目的应用网络药理学方法,研究中药西洋参治疗急性肝损伤的关键作用靶点以及主要信号通路。方法利用中药系统药理数据库和分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology,TCMSP)查找获得西洋参的主要化学成分,在有机小分...目的应用网络药理学方法,研究中药西洋参治疗急性肝损伤的关键作用靶点以及主要信号通路。方法利用中药系统药理数据库和分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology,TCMSP)查找获得西洋参的主要化学成分,在有机小分子生物活性数据库(Pubchem)中获取成分的分子式,在化合物靶标预测平台(SwissTarget Prediction)取得相关靶基因,在基因卡片数据库(GeneCards)采集急性肝损伤相关靶点。通过在线工具Venny2.1取得西洋参和急性肝损伤交集靶基因,在蛋白互作关系的数据库(STRING)构建交集靶蛋白相互作用网络并经Cytoscape 3.7.1软件可视化处理。交集靶基因的GO功能和KEGG通路富集分析均在David网站上进行。结果通过数据分析共获得西洋参的10个有效成分、330个药物相关靶点、急性肝损伤疾病相关靶点7795个、药物-疾病交集靶点291个。西洋参治疗急性肝损伤的作用机制涉及216个生物学进程、30个细胞组成、44个分子功能和116条信号通路。结论西洋参治疗急性肝损伤作用机制,主要与丝裂原活化蛋白激酶差异基因3(mitogen-activated protein kinase 3,MAPK3)、血管上皮生长因子A(vascular endothelial growth factor A,VEGFA)、热休克蛋白90AA1(heat shock protein 90AA1,HSP90AA1)、半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶3(Caspase-3,CASP3)、信号转导和转录激活因子3(signal transducer and activator of transcription 3,STAT3)等关键蛋白及PI3K-Akt、Cancer、MAPK等信号通路相关。展开更多
文摘目的应用网络药理学方法,研究中药西洋参治疗急性肝损伤的关键作用靶点以及主要信号通路。方法利用中药系统药理数据库和分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology,TCMSP)查找获得西洋参的主要化学成分,在有机小分子生物活性数据库(Pubchem)中获取成分的分子式,在化合物靶标预测平台(SwissTarget Prediction)取得相关靶基因,在基因卡片数据库(GeneCards)采集急性肝损伤相关靶点。通过在线工具Venny2.1取得西洋参和急性肝损伤交集靶基因,在蛋白互作关系的数据库(STRING)构建交集靶蛋白相互作用网络并经Cytoscape 3.7.1软件可视化处理。交集靶基因的GO功能和KEGG通路富集分析均在David网站上进行。结果通过数据分析共获得西洋参的10个有效成分、330个药物相关靶点、急性肝损伤疾病相关靶点7795个、药物-疾病交集靶点291个。西洋参治疗急性肝损伤的作用机制涉及216个生物学进程、30个细胞组成、44个分子功能和116条信号通路。结论西洋参治疗急性肝损伤作用机制,主要与丝裂原活化蛋白激酶差异基因3(mitogen-activated protein kinase 3,MAPK3)、血管上皮生长因子A(vascular endothelial growth factor A,VEGFA)、热休克蛋白90AA1(heat shock protein 90AA1,HSP90AA1)、半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶3(Caspase-3,CASP3)、信号转导和转录激活因子3(signal transducer and activator of transcription 3,STAT3)等关键蛋白及PI3K-Akt、Cancer、MAPK等信号通路相关。
