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基于FTIR、UPLC-QTOF-MS~E及UNIFI天然产物数据库快速鉴定普洱茶茶汤絮凝物中的化学成分被引量：1: 1; 作者刘建国巴根纳 +5 位作者蔺炜杨瑞冬余建龙韩之皓侯兆乾王彦平《茶叶通讯》 2022年第4期518-527,共10页; 茶饮料作为当下主流的饮料品类,生产上却面临诸多问题,其中货架期内产生“冷后浑”即是一个关键发展瓶颈,尤其是普洱茶,冷后浑产生的絮凝物给普洱茶类饮品带来令消费者难以接受的视觉体验,而要解决这一问题首先需明确参与普洱茶絮凝的... 展开更多; 关键词普洱茶冷后浑 FTIR UPLC-QTOF-MSE unifi天然产物数据库快速鉴定化学成分茶叶; 在线阅读下载PDF 职称材料

微生物天然产物数据库的建立及应用被引量：4: 2; 作者姜威司书毅 +7 位作者陈湘萍王林庄锡亮邹坚陈鸿珊曹凌霄冯华陈利《中国抗生素杂志》 CAS CSCD 北大核心 2006年第2期119-121,共3页; 微生物天然产物数据库(m icrob ia l natura l products database,M NPD)是由中国医学科学院医药生物技术研究所和创腾科技有限公司联合开发,在M DL IS IS B ase化学信息管理系统上构建的综合性天然产物数据库。包括15000多个微生物天... 展开更多; 关键词微生物天然产物数据库 MDL ISIS Base化学信息管理系统; 在线阅读下载PDF 职称材料

基于众包的天然产物数据库及知识发现系统被引量：1: 3; 作者郑乃仁邓玉林 +1 位作者 Venkat Mathura Fiona Crawford 《轻工学报》 CAS 2016年第4期102-108,共7页; 针对目前天然产物数据库数据更新不及时、数据量不够大等问题,开发了基于众包的天然产物数据库及知识发现系统.该系统利用众包技术构建一个天然产物数据库,使用分子指纹对分子结构进行编码,并采用Tanimoto系数计算相似度实现天然产物和... 展开更多; 关键词众包天然产物数据库知识发现系统; 在线阅读下载PDF 职称材料

中药与天然产物研究中药效团的构建与应用被引量：5: 4; 作者张燕玲王耘乔延江《世界科学技术-中医药现代化》 2004年第4期33-38,共6页; 药效团是指一个包含药物生物活性所必要的所有特性的结构,亦是指药物分子与受体结合或作用时起重要作用的原子或基团组合。药效团的三维结构数据库搜索方法已成为新药研究开发的重要辅助手段。本文较系统地介绍了中药与天然产物研究中... 展开更多; 关键词中药天然产物药效团数据库搜索三维结构; 在线阅读下载PDF 职称材料

基因组挖掘在天然产物发现中的应用和前景被引量：14: 5; 作者杨谦程伯涛 +1 位作者汤志军刘文《合成生物学》 CSCD 2021年第5期697-715,共19页; 天然产物一直以来都是药物先导化合物的重要来源。在药物发现领域,基因组数据常用来识别潜在的药物靶点或寻找先前被忽视的天然产物的生物合成基因簇。尽管基因组测序发现了微生物和植物中存在大量未开发的化学多样性,然而,仅仅利用传... 展开更多; 关键词基因组挖掘天然产物网络工具数据库; 在线阅读下载PDF 职称材料

微生物天然产物早期鉴别及去重复方法研究进展被引量：1: 6; 作者王开梅张亚妮 +1 位作者吴兆圆杨自文《湖北农业科学》北大核心 2013年第22期5409-5414,共6页; 微生物天然产物具有独特的结构多样性。随着研究的深入,研究者在进行天然产物筛选时遇到已知化合物的机会加大,有必要在研究的早期对粗提物中的化合物进行早期鉴别及去重复,以减少不必要的人力、物力及财力的浪费。文章对涉及天然产物... 展开更多; 关键词微生物天然产物早期鉴别去重复薄层层析液相色谱-光谱联用技术数据库; 在线阅读下载PDF 职称材料

基因组挖掘指导天然药物分子的发现被引量：5: 7; 作者奚萌宇胡逸灵 +1 位作者顾玉诚戈惠明《合成生物学》 CSCD 北大核心 2024年第3期447-473,共27页; 天然产物是临床药物的主要来源,也是新药研发过程中先导化合物结构设计和优化的灵感源泉。但传统策略天然药源分子的发现却遭遇了瓶颈,新颖天然产物的数量逐渐无法满足现代药物开发的需求和应对全球多药耐药的威胁。随着测序技术的快速... 展开更多; 关键词基因组挖掘天然产物药物发现生物合成人工智能数据库; 在线阅读下载PDF 职称材料

