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基于越橘果实转录组测序WBC型转运蛋白基因发掘及表达分析
被引量：
2
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作者
康立敏
孙海悦
+7 位作者
陈丽
刘红弟
耿金曼
盖钰卓
刘禹姗
王静
汪立宇
李亚东
《东北农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第5期1-9,共9页
为发掘越橘中WBC型(White brown complex)ABC转运蛋白(ATP-binding cassette transporters)基因,研究其与次生代谢物质(Secondary metabolite)运输关系,从越橘果实转录组测序文库中筛选出21个编码WBC型转运蛋白基因。其中10个基因上调表...
为发掘越橘中WBC型(White brown complex)ABC转运蛋白(ATP-binding cassette transporters)基因,研究其与次生代谢物质(Secondary metabolite)运输关系,从越橘果实转录组测序文库中筛选出21个编码WBC型转运蛋白基因。其中10个基因上调表达,11个基因下调表达,10个上调表达基因中有7个基因显著上调表达。以越橘‘北陆’(Northland)根、茎、叶芽、叶、花芽、花、绿果、粉果、蓝果、蓝果种子、蓝果果皮和蓝果果肉为试验材料,对7个显著上调表达基因进行实时荧光定量PCR(Real-time fluorescence quantitative PCR,q RT-PCR)分析,研究在越橘各个器官和果实发育不同阶段中表达模式。结果表明,越橘中7个WBC转运蛋白基因中有5个基因在果皮和果肉中的表达情况与转录组分析结果一致。越橘所有组织器官中均能检测到WBC型转运蛋白表达,但表达量不同。Unigene5067_All和Unigene27766_All在根中表达量最高,Unigene14517_All、Unigene27928_All和Unigene29820_All分别在茎、花和蓝果中表达量最高,Unigene34381_All和Unigene34438_All表达量从绿果、粉果到蓝果呈递增表达模式,与越橘中花色素苷累积呈现一致性,推测这两个WBC转运蛋白基因可能参与越橘次生代谢物运输。有助于阐明越橘中WBC转运蛋白生理生化功能。
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关键词
越橘
wbc型转运蛋白
荧光定量PCR
表达分析
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题名
基于越橘果实转录组测序WBC型转运蛋白基因发掘及表达分析
被引量：
2
1
作者
康立敏
孙海悦
陈丽
刘红弟
耿金曼
盖钰卓
刘禹姗
王静
汪立宇
李亚东
机构
吉林农业大学园艺学院
出处
《东北农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第5期1-9,共9页
基金
公益性行业(农业)科研专项(201103037)
国家自然科学基金项目(31301755)
+1 种基金
高等学校博士学科点专项科研基金(20132223120004)
人事部留学人员科技活动择优资助项目
文摘
为发掘越橘中WBC型(White brown complex)ABC转运蛋白(ATP-binding cassette transporters)基因,研究其与次生代谢物质(Secondary metabolite)运输关系,从越橘果实转录组测序文库中筛选出21个编码WBC型转运蛋白基因。其中10个基因上调表达,11个基因下调表达,10个上调表达基因中有7个基因显著上调表达。以越橘‘北陆’(Northland)根、茎、叶芽、叶、花芽、花、绿果、粉果、蓝果、蓝果种子、蓝果果皮和蓝果果肉为试验材料,对7个显著上调表达基因进行实时荧光定量PCR(Real-time fluorescence quantitative PCR,q RT-PCR)分析,研究在越橘各个器官和果实发育不同阶段中表达模式。结果表明,越橘中7个WBC转运蛋白基因中有5个基因在果皮和果肉中的表达情况与转录组分析结果一致。越橘所有组织器官中均能检测到WBC型转运蛋白表达,但表达量不同。Unigene5067_All和Unigene27766_All在根中表达量最高,Unigene14517_All、Unigene27928_All和Unigene29820_All分别在茎、花和蓝果中表达量最高,Unigene34381_All和Unigene34438_All表达量从绿果、粉果到蓝果呈递增表达模式,与越橘中花色素苷累积呈现一致性,推测这两个WBC转运蛋白基因可能参与越橘次生代谢物运输。有助于阐明越橘中WBC转运蛋白生理生化功能。
关键词
越橘
wbc型转运蛋白
荧光定量PCR
表达分析
Keywords
blueberry
wbc
transporter
real-time quantitative PCR
expression analysis
分类号
S663.9 [农业科学—果树学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
基于越橘果实转录组测序WBC型转运蛋白基因发掘及表达分析
康立敏
孙海悦
陈丽
刘红弟
耿金曼
盖钰卓
刘禹姗
王静
汪立宇
李亚东
《东北农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015
2
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参考文献
引证文献
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