胃癌患者血清比较蛋白质组学研究 被引量：20

1

作者 高春芳 李冬晖 +3 位作者 赵光 郑国宝 王秀丽 许红兵 《解放军医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第6期457-459,共3页

目的应用蛋白质质谱分析方法寻找胃癌鉴定的生物标志物.方法应用美国CipherGen公司金属亲和表面(IMAC3)芯片和蛋白芯片仪检测38例胃癌患者、82例正常人血清中的蛋白质相对含量.结果 38例胃癌患者与82例正常人在质荷比为1 723～14 048Da... 目的应用蛋白质质谱分析方法寻找胃癌鉴定的生物标志物.方法应用美国CipherGen公司金属亲和表面(IMAC3)芯片和蛋白芯片仪检测38例胃癌患者、82例正常人血清中的蛋白质相对含量.结果 38例胃癌患者与82例正常人在质荷比为1 723～14 048Da间有18种血清蛋白质含量有显著差异.在学习模式下38例胃癌患者及82例正常人均被正确分组,准确率为100%(120/120),灵敏度和特异性分别为100%(38/38)、100%(82/82);在检测模式下38例胃癌患者中有31例被正确论断,82例正常人中有81例被正确分组,灵敏度和特异性分别为81.6% (31/38)、98.8%(81/82).结论该方法可快速、准确检测胃癌,灵敏度、特异性高. 展开更多

关键词 胃肿瘤 肿瘤标记 生物学 表面增强激光解吸附离子化时间飞行质谱(SELDI-TOF-MS)

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结核性胸膜炎患者血清与胸腔积液蛋白质组的初步分析 被引量：15

2

作者 彭德虎 胡锦兴 +3 位作者 石琳 林兆原 冯治宇 刘志辉 《实用医学杂志》 CAS 北大核心 2010年第23期4269-4271,共3页

目的:比较分析结核性胸膜炎患者血清与胸腔积液蛋白质组的异同,为探讨结核性胸膜炎的发生机制和寻找诊断标志物提供实验依据。方法:采用弱阳离子交换蛋白质芯片(WCX2)处理分析样本、应用表面增强激光解析电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS... 目的:比较分析结核性胸膜炎患者血清与胸腔积液蛋白质组的异同,为探讨结核性胸膜炎的发生机制和寻找诊断标志物提供实验依据。方法:采用弱阳离子交换蛋白质芯片(WCX2)处理分析样本、应用表面增强激光解析电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术,以蛋白质/多肽质荷比(m/z)区分不同的蛋白质/多肽,对5例结核性胸膜炎患者血清与胸腔积液蛋白质组进行描述性分析。结果:(1)在5例患者血清中检测到134种血清蛋白质/多肽,其中76种在胸腔积液中未出现;在5例患者胸腔积液中检测到269种蛋白质/多肽,其中211种在血液中未出现。(2)在5例患者血液中均检测到m/z分别为2660、3191、4208、5903、7764、9287等6种蛋白质/多肽;在5例患者胸腔积液中均检测到m/z分别为2416、2660、2900、2940等4种蛋白质/多肽;在5例患者血液和胸腔积液中均检测到m/z为2660的蛋白质/多肽。结论:结核性胸膜炎患者胸腔积液蛋白质组远比其血清蛋白质组复杂,对其进行深入研究有助于明晰结核性胸膜炎的发生机制和寻找诊断标志物。 展开更多

关键词 结核 胸膜 蛋白质组 表面增强激光解析电离飞行时间质谱

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利用血清中蛋白质组构型鉴定Dukes A期结直肠癌 被引量：11

3

作者 高春芳 赵光 +2 位作者 郑国宝 李冬晖 王秀丽 《解放军医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第6期460-462,共3页

目的　通过对血清蛋白质组的质谱分析,寻找用于Dukes A期结直肠癌鉴定的蛋白质组构型。方法　随机取10例Dukes A期及68例Dukes B、C、D期结直肠癌患者的血清作为预备组,另取10例Dukes A期及68例Dukes B、C、D期结直肠癌患者的血清作为... 目的　通过对血清蛋白质组的质谱分析,寻找用于Dukes A期结直肠癌鉴定的蛋白质组构型。方法　随机取10例Dukes A期及68例Dukes B、C、D期结直肠癌患者的血清作为预备组,另取10例Dukes A期及68例Dukes B、C、D期结直肠癌患者的血清作为检测组。预备组血清与金属亲和表面(IMAC3)芯片结合后,用蛋白芯片仪读取数据,分析可得到用于区分Dukes A期和Dukes B、C、D期结直肠癌患者的树状分类规则,并用双盲法测试检测组以证实其准确性。结果　预备组中两类血清蛋白质在质荷比为8 320、8 604、8 867、15 872Da等4处含量有显著差异,得到树状分类规则,其分类准确率为97 4%(76/78),灵敏度为100%(10/10),特异性为97 1%(66/68);对检测组进行双盲检测,结果显示准确率为94 9%(74/78),灵敏度和特异性分别为100%(10/10)、94 1%(64/68)。结论　该方法可快速、准确检测Dukes A期结直肠癌,灵敏度、特异性高。 展开更多

