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甘蓝型油菜TFⅢA型锌指蛋白基因鉴别和表达模式 被引量:1
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作者 柳琼 黄毅 +4 位作者 陶章生 黄顺谋 王新发 黄邦全 刘贵华 《中国油料作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第5期562-571,共10页
植物TFⅢA型锌指蛋白的锌指区含有保守的QALGGH区,属于C2H2型转录因子,参与调控植物生长发育和逆境胁迫应答.参照拟南芥AtZFP基因的C2H2结构域氨基酸序列,采用生物信息学方法鉴定了46个甘蓝型油菜TFⅢA型锌指蛋白基因,分析了基因结构、... 植物TFⅢA型锌指蛋白的锌指区含有保守的QALGGH区,属于C2H2型转录因子,参与调控植物生长发育和逆境胁迫应答.参照拟南芥AtZFP基因的C2H2结构域氨基酸序列,采用生物信息学方法鉴定了46个甘蓝型油菜TFⅢA型锌指蛋白基因,分析了基因结构、生化特性、进化关系和基因表达模式.结果表明:42个基因为单锌指蛋白基因,4个为多锌指蛋白基因;40个基因不含内含子,6个基因含内含子;46个基因的氨基酸序列同源性变幅为9.0% ~99.2%,氨基酸序列保守性差异明显,亚类成员间包含相同的保守基序,亚类间的保守基序不同;PlantCARE分析发现其启动子区富含激素、非生物胁迫及特定生理过程响应的顺式作用元件;RNA-seq分析表明,部分基因在甘蓝型油菜品种中双11号的根、初花期雌蕊和角果中特异表达. 展开更多
关键词 甘蓝油菜 tfⅲa型锌指蛋白基因 基因结构 保守基序 表达模式
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水稻TFⅢA型锌指蛋白基因ZFP207的克隆和表达分析 被引量:6
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作者 孟繁君 黄骥 +2 位作者 鲍永美 江燕 张红生 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2010年第4期387-392,共6页
锌指蛋白是一类重要的转录因子,广泛参与植物的生长发育和胁迫应答过程。文章使用生物信息学方法从水稻中预测并克隆了一个TFⅢA型锌指蛋白基因ZFP207(GenBank登陆号:AK063147.1),该基因包含一个567bp的开放阅读框,编码一条188个氨基酸... 锌指蛋白是一类重要的转录因子,广泛参与植物的生长发育和胁迫应答过程。文章使用生物信息学方法从水稻中预测并克隆了一个TFⅢA型锌指蛋白基因ZFP207(GenBank登陆号:AK063147.1),该基因包含一个567bp的开放阅读框,编码一条188个氨基酸组成的多肽,其编码产物的预测分子量为20.72kDa,等电点为9.67。锌指蛋白ZFP207含有一个典型的TFⅢA型锌指结构,并且在C端含有一个可能具有转录抑制功能的EAR-motif,但不具有任何已知的核定位信号。系统发生分析结果表明,ZFP207与植物中已经发现的单锌指蛋白亲缘关系较近。通过RT-PCR方法分析了ZFP207基因在成株期水稻不同组织中的表达,发现ZFP207在茎和叶中表达量较高,而在穗和根中表达量较低。在酵母中的转录激活实验结果显示,ZFP207在酵母中不具有转录激活功能。 展开更多
关键词 水稻 锌指蛋白 tfⅲa ZFP207基因
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澳洲坚果锌指蛋白基因MiZFP9的克隆与功能分析 被引量:1
3
作者 杨祥燕 蔡元保 +3 位作者 黄思婕 李季东 潘如军 黄运鹏 《南方农业学报》 北大核心 2025年第2期544-552,共9页
【目的】克隆澳洲坚果CCCH型锌指蛋白基因MiZFP9,并分析其在不同组织及低温、干旱胁迫下的表达情况,为深入探究澳洲坚果锌指蛋白基因的抗寒和耐旱分子机理提供理论依据。【方法】从澳洲坚果叶片克隆MiZFP9基因,并对其进行生物信息学分... 【目的】克隆澳洲坚果CCCH型锌指蛋白基因MiZFP9,并分析其在不同组织及低温、干旱胁迫下的表达情况,为深入探究澳洲坚果锌指蛋白基因的抗寒和耐旱分子机理提供理论依据。【方法】从澳洲坚果叶片克隆MiZFP9基因,并对其进行生物信息学分析。通过实时荧光定量PCR检测MiZFP9基因在不同组织中的表达特性及低温和干旱胁迫下的表达模式。【结果】从澳洲坚果叶片中克隆获得MiZFP9基因,属于CCCH型锌指蛋白基因C3H64亚类,其编码蛋白含有活性位点、Zn2+结合位点及CCCH型锌指蛋白的典型结构域ZF_C3H,为稳定的亲水性蛋白,以丝氨酸磷酸化为主,可能定位于细胞质,属于非分泌型蛋白。