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中国黄牛Y-SNPs遗传多样性与起源研究 被引量:23
1
作者 常振华 卫利选 +5 位作者 张润锋 郭本玲 何诚 蓝贤勇 陈宏 雷初朝 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第11期1537-1542,共6页
为了研究中国黄牛Y染色体SNPs的遗传多样性及父系起源,本研究利用PCR-SSCP与测序方法,选择4个牛Y-SNPs位点DDX3Y-7、UTY-19、ZFY-9和ZFY-10,分析了16个中国地方黄牛品种284头公牛与缅甸黄牛4头公牛Y染色体的遗传多样性。结果表明,在中... 为了研究中国黄牛Y染色体SNPs的遗传多样性及父系起源,本研究利用PCR-SSCP与测序方法,选择4个牛Y-SNPs位点DDX3Y-7、UTY-19、ZFY-9和ZFY-10,分析了16个中国地方黄牛品种284头公牛与缅甸黄牛4头公牛Y染色体的遗传多样性。结果表明,在中国16个黄牛品种中,仅发现普通牛Y2和瘤牛Y3单倍型,表明只有Y2和Y3两种父系起源,尚未发现中国黄牛存在普通牛Y1单倍型的分子证据。4头缅甸黄牛均为Y3单倍型。在中国16个黄牛品种中,Y2和Y3单倍型频率分别为57.0%和43.0%,其中Y2单倍型频率在北方黄牛中占优势(98.3%),Y3单倍型频率在南方黄牛中占优势(76.1%),中原黄牛中普通牛Y2的单倍型频率较高,为63.8%,瘤牛Y3的单倍型频率为36.2%。本研究证明,中国黄牛存在普通牛Y2和瘤牛Y3单倍型两种父系起源,Y2单倍型频率自北向南逐渐减少,Y3单倍型频率自北向南逐渐增加,中原地区为普通牛Y2和瘤牛Y3单倍型的交汇处。 展开更多
关键词 黄牛 y-snpS 单倍型 父系起源
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涠洲牛Y-SNPs和Y-STRs遗传多样性及父系起源研究 被引量:2
2
作者 李秀良 李芳玉 +5 位作者 曹艳红 吴柱月 党瑞华 李绍波 陈宏 雷初朝 《中国牛业科学》 2018年第4期29-31,44,共4页
[目的]为从分子水平上探究涠洲牛的遗传多样性、群体遗传结构及父系起源。[方法]本研究利用PCR测序及生物信息学方法,对28头涠洲公牛的2个Y-SNPs标记(UTY-19和ZFY-10)及2个Y-STRs标记(INRA189和BM861)进行多态性检测。[结果]发现28头涠... [目的]为从分子水平上探究涠洲牛的遗传多样性、群体遗传结构及父系起源。[方法]本研究利用PCR测序及生物信息学方法,对28头涠洲公牛的2个Y-SNPs标记(UTY-19和ZFY-10)及2个Y-STRs标记(INRA189和BM861)进行多态性检测。[结果]发现28头涠洲牛全部为Y3单倍型组,根据Y-SNPs标记的核苷酸变异及Y-STRs标记的等位基因大小确定单倍型(Y-SNP-INRA189-BM861),结果显示28头涠洲牛有Y3-88-156和Y3-90-156两种单倍型,单倍型频率分别为89.29%和10.71%,说明涠洲牛只有1个瘤牛Y3父系起源。Y染色体单倍型多样度为0.1984±0.0924,表明涠洲牛的父系遗传多样性较低。[结论]涠洲牛属于瘤牛父系起源,遗传基础十分稳定。 展开更多
关键词 涠洲牛 y-snpS Y-STRS 遗传多样性 父系起源
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南丹牛Y-SNPs与Y-STRs遗传多样性研究 被引量:1
3
作者 李秀良 张俸伟 +5 位作者 曹艳红 吴柱月 党瑞华 李绍波 陈宏 雷初朝 《中国牛业科学》 2019年第2期26-28,共3页
