基于SSU rDNA序列的网状车轮虫群体遗传结构及多样性研究 被引量：3

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作者 许治祥 唐发辉 赵元莙 《水生生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第9期1412-1419,共8页

基于SSU rDNA序列对当前分布于我国的网状车轮虫(Trichodina reticulata Hirschman&Partsch,1955)的群体遗传结构与多样性进行了研究。遗传结构研究结果表明:20个样本共检测到9个单倍型,含4个共享单倍型与5个特有单倍型,其中鲫来源... 基于SSU rDNA序列对当前分布于我国的网状车轮虫(Trichodina reticulata Hirschman&Partsch,1955)的群体遗传结构与多样性进行了研究。遗传结构研究结果表明:20个样本共检测到9个单倍型,含4个共享单倍型与5个特有单倍型,其中鲫来源的Hap3是最大的共享单倍型;草鱼来源的Hap8和小黄黝鱼来源的Hap9暂被视为湖北武汉和西藏地区各自特有的单倍型;同时推测鲫来源的单倍型Hap1为祖先单倍型。结合ML系统发育树分析推测,在多宿主的进化历程中,鲫寄生的网状车轮虫可能是分化最早的群体,且草鱼寄生的网状车轮虫在起源上来自于鲫。遗传多样性结果显示,所有群体均呈现较高的单倍型多样性(Hd≥0.5)与较低的核苷酸多样性(P_(i)<0.005),且鲫来源的单倍型多样性显著高于草鱼来源,但核苷酸多样性(P_(i))明显低于后者。遗传分化(F_(st))与基因流(N_(m))研究结果表明,Group A(鲫来源)与Group B(草鱼来源)群体间相对独立且已经达到了极度分化程度,群体内基因层面的交流较少。综合中性检验与核苷酸单倍型错配分析认为,Group A(鲫来源)未发生过种群扩张,Group B(草鱼来源)则存在过早期的种群扩张历史。 展开更多

关键词 ssu rdna 单倍型多样性 核苷酸多样性 遗传分化 基因流 网状车轮虫

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重寄生车轮虫宿主新记录及种内分化研究

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作者 唐发辉 蒋玉椒 +2 位作者 秦微微 夏萍 赵元莙 《水生生物学报》 北大核心 2025年第6期52-61,共10页

为探索重寄生车轮虫(Trichodina hyperparasitis Chen&Hsieh,1984)种内分化的影响因素,研究通过广泛采样分离获得寄生于乌鳢(Channa argus)与月鳢(Channa asiatica)鳃部的重寄生车轮虫3个地理株系,即重庆沙坪坝乌鳢寄生株系(S株系)... 为探索重寄生车轮虫(Trichodina hyperparasitis Chen&Hsieh,1984)种内分化的影响因素,研究通过广泛采样分离获得寄生于乌鳢(Channa argus)与月鳢(Channa asiatica)鳃部的重寄生车轮虫3个地理株系,即重庆沙坪坝乌鳢寄生株系(S株系)、重庆大足乌鳢寄生株系(D株系)与贵州凯里月鳢寄生株系(K株系),其中贵州凯里为重寄生车轮虫的地理新记录,月鳢为其宿主新记录。结合形态学与分子证据对重寄生车轮虫不同株系进行了比较研究,基于附着盘形态学量化与主成分分析的研究结果显示:三地理株系在虫体大小方面存在显著差异,其中S株系是虫体最大的株系(P<0.05),也是齿体最长的株系(P<0.05),K株系是齿体数最少的株系;S株系与K株系在附着盘整体结构与齿体形态方面存在一定的种内差异(P<0.05);基于SSU rDNA序列的株系比较结果显示,K株系与其他2株系间存在10个碱基变异位点,但3株系间序列相似度为99.45%—100%,遗传距离为0.001—0.003;基于SSU rDNA的系统发育分析显示,重寄生车轮虫与近缘种之间形成了宿主种类特有的单系,即“鲈形目Perciformes支系”与“鲇形目Siluriformes支系”;同时在其种内也形成了宿主种群特有的单系,即“乌鳢支系”与“月鳢支系”。综合研究结果表明,重寄生车轮虫并非一定营“重寄生”生活,且偏好寄生于鳢属(Channa)鱼类;其中乌鳢寄生的两株系间较近缘,与月鳢寄生的株系间则较远缘,且各株系间已存在一定程度的遗传分化与形态分化;推测对于外寄生车轮虫而言,第一生境即宿主的类型可能是影响车轮虫种间或种群分化最直接的因素。 展开更多

