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秦川牛及其杂种牛UCP3基因SNPs检测及其与胴体、肉质性状的相关性
被引量：
9
1
作者
韩瑞华
昝林森
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第6期806-812,共7页
采用PCR-SSCP技术对秦川牛(QQ)及其杂种牛西秦(XQ)、安秦(AQ)、德秦(DQ)4个群体共计229头个体UCP3基因进行SNPs多态性检测,发现了AA、AB、AC、AD 4种基因型。测序结果表明,AA基因型为纯合型;AB基因型在第820位发生C→T突变;AC基因型在第...
采用PCR-SSCP技术对秦川牛(QQ)及其杂种牛西秦(XQ)、安秦(AQ)、德秦(DQ)4个群体共计229头个体UCP3基因进行SNPs多态性检测,发现了AA、AB、AC、AD 4种基因型。测序结果表明,AA基因型为纯合型;AB基因型在第820位发生C→T突变;AC基因型在第775位发生G→A突变;AD基因型在951位发生G→T突变。方差分析结果表明,4个群体中AA基因型个体在宰前活体质量、胴体质量、胴体长、眼肌面积、系水力、大理石花纹中显著高于AB、AC、AD基因型个体(P<0.05);AB基因型个体的背膘厚显著高于AA、AC、AD基因型个体(P<0.05)。初步推断,AA基因型为优势基因型,A为优势等位基因,对选择有正向效应。
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关键词
秦川牛
ucp
3
基因
PCR-SSCP
SNPS
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职称材料
UCP3基因在巴马猪和藏猪脂肪组织中的表达和甲基化分析
被引量：
5
2
作者
范一萍
王彦芳
陶聪
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2019年第12期3627-3634,共8页
为探究解偶联蛋白3(uncoupling protein 3,UCP3)基因在巴马猪和藏猪皮下脂肪组织中的表达和甲基化水平,试验采用实时荧光定量PCR技术检测UCP 3基因在巴马猪和藏猪皮下脂肪组织中的mRNA表达水平;针对猪UCP 3基因启动子区域(-3580^+920 b...
为探究解偶联蛋白3(uncoupling protein 3,UCP3)基因在巴马猪和藏猪皮下脂肪组织中的表达和甲基化水平,试验采用实时荧光定量PCR技术检测UCP 3基因在巴马猪和藏猪皮下脂肪组织中的mRNA表达水平;针对猪UCP 3基因启动子区域(-3580^+920 bp),利用在线软件MethPrimer对该区域进行CpG岛预测,并采用亚硫酸氢盐测序法(bisulfite sequencing PCR,BSP)检测其甲基化水平,探究UCP 3基因甲基化水平在巴马猪和藏猪中的差异。结果显示,巴马猪皮下脂肪组织UCP 3基因表达量显著高于藏猪(P<0.05);在UCP 3基因启动子区预测到3个CpG甲基化岛,分别是CpG island1(-3171^-2928 bp)、CpG island2(-154^-2 bp)和CpG island3(+648^+806 bp),其中CpG island1和CpG island3的甲基化水平在巴马猪和藏猪中差异较小,而藏猪CpG island2的甲基化水平(42.61%)高于巴马猪(24.49%)。本研究绘制了2个猪种CpG island2甲基化水平的黑白点图,其中CpG位点为4、8、9、10、11、12、15,藏猪甲基化频率分别比巴马猪高28.26%、17.39%、26.09%、26.09%、26.09%、23.91%和34.78%。在CpG island2处预测到3个转录因子结合位点(SP2、PPARγ和EGR1)。结果表明,巴马猪和藏猪皮下脂肪组织中UCP 3基因mRNA水平的表达差异可能是由于CpG island2的甲基化水平不同所导致,藏猪DNA甲基化水平在一定程度上阻碍了转录因子与启动子调控区域的结合,从而抑制了UCP 3基因的表达。
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关键词
巴马猪
藏猪
ucp
3
基因
脂肪组织
甲基化
在线阅读
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职称材料
题名
秦川牛及其杂种牛UCP3基因SNPs检测及其与胴体、肉质性状的相关性
被引量：
9
1
作者
韩瑞华
昝林森
机构
西北农林科技大学动物科技学院
出处
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第6期806-812,共7页
