氏耶尔森氏菌(yersinia ruckeri) 嗜水气单胞菌(Aeromonas hydrophila) 中草药 抑菌效果
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单机环境中网络攻防实战演练平台的设计与研究 被引量:12
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作者 张梁斌 俞华丰 高昆 《实验技术与管理》 CAS 北大核心 2014年第10期144-147,共4页
利用虚拟机VMware与GNS3网络设备互联技术,在单机环境中搭建了一个典型网络架构的攻防实战演练平台。结合Ubuntu下的Yersinia攻击工具,实例给出了对Windows 2003Server下的DHCP服务器和热备份路由(HSRP)汇聚交换机的具体攻击过程和相应... 利用虚拟机VMware与GNS3网络设备互联技术,在单机环境中搭建了一个典型网络架构的攻防实战演练平台。结合Ubuntu下的Yersinia攻击工具,实例给出了对Windows 2003Server下的DHCP服务器和热备份路由(HSRP)汇聚交换机的具体攻击过程和相应的防御措施,验证了VMware和GNS3构建虚拟网络实验平台的可行性,为学习和研究网络攻防技术提供了一条实战演练的有效途径。 展开更多
关键词 网络攻防实验平台 单机环境 GNS3 VMWARE yersinia
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新型植酸酶基因YkAPPAS在毕赤酵母中的表达及其酶学特性分析 被引量:2
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作者 朱恒文 田永生 +4 位作者 李大伟 于成野 陈磊 彭日荷 姚泉洪 《上海农业学报》 CSCD 2018年第1期1-7,共7页
根据密码子的偏好性,采用PTDS方法化学合成了一个来源于Yersinia kristesenii的新型植酸酶基因(YkAPPAS),并且作为外分泌蛋白在毕赤酵母GS115中成功表达。重组植酸酶YkAPPAS的蛋白分泌量可达到106.73μg/mL。对重组植酸酶的酶学性质研... 根据密码子的偏好性,采用PTDS方法化学合成了一个来源于Yersinia kristesenii的新型植酸酶基因(YkAPPAS),并且作为外分泌蛋白在毕赤酵母GS115中成功表达。重组植酸酶YkAPPAS的蛋白分泌量可达到106.73μg/mL。对重组植酸酶的酶学性质研究表明:该酶的比活力为2 330 U/mg;最适pH为4.5和6.0;最适温度为45℃;100℃处理5 min后其剩余活性为47.55%;90℃处理5 min后其剩余活性为56.75%;在pH 3—12时的活性均在30%以上。Li^+、EDTA对酶活有一定的激活作用;Zn^(2+)、Cu^(2+)对酶活有一定的抑制作用。重组植酸酶还具有良好的抗胃蛋白酶和胰蛋白酶水解的特性。 展开更多
关键词 植酸酶 毕赤酵母 yersinia kristensenii 酶学性质
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中草药添加剂对鲁氏耶尔森菌感染虹鳟血液生化指标的影响 被引量:6
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作者 冯淇元 陆绍霞 +3 位作者 徐喆 王亚玲 李芳源 刘红柏 《淡水渔业》 CSCD 北大核心 2020年第2期60-66,共7页