[目的]分析南丹牛的Y染色体遗传多样性及父系起源。[方法]用PCR扩增、测序及生物信息学方法进行分析。[结果]通过对25头南丹牛的Y-SNPs和Y-STRs分析,发现南丹牛仅包含瘤牛Y3单倍型组,细分为Y3-88-156和Y3-90-156两种单倍型,单倍型频率... [目的]分析南丹牛的Y染色体遗传多样性及父系起源。[方法]用PCR扩增、测序及生物信息学方法进行分析。[结果]通过对25头南丹牛的Y-SNPs和Y-STRs分析,发现南丹牛仅包含瘤牛Y3单倍型组,细分为Y3-88-156和Y3-90-156两种单倍型,单倍型频率分别为92%和8%,南丹牛的Y染色体单倍型多样度为0.1533±0.0915。[结论]南丹牛是瘤牛父系起源,其遗传基础很稳定。 展开更多
关键词 南丹牛 y-snpS Y-STRS 遗传多样性 父系起源
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Y-STRs和Y-SNPs综合分析方法在父系家系调查中的应用 被引量:3
4
作者 钱恩芳 吴文静 +7 位作者 王磊 王小娟 刘杨 马泉 赵慧 李彩霞 黄江 江丽 《南京医科大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2019年第8期1135-1141,共7页
目的:评估Y-STRs和Y-SNPs综合分析及网络图方法在家系调查中的作用。方法:本研究采集了不同姓氏2个家族共180例男性样本,用YfilerTMPlus试剂盒检测其26个Y-STRs基因座分型,采用微测序技术检测其中36例样本的42个Y-SNPs位点分型,通过直... 目的:评估Y-STRs和Y-SNPs综合分析及网络图方法在家系调查中的作用。方法:本研究采集了不同姓氏2个家族共180例男性样本,用YfilerTMPlus试剂盒检测其26个Y-STRs基因座分型,采用微测序技术检测其中36例样本的42个Y-SNPs位点分型,通过直接计数法和网络图进行Y-STRs单倍型分析,探讨单倍型在家族内的变异和Y-SNPs单倍群的分布。结果:P1家族63例样本中检出18种Y-STRs单倍型,网络图中P1家族呈现为单核心星状聚类,抽取的17例样本均属于N-M231单倍群;P2家族117例样本中检出35种单倍型,网络图呈现为双核心星状聚类,抽取的19例样本均属于O1a1a1a1-F78单倍群。结论:通过Y-STRs单倍型和Y-SNPs单倍群遗传标记综合分析的方法,利用网络图对Y-STRs单倍型遗传信息传递过程中的变异情况进行可视化,扩展可认定为同一家系的范围,为防止错误排除DNA来源人生物学父系家系提供参考。 展开更多
关键词 y-snpS Y-STRS 单倍群 单倍型 家系
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基于Y-SNP和Y-STR揭示汉族人群父系遗传关系 被引量:4
5
作者 朱信 金鑫 +5 位作者 刘俊 杨澜 邹丽馨 李彩霞 黄江 江丽 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期149-167,共19页
汉族是中国人口最多的民族,现有研究多集中于汉族人群的起源、迁徙、融合等遗传历史,以及局部地区汉族人群的父系遗传关系,鲜有全局视角下的汉族人群父系遗传结构研究。本研究检测了362份青海、四川和辽宁的汉族无关男性样本,整合已发... 汉族是中国人口最多的民族,现有研究多集中于汉族人群的起源、迁徙、融合等遗传历史,以及局部地区汉族人群的父系遗传关系,鲜有全局视角下的汉族人群父系遗传结构研究。本研究检测了362份青海、四川和辽宁的汉族无关男性样本,整合已发表文献相关数据,最终获得了国内15个省份16个汉族人群1830人份样本,覆盖89个Y-SNP、16个Y-STR的数据。通过统计Y-SNP单倍群频率、Y-STR单倍型多样性,使用主成分分析(principal component analysis,PCA)、系统发育树、单倍型网络等分析,综合Y-SNP和Y-STR两个反映不同时间尺度的遗传标记,研究不同地区汉族人群之间的遗传分化、汉族人群与其周边少数民族的遗传关系。