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丹参Remorin基因SmREM1.2的克隆及生物信息学和表达分析
1
作者
庞雨萌
刘湘
+3 位作者
董仲春
王新新
赵一伍
赵双双
《山东农业科学》
北大核心
2024年第7期1-7,共7页
Remorin蛋白是一类植物特异的寡聚丝状蛋白,定位于细胞膜,介导脂筏微区形成,在植物逆境胁迫应答及植物免疫调节等过程中发挥重要作用。丹参是我国大宗类中药材,广泛用于心脑血管疾病等的治疗。但目前丹参Remorin蛋白的相关研究报道还不...
Remorin蛋白是一类植物特异的寡聚丝状蛋白,定位于细胞膜,介导脂筏微区形成,在植物逆境胁迫应答及植物免疫调节等过程中发挥重要作用。丹参是我国大宗类中药材,广泛用于心脑血管疾病等的治疗。但目前丹参Remorin蛋白的相关研究报道还不多。本研究基于丹参转录组及基因组数据库,克隆得到丹参Remorin基因SmREM1.2,通过生物信息学方法对其氨基酸组成、保守序列、系统进化进行分析,并对其亚细胞定位及在盐胁迫下的表达情况进行分析。结果表明,该基因CDS全长585 bp,编码194个氨基酸残基。SmREM1.2蛋白为弱酸性不稳定的亲水性蛋白,无信号肽,无跨膜区,含有Remorin_N和Remorin_C保守结构域,二级结构以α螺旋和无规则卷曲为主;氨基酸序列分析结果显示其C端具有高度保守的coiled-coil模体,属于典型的REM蛋白;系统进化树分析结果表明SmREM1.2与芡欧鼠尾草(Salvia hispanica)的Remorin蛋白亲缘关系较近。构建pCAMBIA-SmREM1.2-GFP重组载体,利用烟草瞬时转化系统对SmREM1.2进行亚细胞定位分析,发现该蛋白定位于细胞膜上。通过实时荧光定量PCR分析发现SmREM1.2受盐胁迫诱导上调表达,推测其在盐胁迫下发挥重要作用。本研究结果可为后期深入探索SmREM1.2基因的功能及应用提供理论依据。
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关键词
丹参
smrem1.2
基因
基因克隆
生物信息学分析
表达分析
亚细胞定位
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职称材料
题名
丹参Remorin基因SmREM1.2的克隆及生物信息学和表达分析
1
作者
庞雨萌
刘湘
董仲春
王新新
赵一伍
赵双双
机构
山东师范大学生命科学学院
中国中医科学院中药资源中心/道地药材国家重点实验室培育基地
出处
《山东农业科学》
北大核心
2024年第7期1-7,共7页
基金
国家自然科学基金项目(32070313)
山东师范大学大学生创新创业训练计划项目(202110445273,202110445140)。
文摘
Remorin蛋白是一类植物特异的寡聚丝状蛋白,定位于细胞膜,介导脂筏微区形成,在植物逆境胁迫应答及植物免疫调节等过程中发挥重要作用。丹参是我国大宗类中药材,广泛用于心脑血管疾病等的治疗。但目前丹参Remorin蛋白的相关研究报道还不多。本研究基于丹参转录组及基因组数据库,克隆得到丹参Remorin基因SmREM1.2,通过生物信息学方法对其氨基酸组成、保守序列、系统进化进行分析,并对其亚细胞定位及在盐胁迫下的表达情况进行分析。结果表明,该基因CDS全长585 bp,编码194个氨基酸残基。SmREM1.2蛋白为弱酸性不稳定的亲水性蛋白,无信号肽,无跨膜区,含有Remorin_N和Remorin_C保守结构域,二级结构以α螺旋和无规则卷曲为主;氨基酸序列分析结果显示其C端具有高度保守的coiled-coil模体,属于典型的REM蛋白;系统进化树分析结果表明SmREM1.2与芡欧鼠尾草(Salvia hispanica)的Remorin蛋白亲缘关系较近。构建pCAMBIA-SmREM1.2-GFP重组载体,利用烟草瞬时转化系统对SmREM1.2进行亚细胞定位分析,发现该蛋白定位于细胞膜上。通过实时荧光定量PCR分析发现SmREM1.2受盐胁迫诱导上调表达,推测其在盐胁迫下发挥重要作用。本研究结果可为后期深入探索SmREM1.2基因的功能及应用提供理论依据。
关键词
丹参
smrem1.2
基因
基因克隆
生物信息学分析
表达分析
亚细胞定位
Keywords
Salvia miltiorrhiza Bunge
smrem1.2 gene
gene
cloning
Bioinformatics analysis
Ex-pression analysis
Subcellular localization
分类号
S567.53 [农业科学—中草药栽培]
Q781 [生物学—分子生物学]
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1
丹参Remorin基因SmREM1.2的克隆及生物信息学和表达分析
庞雨萌
刘湘
董仲春
王新新
赵一伍
赵双双
《山东农业科学》
北大核心
2024
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