为研究复方中草药对鲁氏耶尔森菌(Yersinia ruckeri)感染虹鳟(Oncorhynchus mykiss)后其血液生化指标的影响,在虹鳟饲料中分别添加两种复方中草药(复方1组、复方2组),持续投喂28 d。在第28天感染鲁氏耶尔森菌,检测感染后72 h的血清生化... 为研究复方中草药对鲁氏耶尔森菌(Yersinia ruckeri)感染虹鳟(Oncorhynchus mykiss)后其血液生化指标的影响,在虹鳟饲料中分别添加两种复方中草药(复方1组、复方2组),持续投喂28 d。在第28天感染鲁氏耶尔森菌,检测感染后72 h的血清生化指标,并统计各组存活率。结果显示:复方中草药组对虹鳟增重无抑制作用。添加复方中草药可提高虹鳟感染鲁氏耶尔森菌后的存活率,其中复方2组的保护效果最好。感染72 h后,复方2组总蛋白、白蛋白、球蛋白、甘油三酯、总胆固醇含量和碱性磷酸酶活性均高于对照组。复方2组谷丙转氨酶、谷草转氨酶活性低于对照组,乳酸脱氢酶活性显著低于对照组。复方1组和复方2组尿酸含量显著低于对照组。复方中草药组总胆红素、尿素氮、肌酐和血糖含量与对照组相比无显著性差异。结果表明,添加复方中草药能提高鲁氏耶尔森菌感染后虹鳟的存活率,其中复方2组的保护效果最好。 展开更多
关键词 虹鳟(Oncorhynchus mykiss) 中草药 鲁氏耶尔森菌(yersinia ruckeri) 生化指标
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鼠疫耶尔森菌基因组进化与生态位适应研究 被引量:78
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作者 周冬生 韩延平 +18 位作者 宋亚军 童宗中 裴德翠 戴二黑 张玲 包静月 李敏 崔百忠 张秀清 王津 郭兆彪 祁芝珍 金丽霞 翟俊辉 杜宗敏 王效义 汪建 黄培堂 杨瑞馥 《解放军医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2004年第3期204-210,共7页
目的 探索鼠疫耶尔森菌基因组进化的基本规律及其与该菌在自然界适应性演化之间的内在联系。方法 对 36株鼠疫耶尔森菌和 7株假结核耶尔森菌进行芯片比较基因组分析 ,鉴定差异区段 (DFR) ,并对 2 6 0株鼠疫耶尔森菌进行PCR验证 ,分析... 目的 探索鼠疫耶尔森菌基因组进化的基本规律及其与该菌在自然界适应性演化之间的内在联系。方法 对 36株鼠疫耶尔森菌和 7株假结核耶尔森菌进行芯片比较基因组分析 ,鉴定差异区段 (DFR) ,并对 2 6 0株鼠疫耶尔森菌进行PCR验证 ,分析各DFR在这些鼠疫耶尔森菌中的分布 ,同时进行基因组岛分析。结果 在鼠疫耶尔森菌基因组中鉴定出 2 2个DFR ,基于DFR图谱 ,将鼠疫耶尔森菌中国分离株分成 14个基因组型。鼠疫耶尔森菌共有 2 1个基因组岛 ,其中 18个已存在于假结核杆菌中 ,余下 3个为鼠疫耶尔森菌独有。结论 探明了各基因组岛在鼠疫耶尔森菌和假结核耶尔森菌间的差异分布 ,探究了鼠疫耶尔森菌的起源进化 ;建立了鼠疫耶尔森菌基因组分型系统 ;建立了各基因组型别间的系统发育关系 ,初步揭示了鼠疫耶尔森菌基因组的进化规律及其与鼠疫耶尔森菌生态位适应和鼠疫疫源地扩展之间的关系 。 展开更多
关键词 耶尔森氏菌 鼠疫 DNA芯片 基因组进化 生态位适应
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鼠疫耶尔森菌菌株91001全基因组序列测定及初步分析 被引量:40
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作者 宋亚军 童宗中 +26 位作者 王津 郭兆彪 汪莉 韩延平 张建国 裴德翠 周冬生 秦海鸥 庞昕 韩玉军 翟俊辉 李敏 祁芝珍 金丽霞 戴瑞霞 崔百忠 陈峰 李胜霆 叶辰 杜宗敏 王效义 王俊 于军 杨焕明 汪建 黄培堂 杨瑞馥 《解放军医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2004年第3期192-199,共8页
