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甲基化特异性PCR检测FMR1和XIST基因甲基化实验方法的建立 被引量:4
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作者 杨芳 赵新 +3 位作者 张文红 薛丽 王琰 白玉杰 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第11期914-918,共5页
建立一种快速、灵敏的检测脆性X智障基因(fragile X mental retardation,FMR1)、X染色体失活基因(Xchromosome inactivation,XIST)甲基化的方法.用亚硫酸氢钠和对苯二酚对基因组DNA进行脱氨基修饰.以修饰后的DNA为模板,用两套不同的引物... 建立一种快速、灵敏的检测脆性X智障基因(fragile X mental retardation,FMR1)、X染色体失活基因(Xchromosome inactivation,XIST)甲基化的方法.用亚硫酸氢钠和对苯二酚对基因组DNA进行脱氨基修饰.以修饰后的DNA为模板,用两套不同的引物对:1对甲基化特异性引物和1对非甲基化特异性引物扩增FMR1基因(CGG)n重复序列区、FMR1和XIST基因的启动子区.PCR产物进一步克隆、测序.以亚硫酸氢钠和对苯二酚脱氨基修饰后的DNA为模板进行PCR扩增后的产物与预期基因目的基因片段大小相符合,无非特异性扩增产物.测序结果表明,FMR1、XIST基因中的非甲基化的C碱基转变为U碱基,而CpG岛被甲基化的C碱基不改变.成功地建立了检测FMR1、XIST甲基化的方法,为实验室诊断脆性X综合征提供了新的方法. 展开更多
关键词 脆性x智障基因 x染色体基因 甲基化异性PCR 甲基化检测
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Xist lncRNA介导X染色体失活及应用研究进展 被引量:4
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作者 陶维昆 刘波 +2 位作者 黄飞 王杰 高庆华 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2022年第1期216-223,共8页
在哺乳动物胚胎发育过程中,雌性胚胎细胞中一条X染色体转录沉默,导致两性间的剂量补偿称为X染色体失活(X chromosome inactivation,XCI)。X染色体失活中心(X chromosome inactivation center,XIC)是XCI的主要调控区域,X-非活性特异性转... 在哺乳动物胚胎发育过程中,雌性胚胎细胞中一条X染色体转录沉默,导致两性间的剂量补偿称为X染色体失活(X chromosome inactivation,XCI)。X染色体失活中心(X chromosome inactivation center,XIC)是XCI的主要调控区域,X-非活性特异性转录物(X-inactive specific transcript,Xist)位于该区域中且是XCI的关键部分。Xist长链非编码RNA(long chain non-coding RNA,lncRNA)是一种非活性的特异性转录物,能够招募如RNA互作结合蛋白(RNA interaction binding protein,RBP)、染色质修饰因子等一系列辅助因子,促使染色体和细胞核空间结构、染色质组成及X连锁基因转录水平发生改变,从而将有活性的染色体转化为无活性的染色体。对小鼠、人及其他物种研究显示,XCI普遍存在于哺乳动物胚胎发育中,是胚胎存活的基础,然而不同物种胚胎中却存在一些特异性差异。此外,癌症、肿瘤等一些人类疾病也与XCI有关。目前关于XCI机制研究比较零散,作者就Xist lncRNA介导XCI的主要分子机理、调控机制及在不同物种中的研究进行概述。 展开更多
关键词 哺乳动物 x染色体(xCI) x染色体中心(xIC) x-非异性转录物(xist) lncRNA
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长链非编码RNA XIST在系统性红斑狼疮患者外周血CD4+T细胞表达降低并与疾病活动度负相关 被引量:4
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作者 白文栋 许琴 +4 位作者 赵咏梅 席文锦 晁亚妮 何江 邹红云 《细胞与分子免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第9期821-825,共5页
目的探讨长链非编码RNA(lncRNA)X连锁X染色体特异性失活转录本(XIST)在系统性红斑狼疮(SLE)患者外周血CD4+细胞亚群中的表达,并分析其临床意义。方法募集50例SLE患者和30例健康人,比较SLE组和健康对照组CD4+T细胞中XIST表达情况。根据... 目的探讨长链非编码RNA(lncRNA)X连锁X染色体特异性失活转录本(XIST)在系统性红斑狼疮(SLE)患者外周血CD4+细胞亚群中的表达,并分析其临床意义。方法募集50例SLE患者和30例健康人,比较SLE组和健康对照组CD4+T细胞中XIST表达情况。根据系统性红斑狼疮疾病活动度指数(SLEDAI)评分情况将50例SLE患者分为稳定期SLE组(SLEDAI评分<5分,n=19)和活动期SLE组(SLEDAI评分≥5分,n=31)。比较稳定期SLE组和活动期SLE组CD4+T细胞中XIST表达情况。分析活动期SLE患者CD4+T细胞中XIST表达水平与SLEDAI的相关性。根据是否合并狼疮肾炎,将31例活动期SLE患者分为无合并狼疮肾炎组(n=17)和合并狼疮肾炎组(n=14),比较两组CD4+T细胞中XIST表达情况。绘制CD4+T细胞中XIST诊断SLE和合并狼疮肾炎的受试者工作特征(ROC)曲线。结果与健康对照组相比,SLE组CD4+T细胞XIST表达显著降低。与稳定期SLE组相比,活动期SLE组CD4+T细胞中XIST表达显著降低。相关性分析显示,活动期SLE患者CD4+T细胞中XIST表达水平与SLEDAI评分呈负相关。活动期SLE患者中,与无合并狼疮肾炎组相比,合并狼疮肾炎组CD4+T细胞中XIST表达显著降低。ROC曲线结果显示,CD4+T细胞中XIST在诊断SLE及是否合并狼疮肾炎中具有良好效能。结论SLE患者CD4+T细胞中XIST表达显著降低,其表达水平与疾病活动度密切相关,而且在诊断SLE及SLE合并狼疮肾炎方面具有良好效能。 展开更多