自抗基因导向的微生物天然产物挖掘: 8; 作者董华明灯明《南京工业大学学报（自然科学版）》 CAS 北大核心 2023年第3期248-258,共11页; 在后基因组时代,天然产物挖掘因其巨大的应用前景一直备受生物医药领域的研究人员关注。随着研究者对天然产物的生物合成研究的不断深入,从海量的基因组数据中挖掘生物合成基因簇,并从中筛选新天然产物的研究策略,已经越来越受到人们的... 展开更多; 关键词自抗基因抗性基因数据库生物合成基因簇基因组挖掘天然产物; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名基于FTIR、UPLC-QTOF-MS~E及UNIFI天然产物数据库快速鉴定普洱茶茶汤絮凝物中的化学成分被引量：1: 1; 作者刘建国巴根纳蔺炜杨瑞冬余建龙韩之皓侯兆乾王彦平; 机构内蒙古伊利实业集团股份有限公司液态奶事业部研发部沃特世科技(北京)有限公司; 出处《茶叶通讯》 2022年第4期518-527,共10页; 文摘茶饮料作为当下主流的饮料品类,生产上却面临诸多问题,其中货架期内产生“冷后浑”即是一个关键发展瓶颈,尤其是普洱茶,冷后浑产生的絮凝物给普洱茶类饮品带来令消费者难以接受的视觉体验,而要解决这一问题首先需明确参与普洱茶絮凝的核心物质成分。本试验研究应用傅里叶变换红外光谱(FTIR)、超高效液相色谱-高分辨质谱仪(UPLC-QTOF-MS^(E))结合UNIFI天然产物数据库对普洱茶茶汤及絮凝物中的化学成分进行快速鉴定。通过UNIFI数据库自动检出再结合文献检索及人工核对,共鉴定出27种化合物,包括黄烷醇类、黄酮醇类、黄酮类、异黄酮类、酚酸类化合物及氨基酸、咖啡碱等化合物。本试验所用方法可快速对普洱茶茶汤及絮凝物中的化学成分进行定性分析,为普洱茶类饮料冷后浑的解决提供理论依据。; 关键词普洱茶冷后浑 FTIR UPLC-QTOF-MSE unifi天然产物数据库快速鉴定化学成分茶叶; Keywords Pu’er tea Cream down FTIR UPLC-QTOF-MSE unifi natural product database Rapid identification Tea; 分类号 S571.1 [农业科学—茶叶生产加工]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名微生物天然产物数据库的建立及应用被引量：4: 2; 作者姜威司书毅陈湘萍王林庄锡亮邹坚陈鸿珊曹凌霄冯华陈利; 机构中国医学科学院中国协和医科大学医药生物技术研究所创腾科技有限公司; 出处《中国抗生素杂志》 CAS CSCD 北大核心 2006年第2期119-121,共3页; 文摘微生物天然产物数据库(m icrob ia l natura l products database,M NPD)是由中国医学科学院医药生物技术研究所和创腾科技有限公司联合开发,在M DL IS IS B ase化学信息管理系统上构建的综合性天然产物数据库。包括15000多个微生物天然产物的来源、制备、理化性质、二维和三维化学结构、生物活性和原始文献等信息资料,可用于微生物天然产物的信息查询、总结性检索和计算机辅助药物分子设计研究。微生物天然产物数据库是医药领域科研工作者开展药物研发及相关工作的重要工具。本文简要介绍了数据库的开发历程、组成、功能及一些应用实例。; 关键词微生物天然产物数据库 MDL ISIS Base化学信息管理系统; Keywords Microbial natural products Database MDL ISIS Base; 分类号 Q939.9 [生物学—微生物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名基于众包的天然产物数据库及知识发现系统被引量：1: 3; 作者郑乃仁邓玉林 Venkat Mathura Fiona Crawford; 机构北京理工大学生命学院 Roskamp研究所; 出处《轻工学报》 CAS 2016年第4期102-108,共7页; 基金国家重大科学仪器设备开发专项课题(2012YQ04014005); 文摘针对目前天然产物数据库数据更新不及时、数据量不够大等问题,开发了基于众包的天然产物数据库及知识发现系统.该系统利用众包技术构建一个天然产物数据库,使用分子指纹对分子结构进行编码,并采用Tanimoto系数计算相似度实现天然产物和相关文献的检索,可以实时扩充,并为生物学家了解当前研究热点,确定进一步研究方向提供参考.; 关键词众包天然产物数据库知识发现系统; Keywords crowdsourcing natural product database knowledge discovery system; 分类号 R857.3 [医药卫生—航空、航天与航海医学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名中药与天然产物研究中药效团的构建与应用被引量：5: 4; 作者张燕玲王耘乔延江; 机构北京中医药大学中药学院; 出处《世界科学技术-中医药现代化》 2004年第4期33-38,共6页; 基金国家973项目(G1999054400); 文摘药效团是指一个包含药物生物活性所必要的所有特性的结构,亦是指药物分子与受体结合或作用时起重要作用的原子或基团组合。药效团的三维结构数据库搜索方法已成为新药研究开发的重要辅助手段。本文较系统地介绍了中药与天然产物研究中药效团的构建与应用,并对基于药效团三维结构的三维数据库搜索方法及其应用进行了综述。; 关键词中药天然产物药效团数据库搜索三维结构; Keywords pharmaeodynamic aggregation, 3 - dimensional databank, Chinese medicine, medicine made of natural products; 分类号 R285 [医药卫生—中药学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名基因组挖掘在天然产物发现中的应用和前景被引量：14: 5; 作者杨谦程伯涛汤志军刘文; 机构中国科学院上海有机化学研究所中国科学院上海有机化学研究所; 出处《合成生物学》 CSCD 2021年第5期697-715,共19页; 基金国家重点研发计划(2019YFA0905400) 中国科学院B类先导科技专项(XDB20020200) 王宽诚率先人才计划。