关键词 新记录 种内分化 ssu rdna 鳢属鱼类 重寄生车轮虫

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光唇鱼寄生济宁碘泡虫新种的鉴定和描述

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作者 丁鹏 张潇艺 +1 位作者 聂品 柳阳 《渔业研究》 2025年第5期591-597,共7页

【目的】为鉴定寄生于光唇鱼(Acrossocheilus fasciatus)鳃的碘泡虫。【方法】利用形态学、组织学和分子生物学相结合的方法对寄生光唇鱼的碘泡虫进行鉴定和描述。【结果】该碘泡虫寄生于光唇鱼的鳃部,形成椭圆形孢囊,孢囊长96μm、宽58... 【目的】为鉴定寄生于光唇鱼(Acrossocheilus fasciatus)鳃的碘泡虫。【方法】利用形态学、组织学和分子生物学相结合的方法对寄生光唇鱼的碘泡虫进行鉴定和描述。【结果】该碘泡虫寄生于光唇鱼的鳃部,形成椭圆形孢囊,孢囊长96μm、宽58μm。成熟孢子的壳面观呈梨形,孢子长(11.5±0.3)μm(11.2~12.4μm)、宽(6.1±0.3)μm(5.2~6.4μm)。两个极囊大小相等,呈梨形,极囊长(6.0±0.5)μm(5.1~6.9μm)、宽(2.2±0.1)μm(2.0~2.5μm),极丝圈数为4~6圈。形态学比较发现,该碘泡虫与已报道的碘泡虫种类的形态学特征均不一致。组织学分析发现,该碘泡虫寄生于光唇鱼鳃小片中,孢囊内充满不同发育阶段的孢子。分子序列分析发现,该碘泡虫的SSU rDNA序列与GenBank中所有碘泡虫的分子序列均不一致。该碘泡虫与Myxobolus dykovae(EU643627)和M.tasikkenyiren-sis(EU643626)相似性最高,分别为94.16%和92.60%。系统发育分析显示,该碘泡虫与其他寄生于鱼类鳃部的碘泡虫共同形成独立的分支。【结论】综上所述,本研究从光唇鱼鳃部分离的碘泡虫为一新种,根据采样地点将其命名为济宁碘泡虫(M.jiningensis n.sp.)。该碘泡虫是首个报道的寄生于光唇鱼的粘孢子虫种类,该报道为光唇鱼寄生粘孢子虫的研究提供资料。 展开更多

关键词 光唇鱼 济宁碘泡虫 ssu rdna序列 物种鉴定

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我国部分地区羊芽囊原虫流行病学调查 被引量：3

4

作者 刘林科 王朋林 +6 位作者 菅忆晨 李世杰 王占铭 王荣军 张龙现 宁长申 菅复春 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第4期1061-1068,共8页

芽囊原虫(Blastocystis spp.)是人和动物肠道中最常见的原生生物之一,能引起人和动物的肠道疾病和皮肤疾病,且有人兽共患基因亚型。为了解不同地区羊芽囊原虫的感染情况,对来自7个省、区的704份羊粪便样品,基于核糖体小亚基基因(SSU rD... 芽囊原虫(Blastocystis spp.)是人和动物肠道中最常见的原生生物之一,能引起人和动物的肠道疾病和皮肤疾病,且有人兽共患基因亚型。为了解不同地区羊芽囊原虫的感染情况,对来自7个省、区的704份羊粪便样品,基于核糖体小亚基基因(SSU rDNA)位点进行分子流行病学调查,并首次对羊源人兽共患亚型ST3、ST4进行多位点序列分型。结果显示,芽囊原虫总感染率为13.35%(94/704),不同地区、不同品种间感染率差异极显著。芽囊原虫序列分析共发现5个亚型(ST3、ST4、ST5、ST10和ST14),其中,ST3、ST4和ST5为人兽共患基因亚型,MLST分析ST3为Allele 38且在2个基因位点发生了碱基突变。ST4包括Allele 42、Allele 92和Allele 94 3种等位基因。本次调查表明羊芽囊原虫感染普遍,病原存在人兽共患亚型且具遗传多样性,应给予足够重视。 展开更多

