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数据压缩在序列比对中的应用
1
作者
杜娟
呼广跃
《计算机工程与应用》
CSCD
北大核心
2008年第22期241-243,共3页
同源或非同源长基因组序列的分析比较需要高效率的比对算法。开发出一个新的两两比对工具"超级压缩比对"(简称SCA),该系统是建立在Sequitur编码理论专为长基因组序列的两两比对设计。SCA是一个线性算法,并且能够处理序列重排...
同源或非同源长基因组序列的分析比较需要高效率的比对算法。开发出一个新的两两比对工具"超级压缩比对"(简称SCA),该系统是建立在Sequitur编码理论专为长基因组序列的两两比对设计。SCA是一个线性算法,并且能够处理序列重排。实验证明SCA算法能够准确快速的完成长基因组序列的比对。
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关键词
序列比对
sequitur码
锚定
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职称材料
题名
数据压缩在序列比对中的应用
1
作者
杜娟
呼广跃
机构
天津城市建设学院
出处
《计算机工程与应用》
CSCD
北大核心
2008年第22期241-243,共3页
文摘
同源或非同源长基因组序列的分析比较需要高效率的比对算法。开发出一个新的两两比对工具"超级压缩比对"(简称SCA),该系统是建立在Sequitur编码理论专为长基因组序列的两两比对设计。SCA是一个线性算法,并且能够处理序列重排。实验证明SCA算法能够准确快速的完成长基因组序列的比对。
关键词
序列比对
sequitur码
锚定
Keywords
sequence alignment
sequitur
code
anchor
分类号
TP301.6 [自动化与计算机技术—计算机系统结构]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
数据压缩在序列比对中的应用
杜娟
呼广跃
《计算机工程与应用》
CSCD
北大核心
2008
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