MiZFP9蛋白的高级结构主要由无规则卷曲、α-螺旋和延伸链交错组成。MiZFP9基因在Own Choice品种的不同组织中均显著差异表达(P<0.05,下同),其中在刚开放和未开放小花中的相对表达量最高,其次是根和叶,而在茎的相对表达量则最低。在低温胁迫和干旱胁迫下,MiZFP9基因在Own Choice和HAES695品种的相对表达量较对照(处理0 h)均显著上调,其中MiZFP9基因在Own Choice品种中呈先升高后降低的表达模式,在HAES695品种的相对表达量呈波动式变化模式,出现2个峰值,说明其在不同品种中的响应模式存在差异。【结论】MiZFP9基因具有组织表达特异性,并在低温和干旱处理后表达水平明显升高,推测MiZFP9在澳洲坚果组织生长发育及响应低温和干旱胁迫中发挥重要的正向调控作用。 展开更多
关键词 澳洲坚果 CCCH锌指蛋白 基因克隆 功能分析
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大豆C_2H_2型锌指蛋白基因SCTF-1的克隆及功能分析 被引量:10
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作者 宋冰 王丕武 +7 位作者 付永平 范旭红 夏海峰 高玮 洪洋 王贺 张卓 马建 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2012年第6期749-756,共8页
锌指蛋白是一类具有手指型结构的蛋白质,其中一些锌指蛋白是转录因子,对真核生物的生长发育及非生物逆境胁迫的耐受能力都有着重要作用。文章从大豆(Glycine max(L.)Merr.)中克隆了一个新的C2H2型锌指蛋白基因SCTF-1(GenBank登录号:JQ69... 锌指蛋白是一类具有手指型结构的蛋白质,其中一些锌指蛋白是转录因子,对真核生物的生长发育及非生物逆境胁迫的耐受能力都有着重要作用。文章从大豆(Glycine max(L.)Merr.)中克隆了一个新的C2H2型锌指蛋白基因SCTF-1(GenBank登录号:JQ692081),该基因包含一个699 bp的开放阅读框,编码233个氨基酸,无内含子,有两个典型的C2H2型锌指结构。锌指结构中有植物锌指蛋白特有的保守氨基酸序列QALGGH。经软件预测分析,其等电点pI=8.33,分子量24.9 kDa。农杆菌介导的洋葱表皮细胞GFP瞬时表达实验结果表明,SCTF-1蛋白能够定位到细胞核中。通过RT-PCR检测发现该基因在大豆叶和花中的表达量较高,在茎和根的表达量相对较低。在对大豆幼苗的低温胁迫中,SCTF-1基因的表达量明显增加。将SCTF-1基因转入烟草(Nicotiana tabacum L.)中,发现SCTF-1基因的过量表达能够明显提高转基因烟草的耐冷能力。 展开更多
关键词 大豆 锌指蛋白 C2H2 SCtf-1基因 亚细胞定位 耐冷能力
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TFⅢA型锌指蛋白及在提高植物耐逆性中的作用 被引量:17
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作者 黄骥 张红生 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2007年第8期915-922,共8页
TFⅢA型锌指蛋白属于典型的C2H2型锌指蛋白,锌指区具有CX2-4CX3FX5LX2HX3-5H的保守结构。已有研究表明不同植物的TFⅢA型锌指蛋白在非生物胁迫应答反应中发挥了关键的作用。利用TFⅢA家族锌指蛋白基因进行植物耐逆性的遗传改良,可能是... TFⅢA型锌指蛋白属于典型的C2H2型锌指蛋白,锌指区具有CX2-4CX3FX5LX2HX3-5H的保守结构。已有研究表明不同植物的TFⅢA型锌指蛋白在非生物胁迫应答反应中发挥了关键的作用。利用TFⅢA家族锌指蛋白基因进行植物耐逆性的遗传改良,可能是今后植物耐逆基因工程改良的又一个重要方向。 展开更多
关键词 锌指蛋白 tfⅲa 转录抑制因子 非生物胁迫
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冷胁迫下普通油茶CCCH型锌指蛋白基因家族的鉴定和分析 被引量:2
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作者 邢凯峰 姚杏子 +5 位作者 周军 谢昊星 陈容平 赵耀 戎俊 张剑 《经济林研究》 北大核心 2024年第1期11-19,共9页
