白花泡桐TCP家族分析及其对丛枝病和干旱的响应 被引量：4

1

作者 韩建霞 曹喜兵 +1 位作者 刘海芳 范国强 《森林与环境学报》 CSCD 北大核心 2022年第4期337-345,共9页

为探究白花泡桐TCP家族在调控丛枝病和干旱胁迫响应中的作用,对白花泡桐全基因组TCP家族成员进行生物信息学分析。结果表明:白花泡桐TCP家族有35个基因;所有家族成员分布在14条染色体上,每条染色体的基因数量有1~5个;同时,所有成员均包... 为探究白花泡桐TCP家族在调控丛枝病和干旱胁迫响应中的作用,对白花泡桐全基因组TCP家族成员进行生物信息学分析。结果表明:白花泡桐TCP家族有35个基因;所有家族成员分布在14条染色体上,每条染色体的基因数量有1~5个;同时,所有成员均包含基序1;顺式作用元件表明PfTCPs主要参与激素和光响应;结合丛枝病和干旱处理前后白花泡桐TCP的转录组分析,最终发现PfTCP17和PfTCP27可能在调控丛枝病发生和干旱胁迫中发挥重要作用。该结果为进一步培育白花泡桐抗生物和非生物胁迫新品种提供了依据。 展开更多

关键词 白花泡桐 tcp家族鉴定 转录组 丛枝病 干旱胁迫

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景宁木兰TCP家族鉴定及遮阴胁迫表达模式分析 被引量：2

2

作者 任明杰 陆丹迎 +5 位作者 吴超 朱森宇 陈小珺 邬宇峰 申亚梅 马晶晶 《热带亚热带植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第5期623-633,共11页

为明确TCP转录因子家族在景宁木兰(Magnolia sinostellata)遮阴胁迫中的作用,通过模拟自然生境对景宁木兰3 a生嫁接苗进行遮阴处理,基于转录组分析TCP转录因子相关信息,利用转录组表达量和qRT-PCR分析遮阴胁迫下的表达模式。结果表明,... 为明确TCP转录因子家族在景宁木兰(Magnolia sinostellata)遮阴胁迫中的作用,通过模拟自然生境对景宁木兰3 a生嫁接苗进行遮阴处理,基于转录组分析TCP转录因子相关信息,利用转录组表达量和qRT-PCR分析遮阴胁迫下的表达模式。结果表明,从景宁木兰转录组中筛选出12个TCPs基因,编码蛋白长度为228~558个氨基酸,分子量为23.7~52.7 kDa,TCPs蛋白均为不稳定蛋白、亲水性蛋白;TCPs均定位于细胞核,MsTCP20-a/b蛋白还定位于叶绿体。TCPs成员分为2大类,ClassⅠ包含10个TCPs成员,ClassⅡ包含2个TCPs成员。所有成员均含有TCP保守结构域,亲缘关系较近的成员具有相似的保守基序;克隆得到TCPs启动子序列,其序列含有大量光响应和激素响应元件。在遮阴处理后景宁木兰TCPs基因存在差异表达,其中MsTCP9-a与MsTCP2在遮阴后显著上升,MsTCP8、MsTCP9-b、MsTCP7-a、MsTCP15在遮阴后显著下降。因此,景宁木兰TCPs可能在响应遮阴胁迫过程中发挥重要功能。 展开更多

关键词 tcp转录因子家族 景宁木兰 遮阴 基因表达

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花生TCP家族基因鉴定及其在侧枝发育中的表达分析

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作者 张靖男 韦丽君 +5 位作者 陈娟娟 杨鑫雷 穆国俊 侯名语 崔顺立 刘立峰 《河北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第3期25-33,共9页