关键词 长链非编码RNA(lncRNA) x连锁x染色体异性转录本(xist) 系统性红斑狼疮 疾病动度 狼疮肾炎
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长片段非编码RNA XIST可改变人鼻咽癌HNE1细胞对顺铂的耐药性 被引量:8
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作者 王浩 李维 谭国林 《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期357-363,共7页
目的明确长片段非编码RNA(lncRNA)X失活特异性转录本(XIST)对人鼻咽癌细胞顺铂(DDP)耐药性的影响及可能的机制。方法通过荧光定量PCR检测人鼻咽癌顺铂耐药HNE1细胞株(HNE1/DDP)中XIST的表达特征。采用MTT试验观察XIST上调和下调对HNE1/... 目的明确长片段非编码RNA(lncRNA)X失活特异性转录本(XIST)对人鼻咽癌细胞顺铂(DDP)耐药性的影响及可能的机制。方法通过荧光定量PCR检测人鼻咽癌顺铂耐药HNE1细胞株(HNE1/DDP)中XIST的表达特征。采用MTT试验观察XIST上调和下调对HNE1/DDP细胞DDP耐药性的影响,并通过EdU试验和流式细胞技术观察其对HNE1/DDP细胞增殖和凋亡的影响。采用蛋白质印迹法检测XIST上调和下调对促凋亡因子程序性细胞死亡4(PDCD4)和Fas配体(Fas-L)蛋白表达的影响。结果 XIST在HNE1/DDP细胞的表达量显著高于HNE1细胞(0.57±0.06 vs 0.1±0.02,P<0.05)。下调XIST的表达显著降低HNE1/DDP细胞对DDP的耐药性(P<0.05),而上调XIST增加对DDP的耐药性(P<0.05)。下调XIST的表达显著降低HNE1/DDP细胞增殖(6.17±1.93 vs 16.59 4.86, P<0.05)并诱导细胞凋亡[(18.04±4.72)%vs(4.22±1.65)%, P<0.05],而上调XIST增加细胞增殖(25.40±7.21 vs 13.16±3.95, P<0.05)并抑制细胞凋亡[(2.82±0.88)%vs(6.46±1.75)%, P<0.05]。下调XIST的表达显著增加HNE1/DDP细胞中PDCD4(4.10±0.42 vs 1.0±0.12, P<0.05和Fas-L(3.07 0.29 vs 1.0±0.14, P<0.05)蛋白的表达,而上调XIST降低PDCD4(0.36±0.11 vs 1.0±0.18, P<0.05)和Fas-L(0.17±0.09 vs 1.0±0.21, P<0.05)蛋白的表达。结论 XIST在HNE1/DDP细胞中表达升高,下调和上调XIST的表达可分别降低和增加HNE1/DDP细胞对DDP的耐药性,其机制可能与PDCD4和Fas-L蛋白表达改变相关。 展开更多
关键词 x异性转录本 顺铂 人鼻咽癌顺铂耐药HNE1细胞株 耐药性 蛋白
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黄柏提取物对Aβ_(1-42)诱导的海马神经细胞的影响 被引量:3
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作者 谭峰浪 任宏丽 王宏飞 《中国临床药理学与治疗学》 CAS CSCD 2022年第11期1213-1220,共8页
目的:探讨黄柏提取物对Aβ_(1-42)诱导的海马神经细胞的影响及分子机制。方法:分离培养海马神经细胞,将其分为对照组、模型组、模型+黄柏低、中、高浓度组、模型+si-NC组、模型+si-X失活的特异性转录本(XIST)组、模型+黄柏高浓度+pcDNA... 目的:探讨黄柏提取物对Aβ_(1-42)诱导的海马神经细胞的影响及分子机制。方法:分离培养海马神经细胞,将其分为对照组、模型组、模型+黄柏低、中、高浓度组、模型+si-NC组、模型+si-X失活的特异性转录本(XIST)组、模型+黄柏高浓度+pcDNA组、模型+黄柏高浓度+pcDNA-XIST组。MTT检测细胞存活率;流式细胞术检测细胞周期和细胞凋亡;Western blot法检测Cleaved-caspase3蛋白表达;RT-qPCR检测XIST表达水平。结果:模型组细胞存活率、S期细胞比例降低,G_(0)-G _(1)期细胞比例、XIST表达水平、凋亡率、Cleaved-caspase3表达水平升高(P<0.05)。不同浓度黄柏提取物处理及抑制XIST表达后,细胞存活率、S期细胞比例升高,G_(0)-G _(1)期细胞比例、XIST表达水平、凋亡率、Cleaved-caspase3表达水平降低(P<0.05)。过表达XIST减弱了黄柏提取物对Aβ_(1-42)诱导的海马神经细胞增殖、凋亡的影响。结论:黄柏提取物抑制Aβ_(1-42)诱导的海马神经细胞凋亡,可能与下调XIST相关。 展开更多
关键词 黄柏提取物 x活的异性转录本(xist) 阿尔茨海默病 海马神经细胞 凋亡
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