【目的】为挖掘和利用耐寒普通油茶Camellia oleifera遗传资源提供参考。【方法】基于普通油茶的冷胁迫转录组数据,对其CCCH型锌指蛋白基因进行鉴定,并对CCCH型锌指蛋白进行理化性质分析、系统发育分析、保守结构域预测、二级结构预测... 【目的】为挖掘和利用耐寒普通油茶Camellia oleifera遗传资源提供参考。【方法】基于普通油茶的冷胁迫转录组数据,对其CCCH型锌指蛋白基因进行鉴定,并对CCCH型锌指蛋白进行理化性质分析、系统发育分析、保守结构域预测、二级结构预测等相关生物信息学分析,并以庐山高海拔油茶(LSG)和栽培油茶品种赣无1(GW1)为材料,对CCCH型锌指蛋白基因在冷胁迫下的表达情况进行分析。【结果】在普通油茶的冷胁迫转录组数据中共鉴定到24个CCCH型锌指蛋白基因,参考水稻分类方法,将24个CCCH型锌指蛋白聚类到2个亚家族中。保守基序分析结果表明,在24个基因中仅有3种CCCH型锌指蛋白基序类型,即C-X8-C-X5-C-X3-H、C-X7-C-X5-C-X3-H和C-X5-C-X4-C-X3-H,数目分别为92、4和4。转录组表达谱分析结果表明:在野外冷胁迫试验中CoC3H17基因在D4、D5和D6时期的表达量高于D1、D2和D3时期,在室内冷胁迫试验中庐山高海拔油茶和赣无1的CoC3H17基因一直表现为更高的转录本丰度;CoC3H14和CoC3H24基因在野外试验的D4、D5和D6时期均表现为表达量明显上升,且在室内冷胁迫试验中庐山高海拔油茶的这2个基因的表达量高于赣无1。【结论】CoC3H17、CoC3H14和CoC3H24基因可能是普通油茶应对冷胁迫的关键基因。 展开更多
关键词 普通油茶 CCCH锌指蛋白基因家族 生物信息学分析 冷胁迫 转录组
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野生大豆(Glycine soja)C2H2型锌指蛋白基因的克隆与序列分析 被引量:8
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作者 白晶 张必弦 +1 位作者 李新玲 徐香玲 《大豆科学》 CAS CSCD 北大核心 2009年第1期21-25,共5页
根据大豆SCOF-1的CDs区设计特异引物,通过PCR和RT-PCR从野生大豆01-197中克隆到含两个锌指的C2H2型锌指蛋白基因,命名为GjC2H2,GenBank登录号为FJ172776。对其进行核苷酸和氨基酸同源性分析及系统发生分析,结果表明:该基因内部无内含子... 根据大豆SCOF-1的CDs区设计特异引物,通过PCR和RT-PCR从野生大豆01-197中克隆到含两个锌指的C2H2型锌指蛋白基因,命名为GjC2H2,GenBank登录号为FJ172776。对其进行核苷酸和氨基酸同源性分析及系统发生分析,结果表明:该基因内部无内含子,长度为702bp,分子量为25.13KD,与其他锌指蛋白基因有很高的同源性,推测其与植物抗逆性有关。 展开更多
关键词 野生大豆 C2H2锌指蛋白 基因克隆
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Ⅲ型神经中丝蛋白基因与中国高度近视人群相关性的研究 被引量:4
8
作者 李疆 张清炯 +9 位作者 肖学珊 黎仕强 贾小云 郭莉 郭向明 傅容 李家璋 李鸵 张丰生 李炜 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2002年第5期523-526,共4页
为了检测peripherin基因(PRPH)的突变与高度近视的病因有无相关关系,采用PCR-SSCP检测180例中国人高度近视先证者及60例正常人中PRPH基因所有外显子有无突变;对有突变的外显子区域进行克隆测序。结果表明,分析180例高度近视先证者PRP... 为了检测peripherin基因(PRPH)的突变与高度近视的病因有无相关关系,采用PCR-SSCP检测180例中国人高度近视先证者及60例正常人中PRPH基因所有外显子有无突变;对有突变的外显子区域进行克隆测序。结果表明,分析180例高度近视先证者PRPH基因编码区9个外显子及其邻近内含子,分别发现有下列核苷酸改变:密码子21TTC→TTT(Phe21Phe、4/180),nt2138C→G(IVS3、1/180),密码子277GCC→ACC(Ala277Thr、8/180),密码子237CCA→TCA(Arg237stop、1/180),密码子292GCG→GCA(Ala292Ala,1/180),密码子361CUG→CUC(Leu361Leu,12/180),密码子369AAA→AAG(Lys369Lys,12/180),nt3331G→C(IVS7、3/180),其中GCC277ACC为错义突变(Ala277Thr);CCA237TCA为无义突变(Arg237stop);密码子361CUG→CUC,密码子369AAA→AAG属于同义突变并且相连锁。Ala277Thr突变尚存在于正常人群中(1/60),亦存在于患者正常亲属中;Arg237ston仅见于一个常染色体隐性遗传家系的患者中,为杂合性突变。分析180例高度近、视先证者PRPH基因,未发现致病突变,可排除PRPH基因与高度近视病因的相关性。在中国人群中PRPH基因有多种变异。 展开更多