; 文摘天然产物一直以来都是药物先导化合物的重要来源。在药物发现领域,基因组数据常用来识别潜在的药物靶点或寻找先前被忽视的天然产物的生物合成基因簇。尽管基因组测序发现了微生物和植物中存在大量未开发的化学多样性,然而,仅仅利用传统的分离分析方法获取新的天然产物已经无法满足药物发展的需求。随着基因组时代的到来,数字化的基因组挖掘已经成为天然产物发现的重要组成部分。伴随着高通量测序方法的发展和DNA数据的丰富,各种基因组挖掘方法和工具被开发出来,以指导发现和表征这些天然产物。本文综述了近年来基因组挖掘的网络工具、数据库和方法,着重介绍次级代谢产物生物合成基因簇的挖掘手段,从经典的基因组挖掘到基于抗性基因挖掘、基于系统进化发育的挖掘,并对基因组挖掘在天然产物发现中的地位和前景进行了展望。; 关键词基因组挖掘天然产物网络工具数据库; Keywords genome mining natural products web tools database; 分类号 Q31 [生物学—遗传学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名微生物天然产物早期鉴别及去重复方法研究进展被引量：1: 6; 作者王开梅张亚妮吴兆圆杨自文; 机构湖北省生物农药工程研究中心; 出处《湖北农业科学》北大核心 2013年第22期5409-5414,共6页; 基金国家科技支撑计划项目(2011BAE06B004) 湖北省农业科技创新中心项目(2007-620-009-001); 文摘微生物天然产物具有独特的结构多样性。随着研究的深入,研究者在进行天然产物筛选时遇到已知化合物的机会加大,有必要在研究的早期对粗提物中的化合物进行早期鉴别及去重复,以减少不必要的人力、物力及财力的浪费。文章对涉及天然产物早期鉴别及去重复的方法——薄层层析技术(TLC)、高效液相色谱(HPLC)-光谱联用技术及天然产物数据库在天然产物早期鉴别及去重复中的应用进行综述,以期为新药的研究与开发提供一些借鉴。; 关键词微生物天然产物早期鉴别去重复薄层层析液相色谱-光谱联用技术数据库; Keywords microbial natural products early identification dereplication thin-layer chromatography LC-spectroscopy cou-pled techniques databases; 分类号 TQ028.8 [化学工程]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名基因组挖掘指导天然药物分子的发现被引量：5: 7; 作者奚萌宇胡逸灵顾玉诚戈惠明; 机构南京大学生命科学学院南京大学化学化工学院先正达Jealott’s Hill国际研发中心; 出处《合成生物学》 CSCD 北大核心 2024年第3期447-473,共27页; 基金国家重点研发计划(2018YFA0902000) 国家自然科学基金(81925033,22193071,81991522)。; 文摘天然产物是临床药物的主要来源,也是新药研发过程中先导化合物结构设计和优化的灵感源泉。但传统策略天然药源分子的发现却遭遇了瓶颈,新颖天然产物的数量逐渐无法满足现代药物开发的需求和应对全球多药耐药的威胁。随着测序技术的快速迭代,生物学的研究进入了基因组时代,基因组挖掘指导天然产物定向发现的策略得以确立,成功摆脱了传统天然产物发现策略对于生物样本生物量的依赖,极大提高了活性天然产物发现的特异性和成功率。本文简述了基因组挖掘以及相关数据库和生物信息学工具的发展,详细介绍了包括基于核心基因或后修饰基因的经典挖掘手段,自抗性机制、进化理论指导的基因组挖掘和人工智能在活性天然产物发现中的具体应用,并对基因组挖掘在药物发现和多学科交叉领域的影响和发展进行了展望。基因组信息中蕴藏着无可估量的化学潜能,促进基因组挖掘与其他学科间的交叉融合,提升对遗传信息的处理和分析能力,增强下游基因簇表达通量和产物结构预测能力,可实现天然小分子高通量、高新颖性和高效率的发现,为开发具有自主知识产权的新药物、新化学品和新型酶催化剂服务。; 关键词基因组挖掘天然产物药物发现生物合成人工智能数据库; Keywords genome mining natural products drug discovery biosynthesis artificial intelligence databases; 分类号 Q31 [生物学—遗传学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名自抗基因导向的微生物天然产物挖掘: 8; 作者董华明灯明; 机构南京工业大学药学院南京工业大学生物与制药工程学院; 出处《南京工业大学学报（自然科学版）》 CAS 北大核心 2023年第3期248-258,共11页; 基金国家重点研发计划(2019YFA0905700、2017YFC1600900)。; 文摘在后基因组时代,天然产物挖掘因其巨大的应用前景一直备受生物医药领域的研究人员关注。随着研究者对天然产物的生物合成研究的不断深入,从海量的基因组数据中挖掘生物合成基因簇,并从中筛选新天然产物的研究策略,已经越来越受到人们的青睐。在众多的天然产物挖掘方法中,以自抗性基因为导向的挖掘,提供了一种新的分析天然产物合成途径的视角和一种高效的挖掘策略,筛选到的天然产物通常也具有较高的生物活性。重点介绍了天然产物的4种典型的自抗性机制,介绍了现有的抗性基因数据库,举例阐述了近几年出现的自抗性基因导向的天然产物挖掘策略,对基于计算机技术的微生物源天然产物的挖掘进行了展望。; 关键词自抗基因抗性基因数据库生物合成基因簇基因组挖掘天然产物; Keywords self-resistance gene resistance genes database biosynthetic gene clusters discovery of genome natural products; 分类号 Q-31 [生物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