关键词 结直肠肿瘤 肿瘤标记 生物学 蛋白质组学 表面增强激光解吸附离子化时间飞行质谱(SELDI-TOF-MS)

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血清SELDI蛋白质指纹图谱在乳腺癌腋淋巴结转移中的应用研究 被引量：8

4

作者 庞达 杨艳梅 +3 位作者 张国强 马玉彦 唐雅莉 龚建平 《中国肿瘤临床》 CAS CSCD 北大核心 2008年第17期1010-1014,共5页

目的:应用SELDI技术和生物信息学方法从血清中筛选乳腺癌蛋白质标志物并构建检测模型,为预测腋淋巴结(axillary lymph nodes,ALN)转移等提供可能的简便易行的方法。方法:应用SELDI-TOF-MS作为蛋白质组学摘要目的:应用SELDI技术和生物信... 目的:应用SELDI技术和生物信息学方法从血清中筛选乳腺癌蛋白质标志物并构建检测模型,为预测腋淋巴结(axillary lymph nodes,ALN)转移等提供可能的简便易行的方法。方法:应用SELDI-TOF-MS作为蛋白质组学摘要目的:应用SELDI技术和生物信息学方法从血清中筛选乳腺癌蛋白质标志物并构建检测模型,为预测腋研究平台,采用CM10芯片,对乳腺癌的血清进行了检测,探讨了乳腺癌患者血清蛋白质指纹图谱与是否发生ALN转移的关系,并结合生物信息学方法建立了相应的检测模型。结果:通过对ALN有(无)转移的乳腺癌患者血清蛋白指纹图谱数据的比较,找到了11个差异蛋白质峰(P<0.05),M/Z为M2164.16,M3269.90和M3272.31的3个蛋白质峰被选择用于构建分类决策树模型,该模型的交叉验证(测试组)总准确率为81.8%,ALN有转移的乳腺癌患者检出率为83.3%,ALN无转移的检出率为80%。结论:构建的分类决策树模型能达到区分ALN是否有转移的最佳效果,SELDI技术在确定乳腺癌患者是否发生腋淋巴结转移方面有一定的意义。 展开更多

关键词 乳腺癌 表面增强激光解吸电离-飞行时间质谱 生物信息学 蛋白质组学 CM10芯片

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急性心肌梗死病程不同时期患者血清蛋白质组学分析 被引量：9

5

作者 高春芳 郑国宝 +7 位作者 赵光 魏晓真 孟雪 王秀丽 李冬晖 许红兵 王全晖 宋国英 《解放军医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第6期465-466,共2页

目的　探讨蛋白质质谱分析对急性心肌梗死病程不同时期的鉴别意义。方法　应用美国CipherGen公司金属亲和表面(IMAC3)芯片和蛋白芯片仪检测153例心肌梗死患者血清标本(其中刚入院45例,3h标本12例,6h标本22例,9h标本24例,12h标本24例,24... 目的　探讨蛋白质质谱分析对急性心肌梗死病程不同时期的鉴别意义。方法　应用美国CipherGen公司金属亲和表面(IMAC3)芯片和蛋白芯片仪检测153例心肌梗死患者血清标本(其中刚入院45例,3h标本12例,6h标本22例,9h标本24例,12h标本24例,24h标本16例,48h标本10例)中的蛋白质相对含量。结果　不同时期急性心肌梗死患者在质荷比为4kD^12kD间有10种血清蛋白质含量有显著差异。不同时期的患者均被正确判断,准确率为100%(153/153),灵敏度和特异性分别为100%(45/45)和100%(108/108)。结论　该方法可快速、准确检测各期急性心肌梗死,灵敏度、特异性高。 展开更多

关键词 心肌梗死 蛋白质组学 表面增强激光解吸附离子化时间飞行质谱(SELDI-TOF-MS)

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乙型肝炎病毒相关性肝癌患者的比较蛋白质组学研究 被引量：7

6

作者 刘池波 梁勇 +2 位作者 潘春琴 王海宝 牟思华 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2009年第9期1763-1766,共4页