关键词 神经中丝蛋白基因 中国 高度近视 人群 相关性
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沙冬青RING型锌指蛋白基因AmRFP1的克隆与功能初步分析 被引量:2
9
作者 任美艳 杨晓茹 +4 位作者 殷玉梅 郭慧琴 张艳霞 薛敏 王茅雁 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第12期2317-2324,共8页
利用RT-PCR方法,从强抗逆植物蒙古沙冬青克隆到1个受寒旱诱导的锌指蛋白基因AmRFP1。预测其编码蛋白由366个氨基酸残基组成,其中含有1个C3H2C3型锌指结构域,故属于RING-H2(C3H2C3)型锌指蛋白。该蛋白还含有2个跨膜区,很可能定位于细胞... 利用RT-PCR方法,从强抗逆植物蒙古沙冬青克隆到1个受寒旱诱导的锌指蛋白基因AmRFP1。预测其编码蛋白由366个氨基酸残基组成,其中含有1个C3H2C3型锌指结构域,故属于RING-H2(C3H2C3)型锌指蛋白。该蛋白还含有2个跨膜区,很可能定位于细胞质膜。半定量RT-PCR分析表明,在不同季节野外生长沙冬青植株嫩叶中,AmRFP1在夏季只有低水平表达,进入秋季后表达量明显增加,尤其在秋末冬初其表达量迅速增加并达到全年最高峰,但在进入最寒冷的隆冬后又回落至秋季水平并维持到翌年春季基本未变。将该基因在拟南芥中超表达,则明显降低了转基因拟南芥的抗冻性。 展开更多
关键词 沙冬青 RING锌指蛋白 基因克隆 野外表达 功能分析
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条锈菌诱导的小麦C3HC4型锌指蛋白基因的克隆及其特征分析 被引量:2
10
作者 张毅 张岗 +3 位作者 徐进 郭军 黄丽丽 康振生 《西北农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第10期49-54,共6页
应用电子克隆和RT-PCR方法,从小麦叶片中首次分离出1个条锈菌诱导的编码C3HC4型锌指蛋白基因的cDNA序列,暂被命名为TaZFP1。TaZFP1包含一个完整的849 bp的开放阅读框,编码282个氨基酸,具有C3HC4保守结构域;小麦TaZFP1氨基酸序列与水稻Os... 应用电子克隆和RT-PCR方法,从小麦叶片中首次分离出1个条锈菌诱导的编码C3HC4型锌指蛋白基因的cDNA序列,暂被命名为TaZFP1。TaZFP1包含一个完整的849 bp的开放阅读框,编码282个氨基酸,具有C3HC4保守结构域;小麦TaZFP1氨基酸序列与水稻OsZFP1相似性达89%,与玉米ZmZFP1相似性达81%。TaZFP1在小麦根、茎、叶组织中表达量基本一致。在小麦与条锈菌的亲和、非亲和互作中,TaZFP1基因均受条锈菌诱导高水平表达,且非亲和组合表达量高于亲和组合,表明TaZFP1可能参与小麦对条锈菌的防御反应。 展开更多
关键词 条锈菌 小麦 C3HC4锌指蛋白 电子克隆 基因表达
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基于RNA-seq数据发掘响应干旱的谷子C2H2型锌指蛋白基因 被引量:4
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作者 齐帆 范兴 +3 位作者 陈义 王晶慧 许慧晶 马芳芳 《江苏农业科学》 2019年第2期41-45,共5页
C2H2型锌指蛋白在植物响应逆境胁迫以及激素信号转导过程中起着重要作用,为了发掘响应干旱胁迫的谷子C2H2型锌指蛋白基因(SiC2H2),利用转录组测序技术构建谷子聚乙二醇(PEG)处理前后转录组文库,根据表达谱数据鉴定出11个SiC2H2差异表达... C2H2型锌指蛋白在植物响应逆境胁迫以及激素信号转导过程中起着重要作用,为了发掘响应干旱胁迫的谷子C2H2型锌指蛋白基因(SiC2H2),利用转录组测序技术构建谷子聚乙二醇(PEG)处理前后转录组文库,根据表达谱数据鉴定出11个SiC2H2差异表达基因,对其进行理化性质、启动子元件等部分生物信息学分析和进化树及基因结构分析。实时荧光定量逆转录PCR(RT-PCR)验证结果表明,随机选取的4个基因在PEG胁迫前后的表达特点与表达谱数据基本一致。研究结果为后续进一步研究C2H2型锌指蛋白在谷子抗旱性中的作用以及谷子抗旱分子育种提供了理论依据。 展开更多
