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UBE2I和FCGR1A在艾滋病合并活动性肺结核患者中的表达及临床意义
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作者 王敏 杨文沁 +3 位作者 石萌芮 张荣强 王小莉 张志刚 《西安交通大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期782-788,共7页
目的探讨UBE2I和FCGR1A表达对艾滋病(acquired immune deficiency syndrome,AIDS)合并活动性肺结核(active pulmonary tuberculosis,APTB)发病的影响,为疾病监测提供依据。方法从已验证的全基因组转录谱数据集(GSE37250)选取AIDS合并APT... 目的探讨UBE2I和FCGR1A表达对艾滋病(acquired immune deficiency syndrome,AIDS)合并活动性肺结核(active pulmonary tuberculosis,APTB)发病的影响,为疾病监测提供依据。方法从已验证的全基因组转录谱数据集(GSE37250)选取AIDS合并APTB患者98例、AIDS合并潜伏期肺结核感染(latent tuberculosis infection,LTBI)患者84例,筛选两组患者的前30位差异表达基因(differentially expressed gene,DEG)建立PPI交互作用网络、转录因子-差异基因(transcription factor-differentially expressed gene,TF-DEG)、DEG-miRNA和环境化学物-DEG调控网络,绘制11个关键DEGs的受试者工作特征(ROC)曲线并作Logistic回归分析。结果两组患者间存在6054个DEGs,UBE2I为PPI交互作用网络的重要核心节点,FCGR1A对AIDS合并APTB的预测指示能力最佳。单因素Logistic回归显示:UBE2I、FCGR1A的高表达是AIDS合并APTB的危险因素(P<0.05)。调控网络显示:VEGFB是TF-DEG网络的关键基因,与SEPT9、SMAD5等转录因子共同参与调节,与hsa-mir-17-5p、hsa-mir-20a-5p等miRNA存在靶向作用,并受到丙戊酸、硫酸铜等环境化学物的影响。结论VEGFB在AIDS合并APTB发病过程中发挥重要作用,UBE2I和FCGR1A的异常高表达与AIDS合并APTB的疾病进程存在关联,可通过检测UBE2I和FCGR1A的表达水平监测病情。 展开更多
关键词 艾滋病(AIDS) 活动性肺结核(APTB) ube2i基因 FCGR1A基因 丙戊酸
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UBE2O: A Unique Ubiquitin-conjugating Enzyme with Diverse Biological and Pathophysiological Activities
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作者 MAO Chen-Yu WANG Ya-Li MAO Xin-Liang 《中国生物化学与分子生物学报》 北大核心 2025年第6期783-797,共15页
UBE2O is a distinctive ubiquitin-conjugating enzyme characterized by its large size(1292 residues)and dual E2/E3 enzymatic activities,enabling diverse ubiquitylation types.Unlike typical E2 enzymes(150~200 residues),U... UBE2O is a distinctive ubiquitin-conjugating enzyme characterized by its large size(1292 residues)and dual E2/E3 enzymatic activities,enabling diverse ubiquitylation types.Unlike