关键词 羊 芽囊原虫 ssu rdna 亚型 等位基因 MLST

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石斑角形虫(黏体门, 角形虫科)的分子证据及其在不同宿主中的遗传变异 被引量：6

5

作者 黄艳梅 赵元莙 +1 位作者 周杨 杨承忠 《水生生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第6期1263-1269,共7页

研究从中国东海的青石斑鱼Epinephelus awoara Temminck&Schlegel 1842和褐带石斑鱼E.bruneus Bloch 1793的胆囊中检获了石斑角形虫Ceratomyxa epinephela Wu,Wu et hua,1993,首次提供了其SSU rDNA和ITS1 rDNA序列,并基于形态学和... 研究从中国东海的青石斑鱼Epinephelus awoara Temminck&Schlegel 1842和褐带石斑鱼E.bruneus Bloch 1793的胆囊中检获了石斑角形虫Ceratomyxa epinephela Wu,Wu et hua,1993,首次提供了其SSU rDNA和ITS1 rDNA序列,并基于形态学和分子数据进行了重新描述。石斑角形虫成熟孢子的孢子长(4.8±0.5)μm(3.6—5.6μm),孢子厚(31.8±4.8)μm(23.3—37.5μm);孢子壳瓣光滑且等大,由垂直的缝线连接;极囊长(2.9±0.2)μm(2.4—3.7μm),极囊宽(2.6±0.2)μm(2.2—3.1μm);孢子夹角处稍微凹陷,延伸至两端逐渐变平坦,夹角为(175.9±3.7)°(165.5°—179.7°)。基于SSU rDNA序列构建的系统发育树显示石斑角形虫与诺兰角形虫C.nolani Gunter&Adlard 2009,卡特莫尔角形虫C.cutmorei Gunter&Adlard 2009和横山角形虫C.yokoyamai Gunter&Adlard 2009有很近的亲缘关系,且其宿主均为石斑鱼属物种。结果表明,类群关系较近的宿主其寄生的同属黏孢子虫可能具有更近的系统发育关系。基于SSU rDNA和ITS1 rDNA的遗传分析显示,石斑角形虫的4个分离株已发生了明显的遗传分化(形成了4个基因型),形成了不同的种群,但在不同宿主种类间并未形成特有的分化。 展开更多

关键词 石斑角形虫 重描述 ssu rdna ITS1 rdna 遗传变异

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几种放射孢子虫的形态特征和分子鉴定 被引量：2

6

作者 高志鹏 杨坤 +2 位作者 陈凯 习丙文 谢骏 《水生生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第2期446-454,共9页