TCP(Teosinte branched 1/Cycloidea/Proliferating cell factors)转录因子作为植物特有的一类转录因子,参与植物生长发育的多个重要进程。本研究利用生物信息学方法对花生TCP基因家族成员进行鉴定,结合花生侧枝转录组数据进行表达分析... TCP(Teosinte branched 1/Cycloidea/Proliferating cell factors)转录因子作为植物特有的一类转录因子,参与植物生长发育的多个重要进程。本研究利用生物信息学方法对花生TCP基因家族成员进行鉴定,结合花生侧枝转录组数据进行表达分析。结果表明:在四倍体花生AABB、二倍体AA和BB基因组中分别鉴定获得30个AhTCPs、11个AduTCPs和10个AipTCPs,定位到14、6和5条染色体上;与拟南芥AtTCPs蛋白聚类分析发现,花生TCP蛋白可分为ClassⅠ和ClassⅡ(CYC/TB1和CIN)2个亚类;AhTCPs基因中含有1~6个数量不等的外显子和5个不同的motif;蛋白质长度为131~658个氨基酸,分子量为9.94~72.66 kD;大部分成员定位在细胞核上;家族基因启动子顺式作用元件分析发现,在AA、BB、AABB基因组分别获得77、75和94种顺式作用元件。转录组结果分析表明,24个AhTCPs在侧枝发育过程中存在不同程度的表达,大多数AhTCPs基因在2个品种(‘冀花5号’和‘M130’)6个时期中高表达。以上结果为进一步了解花生TCP家族的生物学功能提供理论基础。 展开更多

关键词 花生 tcp转录因子家族 生物信息学分析 表达分析

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垂穗披碱草TCP转录因子家族鉴定及激素响应模式分析

4

作者 彭晓梅 孟晨 +3 位作者 GARC A-CAPARR S Pedro 张宇 杨永平 孙旭东 《广西植物》 北大核心 2025年第5期916-930,共15页

垂穗披碱草(Elymus nutans)是青藏高原地区的优质牧草,具有较高的生态价值和经济价值。TCP是植物特有的转录因子家族,参与调控植物叶片发育、侧枝形成、植物激素合成与信号转导等生理过程。为鉴定垂穗披碱草TCP转录因子家族成员,该研究... 垂穗披碱草(Elymus nutans)是青藏高原地区的优质牧草,具有较高的生态价值和经济价值。TCP是植物特有的转录因子家族,参与调控植物叶片发育、侧枝形成、植物激素合成与信号转导等生理过程。为鉴定垂穗披碱草TCP转录因子家族成员,该研究利用单分子实时(SMRT)测序技术获得了垂穗披碱草全长转录组数据,并对4种激素处理后的垂穗披碱草叶片进行Illumina测序,以探究EnTCP s基因在不同激素处理下的表达模式。结果表明:(1)垂穗披碱草全长转录组测序共获得90956条非冗余转录本。(2)基于全长转录组数据共鉴定到26个EnTCP s,氨基酸数为186~575 aa,亚细胞定位预测显示TCP蛋白均位于细胞核。(3)根据进化树的分支情况可将26个EnTCP s分为Class I、ClassⅡ-a(CIN)和ClassⅡ-b(CYC/TB1)3个亚家族,保守结构域分析表明EnTCPs均含有TCP结构域。(4)不同激素处理后的表达模式分析显示,7个EnTCP s家族成员(En108950、En35573、En10347、En16325、En128790、En10346和En14028)在激素处理后上调/下调表达,它们可能参与了激素合成与信号转导通路;qRT-PCR分析结果显示,En35573和En14028参与生长素响应,En108950、En10347、En128790、En10346和En14028均参与细胞分裂素响应,En14028参与脱落酸响应,En108950参与茉莉酸响应,而En16325可能参与多种激素信号转导通路。该研究结果为后续EnTCP s基因功能研究奠定了基础,为研究EnTCP s对激素响应的分子机制提供了参考依据。 展开更多