typical E2 enzymes(150~200 residues),UBE2O’s multifunctionality allows it to regulate substrate degradation,subcellular localization,and functional modulation.Emerging studies highlight its critical roles in protein quality control,erythroid differentiation,metabolic regulation,and maintenance of circadian rhythm.Dysregulation of UBE2O is implicated in various diseases,including cancers,neurodegenerative disorders,and metabolic diseases.This review extensively discusses the unique structural features,diverse biological functions,and pathological roles of UBE2O,as well as its therapeutic potential for associated diseases. 展开更多
关键词 protein ubiquitylation ubiquitin-conjugating enzyme E2O(UBE2O) monoubiquitylation multi-monoubiquitylation polyubiquitylation
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过表达泛素偶联酶E2C对293T细胞增殖的影响 被引量:2
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作者 黄湘 邱玉林 +2 位作者 谭家余 乔亚峰 李明 《细胞与分子免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2011年第6期634-636,共3页
目的:构建稳定过表达人类泛素偶联酶E2C(UBE2C)的293T人胚肾细胞株,初步探讨其对293T细胞增殖的影响。方法:采用脂质体法将已成功构建的pcDNA3.1(-)/UBE2C真核表达质粒转入293T人胚肾细胞株中,随后经G418筛选4周,得到阳性克隆细胞株;用W... 目的:构建稳定过表达人类泛素偶联酶E2C(UBE2C)的293T人胚肾细胞株,初步探讨其对293T细胞增殖的影响。方法:采用脂质体法将已成功构建的pcDNA3.1(-)/UBE2C真核表达质粒转入293T人胚肾细胞株中,随后经G418筛选4周,得到阳性克隆细胞株;用Western blot技术检测并鉴定UBE2C基因在293T细胞中的表达情况;用MTT法检测UBE2C对293T细胞增殖的影响。结果:Western blot检测显示,转pcDNA3.1(-)/UBE2C组293T细胞的UBE2C蛋白表达水平明显高于转pcDNA3.1(-)组(P<0.01)。MTT法检测结果显示转pcDNA3.1(-)/UBE2C组293T细胞的增殖速度明显快于转pcDNA3.1(-)组(P<0.01)。结论:成功建立稳定过表达UBE2C的293T细胞株,过表达UBE2C可促进293T细胞的增殖。 展开更多
关键词 UBE2C 过表达 293T细胞株 增殖
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泛素结合酶E2C与肿瘤的关系研究进展 被引量:6
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作者 王少冰 王芳 《医学研究生学报》 CAS 北大核心 2015年第5期543-548,共6页
越来越多的证据提示肿瘤细胞内紊乱的泛素化过程调控了肿瘤的发生发展。泛素结合酶E2C(ubiquitinconjugating enzyme E2 C,UBE2 C)是泛素结合酶家族的重要成员,是细胞有丝分裂中期向后期转变的关键调节分子。近年来,UBE2C与肿瘤的关系... 越来越多的证据提示肿瘤细胞内紊乱的泛素化过程调控了肿瘤的发生发展。泛素结合酶E2C(ubiquitinconjugating enzyme E2 C,UBE2 C)是泛素结合酶家族的重要成员,是细胞有丝分裂中期向后期转变的关键调节分子。近年来,UBE2C与肿瘤的关系研究较多,文中就该分子在肿瘤中的表达情况、对肿瘤发生发展的影响及内在机制的研究现状作一综述。 展开更多