筛选并鉴定了乙型肝炎病毒(HBV)相关性肝癌的血清差异表达蛋白.采用蛋白芯片及表面增强激光解吸电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术对正常人与乙型肝炎病毒相关性肝癌患者术前血清分别进行检测,共发现了44个差异蛋白,其中21个上调,23... 筛选并鉴定了乙型肝炎病毒(HBV)相关性肝癌的血清差异表达蛋白.采用蛋白芯片及表面增强激光解吸电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术对正常人与乙型肝炎病毒相关性肝癌患者术前血清分别进行检测,共发现了44个差异蛋白,其中21个上调,23个下调.通过高效液相色谱技术分离纯化其中表达差异最明显的蛋白,并进行质谱鉴定.通过蛋白功能结果分析表明,这些蛋白的差异表达可能与乙型肝炎病毒相关性肝癌的发生机制密切相关. 展开更多

关键词 乙型肝炎病毒相关性肝癌 表面增强激光解吸电离 蛋白质组

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应用SELDI-TOF-MS技术初步建立结直肠癌区域淋巴转移分类树模型 被引量：5

7

作者 高春芳 范乃军 +2 位作者 王秀丽 李冬晖 赵光 《解放军医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2010年第2期121-125,共5页

目的寻找血清中与结直肠癌淋巴结转移相关的特异性生物标志物。方法应用表面增强激光解吸离子化飞行时间质谱仪(SELDI-TOF-MS)检测结直肠癌患者血清的蛋白质谱,利用配套软件进行蛋白质峰值鉴定、聚类并建立分类树模型。70例伴区域淋巴... 目的寻找血清中与结直肠癌淋巴结转移相关的特异性生物标志物。方法应用表面增强激光解吸离子化飞行时间质谱仪(SELDI-TOF-MS)检测结直肠癌患者血清的蛋白质谱,利用配套软件进行蛋白质峰值鉴定、聚类并建立分类树模型。70例伴区域淋巴结转移的结直肠癌患者和75例年龄、性别匹配,无区域淋巴结转移的结直肠癌患者作为训练组,通过软件分析得到分类树模型,以35例伴区域淋巴结转移的结直肠癌患者和30例年龄、性别匹配,无区域淋巴结转移的结直肠癌患者作为测试组进行独立样本的双盲验证。结果共识别出46种组间差异蛋白,其中由质荷比(M/Z)为3104、3781、5867、7970、9290五种蛋白构成的分类树模型可以有效鉴别结直肠癌患者伴或不伴区域淋巴结转移,灵敏度和特异度分别为94.3%(66/70)和100.0%(75/75),经双盲验证其灵敏度、特异度、阳性预测值分别为91.4%(32/35)、96.7%(29/30)、97.0%(32/33)。结论所建立的分类树模型可以准确鉴别结直肠癌患者伴或不伴区域淋巴结转移,对结直肠癌的术前筛查有重要价值。 展开更多

关键词 光谱法 质量 表面增强激光解吸离子化飞行时间 结直肠肿瘤 生物学标记 蛋白质组学 淋巴转移

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胶质瘤脑脊液蛋白质指纹图诊断模型的建立及其在临床诊断中的应用 被引量：4

8

作者 刘建 郑树 +4 位作者 余捷凯 俞学斌 刘伟国 张建民 胡汛 《浙江大学学报（医学版）》 CAS CSCD 2005年第2期141-147,共7页

目的SELDI-TOF建立和评估区分脑胶质瘤与非脑肿瘤、脑胶质瘤与脑良性肿瘤的脑脊液蛋白指纹图诊断模型。方法收集脑胶质瘤、脑良性肿瘤和轻度脑外伤患者的脑脊液共75份,其中50份胶质瘤和非脑肿瘤脑脊液标本,随机分为训练组33份(17例胶质... 目的SELDI-TOF建立和评估区分脑胶质瘤与非脑肿瘤、脑胶质瘤与脑良性肿瘤的脑脊液蛋白指纹图诊断模型。方法收集脑胶质瘤、脑良性肿瘤和轻度脑外伤患者的脑脊液共75份,其中50份胶质瘤和非脑肿瘤脑脊液标本,随机分为训练组33份(17例胶质瘤,16例非脑肿瘤)和盲法测试组17份(5例胶质瘤,12例非脑肿瘤),检测结合在H4蛋白芯片上的蛋白质,获得脑肿瘤和非脑肿瘤的蛋白表达质谱图,用matlab操作平台的人工神经网络分析收集的数据,建立了区分脑胶质瘤与非脑肿瘤的脑脊液蛋白指纹图诊断模型。脑胶质瘤和脑良性肿瘤47份标本,随机分为训练集31份(13例胶质瘤,18例脑良性肿瘤)和盲法测试集16份(9例胶质瘤,7例脑良性肿瘤),运用同样方法分析收集的数据,建立了区分脑胶质瘤与脑良性肿瘤的蛋白指纹图诊断模型。同时运用支持向量机对上述人工神经网络的结果进行验证,二者结果非常相似。结果1建立了区分胶质瘤与非脑肿瘤的脑脊液蛋白指纹图诊断模型,盲法测试胶质瘤诊断的敏感性和特异性分别为100%和91.7%。2建立了区分胶质瘤与脑良性肿瘤的脑脊液蛋白指纹图诊断模型,盲法测试胶质瘤诊断的敏感性和特异性分别为88.9%和100%。结论研究建立的诊断模型为胶质瘤的临床诊断尤其是定性诊断提供了一条崭新的途径。 展开更多