关键词 垂穗披碱草 tcp转录因子家族 全长转录组 外源植物激素 表达模式

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栀子TCP基因家族鉴定及响应盐胁迫表达模式分析

5

作者 林宇清 朱渊铭 +5 位作者 陈丝雨 陈德星 张琼艺 陈淑颖 张培兰 邹双全 《江苏农业科学》 北大核心 2025年第4期126-132,共7页

为明确栀子TCP基因家族及盐胁迫响应,利用生物信息学手段对栀子TCP基因家族进行鉴定、分析和盐胁迫表达试验分析。结果表明,在栀子中共鉴定出16个TCP基因,分为PCF、CYC和CIN共3个亚家族。保守基序、基因结构和理化性质表明,同亚家族基... 为明确栀子TCP基因家族及盐胁迫响应,利用生物信息学手段对栀子TCP基因家族进行鉴定、分析和盐胁迫表达试验分析。结果表明,在栀子中共鉴定出16个TCP基因,分为PCF、CYC和CIN共3个亚家族。保守基序、基因结构和理化性质表明,同亚家族基因保守基序相似,不同亚家族的基因保守基序差异较大,16个栀子TCP基因均为亲水蛋白。染色体定位表明,16个栀子TCP基因不均匀地分布在8条染色体上,且包含多个片断段复制事件。顺式作用元件分析发现,栀子TCP基因中含有多种与植物生长发育、应激反应及激素调节相关的作用元件,以胁迫响应元件MYB和MYc最多;盐胁迫表达量显示,栀子TCP基因均能响应盐胁迫,部分基因在重度盐胁迫特异性表达,推测GjTCP13、GjTCP12和GjTCP6可能为栀子耐盐调控的关键基因。综上所述,栀子TCP基因家族成员能够积极响应盐胁迫,增强栀子的耐盐抗性。 展开更多

关键词 tcp基因家族 栀子 生物信息学 盐胁迫

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文冠果TCP基因家族鉴定及盐胁迫下表达分析

6

作者 陈玉金 于涵 +6 位作者 朱华利 姜涛 刘博 李伟 赵永军 鲁仪增 解孝满 《南方农业学报》 北大核心 2025年第2期441-451,共11页

【目的】对文冠果(Xanthoceras sorbifolium)TCP基因家族进行鉴定,分析其在盐胁迫下的表达情况,探究文冠果的盐胁迫响应机制,为文冠果耐盐种质的选育提供理论依据。【方法】采用生物信息学方法对文冠果TCP基因家族进行鉴定,并进行蛋白... 【目的】对文冠果(Xanthoceras sorbifolium)TCP基因家族进行鉴定,分析其在盐胁迫下的表达情况,探究文冠果的盐胁迫响应机制,为文冠果耐盐种质的选育提供理论依据。【方法】采用生物信息学方法对文冠果TCP基因家族进行鉴定,并进行蛋白理化性质、系统发育进化和保守基序分析,以及基因结构、染色体定位和启动子顺式作用元件分析。采用实时荧光定量PCR检测盐胁迫下文冠果TCP基因(XsTCPs)在叶片和根部的表达情况。【结果】共鉴定出24个文冠果TCP基因家族成员(XsTCP1~XsTCP24),编码的氨基酸残基数量为185~576个,蛋白分子量为20576.21~63366.92 kD,理论等电点为4.62~10.25,均属于亲水性蛋白且定位于细胞核。基于系统发育进化分析结果,可将24个XsTCPs蛋白划分到3个亚家族,其中PCF亚家族包含14个成员、CIN亚家族包含6个成员、CYC/TB1亚家族包含4个成员。除XsTCP23和XsTCP24基因无法定位到染色体外,其余文冠果TCP基因家族成员以单个基因或基因簇的形式不均匀地分布在11条染色体上。在24个XsTCPs蛋白中共发现10个保守基序,其中Motif 1为所有蛋白共有。文冠果TCP基因家族成员含有光响应元件、激素反应元件、应激反应元件和植物生长发育作用元件,其中XsTCP4、XsTCP6、XsTCP7、XsTCP10、XsTCP12、XsTCP13、XsTCP21和XsTCP22基因含有干旱诱导的MYB结合元件;实时荧光定量PCR检测结果表明,盐胁迫下上述基因在文冠果叶片和根部的表达情况均发生明显变化,推测上述8个XsTCPs基因参与盐胁迫响应过程。【结论】XsTCPs蛋白可能通过调控涉及生长发育、新陈代谢和应激反应的多种靶基因参与生物学过程,推测含有干旱诱导的MYB结合元件的8个XsTCPs基因有助于提高文冠果对盐胁迫的抵御能力。 展开更多