为阐明黏孢子虫病的传播途径,在2018—2019年期间作者调查了异育银鲫养殖池塘,从底栖寡毛类苏氏尾鳃蚓中共检测出10种放射孢子虫。基于形态特征鉴定,10种放射孢子虫分别属于6个集合类群,其中雷氏放射孢子虫1种、桔瓣放射孢子虫2种、新... 为阐明黏孢子虫病的传播途径,在2018—2019年期间作者调查了异育银鲫养殖池塘,从底栖寡毛类苏氏尾鳃蚓中共检测出10种放射孢子虫。基于形态特征鉴定,10种放射孢子虫分别属于6个集合类群,其中雷氏放射孢子虫1种、桔瓣放射孢子虫2种、新放射孢子虫2种、三突放射孢子虫2种、棘放射孢子虫2种和匈牙利放射孢子虫1种;这些物种中有4种与作者实验室前期描述种类一致,5种为新发现的物种。研究描述了其形态特征并通过SSU rDNA序列比对分析对应的黏孢子虫种类。结果表明新发现的Triactinomyxon HZ和DF与文献中同类群的Triactinomyxon CZ(GenBank登录号JX477771)序列相似性最高(93.39%和94.48%),Echinactinomyxon LY1与金鱼肌肉寄生Myxobolus lentisuturalis(GenBank登录号AY119688)相似性最高(96.88%),Echinactinomyxon type LY2与Hungactinomyxon(GenBank登录号AY779062)相似性最高(97.86%),Neoactinomyxum type LY与文献报道的Thelohanellus sp.(GenBank登录号MK412938)相似性最高(92.48%)。文章报道的Hungactinomyxon DF与匈牙利发现的Hungactinomyxon(GenBank登录号AY779062)序列相似度达99.41%—99.64%,为同一物种。系统发育分析表明文章所报道的Triactinomyxon HZ和DF与鱼体寄生四极虫亲缘关系较近;Hungactinomyxon DF和Echinactinomyxon LY1及LY2与碘泡虫属亲缘关系较近;Neoactinomyxum LY与单极虫聚为一支。研究新报道的放射孢子虫进一步丰富了对养殖环境中黏孢子虫多样性的认识,为开展黏孢子虫病生态防控奠定基础。 展开更多

关键词 放射孢子虫 异育银鲫 ssu rdna 系统发育分析

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冬季赤水河流域刚毛藻多样性调查及系统发育分析 被引量：1

7

作者 赵志娟 杨小霞 +5 位作者 钟俏君 陈冠海 彭相英 刘本文 朱欢 刘国祥 《水生生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第9期1402-1411,共10页

研究于2019年冬季对赤水河流域开展刚毛藻多样性调查,共设计采样点38个,覆盖赤水河上、中、下游。调查发现:21个采样位点分布有刚毛藻目藻类,其中19个位点有刚毛藻分布。基于核糖体小亚基(SSU rDNA)、核糖体大亚基(LSU rDNA)和内转录间... 研究于2019年冬季对赤水河流域开展刚毛藻多样性调查,共设计采样点38个,覆盖赤水河上、中、下游。调查发现:21个采样位点分布有刚毛藻目藻类,其中19个位点有刚毛藻分布。基于核糖体小亚基(SSU rDNA)、核糖体大亚基(LSU rDNA)和内转录间隔区(ITS)对采集样品进行系统发育分析,结果显示:(1)赤水河流域刚毛藻多样性较高,且该流域上、中、下游均有刚毛藻分布;(2)目前淡水刚毛藻类群包含至少10个支系,赤水河流域采集到的刚毛藻覆盖其中6个支系(分别是clade 1、clade 2、clade 4、clade 7、clade 9和clade 10);(3)相比基于SSU+LSU双分子标记构建的系统进化树,基于SSU+ITS+LSU三分子标记构建的进化树各支系支持度更高,可以较有效地将淡水刚毛藻不同支系区分开来。研究较好地展示了冬季赤水河流域刚毛藻的广泛分布及其分子多样性,丰富了中国淡水丝状绿藻的分类研究,也为赤水河段的水生态环境保护提供了基础数据支持。 展开更多

关键词 赤水河流域 刚毛藻目 多样性 ssu rdna LSU rdna ITS 系统发育分析

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基于核内核糖体小亚基序列的蝗总科系统发育关系分析(英文) 被引量：13

8

作者 印红 李新江 +1 位作者 王文强 印象初 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第6期809-814,共6页