目的 测定对人不致病的鼠疫耶尔森菌布氏田鼠疫源地菌株 910 0 1的全基因组序列 ,并通过比较基因组学研究 ,探索鼠疫耶尔森菌致病性的遗传学机制和进化路线。方法 采用全基因组鸟枪法测定 910 0 1菌株的全基因组序列 ,利用比较基因组... 目的 测定对人不致病的鼠疫耶尔森菌布氏田鼠疫源地菌株 910 0 1的全基因组序列 ,并通过比较基因组学研究 ,探索鼠疫耶尔森菌致病性的遗传学机制和进化路线。方法 采用全基因组鸟枪法测定 910 0 1菌株的全基因组序列 ,利用比较基因组方法对 910 0 1与另外 2株鼠疫耶尔森菌(CO92和KIM)的全基因组进行比较研究。结果 910 0 1菌株的基因组包括 1条染色体和 4个质粒 (pPCP1、pCD1、pMT1和pCRY)。pPCP1质粒长度为 96 0 9bp,与参考菌株基本一致 ;pCD1质粒是编码Ⅲ型分泌系统的质粒 ,长度为70 15 9bp,编码情况与参考菌株基本相同 ,但重排导致了质粒的结构与参考菌株存在差异 ;pMT1质粒长度为10 6 6 4 2bp,保留了较多的原始质粒片段 ,毒力相关基因与参考菌株没有差异 ;pCRY质粒是本研究中新发现的质粒 ,在国内外研究中未曾报道 ,这一质粒长度为2 174 2bp ,具有独立复制能力 ,有一群编码Ⅳ型分泌系统的基因。 910 0 1菌株的染色体长度为4 5 95 0 6 5bp,有 4 0 37个编码序列 (CDS) ,其中 14 1个是假基因 ;染色体中存在着非常丰富的插入序列 ,由于存在IS序列介导的基因组重排 ,910 0 1菌株染色体的结构与参考菌株存在较大差异。通过比较基因组学分析 ,初步确定了910 0 1菌株甘油降解阳性、硝酸盐还原阴性、阿拉? 展开更多
关键词 耶尔森氏菌 鼠疫 基因组 进化 序列分析 DNA
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鼠疫耶尔森菌生物型变异遗传基础的研究和新生物型——田鼠型的提出 被引量:25
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作者 周冬生 童宗中 +16 位作者 宋亚军 张玲 裴德翠 庞昕 韩延平 李敏 崔百忠 王津 郭兆彪 祁芝珍 金丽霞 翟俊辉 杜宗敏 王效义 汪建 黄培堂 杨瑞馥 《解放军医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2004年第3期211-215,共5页
目的 探究鼠疫耶尔森菌生物型变异的遗传基础。方法 通过全基因组序列的比较分析 ,鉴定可能与生物型变异相关的基因突变 ,采用DNA测序和位点特异性PCR的方法 ,分析基因突变在鼠疫耶尔森菌自然分离株中的分布。结果 田鼠鼠疫自然疫源... 目的 探究鼠疫耶尔森菌生物型变异的遗传基础。方法 通过全基因组序列的比较分析 ,鉴定可能与生物型变异相关的基因突变 ,采用DNA测序和位点特异性PCR的方法 ,分析基因突变在鼠疫耶尔森菌自然分离株中的分布。结果 田鼠鼠疫自然疫源地菌株在毒力、生化表型和分子特征上与其他型别鼠疫耶尔森菌相差很大。所有脱氮阴性菌株的napA基因发生了突变 ,所有甘油利用阴性菌株的 glpD基因发生了突变 ,所有阿拉伯糖利用阴性菌株的araC基因发生了突变。结论 提出了一个新的生物型———田鼠型 ;相应糖醇代谢相关基因发生突变是 4个生物型变异的遗传基础。 展开更多
关键词 耶尔森氏菌 鼠疫 生物型 突变