关键词 文冠果 tcp基因家族 盐胁迫 表达分析

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菊苣TCP基因家族鉴定与分析 被引量：5

7

作者 杜洋 张智韦 +6 位作者 陆爽 刘雪 李大勇 徐朝阳 王晨晨 张彬 许立新 《草地学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第8期2428-2439,共12页

TCP转录因子参与调控植物多种生理过程,包括植物叶片发育、花发育、分枝的形成等方面。菊苣(Cichorium intybus L.)是一种优良牧草,但目前还未有关于其TCP基因家族研究的报道。本研究基于菊苣全基因组数据,利用拟南芥(Arabidopsis thali... TCP转录因子参与调控植物多种生理过程,包括植物叶片发育、花发育、分枝的形成等方面。菊苣(Cichorium intybus L.)是一种优良牧草,但目前还未有关于其TCP基因家族研究的报道。本研究基于菊苣全基因组数据,利用拟南芥(Arabidopsis thaliana)、生菜(Lactuca sativa L.)TCP基因家族的氨基酸序列,对菊苣TCP基因家族成员进行鉴定筛选,最终得到39个菊苣TCP基因家族成员。接着利用生物信息学方法对这些成员进行分析发现,39个成员不均匀分布在9条染色体上;氨基酸数目为113~498,分子量为12425.84~56266.57Da;所有成员分为3个亚家族;均含有保守的basic-helix-loop-helix(bHLH)结构域;顺式作用元件分析发现,菊苣TCP家族成员具有多种激素、非生物胁迫和生长发育响应元件;对CIN类TCP基因在菊苣各组织和高温胁迫下进行表达分析发现,这些成员可能参与菊苣的叶片发育调控且对高温胁迫响应。本研究可以为改良菊苣牧草品质提供理论依据。 展开更多

关键词 tcp基因家族 菊苣 表达分析 家族分析

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茉莉花TCP基因家族全基因组鉴定及其表达分析 被引量：5

8

作者 齐香玉 李新茹 +5 位作者 陈双双 冯景 陈慧杰 金玉妍 苗艳华 邓衍明 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2024年第1期63-71,共9页

为探讨茉莉花TCP基因家族在其生长发育过程中的作用,基于茉莉花的基因组数据,利用生物信息学方法对茉莉花TCP(JsTCP)基因进行了全基因组鉴定及分析,并分析了TCP基因家族在花发育不同时期和花粉-柱头互作中的表达水平。结果显示,茉莉花... 为探讨茉莉花TCP基因家族在其生长发育过程中的作用,基于茉莉花的基因组数据,利用生物信息学方法对茉莉花TCP(JsTCP)基因进行了全基因组鉴定及分析,并分析了TCP基因家族在花发育不同时期和花粉-柱头互作中的表达水平。结果显示,茉莉花全基因组中共鉴定出27个TCP基因家族成员,命名为JsTCP1~JsTCP25,其蛋白包含208~539个氨基酸残基,分子量为22.95~56.96 ku,等电点为5.70~9.97,均为不稳定的亲水性蛋白。亚细胞定位预测结果显示,JsTCPs均位于细胞核内。染色体定位结果显示,JsTCPs不均匀分布在10条染色体上。基因结构分析结果显示,JsTCPs具有1~5个外显子以及0~4个内含子。蛋白保守基序和系统进化分析结果显示,JsTCPs均含保守的TCP结构域,可分为ClassⅠ和ClassⅡ2个亚类。启动子顺式作用元件的分析结果显示,JsTCPs启动子上含有多个植物激素响应、胁迫响应和生长发育相关等元件。表达模式分析结果显示,24个JsTCPs基因在茉莉花花发育不同时期表达,22个基因在花粉-柱头互作中表达。总之,本研究鉴定了27个茉莉花TCP基因家族成员,并发现家族成员在花发育不同时期和授粉后不同时期特异表达。 展开更多

关键词 茉莉花 tcp基因家族 全基因组鉴定 系统进化分析 表达分析

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草莓TCP转录因子家族生物信息学鉴定及基因表达分析 被引量：13

