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SSX基因家族HLA-A2.1限制性CTL表位预测及其MHC-Ⅰ亲和力分析 被引量：1
1
作者 何仰东 吴玉章 +6 位作者 林治华 贾正才 姜曼 黎万玲 付晓岚 邓一静 倪兵 《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第9期872-875,共4页
目的 通过对肿瘤基因SSX家族不同成员进行CTL表位预测，并对其与MHC-I亲和力进行分析，为探索基于SSX肿瘤基因家族的免疫治疗奠定基础。方法 利用基于超基序结合量化基序方案开发的HLA-A2．1限制性CTL表位预测软件，对SSX基因家族不同... 目的 通过对肿瘤基因SSX家族不同成员进行CTL表位预测，并对其与MHC-I亲和力进行分析，为探索基于SSX肿瘤基因家族的免疫治疗奠定基础。方法 利用基于超基序结合量化基序方案开发的HLA-A2．1限制性CTL表位预测软件，对SSX基因家族不同成员进行CTL表位预测，然后合成SSX相关待测表位肽P1（AMTKLGFKA）、P4（AMT-KLGFNV）、P5（AMTKLGFKV）和P6（VMTKLGFKV），再对这些合成肽与MHC-I结合亲和力及其结合物稳定性进行实验分析。结果与实验阳性肽（HBcAg，18～27）相比，除P1外，P4、P5、P6均显示较高的结合亲和力；而结合稳定性实验（DC50）结果显示，P1、P4与阳性对照肽（HBcAg，18～27）DC。均大于8h，而P5和P6的DC50介于2～4h之间。结论 计算机软件预测的CTL表位肽，经过体外亲和力与结合稳定性实验筛选到2条理想的表位肽，为该表位的下一步体内鉴定奠定基础。 展开更多
关键词 ssx肿瘤基因 表位预测 HLA-A2.1限制性 结合亲和力
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