关键词 谷子 C2H2锌指蛋白 干旱胁迫 差异表达基因
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核桃Q型C2H2锌指蛋白基因家族全基因组鉴定及表达分析 被引量:2
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作者 马乃膺 雒宏佳 +5 位作者 李建红 辛国 张瑞 王双成 张仲兴 王延秀 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第6期920-934,共15页
【目的】Q型C2H2锌指蛋白在植物抵抗非生物胁迫中起重要作用。为深入了解核桃Q型C2H2锌指蛋白基因家族在核桃全基因组中的特征,对核桃Q型C2H2锌指蛋白(JrZFP)基因家族进行全基因组鉴定与分析,并研究其在核桃干旱和盐胁迫应答过程中的表... 【目的】Q型C2H2锌指蛋白在植物抵抗非生物胁迫中起重要作用。为深入了解核桃Q型C2H2锌指蛋白基因家族在核桃全基因组中的特征,对核桃Q型C2H2锌指蛋白(JrZFP)基因家族进行全基因组鉴定与分析,并研究其在核桃干旱和盐胁迫应答过程中的表达模式。【方法】利用生物信息学方法鉴定了核桃全基因组中的Q型C2H2锌指蛋白基因家族成员,并对其理化性质、染色体定位、进化关系和基因结构进行分析;根据JrZFP基因家族进化树随机挑选15个JrZFP基因,并通过实时荧光定量PCR(real-time quantitative PCR,qRT-PCR)方法检测15个基因在干旱和盐胁迫下的响应特性。【结果】在核桃中共鉴定出82个Q型C2H2锌指蛋白基因,其蛋白质序列长度介于59~636个氨基酸之间,亚细胞定位主要位于细胞核中;该基因家族成员不均匀分布在15条染色体上,其中有11对JrZFPs基因为串联重复基因,63个JrZFP基因参与片段重复事件;基因结构分析表明,75个JrZFP基因无内含子,其余成员含有1~10个外显子;上游启动子区分析发现,该基因家族成员含有参与逆境胁迫和激素响应相关的顺式作用元件。表达分析结果显示,在盐胁迫下15个JrZFP基因均显著上调,以JrZFP55最为明显,推测JrZFP55在核桃NaCl胁迫中起正向调节作用;在干旱胁迫下15个JrZFP基因中上调6个,其中JrZFP12上调最为显著,下调9个,以JrZFP4、JrZFP55和JrZFP57下调程度最大,推测这3个基因在核桃干旱胁迫中起负调控作用。【结论】核桃全基因组中有82个JrZFP家族成员都具有Q型C2H2锌指蛋白典型结构域,且通过qRT-PCR对随机挑选基因进行分析以发现可能参与干旱和盐胁迫的JrZFPs基因,为深入研究核桃JrZFP参与干旱胁迫和盐胁迫提供理论依据。 展开更多
关键词 核桃 QC2H2锌指蛋白基因家族 基因表达
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载脂蛋白C-Ⅲ基因多态性与颈动脉粥样硬化的相关性研究
13
作者 穆鑫 刘少奎 +3 位作者 王筱梅 王翠荣 洪军 初楠 《中华老年心脑血管病杂志》 CAS 北大核心 2010年第8期713-715,共3页
目的在基因水平上定量分析并探讨人载脂蛋白C-Ⅲ(apolipoproteinC-Ⅲ,apoC-Ⅲ)基因多态性与颈动脉粥样硬化(CAS)的相关性。方法选择住院患者和体检者共700例,根据彩色多普勒超声检查是否有CAS形成,分为CAS组(400例)和对照组(300例)。取... 目的在基因水平上定量分析并探讨人载脂蛋白C-Ⅲ(apolipoproteinC-Ⅲ,apoC-Ⅲ)基因多态性与颈动脉粥样硬化(CAS)的相关性。方法选择住院患者和体检者共700例,根据彩色多普勒超声检查是否有CAS形成,分为CAS组(400例)和对照组(300例)。取静脉血行血生化检测和提取全血DNA,结合Taqman探针,通过荧光实时定量PCR,同时分析apoC-Ⅲ—625和—455位点变异与CAS、血脂的关系。结果 CAS组患者apoCⅢ—455C纯合子基因型和—625del—455c基因型的比例明显高于对照组(70.7% vs 52.8%,50.0% vs 25.2%,P<0.05)。CAS伴高TG、单纯高TG受试者apoC-Ⅲ—455C基因的量明显低于CAS不伴高TG和非CAS非高TG受试者(P<0.01)。apoC-Ⅲ—455C基因的量与CAS风险呈正相关。结论 apoC-Ⅲ—455C基因通过脂代谢异常增加CAS的风险。—455C纯合子基因型携带者具有高的患CAS风险。apoC-Ⅲ-625del与-455C有协同增加CAS风险的作用。 展开更多
关键词 颈动脉疾病 载脂蛋白C 超声检查 多普勒 基因 危险因素