单倍群频率统计结果显示单倍群O-M175是汉族人群主体单倍群(青海汉族60.53%~广东汉族92.7%),其下游亚单倍群呈现地域差异化分布。单倍群O2-M122高频分布于各地汉族,总体分布趋势北高南低;单倍群O1b-M268分布频率由南向北递减,尤其在岭南地区汉族人群中分布显著;单倍群O1a-M119在中部汉族人群中分布频率较高。汉族人群遗传结构研究表明,其主要分为北部、中部及南部三个聚类簇,其中青海汉族与其他地区汉族存在一定的遗传分化。在合并少数民族的遗传关系研究中,汉族人群彼此之间遗传关系更紧密,但北部汉族与回族遗传关系更近,而南部汉族则与仡佬族、黎族遗传关系更近。总之,本文基于89个Y-SNP和16个Y-STR,系统地研究了中国不同地域的汉族人群的单倍群分布、遗传亚结构及其与周边少数民族的遗传关系,为群体遗传学、法医遗传学补充理论依据,为Y染色体的法医学应用提供数据支撑。Y-SNP单倍群结合Y-STR单倍型对于分析汉族人群遗传亚结构以及法医学应用具有重要作用。 展开更多
关键词 群体遗传学 法医遗传学 y-snp Y-STR
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岭南黄牛Y-SNP遗传多样性与父系起源研究 被引量:9
6
作者 赵晓诚 林清 +5 位作者 左自意 黄永震 党瑞华 蓝贤勇 陈宏 雷初朝 《中国牛业科学》 2017年第4期4-6,共3页
[目的]通过对岭南牛两个Y-SNPs标记进行研究,了解岭南牛的父系起源及遗传多样性。[方法]采用PCR扩增、测序及生物信息学方法。[结果]通过对30头岭南牛YSNPs标记进行分析,发现有28个Y3单倍型组,占总个体数的93.33%,2个为Y2单倍型组,占6.... [目的]通过对岭南牛两个Y-SNPs标记进行研究,了解岭南牛的父系起源及遗传多样性。[方法]采用PCR扩增、测序及生物信息学方法。[结果]通过对30头岭南牛YSNPs标记进行分析,发现有28个Y3单倍型组,占总个体数的93.33%,2个为Y2单倍型组,占6.67%。表明岭南牛有普通牛和瘤牛2个父系起源。[结论]岭南牛属于南方牛类型,受瘤牛的影响很大,具有瘤牛和普通牛的种质特征。 展开更多
关键词 岭南牛 y-snpS 遗传多样性 父系起源
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大别山牛Y-SNPs和Y-STRs遗传多样性及父系起源研究 被引量:5
7
作者 李芳玉 夏小婷 +3 位作者 贾玉堂 党瑞华 陈宏 雷初朝 《中国牛业科学》 2018年第2期4-6,共3页
[目的]从分子水平分析大别山牛的遗传多样性、群体遗传结构及父系起源。[方法]利用PCR产物测序及荧光微卫星分型方法。[结果]对49头大别山牛公牛的2个YSNPs标记(UTY-19和ZFY-10)及2个Y-STRs标记(INRA189和BM861)进行多态性检测,结果表... [目的]从分子水平分析大别山牛的遗传多样性、群体遗传结构及父系起源。[方法]利用PCR产物测序及荧光微卫星分型方法。[结果]对49头大别山牛公牛的2个YSNPs标记(UTY-19和ZFY-10)及2个Y-STRs标记(INRA189和BM861)进行多态性检测,结果表明,2个Y-SNPs标记在大别山牛中均未检测出多态性,2个Y-STRs标记在大别山牛中均表现为单态,即INRA189标记的等位基因大小均为88bp,BM861均为156bp。根据Y-SNPs与Y-STRs标记的结果,发现49头大别山牛全部为Y3-88-156单倍型,频率为1,表明该品种只有Y3瘤牛父系起源,其单倍型多样度为0,显示大别山牛的父系遗传多样性很低。[结论]大别山牛属于南方黄牛类型,其遗传多样性很低,表明其瘤牛种质特性单一、稳定。 展开更多
关键词 大别山牛 y-snpS Y-STRS 单倍型 遗传多样性 父系起源