9

作者 张志强 卢世雄 +4 位作者 马宗桓 周琪 何红红 陈佰鸿 毛娟 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第12期2031-2043,共13页

TCP转录因子家族是植物特异的一类调控逆境胁迫的重要转录因子。该研究利用生物信息学方法对草莓TCP转录因子家族成员进行鉴定,采用qRT-PCR方法检测转录因子家族在非生物胁迫中的表达,并对相应转录因子家族基因的结构和功能进行了预测,... TCP转录因子家族是植物特异的一类调控逆境胁迫的重要转录因子。该研究利用生物信息学方法对草莓TCP转录因子家族成员进行鉴定,采用qRT-PCR方法检测转录因子家族在非生物胁迫中的表达,并对相应转录因子家族基因的结构和功能进行了预测,为探究TCP转录因子在森林草莓非生物胁迫中的作用奠定基础。结果显示:(1)从森林草莓(Fragaria vesca)基因组和凤梨草莓(Fragaria ananassa)基因组中分别筛选了18个和58个TCP基因,并根据基因在染色体上的位置分别命名为FvTCP1~FvTCP18和FaTCP1~FaTCP58,亚细胞定位显示TCP家族基因主要位于细胞核上。(2)qRT-PCR分析表明,森林草莓家族基因对逆境胁迫具有响应作用,但不同成员在不同胁迫处理下的响应程度存在差异,FvTCP14在200 mmol·L^(-1) NaCl、10%PEG、100μmol·L^(-1) ABA、4℃低温、40℃高温和100 mmol·L^(-1) H_(2)O_(2)处理下相对表达量极显著高于对照,分别是对照的43.78倍、166.73倍、38.39倍、265.87倍、626.24倍和451.85倍,表明FvTCP14响应干旱、盐、ABA、H_(2)O_(2)、低温和高温胁迫;另外发现,FvTCP12在4℃低温、100μmol·L^(-1) ABA和100 mmol·L^(-1) H_(2)O_(2)胁迫下与对照相比呈下调趋势,推测FvTCP12基因对低温、ABA和H_(2)O_(2)胁迫具有负调控作用。研究表明,森林草莓TCP转录因子在不同逆境胁迫中的表达存在一定的差异。 展开更多

关键词 草莓 tcp家族 生物信息学 QRT-PCR

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芥菜TCP转录因子家族全基因组鉴定及表达分析 被引量：7

10

作者 李坤杰 谭杉杉 +4 位作者 孙勃 饶丹 何琦 闵爱玲 李梦瑶 《四川农业大学学报》 CSCD 北大核心 2019年第4期459-468,共10页

【目的】对芥菜基因组中TCP转录因子家族基因成员进行鉴定和序列分析,并分析TCP家族基因在茎发育时期的表达水平,为研究芥菜TCP基因功能和茎膨大机理提供基因源和理论依据。【方法】从芸薹属基因组数据库下载芥菜基因组数据,结合转录组... 【目的】对芥菜基因组中TCP转录因子家族基因成员进行鉴定和序列分析,并分析TCP家族基因在茎发育时期的表达水平,为研究芥菜TCP基因功能和茎膨大机理提供基因源和理论依据。【方法】从芸薹属基因组数据库下载芥菜基因组数据,结合转录组数据,对芥菜TCP转录因子家族成员进行鉴定,并利用生物信息学方法对该家族成员进行理化性质、亚细胞定位、系统发育关系、基因结构、染色体定位及茎不同发育时期基因表达谱等方面的分析。【结果】芥菜TCP家族共有53个成员;系统进化树分析可分为两个大的亚组;TCP基因大都位于细胞核上,但理化性质差异很大;大部分基因没有内含子,基因结构保守性较高;在染色体上分布不均;表达模式分析显示TCP家族基因可能在芥菜茎膨大中起重要作用。【结论】鉴定了53个芥菜TCP家族基因成员,并发现PCF亚组成员在芥菜茎发育时期特异性表达,可能在芥菜茎的生长发育过程中起重要作用,该研究为芥菜及其他植物中TCP家族的鉴定和功能研究提供了理论基础。 展开更多