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矮牵牛冷响应锌指蛋白基因PhTZF1的分离与表达分析 被引量:7
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作者 宁露云 李蓓 +1 位作者 包满珠 张蔚 《华中农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第2期24-30,共7页
利用矮牵牛基因表达谱芯片筛选出应答低温胁迫的关键基因,从中发现1个CCCH型的锌指蛋白基因PhTZF1。通过RT-PCR分离获得该基因的cDNA全长为2 085bp,预测其编码694个氨基酸,含有2个CCCH型锌指蛋白保守结构域。系统进化树分析发现,PhTZF1... 利用矮牵牛基因表达谱芯片筛选出应答低温胁迫的关键基因,从中发现1个CCCH型的锌指蛋白基因PhTZF1。通过RT-PCR分离获得该基因的cDNA全长为2 085bp,预测其编码694个氨基酸,含有2个CCCH型锌指蛋白保守结构域。系统进化树分析发现,PhTZF1与拟南芥AtSZF1相似度最高。利用半定量RT-PCR检测其在根、茎、叶和花中的表达特性发现,正常生长条件下该基因在各组织中的表达都较弱;利用实时定量PCR检测其在低温、干旱、ABA、MeJA、高盐和高渗胁迫处理下的表达情况发现,PhTZF1表现出不同程度的上调,其中对低温胁迫最为敏感且上调倍数最高,初步推测该基因与矮牵牛应答低温、干旱等非生物逆境相关。 展开更多
关键词 矮牵牛 CCCH 锌指蛋白 非生物逆境 基因表达谱
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水稻C2C2锌指蛋白基因OsLSD2对日本晴品种生长及氮素利用的影响 被引量:2
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作者 童君 陈景光 +2 位作者 朱静雯 范晓荣 徐国华 《中国水稻科学》 CAS CSCD 北大核心 2014年第4期435-441,共7页
LSD1基因家族是一类特殊的C2C2型锌指蛋白基因。OsLSD2是LSD1型基因家族的一员。已知LSD1基因参与了植物抗病信号途径。为了培育环境友好型水稻,我们研究了OsLSD2在日本晴中的过量表达。T3代转基因水稻表型表现为株高降低,分蘖数平均减... LSD1基因家族是一类特殊的C2C2型锌指蛋白基因。OsLSD2是LSD1型基因家族的一员。已知LSD1基因参与了植物抗病信号途径。为了培育环境友好型水稻,我们研究了OsLSD2在日本晴中的过量表达。T3代转基因水稻表型表现为株高降低,分蘖数平均减少2个,结实率只有64%~72%,单株产量下降33%~42%,生育期提前15d,对氮素的吸收利用率降低等,说明该基因过量表达显著抑制水稻的生长和氮素转运。 展开更多
关键词 水稻 LSD1锌指蛋白基因 过量表达 氮素转运
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Ⅲ型纤连蛋白组件包含蛋白5通过抑制ERK1/2磷酸化抑制C3H10T1/2细胞成脂分化
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作者 黑伟 何志强 +7 位作者 张燕伟 张万锋 蔡春波 杨阳 高鹏飞 郭晓红 曹果清 李步高 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第5期644-652,共9页
旨在探究Ⅲ型纤连蛋白组件包含蛋白5(typeⅢdomain-containing protein5,FNDC5)对C3H10T1/2细胞成脂分化的调控作用。利用qRT-PCR和Western印迹检测FNDC5在C3H10T1/2细胞成脂分化过程中的时序性表达规律;构建慢病毒包被的过表达/干扰FN... 旨在探究Ⅲ型纤连蛋白组件包含蛋白5(typeⅢdomain-containing protein5,FNDC5)对C3H10T1/2细胞成脂分化的调控作用。利用qRT-PCR和Western印迹检测FNDC5在C3H10T1/2细胞成脂分化过程中的时序性表达规律;构建慢病毒包被的过表达/干扰FNDC5载体,转染C3H10T1/2细胞,采用qRT-PCR检测成脂分化关键基因的表达情况,油红O染色检测脂滴含量,利用Western印迹检测细胞外信号调节激酶(extracellularregulatedkinase1/2,ERK1/2)及磷酸化ERK1/2(P-ERK1/2)的表达水平。