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西藏牛和日喀则驼峰牛Y-SNPs遗传多样性及父系起源研究 被引量:4
8
作者 顿珠加才 张俸伟 +3 位作者 夏小婷 宋恩亮 陈宏 雷初朝 《中国牛业科学》 2017年第6期9-11,共3页
[目的]分析西藏牛和日喀则驼峰牛的Y染色体遗传多样性及父系起源。[方法]采用PCR扩增、测序及生物信息学方法。[结果]通过对13头西藏牛Y-SNPs分析,发现西藏牛包含普通牛Y1、Y2及瘤牛Y3三种单倍型组,其频率分别为0.077、0.846和0.077;对... [目的]分析西藏牛和日喀则驼峰牛的Y染色体遗传多样性及父系起源。[方法]采用PCR扩增、测序及生物信息学方法。[结果]通过对13头西藏牛Y-SNPs分析,发现西藏牛包含普通牛Y1、Y2及瘤牛Y3三种单倍型组,其频率分别为0.077、0.846和0.077;对8头日喀则驼峰牛Y-SNPs的分析表明,日喀则驼峰牛具有普通牛Y2和瘤牛Y3两种单倍型组,其频率分别为0.125和0.875。西藏牛和日喀则驼峰牛的单倍型多样度分别为0.2949±0.1558和0.2500±0.1802,表明西藏牛和日喀则驼峰牛具有较低的父系遗传多样性。[结论]西藏牛主要为普通牛Y2起源,日喀则驼峰牛主要为瘤牛Y3起源,且其遗传多样性较低。 展开更多
关键词 西藏牛 日喀则驼峰牛 y-snpS 遗传多样性 父系起源
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湘西黄牛Y-SNPs遗传多样性研究 被引量:3
9
作者 蔡翠翠 宁庆庆 +4 位作者 陈秋明 祝远魁 陈宁博 陈宏 雷初朝 《中国牛业科学》 2019年第5期34-36,共3页
[目的]通过Y-SNP分子标记方法研究湘西黄牛的遗传多样性、群体遗传结构及父系起源。[方法]采用PCR扩增、测序与生物信息学方法,对24头湘西黄牛的2个Y-SNPs(UTY-19和ZFY-10)标记进行多态性分析。[结果]结果表明,湘西黄牛有Y1和Y3两种单... [目的]通过Y-SNP分子标记方法研究湘西黄牛的遗传多样性、群体遗传结构及父系起源。[方法]采用PCR扩增、测序与生物信息学方法,对24头湘西黄牛的2个Y-SNPs(UTY-19和ZFY-10)标记进行多态性分析。[结果]结果表明,湘西黄牛有Y1和Y3两种单倍型组,频率分别为12.5%和87.5%,表明湘西黄牛可能有普通牛和瘤牛2个父系起源。湘西黄牛的Y-SNP遗传多样度为0.2283±0.0978,表明湘西黄牛具有较低的父系遗传多样性,品种纯度较高。[结论]湘西黄牛的父系起源为瘤牛Y3单倍型组,其Y1单倍型组为国外肉牛杂交所致。 展开更多
关键词 湘西黄牛 y-snpS 单倍型组 父系起源
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隆林黄牛Y-SNPs遗传多样性与起源研究 被引量:3
10
作者 宣泽义 曹艳红 +2 位作者 贾鹏 陈少梅 雷初朝 《中国牛业科学》 2019年第5期14-16,共3页
[目的]为从分子水平探究隆林黄牛的遗传多样性及父系起源。[方法]利用PCR测序及生物信息方法,对20头隆林黄牛公牛的2个Y-SNPs标记(UTY-19和ZFY-10)进行多态性检测。[结果]结果显示,20头隆林黄牛中有14头为Y3单倍型组(70%),有6头牛为Y2... [目的]为从分子水平探究隆林黄牛的遗传多样性及父系起源。[方法]利用PCR测序及生物信息方法,对20头隆林黄牛公牛的2个Y-SNPs标记(UTY-19和ZFY-10)进行多态性检测。[结果]结果显示,20头隆林黄牛中有14头为Y3单倍型组(70%),有6头牛为Y2单倍型组(30%),Y染色体单倍型多样度为0.4421±0.0875,表明隆林牛具有丰富的Y染色体遗传多样性。[结论]隆林黄牛具有瘤牛和普通牛2个父系起源,以瘤牛父系起源为主。 展开更多
关键词 隆林黄牛 y-snpS 单倍型组 起源