	题名	作者	出处	发文年	被引量	操作
1	基于FTIR、UPLC-QTOF-MS~E及UNIFI天然产物数据库快速鉴定普洱茶茶汤絮凝物中的化学成分	刘建国巴根纳蔺炜杨瑞冬余建龙韩之皓侯兆乾王彦平	《茶叶通讯》	2022	1	在线阅读下载PDF 职称材料
2	微生物天然产物数据库的建立及应用	姜威司书毅陈湘萍王林庄锡亮邹坚陈鸿珊曹凌霄冯华陈利	《中国抗生素杂志》 CAS CSCD 北大核心	2006	4	在线阅读下载PDF 职称材料
3	基于众包的天然产物数据库及知识发现系统	郑乃仁邓玉林 Venkat Mathura Fiona Crawford	《轻工学报》 CAS	2016	1	在线阅读下载PDF 职称材料
4	中药与天然产物研究中药效团的构建与应用	张燕玲王耘乔延江	《世界科学技术-中医药现代化》	2004	5	在线阅读下载PDF 职称材料
5	基因组挖掘在天然产物发现中的应用和前景	杨谦程伯涛汤志军刘文	《合成生物学》 CSCD	2021	14	在线阅读下载PDF 职称材料
6	微生物天然产物早期鉴别及去重复方法研究进展	王开梅张亚妮吴兆圆杨自文	《湖北农业科学》北大核心	2013	1	在线阅读下载PDF 职称材料
7	基因组挖掘指导天然药物分子的发现	奚萌宇胡逸灵顾玉诚戈惠明	《合成生物学》 CSCD 北大核心	2024	5	在线阅读下载PDF 职称材料
8	自抗基因导向的微生物天然产物挖掘	董华明灯明	《南京工业大学学报（自然科学版）》 CAS 北大核心	2023	0	在线阅读下载PDF 职称材料