C3H10T1/2细胞成脂诱导分化8d,Fndc5的表达量明显升高(P<0.05);C3H10T1/2细胞中过表达FNDC5,成脂分化关键基因过氧化物酶体增殖物激活受体-γ(peroxisome proliferator-activated receptor-γ,PPARγ)、脂肪酸结合蛋白4(fatty acid binding protein 4,FABP4)和CCAAT增强子结合蛋白α(CCAAT enhancer binding protein alpha, C/EBPα)的表达量显著降低(P<0.01),CCAAT增强子结合蛋白β(CCAAT enhancer binding protein beta, C/EBPβ)表达量明显降低(P<0.05),脂滴含量明显减少,P-ERK1/2的含量明显降低(P<0.05)。C3H10T1/2细胞中干扰FNDC5,成脂分化关键基因PPARγ、C/EBPβ、FABP4和C/EBPα的表达量显著升高(P<0.01),脂滴含量明显增加,P-ERK1/2的含量明显升高(P<0.05)。本研究发现,FNDC5可以通过抑制ERK1/2的磷酸化水平,抑制C3H10T1/2细胞的成脂分化,为FNDC5调控脂肪沉积的机制研究提供参考数据。 展开更多
关键词 C3H10T1/2细胞 成脂分化 纤连蛋白组件包含蛋白5基因 ERK1/2
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E3泛素连接酶接头蛋白SPOP介导的底物非降解型泛素化修饰 被引量:5
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作者 林婷 曹心怡 金晓锋 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第7期874-882,共9页
蛋白质的翻译后修饰是保证其能正常行使功能的前提,泛素化修饰是维持细胞正常蛋白质水平和活性的重要翻译后修饰类型。近年来,大量研究发现,E3泛素连接酶斑点型锌指结构蛋白(speckle-type POZ protein,SPOP)在诸多肿瘤与遗传疾病中存在... 蛋白质的翻译后修饰是保证其能正常行使功能的前提,泛素化修饰是维持细胞正常蛋白质水平和活性的重要翻译后修饰类型。近年来,大量研究发现,E3泛素连接酶斑点型锌指结构蛋白(speckle-type POZ protein,SPOP)在诸多肿瘤与遗传疾病中存在突变,这些突变主要集中在识别底物的MATH结构域影响了与底物之间的结合,进而影响底物的蛋白质水平、定位及活性,并扰乱正常生理功能从而诱发疾病。野生型SPOP能正常结合底物,这些底物绝大多数由SPOP泛素化后进入蛋白酶体途径降解,而也有个别重要底物泛素化后仅是影响其功能改变而并非蛋白质水平的变化。鉴于SPOP在细胞内的重要功能,本文将对SPOP的底物泛素化修饰类型及功能进行详细介绍。包括:泛素-蛋白酶体系统(ubiquitin-proteasome system,UPS),SPOP的结构、功能和作用途径以及SPOP的非降解型泛素化修饰。重点围绕SPOP的3个非降解底物:髓样分化因子88(myeloid differentiation primary response protein 88,MyD88)介导的NF-κB信号通路、组蛋白macroH2A1(macroH2A.1 histone,macroH2A1)的X染色体沉默信号通路,以及成蛋白INF2(inverted formin 2)介导的线粒体分裂融合等信号通路,将其抑制肿瘤发生发展的分子机制进行总结,以期为肿瘤精准靶向治疗提供新思路。 展开更多
关键词 非降解泛素化修饰 斑点锌指结构蛋白 κ基因结合核因子信号通路 线粒体分裂融合信号通路
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经DCAG方案化疗后AML患者血清HOXA9、PCⅢ、SE-CAD水平的变化及其与预后的关系 被引量:3
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作者 苏欢 文宁 +1 位作者 向婕 王能勇 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期987-992,共6页