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贵州布依族、仡佬族、仫佬族、毛南族、壮族Y-SNP的初步研究 被引量:9
11
作者 刘烜 单可人 +6 位作者 齐晓岚 何燕 赵艳 吴昌学 李毅 褚迅 任锡麟 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2006年第11期1350-1354,共5页
为分析贵州布依族、仡佬族、仫佬族、毛南族、壮族父系遗传结构,探讨其起源及迁徒。通过聚合酶链式反应-限制性内切酶长度多态性(PCR-RFLP)方法检测贵州境内5个民族10个SNP位点构成的Y染色体单倍型,并以省内苗族为对照分析其父系遗传结... 为分析贵州布依族、仡佬族、仫佬族、毛南族、壮族父系遗传结构,探讨其起源及迁徒。通过聚合酶链式反应-限制性内切酶长度多态性(PCR-RFLP)方法检测贵州境内5个民族10个SNP位点构成的Y染色体单倍型,并以省内苗族为对照分析其父系遗传结构。结果显示5个民族集中于Y-SNP中H8单倍型,苗族样本集中于Y-SNP中的H8、H11与H12单倍型。说明贵州省布依族、仡佬族、仫佬族、毛南族、壮族5个民族之间有密切联系,且与国内其他地域有较大的遗传差异,是一个相对独立的群体。 展开更多
关键词 贵州少数民族 Y染色体-单核苷酸多态性 单倍型
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微测序技术检测12个Y-SNP及其遗传多态性 被引量:6
12
作者 杜宏 张林 +3 位作者 周斌 张海军 梁伟波 沈月华 《法医学杂志》 CAS CSCD 2006年第2期125-129,共5页
目的应用SNaPshotKit对Y染色体上12个SNP位点进行快速而准确的检测,对四川地区78个汉族男性无关个体进行群体遗传学研究,并对陈旧骨骼和性犯罪案件的相关物证进行检验。方法对SRY2627、SRY1532、M13、M20、SRY8299、Tat、M69及M9、92R7... 目的应用SNaPshotKit对Y染色体上12个SNP位点进行快速而准确的检测,对四川地区78个汉族男性无关个体进行群体遗传学研究,并对陈旧骨骼和性犯罪案件的相关物证进行检验。方法对SRY2627、SRY1532、M13、M20、SRY8299、Tat、M69及M9、92R7、M17、M19、M112两组共12个Y-SNP位点进行复合扩增,PCR产物经纯化处理后,采用SNaPshotKit试剂结合毛细管电泳技术对单核苷酸多态性进行检测。结果建立了12个Y-SNP位点的微测序快速检测系统,在四川地区人群中发现M9、SRY8299二个位点存在变异。结论复合扩增结合微测序技术能够同时对多个Y-SNP的多态性进行快速而准确的检测,建立的检测系统在法医学个体识别中具有应用价值。 展开更多
关键词 Y—SNP 微测序 遗传多态性 复合扩增
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昭通牛Y-SNPs和Y-STRs遗传多样性和父系起源研究
13
作者 宁庆庆 亐开兴 +4 位作者 胡应武 张继才 黄必志 陈宏 雷初朝 《中国牛业科学》 2019年第3期25-28,共4页
[目的]从分子水平分析昭通牛的遗传多样性、群体遗传结构及父系起源。[方法]利用PCR产物直接测序和荧光微卫星分型方法对24头昭通牛2个Y-SNPs标记(UTY-19和ZFY-10)和2个Y-STRs标记(INRA189和BM861)进行遗传多态性检测。[结果]发现昭通牛... [目的]从分子水平分析昭通牛的遗传多样性、群体遗传结构及父系起源。[方法]利用PCR产物直接测序和荧光微卫星分型方法对24头昭通牛2个Y-SNPs标记(UTY-19和ZFY-10)和2个Y-STRs标记(INRA189和BM861)进行遗传多态性检测。[结果]发现昭通牛有Y2-90-158和Y3-88-156两种单倍型(Y-SNPs-INRA189-BM861),频率分别为29.17%和70.83%,表明昭通牛有普通牛和瘤牛两种父系起源。Y染色体单倍型多样度为0.4312±0.0812,说明昭通牛的遗传多样性较高。[结论]昭通牛以瘤牛Y3单倍型组为主,具有南方黄牛特征,与其地理分布和气候及形态特征相一致。 展开更多