关键词 泛素结合酶 UBE2C 有丝分裂 肿瘤
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羧基末端结合蛋白CtBP2与泛素结合酶UBE2Ⅰ的相互作用 被引量:1
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作者 叶晓霞 石彦 +2 位作者 霍克克 陈东 吴民华 《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第17期1783-1788,共6页
目的筛选并确定人羧基末端结合蛋白CtBP2的相互作用蛋白。方法用酵母双杂交技术,以人CtBP2为诱饵蛋白筛选人肝cDNA文库,获得与之相互作用的候选蛋白,采用酵母共转化和细胞免疫共沉淀实验确认相互作用的特异性,最后利用荧光蛋白融合表达... 目的筛选并确定人羧基末端结合蛋白CtBP2的相互作用蛋白。方法用酵母双杂交技术,以人CtBP2为诱饵蛋白筛选人肝cDNA文库,获得与之相互作用的候选蛋白,采用酵母共转化和细胞免疫共沉淀实验确认相互作用的特异性,最后利用荧光蛋白融合表达技术和荧光显微镜观察确认CtBP2与其相互作用蛋白的亚细胞共定位情况。结果酵母双杂交筛选获得了41个与Bd-CtBP2相互作用的阳性克隆,编码10个不同的蛋白,其中有4个克隆编码泛素结合酶UBE2Ⅰ的不同片段。从人肝cDNA文库中扩增获得UBE2Ⅰ的全长编码序列,酵母共转化和细胞免疫共沉淀实验证实CtBP2与UBE2Ⅰ能够特异性结合。亚细胞定位研究表明GFP-CtBP2弥散分布于细胞核,DsRed-UBE2Ⅰ不均匀分布于细胞核,有部分点状聚集。两者共转染时能够呈点状共定位于细胞核。结论人CtBP2能够在细胞核内与UBE2Ⅰ特异性相互作用,是UBE2Ⅰ的靶蛋白。 展开更多
关键词 羧基末端结合蛋白 酵母双杂交 泛素结合酶UBE2Ⅰ 免疫共沉淀 亚细胞共定位
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鸽泛素结合酶蛋白(UBE2)基因的生物信息学分析 被引量:1
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作者 高鹏飞 赵慧婷 王钦德 《畜牧兽医科技信息》 2010年第11期24-26,共3页
在鸽脑垂体全长cDNA文库构建成功和泛素(Ubiquitin,UB) 和泛素结合酶(ubiquitin-conjugating enzyme,UBE2)基因全长cDNA克隆成功的基础上,通过生物信息学方法对UBE2基因序列进行分析。预测UBE2基因编码蛋白的理化特性、功能域、二级结... 在鸽脑垂体全长cDNA文库构建成功和泛素(Ubiquitin,UB) 和泛素结合酶(ubiquitin-conjugating enzyme,UBE2)基因全长cDNA克隆成功的基础上,通过生物信息学方法对UBE2基因序列进行分析。预测UBE2基因编码蛋白的理化特性、功能域、二级结构及三级结构等。该序列的GenBank登录号为 EU914824。UBE2基因编码的蛋白为胞内蛋白,其二级结构预测结果中α螺旋约占26.39%、β延伸链约占18.75%、无规则卷曲约占 54.86%。通过对UBE2基因的cDNA序列并对其进行的生物信息学分析,结果有望能为UBE2相关功能研究提供理论参考。 展开更多
关键词 UBE2基因 CDNA文库 生物信息学
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斑节对虾UBE2H基因克隆及其表达 被引量:3
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作者 唐蕾 傅明骏 +3 位作者 刘文生 黄建华 周发林 江世贵 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第11期1958-1965,共8页