关键词 表面加强解析/电离-飞行时间-质谱仪 神经网络(计算机) 支持向量机 诊断模型 脑肿瘤/诊断 神经胶质瘸/诊断 肿瘤标记物 生物学/脑脊液

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SELDI-TOF-MS筛查乳腺癌患者血清特异性蛋白的探讨 被引量：6

9

作者 刘彩刚 路平 +5 位作者 赵祥 顾劲松 刘金龙 庞葵 朱晓宣 张瑞山 《中国肿瘤临床》 CAS CSCD 北大核心 2007年第13期728-730,共3页

目的:应用表面增强激光解吸电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术寻找乳腺癌患者血清特异性蛋白。方法:应用弱阳离子蛋白质芯片(WCX2)及SELDI-TOF-MS技术检测12例正常人、10例乳腺良性病患者和22例乳腺癌患者血清中蛋白的相对含量。结果... 目的:应用表面增强激光解吸电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术寻找乳腺癌患者血清特异性蛋白。方法:应用弱阳离子蛋白质芯片(WCX2)及SELDI-TOF-MS技术检测12例正常人、10例乳腺良性病患者和22例乳腺癌患者血清中蛋白的相对含量。结果:三组样本质荷比在2000～30000Da间3939.314Da与3960.478Da的2个蛋白峰有显著差异。结论:SELDI-TOF-MS技术对乳腺癌早期诊断和特异性肿瘤标记物的筛选等方面具有一定价值,值得推广。 展开更多

关键词 乳腺肿瘤 弱阳离子蛋白质芯片 表面增强激光解吸电离飞行时间质谱

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血清蛋白质指纹谱对结直肠癌的鉴别诊断价值研究 被引量：3

10

作者 高春芳 盛新华 +3 位作者 王秀丽 郑国宝 赵光 李冬晖 《解放军医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2010年第2期130-133,共4页

目的探讨应用血清蛋白质指纹谱鉴别结直肠癌与其他常见恶性肿瘤的效能。方法应用表面增强激光解吸离子化飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术检测58例结直肠癌、30例结直肠良性疾病、90例其他恶性肿瘤(乳腺癌、胃癌、食管癌、肝癌、肺癌及... 目的探讨应用血清蛋白质指纹谱鉴别结直肠癌与其他常见恶性肿瘤的效能。方法应用表面增强激光解吸离子化飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术检测58例结直肠癌、30例结直肠良性疾病、90例其他恶性肿瘤(乳腺癌、胃癌、食管癌、肝癌、肺癌及肾癌各15例)患者及57例正常人的血清蛋白质指纹谱,建立结直肠癌鉴别诊断最优分类树模型。再从同期住院或健康体检人群中随机抽取以上诸病种及正常人各10例组成测试组,对鉴别诊断模型进行盲法验证。结果成功建立了由16种不同M/Z蛋白组成的结直肠癌鉴别诊断模型,该模型在测试模式下对结直肠癌的鉴别诊断准确率为83.8%,敏感度和总特异度分别为86.2%、83.1%,盲法验证总准确率为74.4%。结论应用血清蛋白质指纹谱技术建立的结直肠癌鉴别诊断模型具有较高的敏感度与特异度。 展开更多

关键词 结直肠肿瘤 光谱法 质量 表面增强激光解吸离子化飞行时间 蛋白质组学 诊断 鉴别

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SELDI技术对马尔尼菲青霉菌酵母相和霉菌相蛋白质组表达差异的分析 被引量：4

11

作者 刘栋华 刘晓军 谭升顺 《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第1期59-61,共3页

目的比较马尔尼菲青霉菌酵母相和霉菌相蛋白质组表达差异。方法应用表面增强激光解吸离子化飞行时间质谱技术(SELDI)检测马尔尼菲青霉菌酵母相和霉菌相的蛋白质谱。用PBSIIC型蛋白质芯片阅读机读取数据并进行分析。结果在WCX2芯片上共捕... 目的比较马尔尼菲青霉菌酵母相和霉菌相蛋白质组表达差异。方法应用表面增强激光解吸离子化飞行时间质谱技术(SELDI)检测马尔尼菲青霉菌酵母相和霉菌相的蛋白质谱。用PBSIIC型蛋白质芯片阅读机读取数据并进行分析。结果在WCX2芯片上共捕获75个蛋白峰,其中10个蛋白质在酵母相高表达,3个蛋白质在霉菌相高表达。相对分子质量为2900和3151蛋白质仅在酵母相表达,13151和13285蛋白质仅在霉菌相表达。结论SELDI技术可以检测出马尔尼菲青霉菌霉菌相和酵母相表达的小分子蛋白质差异。 展开更多