关键词 昭通牛 y-snpS Y-STRS 单倍型组 父系起源
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夏南牛Y-STRs和Y-SNPs多态性及父系起源研究
14
作者 曾璐岚 史红侠 +5 位作者 祁兴磊 林凤鹏 黄永震 蓝贤勇 陈宏 雷初朝 《中国牛业科学》 2018年第4期1-3,共3页
[目的]为从分子水平上探究夏南牛的父系遗传多态性、群体遗传结构及起源。[方法]采用直接测序、荧光微卫星分型方法。[结果]通过2个Y-SNPs标记(UTY-19和ZFY-10)分析发现,32头夏南牛属于普通牛Y2单倍型组,所占频率为100%。通过2个Y-STRs... [目的]为从分子水平上探究夏南牛的父系遗传多态性、群体遗传结构及起源。[方法]采用直接测序、荧光微卫星分型方法。[结果]通过2个Y-SNPs标记(UTY-19和ZFY-10)分析发现,32头夏南牛属于普通牛Y2单倍型组,所占频率为100%。通过2个Y-STRs位点(INRA189和BM861)的遗传多态性分析,发现32头夏南牛在2个Y-STRs标记中均无多态性,INRA189标记只有102bp等位基因,BM861标记只有158bp等位基因。结合Y-SNP与Y-STRs的分型结果,判定夏南牛只有1种Y染色体单倍型(Y2-102-158),其Y染色体单倍型多样度为0。[结论]夏南牛只有Y2普通牛父系起源且父系遗传基础稳定、单一,这与夏南牛的培育历史相一致。 展开更多
关键词 夏南牛 y-snpS Y-STRS 遗传多样性 父系起源
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滇中牛Y-SNPs和Y-STRs遗传多样性研究
15
作者 贾鹏 王凯悦 +5 位作者 亐开兴 张继才 黄必志 苏相生 陈宏 雷初朝 《中国牛业科学》 2019年第4期7-9,62,共4页
[目的]为探究云南滇中牛的Y染色体遗传结构与血统来源,以期为该黄牛品种的资源保护与利用提供科学依据。[方法]采用PCR扩增和荧光分型方法,对27头滇中牛的Y-SNPs(UTY19和ZFY10)和Y-STRs(INRA189和BM861)遗传多样性进行分析。[结果]27头... [目的]为探究云南滇中牛的Y染色体遗传结构与血统来源,以期为该黄牛品种的资源保护与利用提供科学依据。[方法]采用PCR扩增和荧光分型方法,对27头滇中牛的Y-SNPs(UTY19和ZFY10)和Y-STRs(INRA189和BM861)遗传多样性进行分析。[结果]27头滇中牛包含Y2和Y3两种单倍型组,其频率分别为22.22%和77.78%。结合Y-SNPs和Y-STRs的分型结果,发现这27头滇中牛存在Y2-90-158、Y3-88-156和Y3-90-156共3种Y染色体单倍型(Y-SNP-INRA189-BM861),Y染色体单倍型多样度为0.5128±0.0904,其遗传多样性较高。[结论]滇中牛Y染色体遗传多样性较高,有普通牛和瘤牛2个父系起源,以瘤牛血统为主。 展开更多
关键词 滇中牛 y-snpS Y-STRS 遗传多样性 父系起源
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皖南牛Y-STRs与Y-SNPs遗传多样性研究 被引量:7
16
作者 侯佳雯 夏小婷 +4 位作者 贾玉堂 刘善斋 党瑞华 陈宏 雷初朝 《中国牛业科学》 2018年第1期30-32,39,共4页