【目的】克隆斑节对虾(Penaeusmonodon)泛素结合酶E2 H基因(UBE2H),了解其组织特异性表达情况,为揭示UBE2H在斑节对虾卵巢发育过程的作用提供依据。【方法】PCR扩增斑节对虾UBE2H基因的开放阅读框,利用实时荧光定量PCR检测UBE2H... 【目的】克隆斑节对虾(Penaeusmonodon)泛素结合酶E2 H基因(UBE2H),了解其组织特异性表达情况,为揭示UBE2H在斑节对虾卵巢发育过程的作用提供依据。【方法】PCR扩增斑节对虾UBE2H基因的开放阅读框,利用实时荧光定量PCR检测UBE2H基因在斑节对虾各组织及不同发育期斑节对虾肝胰腺和卵巢中的表达情况;并构建pET32a-UBE2H原核表达重组质粒,进行诱导表达及蛋白纯化。【结果】克隆获得的斑节对虾UBE2H基因全长1010 bp (GenBank登录号KU870456),其中,5'非编码区77 bp,3'非编码区378 bp,开放阅读框555 bp(编码184个氨基酸)。斑节对虾UBE2H蛋白等电点(pI)4.88,分子量20.85 kD。斑节对虾UBE2H氨基酸序列与其他物种相似度很高,为78.00%-83.00%。实时荧光定量PCR检测结果显示,UBE2H基因在斑节对虾淋巴组织中表达量最高,其次为鳃;在斑节对虾不同卵巢发育期肝胰腺和卵巢中的表达量均呈先上升后下降的变化趋势,但其峰值出现时间存在差异,肝胰腺的最高表达量出现在卵巢III期,卵巢的最高表达量出现在卵巢II期。经原核表达获得的斑节对虾UBE2H融合蛋白约39.00 kD,纯化后的蛋白浓度为2.92μg/μL。【结论】斑节对虾UBE2H参与了其卵母细胞发育和肝胰腺中卵黄蛋白的转运过程,与斑节对虾的卵巢发育密切相关。 展开更多
关键词 斑节对虾 UBE2H基因 克隆 实时荧光定量PCR 原核表达
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UBE2W抑制TNFα诱导的NF-κB转录活性 被引量:4
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作者 王少鑫 巩伟丽 +1 位作者 陈媛 靳宝锋 《科学技术与工程》 北大核心 2012年第35期9457-9460,共4页
UBE2W(ubiquitin-conjugating enzyme E2W)是一新的泛素结合酶,关于其功能研究甚少。采用双荧光报告系统和Western blot等方法,分别干涉和过表达UBE2W,分析UBE2W对TNF(刺激下NF-(B转录活性的影响。结果显示UBE2W能够显著抑制TNFα诱导的... UBE2W(ubiquitin-conjugating enzyme E2W)是一新的泛素结合酶,关于其功能研究甚少。采用双荧光报告系统和Western blot等方法,分别干涉和过表达UBE2W,分析UBE2W对TNF(刺激下NF-(B转录活性的影响。结果显示UBE2W能够显著抑制TNFα诱导的NF-κB的转录活性,提示该基因可能参与NF-κB相关功能的调控。 展开更多
关键词 UBE2W NF-ΚB TNFΑ
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草菇采后生物学特性变化及保鲜技术研究进展 被引量:7
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作者 李瑞容 林俊芳 +2 位作者 郑倩望 邹苑 郭丽琼 《中国蔬菜》 北大核心 2021年第6期27-33,共7页
草菇味道鲜美,香味浓郁,具有较高的营养价值和药用价值。本文介绍了草菇高温开伞、褐变、低温自溶等导致其较难贮藏、货架期短的生物学特性。同时,总结了通过包装、辐照、超声波、保鲜液洗涤、涂膜、臭氧以及分子技术保鲜等保持草菇采... 草菇味道鲜美,香味浓郁,具有较高的营养价值和药用价值。本文介绍了草菇高温开伞、褐变、低温自溶等导致其较难贮藏、货架期短的生物学特性。同时,总结了通过包装、辐照、超声波、保鲜液洗涤、涂膜、臭氧以及分子技术保鲜等保持草菇采后品质的保鲜方法。建议培育耐低温菌株,在低温下贮藏,与物理方法(气调包装、超声波)或化学方法相结合的复合保鲜方式,实现草菇提质保鲜,延长货架期。另外,采用UBE2抑制剂来改善草菇的耐低温胁迫能力为未来研究提供了新方向。 展开更多
关键词 草菇 生物学特性 低温自溶 保鲜方法 UBE2抑制剂 综述
