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垂穗披碱草TCP转录因子家族鉴定及激素响应模式分析
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作者 彭晓梅 孟晨 +3 位作者 GARC A-CAPARR S Pedro 张宇 杨永平 孙旭东 《广西植物》 北大核心 2025年第5期916-930,共15页
垂穗披碱草(Elymus nutans)是青藏高原地区的优质牧草,具有较高的生态价值和经济价值。TCP是植物特有的转录因子家族,参与调控植物叶片发育、侧枝形成、植物激素合成与信号转导等生理过程。为鉴定垂穗披碱草TCP转录因子家族成员,该研究... 垂穗披碱草(Elymus nutans)是青藏高原地区的优质牧草,具有较高的生态价值和经济价值。TCP是植物特有的转录因子家族,参与调控植物叶片发育、侧枝形成、植物激素合成与信号转导等生理过程。为鉴定垂穗披碱草TCP转录因子家族成员,该研究利用单分子实时(SMRT)测序技术获得了垂穗披碱草全长转录组数据,并对4种激素处理后的垂穗披碱草叶片进行Illumina测序,以探究EnTCP s基因在不同激素处理下的表达模式。结果表明:(1)垂穗披碱草全长转录组测序共获得90956条非冗余转录本。(2)基于全长转录组数据共鉴定到26个EnTCP s,氨基酸数为186~575 aa,亚细胞定位预测显示TCP蛋白均位于细胞核。(3)根据进化树的分支情况可将26个EnTCP s分为Class I、ClassⅡ-a(CIN)和ClassⅡ-b(CYC/TB1)3个亚家族,保守结构域分析表明EnTCPs均含有TCP结构域。(4)不同激素处理后的表达模式分析显示,7个EnTCP s家族成员(En108950、En35573、En10347、En16325、En128790、En10346和En14028)在激素处理后上调/下调表达,它们可能参与了激素合成与信号转导通路;qRT-PCR分析结果显示,En35573和En14028参与生长素响应,En108950、En10347、En128790、En10346和En14028均参与细胞分裂素响应,En14028参与脱落酸响应,En108950参与茉莉酸响应,而En16325可能参与多种激素信号转导通路。该研究结果为后续EnTCP s基因功能研究奠定了基础,为研究EnTCP s对激素响应的分子机制提供了参考依据。 展开更多
关键词 垂穗披碱草 tcp转录因子家族 全长转录 外源植物激素 表达模式
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景宁木兰TCP家族鉴定及遮阴胁迫表达模式分析 被引量:2
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作者 任明杰 陆丹迎 +5 位作者 吴超 朱森宇 陈小珺 邬宇峰 申亚梅 马晶晶 《热带亚热带植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第5期623-633,共11页
为明确TCP转录因子家族在景宁木兰(Magnolia sinostellata)遮阴胁迫中的作用,通过模拟自然生境对景宁木兰3 a生嫁接苗进行遮阴处理,基于转录组分析TCP转录因子相关信息,利用转录组表达量和qRT-PCR分析遮阴胁迫下的表达模式。结果表明,... 为明确TCP转录因子家族在景宁木兰(Magnolia sinostellata)遮阴胁迫中的作用,通过模拟自然生境对景宁木兰3 a生嫁接苗进行遮阴处理,基于转录组分析TCP转录因子相关信息,利用转录组表达量和qRT-PCR分析遮阴胁迫下的表达模式。结果表明,从景宁木兰转录组中筛选出12个TCPs基因,编码蛋白长度为228~558个氨基酸,分子量为23.7~52.7 kDa,TCPs蛋白均为不稳定蛋白、亲水性蛋白;TCPs均定位于细胞核,MsTCP20-a/b蛋白还定位于叶绿体。TCPs成员分为2大类,ClassⅠ包含10个TCPs成员,ClassⅡ包含2个TCPs成员。所有成员均含有TCP保守结构域,亲缘关系较近的成员具有相似的保守基序;克隆得到TCPs启动子序列,其序列含有大量光响应和激素响应元件。在遮阴处理后景宁木兰TCPs基因存在差异表达,其中MsTCP9-a与MsTCP2在遮阴后显著上升,MsTCP8、MsTCP9-b、MsTCP7-a、MsTCP15在遮阴后显著下降。因此,景宁木兰TCPs可能在响应遮阴胁迫过程中发挥重要功能。 展开更多
关键词 tcp转录因子家族 景宁木兰 遮阴 基因表达
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花生TCP家族基因鉴定及其在侧枝发育中的表达分析
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作者 张靖男 韦丽君 +5 位作者 陈娟娟 杨鑫雷 穆国俊 侯名语 崔顺立 刘立峰 《河北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第3期25-33,共9页
TCP(Teosinte branched 1/Cycloidea/Proliferating cell factors)转录因子作为植物特有的一类转录因子,参与植物生长发育的多个重要进程。本研究利用生物信息学方法对花生TCP基因家族成员进行鉴定,结合花生侧枝转录组数据进行表达分析... TCP(Teosinte branched 1/Cycloidea/Proliferating cell factors)转录因子作为植物特有的一类转录因子,参与植物生长发育的多个重要进程。本研究利用生物信息学方法对花生TCP基因家族成员进行鉴定,结合花生侧枝转录组数据进行表达分析。结果表明:在四倍体花生AABB、二倍体AA和BB基因组中分别鉴定获得30个AhTCPs、11个AduTCPs和10个AipTCPs,定位到14、6和5条染色体上;与拟南芥AtTCPs蛋白聚类分析发现,花生TCP蛋白可分为ClassⅠ和ClassⅡ(CYC/TB1和CIN)2个亚类;AhTCPs基因中含有1~6个数量不等的外显子和5个不同的motif;蛋白质长度为131~658个氨基酸,分子量为9.94~72.66 kD;大部分成员定位在细胞核上;家族基因启动子顺式作用元件分析发现,在AA、BB、AABB基因组分别获得77、75和94种顺式作用元件。转录组结果分析表明,24个AhTCPs在侧枝发育过程中存在不同程度的表达,大多数AhTCPs基因在2个品种(‘冀花5号’和‘M130’)6个时期中高表达。以上结果为进一步了解花生TCP家族的生物学功能提供理论基础。 展开更多
关键词 花生 tcp转录因子家族 生物信息学分析 表达分析
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棉花GhTCP2基因启动子分离及其在幼嫩组织的表达分析 被引量:2
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作者 邢进 刘伟娜 +4 位作者 赵琳琳 赵金凤 张文会 赵宝华 李学勇 《棉花学报》 CSCD 北大核心 2013年第3期197-204,共8页
采用Genome walking的方法分离了GhTCP2基因的启动子区,应用在线分析软件PLACE对该启动子序列进行分析,发现含有多个与细胞周期、细胞分裂素、生长素相关的顺式作用元件。构建了GhTCP2基因启动子驱动报告基因GUS的植物表达载体并转化了... 采用Genome walking的方法分离了GhTCP2基因的启动子区,应用在线分析软件PLACE对该启动子序列进行分析,发现含有多个与细胞周期、细胞分裂素、生长素相关的顺式作用元件。构建了GhTCP2基因启动子驱动报告基因GUS的植物表达载体并转化了模式植物拟南芥。转基因拟南芥的组织化学染色显示,GUS基因主要在根尖、幼叶、顶芽、侧芽和花蕾中表达。这说明棉花GhTCP2基因启动子可以驱动目的基因在植物的幼嫩组织表达,该启动子有望在植物抗虫基因工程中应用。 展开更多
关键词 棉花 tcp家族转录因子 启动子 特异性表达
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