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鼠疫耶尔森菌全基因组DNA芯片的研制及用于比较基因组学分析 被引量:21
14
作者 周冬生 韩延平 +17 位作者 戴二黑 宋亚军 包静月 裴德翠 李敏 崔百忠 张秀清 童宗中 王津 郭兆彪 祁芝珍 金丽霞 翟俊辉 杜宗敏 王效义 汪建 黄培堂 杨瑞馥 《解放军医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2004年第3期200-203,共4页
目的 研制鼠疫耶尔森菌全基因组DNA芯片 ,并将其用于比较基因组分析。方法 挑选出 4 0 0 5条鼠疫耶尔森菌基因 ,PCR扩增各基因 ,以纯化的PCR产物点样制备芯片 ,采用双色荧光杂交策略 ,进行芯片比较基因组杂交。结果 设计了若干质控... 目的 研制鼠疫耶尔森菌全基因组DNA芯片 ,并将其用于比较基因组分析。方法 挑选出 4 0 0 5条鼠疫耶尔森菌基因 ,PCR扩增各基因 ,以纯化的PCR产物点样制备芯片 ,采用双色荧光杂交策略 ,进行芯片比较基因组杂交。结果 设计了若干质控杂交组合 ,芯片杂交结果与全基因组测序结果完全一致。 展开更多
关键词 耶尔森氏菌 鼠疫 DNA芯片 比较基因组学
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胶体金免疫层析法快速检测鼠疫耶尔森菌F1抗体 被引量:17
15
作者 胡孔新 王静 +7 位作者 周蕾 闫中强 李伟 姚李四 牛春莉 李瑾 马颖 陈维娜 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第3期198-201,共4页
目的建立检测鼠疫耶尔森菌F1抗体的胶体金标记免疫层析方法。方法胶体金标记纯化鼠疫F1抗原,双抗原夹心法原理制成免疫层析检测试纸条,并对兔、羊、人和黄鼠血清进行检测评价。结果用80份不同动物种属的阴性血清进行检测,未出现非特异... 目的建立检测鼠疫耶尔森菌F1抗体的胶体金标记免疫层析方法。方法胶体金标记纯化鼠疫F1抗原,双抗原夹心法原理制成免疫层析检测试纸条,并对兔、羊、人和黄鼠血清进行检测评价。结果用80份不同动物种属的阴性血清进行检测,未出现非特异性反应,对5份恢复期病人血清、13份免疫兔血清和2份免疫羊血清检测也取得阳性结果,对于8份I HA临界阳性(滴度1∶20)的达乌尔黄鼠血清检出阳性6份。结论建立了可以用于现场快速检测鼠疫F1抗体的胶体金免疫层析方法。 展开更多
关键词 鼠疫菌 F1抗原 胶体金 免疫层析法
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中国鼠疫菌某些生化特征及地理分布 被引量:16
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作者 祁美英 熊浩明 +7 位作者 魏柏青 李存香 杨晓艳 靳娟 冯建萍 金星 魏荣杰 代瑞霞 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第2期121-124,共4页
目的探讨中国鼠疫菌株生化性状及地理分布特征。方法采用常规方法,研究我国现有11种类型的鼠疫自然疫源地2 370株鼠疫菌酵解麦芽糖、鼠李糖、蜜二糖、阿胶糖、甘油及脱氮反应的变化。结果根据测定结果,与地理分布生物群落联系起来,可将... 目的探讨中国鼠疫菌株生化性状及地理分布特征。方法采用常规方法,研究我国现有11种类型的鼠疫自然疫源地2 370株鼠疫菌酵解麦芽糖、鼠李糖、蜜二糖、阿胶糖、甘油及脱氮反应的变化。结果根据测定结果,与地理分布生物群落联系起来,可将中国鼠疫自然疫源地鼠疫菌分为新的17个生化型:青藏高原青海田鼠鼠疫自然疫源地分离的鼠疫菌定名为川青高原型,新疆准噶尔盆地大沙鼠鼠疫疫源地鼠疫菌定名为准噶尔型,云南省玉龙县大绒鼠、齐氏姬鼠分离暂定名为玉龙型。