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基于生物信息学途径评估UBE2家族及UBE2T基因在肺腺癌中的表达及临床意义 被引量:5
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作者 杨豪帅 赖慧娜 +1 位作者 饶怡茹 林晓平 《中山大学学报(医学科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2020年第3期445-451,共7页
【目的】探究泛素结合酶E2家族和泛素结合酶E2T(UBE2T)在肺腺癌中的表达情况及其与临床病理特征之间的关系。【方法】利用linkedomics平台进行UBE2C、UBE2M、UBE2S、UBE2T、UBE2V2 mRNA表达水平与肺腺癌临床特征之间的关系分析,对总生... 【目的】探究泛素结合酶E2家族和泛素结合酶E2T(UBE2T)在肺腺癌中的表达情况及其与临床病理特征之间的关系。【方法】利用linkedomics平台进行UBE2C、UBE2M、UBE2S、UBE2T、UBE2V2 mRNA表达水平与肺腺癌临床特征之间的关系分析,对总生存时间(OS;Cox回归检验)、总分期(Kruskal-Wallis H检验)、T分期(Kruskal-Wallis H检验)、N分期(Kruskal-Wallis H检验)及M分期(Wilcox秩和检验)进行差异比较。运用肿瘤基因组图谱(TCGA)数据库获取UBE2T基因在肺腺癌组织和癌旁组织中的表达信息,将结果进行两独立样本t检验。利用GSEA软件进行KEGG通路及富集分析。【结果】UBE2C、UBE2M、UBE2S、UBE2T、UBE2V2 mRNA表达量与肺腺癌的临床病理特征存在相关关系。其中,UBE2T高表达者其OS较短,TNM分期较晚者UBE2T呈高表达,差异均具有统计学意义(P<0.05)。UBE2T mRNA表达量在肺腺癌中明显升高(P<0.01)。基因富集结果显示高表达的UBE2T与细胞周期(FDR=0),剪接体(FDR=0),DNA修复(FDR=0)及糖代谢等36个信号通路密切相关(FDR<0.05)。UBE2家族的UBE2C、UBE2M、UBE2S、UBE2T、UBE2V2 mRNA均与肺腺癌的临床病理特征存在相关关系,其中UBE2T的表达水平与临床分期及预后的关系最为密切,且与肿瘤细胞糖酵解通路密切相关。【结论】UBE2家族与肺腺癌临床病理特征相关。UBE2T mRNA有望成为肺腺癌新的生物标志物。 展开更多
关键词 肺腺癌 UBE2T UBE2家族 基因表达 数据库 泛素化 糖代谢
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NEDD8结合酶UBE2F调控肺腺癌转移的分子机制研究 被引量:2
11
作者 林雄智 张路易 +2 位作者 贺连平 梁勇 周丽莎 《中国临床药理学与治疗学》 CAS CSCD 北大核心 2024年第6期612-620,共9页
目的:探究NEDD8结合酶UBE2F对肺腺癌(lung adenocarcinoma,LUAD)转移的影响。方法:利用TIMER2.0、UALCAN、HPA等数据库分析UBE2F在肺腺癌中的表达情况;利用Kaplan-MeierPlotter数据库分析UBE2F表达与肺腺癌生存率的关系;运用CRISPR/Cas... 目的:探究NEDD8结合酶UBE2F对肺腺癌(lung adenocarcinoma,LUAD)转移的影响。方法:利用TIMER2.0、UALCAN、HPA等数据库分析UBE2F在肺腺癌中的表达情况;利用Kaplan-MeierPlotter数据库分析UBE2F表达与肺腺癌生存率的关系;运用CRISPR/Cas9技术构建UBE2F敲除的肺腺癌细胞系,并构建UBE2F敲除的裸鼠肺腺癌转移瘤模型,验证UBE2F敲除对肺腺癌转移的影响;通过细胞划痕实验以及Transwell迁移和侵袭实验检测UBE2F敲除对肺腺癌细胞侵袭、迁移能力的影响;Westernblot法和RealtimePCR法检测下调UBE2F表达对上皮-间充质转化(epithelial-mesenchymal transformation,EMT)转录因子Snail表达的影响。结果:多个数据库分析表明,UBE2F在肺腺癌中高表达,且高表达患者比低表达患者具有更好的预后;体内实验表明,与对照组相比,UBE2F敲除后裸鼠肺表面转移的小结节数目显著增多(P<0.05);细胞划痕实验以及Transwell实验表明,UBE2F敲除增强肺腺癌细胞的迁移和侵袭能力,差异具有统计学意义(P<0.05);Westernblot和Re-altimePCR结果显示,UBE2F敲除升高EMT转录因子Snail蛋白水平和mRNA水平。结论:敲除UBE2F诱导Snail积聚,进而导致肺腺癌细胞的侵袭和转移。 展开更多