关键词 芥菜 tcp家族 全基因组鉴定 进化分析 表达分析

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雷蒙德氏棉和亚洲棉TCP基因家族的生物信息学分析 被引量：3

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作者 李燕 姚金波 +1 位作者 陈伟 张永山 《棉花学报》 CSCD 北大核心 2016年第5期434-442,共9页

TCP基因家族是植物中特有的一类转录因子家族,涉及了植物的多种生长途径以及各种生理生化反应的信号传导。为了更好地了解TCP基因家族在雷蒙德氏棉和亚洲棉基因组中的数量和分布情况等,通过生物信息学方法,在雷蒙德氏棉(D5)和亚洲棉(A2... TCP基因家族是植物中特有的一类转录因子家族,涉及了植物的多种生长途径以及各种生理生化反应的信号传导。为了更好地了解TCP基因家族在雷蒙德氏棉和亚洲棉基因组中的数量和分布情况等,通过生物信息学方法,在雷蒙德氏棉(D5)和亚洲棉(A2)全基因组中分别鉴定出37个TCP基因家族成员,并对TCP家族成员进行基因结构、染色体定位、保守域、进化关系等分析。结果表明,雷蒙德氏棉和亚洲棉全基因组分别编码37个TCP转录因子成员。雷蒙德氏棉30个成员基因分布在10条染色体上,亚洲棉37个成员基因分布在13条染色体上;内含子/外显子结构分析表明,TCP基因结构较为简单,大部分不含内含子;功能结构域分析,发现所有TCP转录因子具有高度保守的TCP结构域;根据结构域差异和系统发育分析的结果,将TCP基因家族分成2个亚族,进一步划分为PCF、CIN、CYC/TB1三个亚类。以上结果为进一步研究棉花TCP基因家族各成员的功能奠定一定的理论基础。 展开更多

关键词 tcp基因家族 雷蒙德氏棉 亚洲棉 生物信息学

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二穗短柄草TCP转录因子的全基因组鉴定及其对非生物胁迫的响应

12

作者 陈俊赫 谢欣怡 +2 位作者 黄君婷 孙风顺 齐娟 《山东农业大学学报（自然科学版）》 北大核心 2024年第5期675-686,共12页

二穗短柄草是一年生温带早熟禾亚科植物,具有遗传资源丰富、与禾谷类作物亲缘关系密切等特点,是一种重要的禾谷类模式植物。TEOSINTE BRANCHED1/CINCINNATA/PROLIFERATING CEL FACTOR(TCP)家族是植物特异转录因子,广泛调控植物生长发育... 二穗短柄草是一年生温带早熟禾亚科植物,具有遗传资源丰富、与禾谷类作物亲缘关系密切等特点,是一种重要的禾谷类模式植物。TEOSINTE BRANCHED1/CINCINNATA/PROLIFERATING CEL FACTOR(TCP)家族是植物特异转录因子,广泛调控植物生长发育。然而,有关二穗短柄草TCP转录因子的信息仍不清楚。本文对二穗短柄草的TCP基因进行了全基因组鉴定,共鉴定出了21个TCP基因(BdTCPs)。分类结果显示,21个BdTCPs主要分为以下两个亚组:11个PROLIFERATING CEL FACTOR(PCF)基因(Ⅰ类)、7个CINCINNATA(CIN)基因和3个CYCLOIDEA(CYC)基因(Ⅱ类)。序列分析表明,二穗短柄草TCP蛋白均包含TCP/TCP superfamily结构域,且外显子-内含子结构各不相同。Motif分析表明,二穗短柄草TCP家族成员均含有Motif 1和Motif 2,暗示这两个基序是其发挥功能所必需的保守区域。顺式作用元件分析表明,所有BdTCPs的启动子区域都含有植物激素和环境响应元件,暗示BdTCPs基因可能参与非生物胁迫响应。荧光定量PCR结果显示,21个BdTCPs均对盐胁迫不敏感,但其中2个基因(BdTCP10、BdTCP15)参与了干旱胁迫的瞬时响应,且表达量均发生了极显著上调,表明Bd TCP10和BdTCP15基因在二穗短柄草应对干旱胁迫中起正调控作用。上述结果为进一步研究TCP在调控二穗短柄草的生长发育及其在非生物胁迫响应中的作用提供了重要线索。 展开更多