关键词 马尔尼菲青霉菌 酵母相 霉菌相 蛋白质组 表面增强激光解吸离子化

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SELDI-TOF-MS技术筛查预测乳腺癌患者曲妥珠单抗耐药的生物标志物 被引量：3

12

作者 郑弘宇 陈慧菁 +3 位作者 吴凡 黄伟炜 陈强 叶韵斌 《中国肿瘤生物治疗杂志》 CAS CSCD 北大核心 2010年第4期368-373,共6页

目的:应用表面加强激光解析电离化飞行时间质谱技术(surface enhanced laser desorption/ionization-time of flight-mass spectrometry,SELDI-TOF-MS)比较乳腺癌曲妥珠单抗治疗耐药患者与非耐药患者血清蛋白质谱的差异,筛选预测乳腺癌... 目的:应用表面加强激光解析电离化飞行时间质谱技术(surface enhanced laser desorption/ionization-time of flight-mass spectrometry,SELDI-TOF-MS)比较乳腺癌曲妥珠单抗治疗耐药患者与非耐药患者血清蛋白质谱的差异,筛选预测乳腺癌患者曲妥珠单抗耐药的标志蛋白。方法:选择福建省肿瘤医院2008年1月至2009年10月曲妥珠单抗治疗的乳腺癌患者35例,以临床界定标准将患者分为耐药组(11例)和非耐药组(24例)。应用SELDI-TOF-MS技术检测两组患者外周血蛋白质表达谱的差异,以差异蛋白峰值比1.5为耐药的蛋白界定标准,以此标准判定患者耐药与否。分析该蛋白界定标准评判曲妥珠单抗耐药的灵敏度、特异度以及阳性预测值、阴性预测值。结果:以临床界定标准评判的曲妥珠单抗耐药的发生与患者年龄、分期、腋窝淋巴结转移和ER/PR双阴无关。临床耐药组和非耐药组患者外周血蛋白质表达谱比较显示,耐药患者的蛋白质峰7971Da、9284Da显著降低(P<0.05)。以蛋白界定标准评判患者曲妥单抗耐药与非耐药,7971Da评判时的灵敏度为81.82%(9/11)、特异度为83.33%(20/24)、阳性预测值为69.23%(9/13)、阴性预测值为90.91%(20/22);以9284Da评判时的灵敏度为72.73%(8/11)、特异度为79.17%(19/24)、阳性预测值为61.54%(8/13)、阴性预测值为86.36%(19/22)。结论:应用SELDI-TOF-MS技术检测的差异蛋白质峰7971Da、9284Da似可作为预测乳腺癌患者曲妥珠单抗耐药的生物标志物。 展开更多

关键词 表面加强激光解析电离化飞行时间质谱技术 乳腺肿瘤 曲妥珠单抗 耐药 生物标志物

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心理训练对心理应激后陆军特种兵血清蛋白质谱特征的影响 被引量：8

13

作者 张蓉 张莉 《解放军医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2011年第9期985-987,共3页

目的观察采取不同方式进行心理训练后,陆军特种兵心理应激时血清蛋白质谱的变化特点,以评价心理训练效果。方法将96名特种兵新兵随机均分为单纯心理训练组、循环心理训练组和对照组(n=32),训练4周后,参加高强度模拟防暴演习。采用表面... 目的观察采取不同方式进行心理训练后,陆军特种兵心理应激时血清蛋白质谱的变化特点,以评价心理训练效果。方法将96名特种兵新兵随机均分为单纯心理训练组、循环心理训练组和对照组(n=32),训练4周后,参加高强度模拟防暴演习。采用表面增强激光解吸电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术结合蛋白质芯片检测各组血清蛋白表达谱的变化。结果方差分析结果显示,3组血清中质荷比(M/Z)为6417.89、134.21、5 171.91、4 972.7Da的4种蛋白相对含量差异显著(P<0.05);与对照组比较,单纯心理训练组M/Z为9134.21、5 171.9Da的2种蛋白表达显著升高(P<0.05),而循环心理训练组4种蛋白的表达均显著升高(P<0.05);与单纯心理训练组比较,循环心理训练组M/Z为6417.81、4 972.7Da的2种蛋白表达显著升高(P<0.05)。M/Z为6417.8和14 972.7Da的蛋白组成的分类树模型在学习模式及测试模式下可将96名战士完全正确分组。结论心理训练可使应激后低表达的蛋白明显上调,提高机体对心理应激的适应能力,且循环心理训练的效果优于单纯心理训练。 展开更多