关键词 NEDD8结合酶 UBE2F SNAIL 肺腺癌 转移
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大鲵泛素结合酶cgsUBE2L3基因克隆及其在免疫应答中的表达分析 被引量:1
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作者 刘榴 石君玲 +1 位作者 尤修玲 廖志勇 《安徽农业科学》 CAS 2017年第22期93-97,154,共6页
[目的]研究泛素结合酶UBE2L3基因在大鲵免疫应答过程中的作用。[方法]克隆大鲵泛素结合酶基因(cgsUBE2L3),进行相关生物信息学分析,并通过qRT-PCR对其组织分布及免疫刺激下的表达谱进行分析。[结果]成功克隆了cgsUBE2L3基因,该基因全长... [目的]研究泛素结合酶UBE2L3基因在大鲵免疫应答过程中的作用。[方法]克隆大鲵泛素结合酶基因(cgsUBE2L3),进行相关生物信息学分析,并通过qRT-PCR对其组织分布及免疫刺激下的表达谱进行分析。[结果]成功克隆了cgsUBE2L3基因,该基因全长包含一个462 bp的开放阅读框,编码154个氨基酸,预计蛋白分子量为21.2 ku;cgsUBE2L3氨基酸序列保守性很高,与非洲爪蟾的同源性高达97.4%;此外,qRT-PCR结果显示,cgsUBE2L3基因在大鲵组织中广泛分布,且被LPS感染的大鲵多个免疫组织中cgsUBE2L3的mRNA水平均发生了明显变化。[结论]cgsUBE2L3基因具有高度保守的结构特征,其组织分布具有特异性且参与大鲵抵抗LPS刺激的免疫应答。 展开更多
关键词 大鲵 UBE2L3 序列分析 免疫应答
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泛素结合酶UBE2G2基因调控胞内布鲁氏菌存活的作用 被引量:1
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作者 印双红 张俊波 +7 位作者 张孟琴 易萌 易彩霞 蔡春连 毛宏 易继海 李志强 陈创夫 《江苏农业科学》 北大核心 2022年第16期180-186,共7页
为了探讨泛素结合酶UBE2G2在胞内布鲁氏菌繁殖中的作用,通过分别构建过表达载体和设计合成小干扰RNA(siRNA)对UBE2G2基因进行过表达和沉默;利用MTT比色法检测UBE2G2基因沉默或过表达对细胞活性的影响;利用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测... 为了探讨泛素结合酶UBE2G2在胞内布鲁氏菌繁殖中的作用,通过分别构建过表达载体和设计合成小干扰RNA(siRNA)对UBE2G2基因进行过表达和沉默;利用MTT比色法检测UBE2G2基因沉默或过表达对细胞活性的影响;利用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测布鲁氏菌M5-90感染对UBE2G2基因表达的影响;用布鲁氏菌M5-90感染过表达和沉默UBE2G2基因的细胞,利用qRT-PCR检测细胞中CHOP基因表达的变化,利用菌落计数法检测胞内细菌数量的变化,利用试剂盒检测乳酸脱氢酶(LDH)、白介素18(IL-18)和γ-干扰素(IFN-γ)水平的变化。结果显示,获得UBE2G2基因的过表达作用的载体pLVX-puro-UBE2G2;筛选出UBE2G2基因的干扰效果最佳片段为UBE2G2-83-siRNA;UBE2G2基因沉默或过表达对细胞活性没有影响;M5-90感染可提高细胞中UBE2G2基因的表达;M5-90感染过表达UBE2G2基因的细胞,可提高细胞中LDH水平和胞内细菌数量并可抑制CHOP的表达、IL-18和IFN-γ的水平;M5-90感染沉默UBE2G2基因的细胞,可提高细胞CHOP的表达、IL-18和IFN-γ的水平并可抑制LDH水平和胞内细菌数量。结果表明,泛素结合酶UBE2G2可调控胞内布鲁氏菌存活。 展开更多