[目的]从分子水平探究皖南牛的遗传多样性、群体遗传结构及父系起源。[方法]利用PCR产物直接测序、荧光微卫星分型方法,选择2个Y-SNPs标记(UTY-19和ZFY-10)和2个Y-STRs位点(INRA189和BM861)对35头皖南公牛进行遗传多样性检测。[结果]发... [目的]从分子水平探究皖南牛的遗传多样性、群体遗传结构及父系起源。[方法]利用PCR产物直接测序、荧光微卫星分型方法,选择2个Y-SNPs标记(UTY-19和ZFY-10)和2个Y-STRs位点(INRA189和BM861)对35头皖南公牛进行遗传多样性检测。[结果]发现35头皖南公牛包含Y1、Y2和Y3 3种单倍型组,其频率分别为2.86%、8.56%和88.58%。普通牛Y1单倍型组只有1种单倍型(Y1-98-158),普通牛Y2单倍型组有3种单倍型(Y2-102-158、Y2-104-158和Y2-106-158),瘤牛Y3单倍型组只有1种单倍型(Y3-88-156),皖南牛Y染色体单倍型多样度为0.2185±0.0924,表明皖南牛有普通牛与瘤牛2个父系起源,遗传多样性较低。[结论]皖南牛属于南方黄牛类型,以瘤牛的种质特性为主。 展开更多
关键词 皖南牛 Y—SNPs Y—STRs 遗传多样性 父系起源
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贵州壮侗语族7个少数民族21个Y-SNP多态性
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作者 张秀秀 喻艳琴 +4 位作者 田薇 张婷 王婵娟 单可人 何燕 《中山大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2020年第1期125-132,共8页
调查贵州壮侗语族7个少数民族(水族、布依族、侗族、仡佬族、壮族、毛南族、仫佬族)人群Y染色体上21个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点的遗传多态性,并探讨该人群与其他民族以及其他语族之间的遗传关系。采用SN... 调查贵州壮侗语族7个少数民族(水族、布依族、侗族、仡佬族、壮族、毛南族、仫佬族)人群Y染色体上21个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点的遗传多态性,并探讨该人群与其他民族以及其他语族之间的遗传关系。采用SNapShot法对445例贵州壮侗语族7个少数民族男性个体21个Y-SNP位点进行复合扩增检测,用直接计数法计算等位基因频率、单倍型频率与单倍群频率,运用SPSS 24软件进行主成分分析。在贵州水族、布依族、侗族、仡佬族、壮族、毛南族和仫佬族中,21个Y-SNP组成的单倍型多态性值(haplotype diversity,HD)分别为0.5977、0.9456、0.8856、0.8869、0.7686、0.3587和0.7078;与已报道的其他9个民族人群单倍群分布频率进行主成分分析,壮侗语族与苗瑶语族聚在一起。从父系遗传角度分析,壮侗语族与苗瑶语族亲缘关系较近。 展开更多
关键词 壮侗语族 Y染色体 单核苷酸多态性 遗传多态性 贵州
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广西仫佬族Y染色体和mtDNA的遗传结构分析 被引量:6
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作者 王晓庆 王传超 +1 位作者 邓琼英 李辉 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2013年第2期168-174,共7页
