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羊口疮病毒ORFV113蛋白的主要特性及B细胞和T细胞抗原表位预测 被引量:1
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作者 李刚 龙琴琴 +2 位作者 吴鹏 曾月娥 庞峰 《贵州畜牧兽医》 2023年第5期45-48,共4页
为了预测羊口疮病毒ORFV113蛋白的主要特性及其优势B细胞和T细胞抗原表位,分别利用在线软件ProtParam预测ORFV113蛋白的理化性质,DeepTMHMM预测其跨膜区,SignalP 6.0预测其信号肽,SOPMA预测其二级结构,PSORT预测其亚细胞定位,ABCpred预... 为了预测羊口疮病毒ORFV113蛋白的主要特性及其优势B细胞和T细胞抗原表位,分别利用在线软件ProtParam预测ORFV113蛋白的理化性质,DeepTMHMM预测其跨膜区,SignalP 6.0预测其信号肽,SOPMA预测其二级结构,PSORT预测其亚细胞定位,ABCpred预测其优势B细胞表位,IEDB预测其优势细胞毒性T细胞表位。结果:ORFV113蛋白由208个氨基酸组成,为不稳定亲水性蛋白,分子质量约22.08 ku,理论等电点(PI)为4.36,在3~25 aa处存在1个跨膜区,不含信号肽,主要定位于细胞质膜;ORFV113蛋白的二级结构由延伸链(16.35%)、α-螺旋(23.08%)、β-转角(4.81%)、无规则卷曲(55.77%)组成;ORFV113蛋白存在11个优势B细胞表位,分别位于164~179 aa、62~77 aa、132~147 aa、120~135 aa、138~153 aa、101~116 aa、56~71 aa、188~203 aa、175~190 aa、49~64 aa、108~123 aa;存在3个优势T细胞表位,分别位于63~71 aa、121~129 aa、162~170 aa。结论:ORFV113蛋白为亲水性的跨膜蛋白,含有多个优势B细胞和T细胞抗原表位,可作为多表位疫苗的靶点。 展开更多
关键词 羊口疮病毒 ORFV113蛋白 蛋白特性 B细胞抗原 t细胞抗原表位
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猪圆环病毒2型ORF1和ORF3T淋巴细胞抗原表位的克隆与原核表达
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作者 高娟 王艳玲 +2 位作者 蒋再学 竺薇 罗满林 《华南农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第1期93-97,共5页
根据Stevenson筛选出来的3个具有活性的T淋巴细胞抗原表位(T lymphocyte epitope,TCE)合成tce基因(180 bp),成功插入到pMD18-T Simple载体中,筛选获得重组质粒,命名为pMD-TCE.将tce酶切产物亚克隆到原核表达载体pET-32a(+)中,获得重组质... 根据Stevenson筛选出来的3个具有活性的T淋巴细胞抗原表位(T lymphocyte epitope,TCE)合成tce基因(180 bp),成功插入到pMD18-T Simple载体中,筛选获得重组质粒,命名为pMD-TCE.将tce酶切产物亚克隆到原核表达载体pET-32a(+)中,获得重组质粒,命名为pET-TCE.用IPTG进行诱导表达,收集菌液进行SDS-PAGE检测,结果显示合成基因在pET-32a(+)中获得了高效融合表达,其表达蛋白相对分子质量约为25 000,Western-blot分析结果表明,获得的融合蛋白可与猪圆环病毒2型(PCV2)阳性血清发生特异性反应,具有良好的免疫原性. 展开更多
关键词 猪圆环病毒2型 t淋巴细胞抗原 克隆 原核
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羊口疮病毒114蛋白的优势抗原表位预测及ORFV多表位疫苗的构建 被引量:2
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作者 周伟杰 梁绍波 +1 位作者 龙琴琴 庞峰 《贵州畜牧兽医》 2024年第1期21-24,共4页
为了探究羊口疮病毒114蛋白作为羊口疮病毒多表位疫苗靶标的可能性,试验利用在线软件ABCpred预测114蛋白的优势B细胞表位,利用在线软件IEDB的MHC-Ⅰbinding server预测114蛋白的优势细胞毒性T细胞(CTL)表位;利用IEDB的MHC-Ⅱbinding ser... 为了探究羊口疮病毒114蛋白作为羊口疮病毒多表位疫苗靶标的可能性,试验利用在线软件ABCpred预测114蛋白的优势B细胞表位,利用在线软件IEDB的MHC-Ⅰbinding server预测114蛋白的优势细胞毒性T细胞(CTL)表位;利用IEDB的MHC-Ⅱbinding server预测114蛋白的优势辅助性T细胞(HTL)表位;使用柔性短肽接头连接114蛋白的优势B、T细胞抗原表位,构建羊口疮病毒多表位疫苗。结果:羊口疮病毒114蛋白由346个氨基酸组成,包含12个优势B细胞抗原表位,分别位于292~307 aa、264~279 aa、146~161 aa、331~346 aa、113~128 aa、298~313 aa、35~50 aa、324~339 aa、281~296 aa、162~177 aa、315~330 aa、204~219 aa;包含1个优势CTL抗原表位,位于65~73 aa;包含5个优势HTL抗原表位,分别位于69~83 aa、68~82 aa、70~84 aa、48~62 aa、284~298 aa;构建了基于114蛋白的优势抗原表位的羊口疮病毒多表位疫苗。结论:羊口疮病毒114蛋白包含多个优势B细胞和T细胞抗原表位,可作为羊口疮病毒多表位疫苗的候选靶标,具有诱导强烈体液免疫与细胞免疫反应的可能性。 展开更多
关键词 羊口疮病毒 114蛋白 B细胞抗原 t细胞抗原表位 疫苗
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非洲猪瘟病毒Pig/HLJ/2018株CP2475L编码蛋白pp220的生物信息学分析 被引量:3
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作者 曹乾大 戴碧红 +1 位作者 曹雪莲 杨旸 《猪业科学》 2021年第7期100-105,共6页
非洲猪瘟是世界动物卫生组织(OIE)的A类动物疫病,我国将其列为一类动物疫病,自2018年传入我国以来,对我国的养殖业造成巨大的冲击。pp220蛋白是非洲猪瘟病毒CP2475L基因编码的多聚蛋白前体,其经过酶解加工后形成病毒主要的结构蛋白。文... 非洲猪瘟是世界动物卫生组织(OIE)的A类动物疫病,我国将其列为一类动物疫病,自2018年传入我国以来,对我国的养殖业造成巨大的冲击。pp220蛋白是非洲猪瘟病毒CP2475L基因编码的多聚蛋白前体,其经过酶解加工后形成病毒主要的结构蛋白。文章从生物信息学角度分析了pp220蛋白的基本理化特性、跨膜区、信号肽、优势B、T细胞抗原表位和构建了基于pp220蛋白的遗传进化树,通过分析结果,文章对非洲猪瘟病毒的基础数据进行了补充,以期能为非洲猪瘟防控提供基础信息和指引。 展开更多
关键词 非洲猪瘟 CP2475L pp220 生物信息学 B、t细胞抗原表位 进化树
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