用核糖体SSUrDNA全序列对蝗总科 (Acridoidea)进行了分子系统学研究。依据测定的 8种蝗虫的SSUrDNA全序列 (平均 184 4bp) ,并从GenBank中选取了 6种内群种类和 2种外群种类的SSUrDNA同源序列 ,进行序列分析。利用Clustal、MEGA和PHYLI... 用核糖体SSUrDNA全序列对蝗总科 (Acridoidea)进行了分子系统学研究。依据测定的 8种蝗虫的SSUrDNA全序列 (平均 184 4bp) ,并从GenBank中选取了 6种内群种类和 2种外群种类的SSUrDNA同源序列 ,进行序列分析。利用Clustal、MEGA和PHYLIP软件构建分子系统树 (距离邻接法Neighbor_Joining ,NJ;最小进化法MinimumEvolution)。结果显示 :( 1)蝗总科是一个单系类群 ;( 2 )锥头蝗科 (Chrotogonidae)和瘤锥蝗科 (Pyrgomorphidae)亲缘关系较近 ,为蝗总科最原始的类群 ;( 3)网翅蝗科(Arcypteridae)和槌角蝗科 (Gomphoceridae)有较近的亲缘关系 ;( 4)斑翅蝗科 (Oedipodidae)为最进化的类群 ;( 5 )SSUrDNA序列保守性强 ,转换 (transition)取代的速率大于或接近颠换 (transversion)取代的速率 ;( 6 )在系统树中 ,总科首先分离 ,大多数同科不同属的类群以高置信度聚合在一起 。 展开更多

关键词 蝗总科 ssu rdna 分子系统发育

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南海赤潮亚历山大藻的分子鉴定及“塔玛复合种”的分子系统发生分析 被引量：3

9

作者 刘晨临 陈艳 +1 位作者 刘胜浩 黄晓航 《海洋学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第1期163-169,共7页

利用SSU rDNA和ITS分子指标,结合GenBank和其他文献中的基因序列构建了系统树,对一株分离自我国南海的亚历山大藻"塔玛复合种"NH01进行了鉴定,发现SSU rDNA和ITS序列构建的系统树中,不同地理基因型的"塔玛复合种"... 利用SSU rDNA和ITS分子指标,结合GenBank和其他文献中的基因序列构建了系统树,对一株分离自我国南海的亚历山大藻"塔玛复合种"NH01进行了鉴定,发现SSU rDNA和ITS序列构建的系统树中,不同地理基因型的"塔玛复合种"均构成独立分支。与我国沿海所有的"塔玛复合种"一致,NH01也属于"亚洲温带"型。探讨了SSU rDNA和ITS分子指标用于塔玛和链状亚历山大藻鉴别的可行性,比较了2种不同的基于ITS序列的亚历山大藻的系统分类方法。认为SSU rDNA和ITS序列均可以应用于亚历山大藻种甚至种下水平的检测,可以准确判断其地理基因型。提出利用SSU rDNA和ITS等核酸序列标记的方法作为鉴定、调研我国海域的亚历山大藻"塔玛复合种"的常规手段。通过比对不同地理基因型的ITS序列,确定了一段DNA序列,可以用于鉴别不同地理基因型的亚历山大藻"塔玛复合种"。 展开更多

关键词 “塔玛复合种” ssu rdna ITS 条形码

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南海沉积物中有孔虫分子生物学鉴定的初步研究 被引量：2

10

作者 徐美香 赵泉鸿 肖湘 《台湾海峡》 CAS CSCD 2004年第3期354-359,共6页

本文以南海深海表层沉积物中的有孔虫样品为研究对象,提取了样品的总DNA片段,利用特异性DNA探针,进行有孔虫的SSUrDNA扩增,对获得的PCR产物进行克隆,测序及分析,证实确为潜在的有孔虫DNA.进化树分析揭示了研究样品中可能存在的有孔虫种类。

关键词 海洋浮游动物 分子生物学:有孔虫 DNA提取 ssu rdna 进化树

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基于TaqMan-MGB探针的虾肝肠胞虫荧光定量PCR检测方法 被引量：7

11

作者 马来 童桂香 +5 位作者 韦信贤 曾德乾 熊建华 王瑞 黄光华 江林源 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2020年第6期1319-1326,共8页