关键词 布鲁氏菌 UBE2G2基因 RNA干扰 真核表达 胞内存活
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过表达泛素偶联酶(UBE2C)对小鼠胚胎发育的影响 被引量:1
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作者 向云龙 张亮 陈卓 《黑龙江动物繁殖》 2014年第1期3-7,共5页
UBE2C(Ubiquitin-conjugating enzyme 2C)属于E2泛素偶联酶家族成员,较为明确的作用是调控有丝分裂检验点以及控制细胞周期进程,但其在小鼠胚胎中的作用尚不明确。本文首先探讨了小鼠多种组织以及胚胎不同发育时期UBE2C表达图谱,其次在... UBE2C(Ubiquitin-conjugating enzyme 2C)属于E2泛素偶联酶家族成员,较为明确的作用是调控有丝分裂检验点以及控制细胞周期进程,但其在小鼠胚胎中的作用尚不明确。本文首先探讨了小鼠多种组织以及胚胎不同发育时期UBE2C表达图谱,其次在小鼠受精卵中通过显微注射过表达UBE2C分析其对小鼠早期胚胎发育的影响。结果表明:过表达UBE2C后导致胚胎2-细胞发育阻滞,证明UBE2C在胚胎发育过程中具有重要功能,其作用可能是通过降解卵母细胞储存的母源蛋白,从而确保小鼠早期胚胎正常发育进程。 展开更多
关键词 泛素偶联酶(UBE2C) 小鼠 受精卵 显微注射
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高表达UBE2S通过增加癌细胞干性促进肝癌的进程机制
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作者 陈浩 李振汉 +3 位作者 王明婷 卢林明 唐乾利 罗良平 《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期455-464,共10页
目的探究UBE2S在肝癌微环境不同细胞类型的特异性表达及对肝癌细胞干性的影响。方法使用TCGA数据库分析肝癌中UBE2S转录水平及其启动子甲基化水平差异,使用CPTAC数据库分析UBE2S蛋白水平差异。使用TISCH单细胞测序数据挖掘UBE2S在不同... 目的探究UBE2S在肝癌微环境不同细胞类型的特异性表达及对肝癌细胞干性的影响。方法使用TCGA数据库分析肝癌中UBE2S转录水平及其启动子甲基化水平差异,使用CPTAC数据库分析UBE2S蛋白水平差异。使用TISCH单细胞测序数据挖掘UBE2S在不同细胞类型中的表达,并分析细胞通讯的强度以及细胞群各自的关键转录因子。免疫组化验证UBE2S在肝癌组织中的表达;多色免疫荧光检测UBE2S在肝癌细胞以及T细胞的表达情况。利用shRNA敲低肝癌细胞HCC-LM3中的UBE2S,分为shCtrl(对照组)、shUBE2S-1(敲低组1)、shUBE2S-2(敲低组2)3个组,利用克隆形成实验、悬浮成球实验检测UBE2S敲低对HCC-LM3干性影响。结果UBE2S在TCGA数据库中非配对肿瘤组织中高表达(P<0.001),配对肿瘤组织中也高表达(P<0.001),随着肿瘤分级增高,转录水平逐渐增高(P<0.001);在CPTAC数据库中肝癌组织UBE2S蛋白水平表达也增高(P<0.001);肝癌中UBE2S启动子甲基化水平降低(P<0.001);TP53突变组UBE2S转录水平更高(P<0.001)。单细胞测序结果显示,UBE2S在T细胞等细胞群高表达;内皮与上皮及成纤维细胞之间的细胞交互强度较高,SMAD1等转录因子可能是Tprolif细胞关键转录因子。与正常组织相比,UBE2S在肝癌组织高表达;且在肝癌细胞和T细胞中均有较高表达。克隆形成实验显示:与shCtrl组相比,敲低UBE2S能减少肝癌细胞克隆形成数目(shUBE2S-1,P<0.05、P<0.01;shUBE2S-2,P<0.01、P<0.05);悬浮成球实验显示:与shCtrl组相比,敲低UBE2S能减少肝癌细胞肿瘤球形成数目(shUBE2S-1,P<0.05、P<0.01;shUBE2S-2,P<0.01、P<0.01)。结论UBE2S在肝癌组织T细胞中高表达,与预后不良相关,且其能促进肝癌细胞干细胞特性。 展开更多
关键词 单细胞测序 UBE2S 肝癌 T细胞
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