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题名苹果TIPs亚家族成员鉴定与干旱胁迫响应分析
被引量：2
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作者
刘河
卢世雄
梁国平
毛娟
陈佰鸿
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机构
甘肃农业大学园艺学院
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出处
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第7期1083-1093,共11页
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基金
甘肃省科技重大专项(22ZD6NA045)
甘肃省2023年现代丝路寒旱农业科技项目(KJZC-2023-13)。
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文摘
【目的】鉴定并分析苹果液泡膜内在蛋白(TIP)亚家族成员,探究该亚家族成员在苹果干旱胁迫下的表达模式,为研究苹果抗旱性基因资源挖掘和利用提供参考。【方法】通过生物信息学方法对苹果MdTIPs全基因组进行鉴定,分析其家族成员的理化性质、基因结构、保守基序、顺式作用元件、系统进化树等,并结合实时荧光定量PCR(qRT-PCR)分析其在干旱胁迫下不同器官中的表达模式。【结果】在苹果基因组中,共检索到13个MdTIP基因,大部分成员亚细胞定位预测在质膜上,分布于10条染色体上,且每条染色体定位有1~3个成员;该基因家族成员的启动子区域包含多种响应激素和逆境胁迫的应答元件;qRT-PCR显示,MdTIPs亚家族成员在根中除MdTIP1;1外其余均受上调表达,且MdTIP1;3和MdTIP1;4与对照相比,分别上调表达了5.27倍和5.69倍,表明其是参与调控干旱胁迫的关键基因。【结论】鉴定并提供了MdTIPs亚家族成员信息,10个MdTIPs亚家族成员在根、茎、叶中差异表达,12个亚家族成员在根中高表达。
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关键词
苹果
水通道蛋白
tips亚家族基因
水分运输
生物信息学
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Keywords
apple
aquaporin
tips subfamily
water transport
bioinformatics
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分类号
Q786
[生物学—分子生物学]
S661.1
[农业科学—果树学]
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