【目的】基于TaqMan-MGB探针建立虾肝肠胞虫(EHP)荧光定量PCR检测方法,为EHP的快速定量检测及实时监测提供技术手段。【方法】以EHP的SSU rDNA基因为检测靶基因,在其保守区设计特异性的扩增引物和TaqMan-MGB探针,将PCR扩增目标片段克隆... 【目的】基于TaqMan-MGB探针建立虾肝肠胞虫(EHP)荧光定量PCR检测方法,为EHP的快速定量检测及实时监测提供技术手段。【方法】以EHP的SSU rDNA基因为检测靶基因,在其保守区设计特异性的扩增引物和TaqMan-MGB探针,将PCR扩增目标片段克隆至pMD18-T载体构建重组质粒pMD18-T-SSU^EHP(标准品),以标准品DNA为模板优化反应体系,建立检测EHP的TaqMan-MGB探针荧光定量PCR;以10倍梯度稀释的标准品DNA为模板构建扩增标准曲线,并进行特异性、敏感性、重复性及临床应用试验。【结果】制备的重组质粒pMD18-T-SSU^EHP DNA稳定性好,可满足作为标准品和阳性对照的要求;标准品(pMD18-T-SSU^EHP)起始模板范围为2.0×10^1~2.0×10^9拷贝/反应时,建立的标准曲线线性关系良好,对应的线性回归方程为y=-3.232×lg(x)+39.51。基于TaqMan-MGB探针建立的EHP荧光定量PCR对标准品的检测灵敏度可达20拷贝/反应,对临床虾样品EHP的检测灵敏度约10拷贝/mg,较农业农村部推荐的套式PCR约提高10倍;对虾类其他常见病原均无扩增反应,其组内和组间变异系数分别为0.26%~0.72%和0.56%~0.92%,整个检测过程可在1 h内完成。采用建立的TaqMan-MGB探针荧光定量PCR与套式PCR同时对276份临床虾样品进行检测比较,发现两种方法的符合率为96.7%,检测低拷贝数虾样品时前者具有更高的灵敏度;2018和2019年广西虾样品的EHP阳性检出率分别为16.2%和30.6%。【结论】基于TaqMan-MGB探针建立的EHP荧光定量PCR检测方法具有特异性强、灵敏度高、重复性好、定量范围宽及简单快速等优点,适用于虾类样品的EHP定量检测,可为EHP实时监测及EHPD快速诊断提供一种新的技术手段。 展开更多

关键词 虾肝肠胞虫 ssu rdna基因 TAQMAN-MGB探针 荧光定量PCR

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腹毛亚纲纤毛虫三个中国新记录种和一个罕见种的形态学研究

12

作者 李平 常剑波 +3 位作者 寇晓梅 侯晓鹏 邵晨 牛乐 《水生生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第12期2069-2080,共12页

利用活体观察及现代染色方法对采集自陕西和广西的三个腹毛亚纲纤毛虫中国新记录种及一个罕见种——阿氏澳纤虫Australocirrus aspoecki(罕见种)、寡毛侧毛虫Pleurotricha oligocirrata、陆生陆生半小双虫Hemiamphisiella terricola ter... 利用活体观察及现代染色方法对采集自陕西和广西的三个腹毛亚纲纤毛虫中国新记录种及一个罕见种——阿氏澳纤虫Australocirrus aspoecki(罕见种)、寡毛侧毛虫Pleurotricha oligocirrata、陆生陆生半小双虫Hemiamphisiella terricola terricola和藓生拟列虫Paraholosticha muscicola的形态学特征进行了研究并与以往报道种群做了详细的比较。研究发现:(1)阿氏澳纤虫个体大小小于以往报道种群,小核、背触毛列、口围带小膜,左右缘棘毛数目均少于以往报道种群;(2)寡毛侧毛虫的中国种群比已报道的韩国种群的口围带小膜数目少,但额腹棘毛数略多;(3)陆生陆生半小双虫中国种群形态特征与前人报道的奥地利种群(模式种群)和澳大利亚种群比较接近,与斐济种群的小双虫棘毛列棘毛数、右腹棘毛列棘毛数、左缘棘毛数和右缘棘毛数差异较大;(4)藓生拟列虫的中国种群的形态统计数据与以往报道种群有较大差异,但活体特征差异较小。研究同时提供了以上4个物种的SSU rDNA序列,并与同物种其他种群、同属物种及分子亲缘种进行了序列相似性和核苷酸差异数目的比较。研究为中国腹毛亚纲纤毛虫的多样性、形态资源和种质资源的记录进行了积累和补充。 展开更多