青藏高原喜马拉雅旱獭鼠疫自然疫源地生化性状较为复杂,含5种类型生化型,其中藏南地区1983年后新增加了27个疫源县,本研究发现青藏高原型菌株不仅只分部在藏北高原,在藏南地区已有分布,且岗底斯山型菌株原来只分布在西南地区的仲巴、普兰,现已延伸到藏南地区。还发现一些鼠疫自然疫源地鼠疫菌生化特性有交串现象,如云南省家、野鼠鼠疫自然疫源地鼠疫菌,内蒙古高原长爪沙鼠、达乌尔黄鼠鼠疫自然疫源地。结论中国鼠疫菌对糖酵解特性较稳定,鼠疫菌生化型在各疫源地呈明显的地区性分布,与主要宿主、地理气候条件、植被等密切相关,分为17个生化型。 展开更多
关键词 中国 鼠疫菌 生化特征 地理分布
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鼠疫耶尔森菌DNA标识序列的鉴定及其应用研究 被引量:16
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作者 韩延平 周冬生 +16 位作者 宋亚军 裴德翠 李敏 崔百忠 包静月 张秀清 童宗中 王津 郭兆彪 祁芝珍 金丽霞 翟俊辉 杜宗敏 王效义 汪建 黄培堂 杨瑞馥 《解放军医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2004年第4期307-309,共3页
目的 确定鼠疫耶尔森菌DNA标识序列 ,以用于鼠疫耶尔森菌的快速检测和鉴定。方法 通过芯片比较基因组杂交和PCR验证 ,鉴定鼠疫耶尔森菌DNA标识序列 ,针对标识序列设计特定的PCR引物。结果 鼠疫耶尔森菌基因组中存在 3个区段 ,共 2 8... 目的 确定鼠疫耶尔森菌DNA标识序列 ,以用于鼠疫耶尔森菌的快速检测和鉴定。方法 通过芯片比较基因组杂交和PCR验证 ,鉴定鼠疫耶尔森菌DNA标识序列 ,针对标识序列设计特定的PCR引物。结果 鼠疫耶尔森菌基因组中存在 3个区段 ,共 2 8条基因 ,均是鼠疫耶尔森菌DNA标识序列。针对其中 3条基因设计PCR引物 ,能特异性扩增出鼠疫耶尔森菌 ,与来自其他非鼠疫耶尔森菌的DNA无交叉反应。结论 鼠疫耶尔森菌存在DNA标识序列 ,并能用于鼠疫耶尔森菌的快速检测与鉴定。 展开更多
关键词 耶尔森氏菌 鼠疫 DNA芯片 标识序列
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河南省2011-2013年小肠结肠炎耶尔森菌监测结果分析 被引量:12
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作者 穆玉姣 张白帆 +3 位作者 李孟磊 赵嘉咏 景怀琦 夏胜利 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第9期835-838,共4页
目的了解河南省小肠结肠炎耶尔森菌的宿主分布、血清学及毒力基因情况。方法于2011—2013年采集腹泻病人粪便、各类家禽家畜粪便、苍蝇以及生熟肉制品涂抹标本,共6 057份,采用冷增菌方法进行目的菌分离。对不同宿主样本中分离到的小肠... 目的了解河南省小肠结肠炎耶尔森菌的宿主分布、血清学及毒力基因情况。方法于2011—2013年采集腹泻病人粪便、各类家禽家畜粪便、苍蝇以及生熟肉制品涂抹标本,共6 057份,采用冷增菌方法进行目的菌分离。对不同宿主样本中分离到的小肠结肠炎耶尔森菌进行系统生化鉴定、血清学分型和毒力基因PCR检测。结果 6 057份样本中共分离出288株小肠结肠炎耶尔森菌,检出率为4.75%。所分离的小肠结肠炎耶尔森菌主要血清型是O∶8和O∶5,生物分型以1A为主。O∶3血清型多具有致病性,其中以猪分离株最多。结论河南省小肠结肠炎耶尔森菌在人群和各类动物中均有存在,猪是小肠结肠炎耶尔森菌致病性菌株的主要宿主。 展开更多