关键词 tcp家族 生物信息学 二穗短柄草 非生物胁迫 干旱胁迫

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棉花GhTCP2基因启动子分离及其在幼嫩组织的表达分析 被引量：2

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作者 邢进 刘伟娜 +4 位作者 赵琳琳 赵金凤 张文会 赵宝华 李学勇 《棉花学报》 CSCD 北大核心 2013年第3期197-204,共8页

采用Genome walking的方法分离了GhTCP2基因的启动子区,应用在线分析软件PLACE对该启动子序列进行分析,发现含有多个与细胞周期、细胞分裂素、生长素相关的顺式作用元件。构建了GhTCP2基因启动子驱动报告基因GUS的植物表达载体并转化了... 采用Genome walking的方法分离了GhTCP2基因的启动子区,应用在线分析软件PLACE对该启动子序列进行分析,发现含有多个与细胞周期、细胞分裂素、生长素相关的顺式作用元件。构建了GhTCP2基因启动子驱动报告基因GUS的植物表达载体并转化了模式植物拟南芥。转基因拟南芥的组织化学染色显示,GUS基因主要在根尖、幼叶、顶芽、侧芽和花蕾中表达。这说明棉花GhTCP2基因启动子可以驱动目的基因在植物的幼嫩组织表达,该启动子有望在植物抗虫基因工程中应用。 展开更多

关键词 棉花 tcp家族转录因子 启动子 特异性表达

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茄子TCP转录因子的鉴定及胁迫处理下的表达分析 被引量：5

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作者 梅文宇 方燕芬 +5 位作者 宫超 麦培婷 孙保娟 李植良 李涛 孙光闻 《广东农业科学》 CAS 2022年第12期20-33,共14页

【目的】鉴定茄子TCP基因并对茄子TCP转录因子家族成员分析。确定其在胁迫、激素处理下的表达情况,为深入研究茄子TCP基因的功能奠定基础。【方法】从茄子基因组鉴定SmTCP基因家族成员,利用生物信息学方法对茄子TCP转录因子家族成员的... 【目的】鉴定茄子TCP基因并对茄子TCP转录因子家族成员分析。确定其在胁迫、激素处理下的表达情况,为深入研究茄子TCP基因的功能奠定基础。【方法】从茄子基因组鉴定SmTCP基因家族成员,利用生物信息学方法对茄子TCP转录因子家族成员的理化性质、分布情况进行分析。以高温(42℃)、低温(4℃)、盐胁迫(200μmol/L NaCl溶液)、重金属(100μmol/L CdCl_(2)溶液)、青枯菌、水杨酸及脱落酸处理茄子幼苗,利用qRT-PCR技术分析茄子TCP基因在7种处理及不同器官的表达情况。【结果】共鉴定到32个茄子TCP成员,并进行生物信息学分析。qRT-PCR分析结果显示,茄子SmTCP基因受生物及环境胁迫响应上调,激素处理中,ABA处理后茄子TCP整体出现上调,SA处理后茄子SmTCP整体出现下调,茄子TCP在叶跟果中的的含量较高。【结论】茄子TCP基因受胁迫响应表达,SmTCP成员响应胁迫表达情况及各器官中的表达量不同,ClassⅠ类TCP大多成员在热胁迫下存在明显上调响应。推测茄子TCP基因可能参与抵御逆境胁迫。 展开更多

关键词 茄子 tcp基因家族 逆境胁迫 激素处理 表达分析

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西瓜全基因组ClTCP转录因子的鉴定与表达分析

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作者 胡仲远 廖南峤 +5 位作者 时丕彪 张明方(编译) Kateta Malangisha Guy 吴维芳 方炳生 杨景华 《中国瓜菜》 CAS 北大核心 2019年第8期245-246,共2页