基金
国家863计划项目(2006AA10Z1A1)
陕西省2006年重大科技专项(2006KZ07-G1)
西北农林科技大学拔尖人才支持计划基金资助
文摘
采用PCR-SSCP技术对秦川牛(QQ)及其杂种牛西秦(XQ)、安秦(AQ)、德秦(DQ)4个群体共计229头个体UCP3基因进行SNPs多态性检测,发现了AA、AB、AC、AD 4种基因型。测序结果表明,AA基因型为纯合型;AB基因型在第820位发生C→T突变;AC基因型在第775位发生G→A突变;AD基因型在951位发生G→T突变。方差分析结果表明,4个群体中AA基因型个体在宰前活体质量、胴体质量、胴体长、眼肌面积、系水力、大理石花纹中显著高于AB、AC、AD基因型个体(P<0.05);AB基因型个体的背膘厚显著高于AA、AC、AD基因型个体(P<0.05)。初步推断,AA基因型为优势基因型,A为优势等位基因,对选择有正向效应。
关键词
秦川牛
ucp
3
基因
PCR-SSCP
SNPS
Keywords
Qinchuan cattle
ucp 3 gene
PCR-SSCP
SNPs
分类号
S813.3 [农业科学—畜牧学]
Q343.15 [生物学—遗传学]
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职称材料
题名
UCP3基因在巴马猪和藏猪脂肪组织中的表达和甲基化分析
被引量：
5
2
作者
范一萍
王彦芳
陶聪
机构
中国农业科学院北京畜牧兽医研究所
出处
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2019年第12期3627-3634,共8页
基金
国家自然科学基金青年基金(31601929)
中国农业科学院“青年英才”项目(ASTIP-IAS05)
文摘
为探究解偶联蛋白3(uncoupling protein 3,UCP3)基因在巴马猪和藏猪皮下脂肪组织中的表达和甲基化水平,试验采用实时荧光定量PCR技术检测UCP 3基因在巴马猪和藏猪皮下脂肪组织中的mRNA表达水平;针对猪UCP 3基因启动子区域(-3580^+920 bp),利用在线软件MethPrimer对该区域进行CpG岛预测,并采用亚硫酸氢盐测序法(bisulfite sequencing PCR,BSP)检测其甲基化水平,探究UCP 3基因甲基化水平在巴马猪和藏猪中的差异。结果显示,巴马猪皮下脂肪组织UCP 3基因表达量显著高于藏猪(P<0.05);在UCP 3基因启动子区预测到3个CpG甲基化岛,分别是CpG island1(-3171^-2928 bp)、CpG island2(-154^-2 bp)和CpG island3(+648^+806 bp),其中CpG island1和CpG island3的甲基化水平在巴马猪和藏猪中差异较小,而藏猪CpG island2的甲基化水平(42.61%)高于巴马猪(24.49%)。本研究绘制了2个猪种CpG island2甲基化水平的黑白点图,其中CpG位点为4、8、9、10、11、12、15,藏猪甲基化频率分别比巴马猪高28.26%、17.39%、26.09%、26.09%、26.09%、23.91%和34.78%。在CpG island2处预测到3个转录因子结合位点(SP2、PPARγ和EGR1)。结果表明,巴马猪和藏猪皮下脂肪组织中UCP 3基因mRNA水平的表达差异可能是由于CpG island2的甲基化水平不同所导致,藏猪DNA甲基化水平在一定程度上阻碍了转录因子与启动子调控区域的结合,从而抑制了UCP 3基因的表达。
关键词
巴马猪
藏猪
ucp
3
基因
脂肪组织
甲基化
Keywords
Bama pigs
Tibetan pigs
ucp 3 gene
adipose tissue
methylation
分类号
Q78 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
秦川牛及其杂种牛UCP3基因SNPs检测及其与胴体、肉质性状的相关性
韩瑞华
昝林森
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2009
9
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
UCP3基因在巴马猪和藏猪脂肪组织中的表达和甲基化分析
范一萍
王彦芳
陶聪
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2019
5
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职称材料
已选择
0
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