关键词 小肠结肠炎耶尔森菌 宿主 血清学分型 毒力因子
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鲟源鲁氏耶尔森氏菌的分离鉴定及药敏特性研究 被引量:20
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作者 杨移斌 夏永涛 +2 位作者 郑卫东 胡鲲 杨先乐 《水生生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第2期393-398,共6页
西伯利亚鲟隶属于硬骨鱼纲,辅鳍亚纲,硬鳞总目,鲟形目(Acipenseriformes),全世界现存26种鲟[1],我国的鲟类有2科3属8种,分布在长江水系的有中华鲟(Acipenser sinensis)、白鲟(Psephurus gladius)和达氏鲟(Acipenserdabryanus);... 西伯利亚鲟隶属于硬骨鱼纲,辅鳍亚纲,硬鳞总目,鲟形目(Acipenseriformes),全世界现存26种鲟[1],我国的鲟类有2科3属8种,分布在长江水系的有中华鲟(Acipenser sinensis)、白鲟(Psephurus gladius)和达氏鲟(Acipenserdabryanus);黑龙江水系的有施氏鲟(Acipenser schrenckii)和达氏鳇(Huso dauricus);新疆地区有裸腹鲟(Acipenser nudiventris)、小体鲟(Acipenser ruthenus)和西伯利亚鲟(Acipenser baerii)[2]。 展开更多
关键词 鲁氏耶尔森氏菌 16S RDNA 药敏特性 西伯利亚鲟
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斑点叉尾(Ictalunes punctatus)源鲁氏耶尔森氏菌的分离鉴定及系统发育分析 被引量:25
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作者 范方玲 汪开毓 +2 位作者 耿毅 黄小丽 陈德芳 《海洋与湖沼》 CAS CSCD 北大核心 2010年第6期862-868,共7页
从发病的斑点叉尾肝脏和肾脏均分离到一高致病性的菌株(FF003),感染该菌后斑点叉尾表现为体表多处点状出血,特别是在下颌、腹壁、体侧处,各内脏器官不同程度出血,尤其是腹内膜和鳔内膜斑块状出血。该菌为非发酵型需氧,革兰氏阴性杆菌,... 从发病的斑点叉尾肝脏和肾脏均分离到一高致病性的菌株(FF003),感染该菌后斑点叉尾表现为体表多处点状出血,特别是在下颌、腹壁、体侧处,各内脏器官不同程度出血,尤其是腹内膜和鳔内膜斑块状出血。该菌为非发酵型需氧,革兰氏阴性杆菌,对除麦芽糖、甘露糖、果糖、海藻糖、D-甘露醇以外的多种糖类不利用产酸,氧化酶阴性,精氨酸双水解酶、鸟氨酸脱羧酶、赖氨酸脱羧酶阳性,MR阳性。在以该菌16S rDNA序列(GenBank登录号为FJ908709)和GenBank数据库内同源性较高的细菌16SrDNA序列构建的系统发育树中,分离菌FF003株与鲁氏耶尔森氏菌(Yersinia ruckeri)聚为一个分支,结合形态和生理生化特点将其鉴定为鲁氏耶尔森氏菌。药敏实验结果表明氟哌酸、环丙沙星、强力霉素、氯霉素对其高度敏感,头孢拉定、克拉霉素、磺胺甲基异唑、庆大霉素、麦迪霉素等药物不敏感。 展开更多
关键词 斑点叉尾 鲁氏耶尔森氏菌 16S RDNA 系统发育 药敏试验
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