目的:探讨急性髓系白血病(AML)患者采用DCAG方案化疗后血清同源盒基因A9(HOXA9)、可溶性E钙黏蛋白(SE-CAD)及Ⅲ型前胶原蛋白(PCⅢ)水平的变化及其与预后的关系。方法:回顾性分析2018年3月至2021年12月经本院确诊并收治的80例复发难治性... 目的:探讨急性髓系白血病(AML)患者采用DCAG方案化疗后血清同源盒基因A9(HOXA9)、可溶性E钙黏蛋白(SE-CAD)及Ⅲ型前胶原蛋白(PCⅢ)水平的变化及其与预后的关系。方法:回顾性分析2018年3月至2021年12月经本院确诊并收治的80例复发难治性AML患者的资料,按照治疗方案不同将其分为DCAG组(n=40)与CAG组(n=40),对比治疗前后各组的临床疗效及HOXA9、SE-CAD、PCⅢ水平的变化;另按照临床疗效将所有患者分为缓解组(n=58)与未缓解组(n=22),通过单因素和多因素分析影响AML患者预后的危险因素;采用ROC曲线分析HOXA9、SE-CAD、PCⅢ三项单一指标及三者联合对预后的预测效能。结果:相比于治疗前,DCAG组与CAG组患者在治疗后的HOXA9、SE-CAD、PCⅢ水平均有所下降,但DCAG组患者各指标的改善效果明显优于CAG组,且DCAG组患者在治疗后的临床疗效显著优于CAG组(均P<0.05);多因素分析结果显示,骨髓原始细胞比率、HOXA9 m RNA、SE-CAD及PCⅢ水平升高是影响AML患者化疗疗效的独立危险因素(均P<0.05);ROC曲线分析显示,HOXA9 m RNA、SE-CAD及PCⅢ联合能够有效预测AML预后情况,其敏感度为84.80%、特异度为88.20%。结论:应用DCAG的化疗方案能够显著改善AML患者的HOXA9 m RNA、SE-CAD及PCⅢ水平;且这三项指标作为影响AML患者预后的危险因素,通过联合检测能够对AML患者的预后情况进行有效预测。 展开更多
关键词 急性髓系白血病 同源盒基因A9 可溶性E钙黏蛋白 前胶原蛋白 DCAG化疗方案
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小麦TaCRF2基因的克隆及其在烟草中的初步功能验证 被引量:5
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作者 郭丽香 高世庆 +5 位作者 唐益苗 王永波 刘美英 张朝 徐蓓 赵昌平 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第8期1389-1397,共9页
通过RT-PCR方法从小麦cDNA中扩增获得1个锌指蛋白基因TaCRF2,该基因的cDNA长度为843bp,序列分析表明它编码1个含有280个氨基酸的蛋白质。在线软件预测该蛋白质的相对分子质量为30.97kD,等电点为7.03,且在C-末端含有1个典型的RING-H2型... 通过RT-PCR方法从小麦cDNA中扩增获得1个锌指蛋白基因TaCRF2,该基因的cDNA长度为843bp,序列分析表明它编码1个含有280个氨基酸的蛋白质。在线软件预测该蛋白质的相对分子质量为30.97kD,等电点为7.03,且在C-末端含有1个典型的RING-H2型锌指蛋白结构域,在N-末端含有2个跨膜结构域。氨基酸序列比对发现,TaCRF2与水稻中1个RING型锌指蛋白(ABF95226)的相似度为82%。亚细胞定位分析显示,该蛋白分布在细胞核和细胞膜上。real-time RT-PCR表达特性分析显示,TaCRF2基因的表达受干旱、高盐和外源ABA的强烈诱导,低温对该基因的表达量影响不明显。初步功能验证发现过表达TaCRF2基因增强了转基因烟草对干旱和高盐胁迫的耐性。 展开更多
关键词 烟草 小麦 RING-H2锌指蛋白 TaCRF2基因 干旱胁迫 盐胁迫
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在心脏组织表达的一个人类新基因
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作者 罗开梅 王跃群 +3 位作者 皮花亮 袁婺洲 李大力 吴秀山 《湖南师范大学自然科学学报》 EI CAS 北大核心 2003年第2期79-83,共5页
KRAB C2H2型锌指蛋白是一类具有重要功能的转录调节因子.初步克隆了一个新的人类KRAB C2H2型锌指蛋白基因,经国际基因命名委员会批准命名为ZNF382.此基因长2824bp,含5个外显子,4个内含子,在基因组DNA上长约23kb.它编码548个氨基酸,在氮... KRAB C2H2型锌指蛋白是一类具有重要功能的转录调节因子.初步克隆了一个新的人类KRAB C2H2型锌指蛋白基因,经国际基因命名委员会批准命名为ZNF382.此基因长2824bp,含5个外显子,4个内含子,在基因组DNA上长约23kb.它编码548个氨基酸,在氮末端含一个KRAB框,碳末端含一个未成形的锌指(VZF)和9个锌指(ZF).Northern杂交结果表明,ZNF382mRNA在早期胚胎时期(至少在妊娠34d之前)就开始表达,在不同时期人类胚胎组织中广泛表达,包括小脑、肾、大脑、肺、心脏、骨骼肌、舌和肾上腺.在成人组织其表达限制在心脏,其结构和表达特征预示着ZNF382在心脏发育和功能的发挥起着潜在的作用. 展开更多
关键词 人类基因 KRAB/C2H2锌指蛋白 人类胚胎组织 基因表达 基因克隆 心脏发育
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