关键词 应激 心理学 适应 心理学 蛋白质组 军事人员 光谱法 质量 表明增强激光解吸离子化飞行时间

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应用SELDI技术建立下咽鳞癌放疗疗效预测模型 被引量：2

14

作者 田文栋 曾宗渊 +1 位作者 于文斌 李湘平 《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第6期1282-1287,共6页

目的利用表面增强激光解吸电离-飞行时间-质谱技术从蛋白质组学的角度探讨下咽鳞癌的血清蛋白质组指纹图谱。方法采集58例下咽鳞癌患者血清,采用CM10芯片和PBSⅡ-C型蛋白质芯片阅读机检测,对下咽鳞癌不同组别的血清蛋白质指纹图谱进行比... 目的利用表面增强激光解吸电离-飞行时间-质谱技术从蛋白质组学的角度探讨下咽鳞癌的血清蛋白质组指纹图谱。方法采集58例下咽鳞癌患者血清,采用CM10芯片和PBSⅡ-C型蛋白质芯片阅读机检测,对下咽鳞癌不同组别的血清蛋白质指纹图谱进行比较,寻找潜在的相关差异蛋白,初步建立预测下咽鳞癌放疗敏感性决策分类树模型。结果颈淋巴结转移组和无颈淋巴结转移组血清各差异蛋白峰的表达强度差别均无统计学意义(P>0.05);分化较差组和分化较好组有1个血清差异蛋白的表达强度差别有统计学意义(P<0.05),但区分度并不理想;化疗敏感组和化疗不敏感组差别无统计学意义(P>0.05);放疗敏感组和放疗不敏感组比较,P≤0.05时有5个差异性表达蛋白峰,均在放疗敏感组高表达。Biomarker Pattern软件选取2个差异性蛋白峰建立的下咽鳞癌放疗敏感性分类树预测模型,灵敏度100%(13/13),特异度83.33%(10/12)。结论下咽鳞癌放疗敏感组患者血清中m/z为6115.75的蛋白较放疗不敏感组高表达(P=0.0019)。初步建立的放疗敏感性预测模型有望用于预测下咽鳞癌的放疗敏感性。 展开更多

关键词 下咽肿瘤 鳞状细胞癌 蛋白质组 SELDI

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SELDI-TOF-MS技术在口腔黏膜癌前病变和口腔鳞癌的唾液诊断模型中的应用 被引量：4

15

作者 平飞云 孙钢 何虹 《中国病理生理杂志》 CAS CSCD 北大核心 2010年第1期203-208,共6页

目的:分析唾液中蛋白质组对口腔鳞癌患者的动态变化的意义,对口腔鳞癌和癌前病变的相关诊断模型的建立进行初步探索。方法:按标准提取唾液标本,采用SELDI-TOF-MS技术,对17例口腔鳞癌患者、7例区域性转移患者、8例白斑患者和15例健康志... 目的:分析唾液中蛋白质组对口腔鳞癌患者的动态变化的意义,对口腔鳞癌和癌前病变的相关诊断模型的建立进行初步探索。方法:按标准提取唾液标本,采用SELDI-TOF-MS技术,对17例口腔鳞癌患者、7例区域性转移患者、8例白斑患者和15例健康志愿者的唾液蛋白质指纹图谱进行比较,并采用整合性生物信息学方法建立诊断模型。结果:得到唾液诊断模型Ⅰ,为原发性口腔鳞癌患者与正常人的诊断模型:质荷比分别为5797、2902、3883和4951的4个蛋白质峰。其中5797、2902和3883在原发性口腔鳞癌患者唾液中低表达。4951在原发性口腔鳞癌患者唾液中高表达。敏感性为93.33%,特异性为88.24%,总准确率为90.63%。唾液诊断模型Ⅱ,为OSCC区域性转移患者与正常人的诊断模型:质荷比分别为5446、4934、4968、3296、4800和2901的6个蛋白质峰。其中5446、4934和3296在口腔鳞癌区域性转移患者唾液中高表达。4968、4800和2901在口腔鳞癌区域性转移患者唾液中低表达,敏感性为100.00%,特异性为85.71%,总准确率为95.45%。唾液诊断模型Ⅲ,为白斑患者与正常人的诊断模型:质荷比分别为9515、2230、2238、5694和2646的5个蛋白质峰。其中9515和5694在白斑患者唾液中高表达。2230、2238和2646在白斑患者唾液中低表达,敏感性为93.33%,特异性为85.71%,总准确率为86.96%。结论:结合SELDI-TOF-MS和生物信息学方法,唾液对肿瘤的诊断意义将进一步发挥其价值。本研究根据口腔粘膜上皮癌前病变、癌变、转移的唾液蛋白质组的变化,初步建立了3个早期诊断模型。 展开更多