目的与意义:TCP蛋白是植物特有的一类转录因子,对植物的生长发育及形态建成起着重要的调控作用,比如:种子萌发、植株分枝、叶和花的发育等过程.西瓜是世界性的重要经济作物,栽培面积广阔,经济效益显著.但是关于西瓜TCP基因家族的研究至... 目的与意义:TCP蛋白是植物特有的一类转录因子,对植物的生长发育及形态建成起着重要的调控作用,比如:种子萌发、植株分枝、叶和花的发育等过程.西瓜是世界性的重要经济作物,栽培面积广阔,经济效益显著.但是关于西瓜TCP基因家族的研究至今还没有报道.本研究利用生物信息学分析,功能预测与验证等方法,揭示西瓜TCP家族的结构与表达特征,为西瓜TCP家族的功能分析奠定基础. 展开更多

关键词 tcp转录因子 西瓜 表达分析 全基因组 tcp基因家族 鉴定 CL 生长发育

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甜瓜TCP基因家族全基因组的鉴定与表达分析

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作者 李海伦 高宁宁 +7 位作者 郭姚淼 孙东玲 王月玲 谢夔熙 李鹏飞 段世享 赵卫星 杨森 《河南农业科学》 2025年第9期127-140,共14页

TCP基因家族是植物体内特有的、与植物生长发育的不同阶段密切相关的一类转录因子,在甜瓜中的研究鲜见报道。利用生物信息学方法对甜瓜TCP基因家族成员进行鉴定,并对其理化性质、亚细胞定位、系统进化、染色体定位、基因结构、保守基序... TCP基因家族是植物体内特有的、与植物生长发育的不同阶段密切相关的一类转录因子,在甜瓜中的研究鲜见报道。利用生物信息学方法对甜瓜TCP基因家族成员进行鉴定,并对其理化性质、亚细胞定位、系统进化、染色体定位、基因结构、保守基序、顺式元件、miRNA及基因表达模式进行分析。结果表明,鉴定出29个含有TCP结构域的TCP基因家族成员,不均等地分布在9条染色体上。甜瓜TCP转录因子家族蛋白的氨基酸数在61~600 aa,分子质量在7115.16~65469.20 u,理论等电点在5.62~10.06。亚细胞定位预测分析表明,28个TCP蛋白定位在细胞核。根据系统发育分析可将家族成员划分为ClassⅠ和ClassⅡ2个亚家族,进一步细分为PCF、CYC/TB1、CIN 3个亚组。CmTCP基因结构都比较简单,均含有1或2个外显子,极少数基因含有内含子,29个基因都含有Motif 1,不同亚组成员含有的Motif存在差异。顺式元件预测分析显示,甜瓜TCP基因家族启动子序列以光响应、激素响应、生长发育调控等相关元件为主。miRNA预测分析得出25个miRNA与13个CmTCP基因相互作用。甜瓜基因组数据库RNASeq分析显示,26个CmTCP基因在甜瓜组织中既有明确的组织分工表达,又有特定的组织部位表达;qRT-PCR结果表明,CmTCP-CYC/TB1基因成员在甜瓜不同组织中的相对表达量差异显著。 展开更多

关键词 甜瓜 tcp基因家族 生物信息学分析 全基因组鉴定 表达分析

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CYC类基因在被子植物花发育中的研究进展 被引量：2

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作者 徐蕴如 李玥莹 +2 位作者 逄洪波 张雨欣 刘羽莲 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第3期10-16,共7页

CYCLOIDEA(CYC)类基因属于TCP基因家族成员,在花发育过程中具有重要作用。CYC类基因在被子植物进化过程中发生基因复制事件,形成CYC1、CYC2和CYC3三大分支,其中CYC2分支成员在花对称性形成方面具有主要调控作用。CYC1和CYC3分支成员开... CYCLOIDEA(CYC)类基因属于TCP基因家族成员,在花发育过程中具有重要作用。CYC类基因在被子植物进化过程中发生基因复制事件,形成CYC1、CYC2和CYC3三大分支,其中CYC2分支成员在花对称性形成方面具有主要调控作用。CYC1和CYC3分支成员开展研究较少。综述了国内外CYC类基因的研究现状及其存在问题,并对CYC类基因的研究前景做了展望。 展开更多

关键词 CYC类基因 花对称性 tcp基因家族 进化

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