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题名肿瘤坏死因子与其受体相互作用的计算机模拟研究
被引量:2
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作者
王国力
周晓巍
黄培堂
黄翠芬
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机构
军事医学科学院生物工程研究所
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出处
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
1998年第3期280-288,共9页
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基金
中国博士后科学基金
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文摘
利用同源模建方法,以TNFR55受体胞外区的晶体结构为参考模板,预测了TNFR75受体胞外区Cys18~Phe147片段的三维结构.根据R55受体胞外区与LT相结合的复合物的晶体结构,预测了TNF与R55及R75胞外区的复合物的三维结构,模拟了TNF与受体之间的相互作用.由于TNF与受体的作用形式是三聚体对三聚体,因此在模拟TNF与受体相互作用时选择了包括一个非对称的TNF三聚体和一个受体(R55或R75)单体的模拟系统.结合已有的突变体实验结果,利用计算机模拟分析手段,发现了一些TNF突变体之所以具有受体选择性的三维结构基础和发挥了关键作用的氨基酸残基以及这些残基之间的主要作用形式.研究深化了对已有的突变体实验结果的认识,建立了不同的实验结果之间的内在关联,为以后有目的的新型突变体设计和实验研究打下了基础.
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关键词
受体
同源模建
结构功能关系
肿瘤坏死因子
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Keywords
tnfreceptor complex,homology modeling,structurefunction relationship
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分类号
Q516
[生物学—生物化学]
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题名用计算机模拟研究人肿瘤坏死因子的结构功能
被引量:1
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作者
陈建军
孙苗
陈常庆
王德宝
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机构
中国科学院上海生物工程研究中心
中国科学院上海生物化学研究所
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出处
《高技术通讯》
EI
CAS
CSCD
2000年第2期6-12,5,共8页
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基金
86 3计划资助项目!( 86 3 10 3 13 0 1 0 4)
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文摘
人肿瘤坏死因子(humantumornecrosisfactor,hTNFα)的生物学活性是由两种不同受体(TNFR1/R55和TNFR2/R75)介导的。为了了解hTNFα与这两种受体相互作用的异同之处,以便指导hTNFα的蛋白质工程改造,根据LT与R55受体胞外区复合物的晶体结构及hTNFα和LT与两种受体结合的相似性,预测了hTNFα与其两种受体胞外区形成复合物的三维结构模型。并根据所得的计算机模型,分析了hTNFα和受体结合前后的溶剂可及表面积的变化,以及受体与hTNFα之间可能形成的氢键、明显的静电作用和疏水作用。然后根据模型对hTNFα的结构-功能关系进行了分析,并以此为基础设计了几个新的hTNFα突变体。
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关键词
人肿瘤坏死因子
计算机模拟
结构功能关系
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Keywords
htnfα receptor complex, homology modeling, structure function relationship, mutant
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分类号
R73-354
[医药卫生—肿瘤]
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