文章对我国广西仫佬族91个无关男性个体Y-STR、Y-SNP、mtDNA HVS-Ⅰ和mtDNA-SNP等进行检测分型,探索仫佬族的分子遗传结构。结果显示:Y染色体单倍群O1a1-P203和O2a1*-M95在仫佬族中为高频单倍群,利用Y-STR构建的N-J树中仫佬族与侗族聚类... 文章对我国广西仫佬族91个无关男性个体Y-STR、Y-SNP、mtDNA HVS-Ⅰ和mtDNA-SNP等进行检测分型,探索仫佬族的分子遗传结构。结果显示:Y染色体单倍群O1a1-P203和O2a1*-M95在仫佬族中为高频单倍群,利用Y-STR构建的N-J树中仫佬族与侗族聚类,说明在父系遗传上仫佬族与侗族遗传关系较近;mtDNA中F1a、M*、B4a、B5a等4类单倍群高频出现,体现出仫佬族在母系遗传方面具有典型的东亚南方群体特征。17个Y-STR位点和mtDNA HVS-Ⅰ具有丰富的遗传多态性,在群体遗传学和法医学方面具有应用前景。 展开更多
关键词 仫佬族 Y-STR y-snp MTDNA 遗传结构
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文山牛Y染色体遗传多样性与父系起源研究 被引量:3
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作者 亐开兴 王凯悦 +6 位作者 张继才 黄必志 陈宁博 冯光杰 李顺东 陈宏 雷初朝 《中国牛业科学》 2019年第3期1-4,共4页
[目的]探究云南文山牛群体Y染色体遗传结构与血统来源,以期为该黄牛品种的资源保护与利用提供科学依据。[方法]研究采用PCR扩增和生物信息学方法,对55头文山牛Y-SNPs(UTY19和ZFY10)和Y-STRs(INRA189和BM861)遗传多样性进行系统研究。[结... [目的]探究云南文山牛群体Y染色体遗传结构与血统来源,以期为该黄牛品种的资源保护与利用提供科学依据。[方法]研究采用PCR扩增和生物信息学方法,对55头文山牛Y-SNPs(UTY19和ZFY10)和Y-STRs(INRA189和BM861)遗传多样性进行系统研究。[结果]55头文山牛均属于瘤牛Y3单倍型组,结合Y-SNPs和Y-STRs分型结果,发现文山牛中存在Y3-88-156和Y3-90-156两种Y染色体单倍型,Y染色体单倍型多样度为0.1684±0.0636。[结论]云南文山牛只有瘤牛父系起源,其遗传血统稳定,纯合度高。 展开更多
关键词 文山牛 y-snpS Y-STRS 遗传多样性 父系起源
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渤海黑牛Y染色体遗传多样性及父系起源研究
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作者 常振华 侯佳雯 +3 位作者 宋恩亮 成海建 陈宏 雷初朝 《中国牛业科学》 2018年第4期41-44,共4页
[目的]为研究渤海黑牛的遗传多样性、群体遗传结构及父系起源。[方法]采用PCR扩增、琼脂糖凝胶电泳的方法,利用Y-SNPs和Y-STRs联合标记,对15头纯种渤海黑牛和15头与日本和牛杂交改良的渤海黑牛公牛进行遗传多样性检测。[结果]发现15头... [目的]为研究渤海黑牛的遗传多样性、群体遗传结构及父系起源。[方法]采用PCR扩增、琼脂糖凝胶电泳的方法,利用Y-SNPs和Y-STRs联合标记,对15头纯种渤海黑牛和15头与日本和牛杂交改良的渤海黑牛公牛进行遗传多样性检测。[结果]发现15头纯种渤海黑牛中普通牛Y1单倍型组所占频率为6.67%,普通牛Y2单倍型组所占频率为20.00%,瘤牛Y3单倍型组所占频率为73.33%,单倍型多样度为0.4476±0.1345;15头与日本和牛杂交改良的个体中,Y1单倍型组所占频率为40.00%,Y2单倍型组所占频率为26.67%,Y3单倍型组所占频率为33.33%,单倍型多样度为0.7048±0.0535。结果表明,渤海黑牛群体存在普通牛Y1、Y2和瘤牛Y3三种父系起源,遗传多样性较高。[结论]纯种渤海黑牛的父系以瘤牛为主,同时兼有普通牛Y2的种质特征。 展开更多
关键词 渤海黑牛 y-snpS Y-STRS 遗传多样性 父系起源
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