关键词 口腔肿瘤 表面增强激光解吸电离飞行时间质谱 唾液 蛋白质组

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应用SELDI蛋白芯片技术对肝炎后肝硬化早期癌变的蛋白质组学研究 被引量：2

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作者 郑国宝 高春芳 +2 位作者 王秀丽 赵光 李冬晖 《解放军医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2010年第2期134-136,共3页

目的探讨肝炎后肝硬化早期癌变的血清蛋白质组学特点。方法应用表面增强激光解吸离子化飞行时间质谱仪(SELDI-TOF-MS)结合铜离子蛋白芯片检测62例肝炎后肝硬化与100例Ⅰ-Ⅱ期(T1-2N0M0)肝癌并肝硬化患者的血清蛋白质谱,采用Biomarker Wi... 目的探讨肝炎后肝硬化早期癌变的血清蛋白质组学特点。方法应用表面增强激光解吸离子化飞行时间质谱仪(SELDI-TOF-MS)结合铜离子蛋白芯片检测62例肝炎后肝硬化与100例Ⅰ-Ⅱ期(T1-2N0M0)肝癌并肝硬化患者的血清蛋白质谱,采用Biomarker Wizard和Biomarker Patterns软件分析并建立分类树模型,并对分类树模型的诊断效能进行验证。结果对肝炎后肝硬化与肝癌并肝硬化患者的血清蛋白质谱进行分析,建立了由4种差异蛋白组成的分类树模型。采用该分类树模型在学习模式下对100例肝癌伴肝硬化、62例肝炎肝硬化患者进行分组,准确率为99.4%(161/162),诊断肝癌伴肝硬化的灵敏度和特异度分别为99.0%(99/100)、100.0%(62/62),在测试模式下对上述患者进行分组,其准确率为94.4%(153/162),诊断肝癌伴肝硬化的灵敏度和特异度分别为95.0%(95/100)、93.5%(58/62)。结论应用SELDI蛋白芯片技术筛选肝炎后肝硬化早期癌变具有方便、快捷、灵敏度高、特异性强的优点。 展开更多

关键词 肝硬化 肝炎后 癌 肝细胞 光谱法 质量 表面增强激光解吸离子化飞行时间 蛋白质组学 早期诊断

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SELDI-TOF-MS技术检测心绞痛患者血浆蛋白指纹图谱的研究 被引量：2

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作者 何文娟 胡豫 +4 位作者 张小平 余捷凯 洪梅 郭涛 宋善俊 《中国病理生理杂志》 CAS CSCD 北大核心 2009年第2期389-391,共3页

目的:采用表面增强激光解析/电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术检测心绞痛患者血浆蛋白质指纹图谱,从中筛选出特异的分子标志物。方法:应用SELDI-TOF-MS技术及金属离子螯合(IMAC-3)蛋白质芯片对20例心绞痛患者和29例正常对照者血浆样... 目的:采用表面增强激光解析/电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术检测心绞痛患者血浆蛋白质指纹图谱,从中筛选出特异的分子标志物。方法:应用SELDI-TOF-MS技术及金属离子螯合(IMAC-3)蛋白质芯片对20例心绞痛患者和29例正常对照者血浆样本进行检测,借助生物信息学工具(非线性的支持向量机,SVM)提出心绞痛的诊断模型,并运用留一交叉验证法来评估该模型的判别效能。结果:用SELDI-TOF-MS技术筛选出由3个有显著差异的蛋白质峰[质荷比(m/z)分别为2667.3、5914.0和6890.5]组合构建的诊断模型,可将20例心绞痛患者和29例正常人全部正确分组,诊断特异性和灵敏度均为100%。结论:SELDI-TOF-MS技术在心绞痛的诊断中具有较高灵敏度和特异性,发现的蛋白质峰可能在心绞痛的发病中起一定作用,血浆中分子标志物的发现有助于心绞痛的早期诊断。 展开更多

关键词 心绞痛 表面增强激光解吸/电离飞行时间质谱 蛋白质组

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帕金森病相关血清蛋白质标志物的筛选及鉴定 被引量：2

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作者 周婷 刘池波 +1 位作者 徐小辉 梁海燕 《中国病理生理杂志》 CAS CSCD 北大核心 2013年第4期664-669,共6页

