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题名茶树STOP基因家族的鉴定及表达模式分析
被引量：2
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作者
龙露
汤丹丹
陈玮
谭礼强
陈盛相
唐茜
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机构
四川农业大学园艺学院
精制川茶四川省重点实验室
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出处
《茶叶科学》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第3期386-398,共13页
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基金
国家自然科学基金(32202538)
四川省自然科学基金(2022NSFSC0180、2023NSFSC0166)
+3 种基金
四川省科技厅重点研发项目(2021YFN0004)
雅安市科技计划项目(22SXHZ0057)
特色茶树新品种高效繁育技术集成与示范(2022YSX12)
雅安名山省级农业科技园区现代茶产业关键技术集成研究与示范(2021YFN0031)。
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文摘
STOP(Sensitive to proton rhizotoxicity)是一类C_(2)H_(2)型锌指结构转录因子,在植物多种胁迫耐受机制中发挥重要调控作用。基于茶树(Camellia sinensis)全基因组数据共鉴定出6个STOP家族基因,并运用生物信息学和实时荧光定量PCR(qRT-PCR)等方法对其进行分析。结果表明,6个CsSTOPs基因编码376~505个氨基酸,蛋白质分子量为42.17~56.36 kDa,理论等电点为5.53~8.85,均为不稳定蛋白;蛋白质保守结构域分析发现,它们均含zf-C_(2)H_(2)保守结构域;系统进化分析显示,茶树的STOP基因与拟南芥、甜橙、烟草的同源性较高;启动子顺式作用元件分析发现,CsSTOPs具有许多与生长发育、激素响应及非生物胁迫相关的作用元件;茶树各器官的转录组数据分析结果表明,CsSTOP1在根、果实、成熟叶片中的表达量较高,CsSTOP2在幼嫩叶片中的表达量较高,CsSTOP3在老叶中的表达量较高,而Cs STOP4和Cs STOP5在各个器官中的表达都较低。CsSTOPs基因能够被PEG诱导的干旱胁迫、盐胁迫、茉莉酸甲酯胁迫和冷胁迫处理诱导表达,说明CsSTOPs基因参与调控茶树生长发育和响应非生物胁迫过程。qRT-PCR检测发现,CsSTOPs、CsGS1s和CsGDHs基因在高NH_(4)^(+)浓度处理(4.5 mmol·L^(-1))的峨眉问春茶树叶和根中的表达量均高于对照处理(CK),尤其是叶中CsSTOPs、CsGS1.1、CsGS1.3和CsGDH2在高NH_(4)^(+)浓度处理下的表达量显著高于对照。研究结果初步解析了CsSTOPs的基本特征和功能,发现CsSTOPs可响应高NH_(4)^(+)浓度处理,可能与CsGS1s和CsGDHs协同调控茶树适应高NH_(4)^(+)环境的过程。
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关键词
茶树
stop基因家族
生物信息学分析
基因表达
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Keywords
tea plant
stop gene family
bioinformatics analysis
gene expression
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分类号
S571.1
[农业科学—茶叶生产加工]
Q52
[生物学—生物化学]
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