目的:探讨并初步鉴定帕金森病患者血清中相关蛋白质作为特异标志物的可能性。方法:应用表面增强激光解吸电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)结合纳米磁珠技术检测44例帕金森病和60例健康对照的血清标本,应用生物信息学方法筛选差异蛋白峰,... 目的:探讨并初步鉴定帕金森病患者血清中相关蛋白质作为特异标志物的可能性。方法:应用表面增强激光解吸电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)结合纳米磁珠技术检测44例帕金森病和60例健康对照的血清标本,应用生物信息学方法筛选差异蛋白峰,经高效液相色谱(HPLC)分离出差异蛋白,酶解后进行液质联用串联质谱(LC-MS/MS)分析,利用Xcalibur的程序组件BioWorks 3.2完成蛋白质序列数据库鉴定分析。结果:经SELDI-TOF-MS结合纳米磁珠技术筛选出质荷比m/z位于8 937的蛋白质在帕金森病中高表达(帕金森病组表达强度为27.47±16.58,正常组表达强度为5.01±3.47),有显著差异(P<0.01);6 636和8 697的蛋白质在帕金森病中低表达(帕金森病组表达强度为5.43±2.66和20.22±9.57,正常组表达强度为18.85±7.56和51.13±26.22),有显著差异(P<0.01)。联合上述3种潜在蛋白质标志物,可区分帕金森病组和对照组,其中帕金森病患者检出率为90.0%(27/30),健康者检出率为92.5%(37/40)。对m/z为6 636、8 697和8 937的标志物进行鉴定,结果分别为载脂蛋白C-I、载脂蛋白C-III和补体成分3a。结论:鉴定出的载脂蛋白C-I、载脂蛋白C-III和补体成分3a在帕金森病的诊断中具有一定价值,值得进一步研究和探讨。 展开更多

关键词 帕金森病 蛋白质组 表面增强激光解吸电离飞行时间质谱法 液相色谱-质谱联用串联质谱

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肺癌患者血清蛋白质组的特征研究 被引量：2

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作者 高春芳 赵光 +1 位作者 王秀丽 李冬晖 《解放军医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2010年第4期439-441,共3页

目的比较肺癌患者、肺良性病患者及正常人血清蛋白质组的差异,以期发现可用于肺癌诊断的生物学指标。方法采用表面增强激光解吸离子化飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)蛋白芯片技术,检测89例肺癌患者、64例肺良性病患者及68例健康人血清,筛... 目的比较肺癌患者、肺良性病患者及正常人血清蛋白质组的差异,以期发现可用于肺癌诊断的生物学指标。方法采用表面增强激光解吸离子化飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)蛋白芯片技术,检测89例肺癌患者、64例肺良性病患者及68例健康人血清,筛选出有分类意义的差异蛋白并建立分类树模型。再从同期住院或健康体检人群中随机抽取肺癌患者、肺良性病患者及健康人各30例组成测试组,对诊断分类树模型进行盲法验证。结果比较三组血清,共发现39种差异蛋白质(P<0.05),由其中质荷比(M/Z)为4485、5252、5807、5908、5969、6113、6625、8946、8998、9137、9183、9298、9498、13878、15128、15867、16081的17种蛋白建立的诊断分类树模型,对肺癌、肺良性病、健康人的分类准确率为98.2%(217/221),敏感度为98.9%(88/89),特异度为97.7%(129/132),双盲验证的敏感度和特异度分别为90.0%(27/30)和93.3%(56/60)。结论利用SELDI-TOF-MS技术建立的肺癌诊断分类树模型具有较高的敏感度和特异度,可用于肺癌的快速诊断。 展开更多

关键词 肺肿瘤 光谱法 质量 表面增强激光解吸离子化飞行时间 蛋白质组学 生物学标记

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表面增强激光解析电离光谱技术分析人卵泡发育过程中蛋白质组学变化 被引量：2

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作者 李黎 邢福祺 +2 位作者 陈士岭 孙玲 李红 《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第2期275-278,共4页

目的应用蛋白质芯片和质谱技术,建立人成熟卵泡液及窦卵泡液的蛋白质表达指纹图谱,寻找在卵泡生长发育过程中起关键作用的蛋白质。方法采用表面增强激光解析电离飞行时间质谱技术和弱阳离子交换蛋白质芯片检测48例人成熟卵泡液、21例窦... 目的应用蛋白质芯片和质谱技术,建立人成熟卵泡液及窦卵泡液的蛋白质表达指纹图谱,寻找在卵泡生长发育过程中起关键作用的蛋白质。方法采用表面增强激光解析电离飞行时间质谱技术和弱阳离子交换蛋白质芯片检测48例人成熟卵泡液、21例窦卵泡液中的蛋白质变化,使用PBSⅡ-C型蛋白质芯片阅读机读取数据,获得的结果采用Ciphergen公司的Biomarker wizard和Biomarker Patterns System软件进行分析。结果成熟卵泡液组与窦卵泡液组蛋白质谱相比,有4种蛋白质在含量上有显著差异,2种蛋白质在成熟卵泡液组表达上调,2种蛋白质表达下降。结论成熟卵泡液与窦卵泡液蛋白质谱存在显著差异,差异蛋白可能与卵泡发育、卵子受精密切相关。 展开更多

关键词 表面增强激光解吸附离子化时间飞行质谱 蛋白质芯片 人卵泡液

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