关键词 腹毛亚纲 澳纤虫属 侧毛虫属 半小双虫属 拟列虫属 形态学 中国新记录 ssu rdna

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一株产凝乳酶变色栓菌鉴定及其凝乳酶的分离纯化与酶学性质研究 被引量：1

13

作者 黄武营 李云 +1 位作者 朱慧 周飞 《食品与发酵工业》 CAS CSCD 北大核心 2024年第12期243-250,I0008,共9页

微生物凝乳酶具有生产周期短和易于发酵生产的优点,是传统小牛皱胃酶的经济高效替代选择之一。为了筛选新的凝乳酶产生菌,该研究以从传统发酵腐乳分离的霉菌为出发菌株,筛选具有高凝乳活性和低蛋白水解活性的霉菌菌株。采用内源转录区... 微生物凝乳酶具有生产周期短和易于发酵生产的优点,是传统小牛皱胃酶的经济高效替代选择之一。为了筛选新的凝乳酶产生菌,该研究以从传统发酵腐乳分离的霉菌为出发菌株,筛选具有高凝乳活性和低蛋白水解活性的霉菌菌株。采用内源转录区间隔区结合线粒体小亚基核糖体DNA扩增测序的方法对菌株进行了分子鉴定。通过硫酸铵分级盐析沉淀、DEAE-Sepharose Fast Flow阴离子交换柱、Sephadex G100凝胶过滤层析法对酶进行了纯化,并研究了凝乳酶酶学特性。筛选出菌株CQ3具有良好的凝乳活性和低蛋白水解活性,该菌株鉴定为变色栓菌(Trametes versicolor)。CQ3凝乳酶纯化后经SDS-PAGE分析呈现出分子质量为61 kDa的唯一条带。该酶作用的最适温度为45℃,最适pH值为6.5,Ca^(2+)对酶活力有显著的促进作用。该酶在pH值为4.5~7.0和温度低于50℃条件下有良好的稳定性。蛋白酶抑制剂试验表明,该酶为一种天冬氨酸蛋白酶。该研究结果报道了一种新的产凝乳酶菌种资源,为丰富凝乳酶产生菌株资源,进一步评价栓菌凝乳酶在干酪加工适用性的研究提供了理论基础。 展开更多

关键词 凝乳酶 变色栓菌 酶的分离纯化 内源转录间隔区 线粒体小亚基核糖体DNA

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胃肠道微生态的分子生物学技术研究进展 被引量：1

14

作者 于萍 王加启 +4 位作者 卜登攀 贺云霞 魏宏阳 周凌云 刘卉 《中国畜牧兽医》 CAS 2008年第3期5-8,共4页

哺乳动物胃肠道中的小型生物群被赋予高种群密度、广泛的多样性及相互作用的复杂性等特性,它们在宿主营养、生理和免疫等方面起着主要作用。作者综述了研究动物胃肠道微生物的现代分子生物学技术的原理及应用,并展望随着分子生物学技术... 哺乳动物胃肠道中的小型生物群被赋予高种群密度、广泛的多样性及相互作用的复杂性等特性,它们在宿主营养、生理和免疫等方面起着主要作用。作者综述了研究动物胃肠道微生物的现代分子生物学技术的原理及应用,并展望随着分子生物学技术的飞速发展,对胃肠道微生物的研究将会更加深入,从而为指导实践提供可靠的理论依据。 展开更多

关键词 胃肠道小型生物群 微生物生态学 小亚基rRNA/rdna 分子技术

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一株寄生于大黄鱼的盾纤毛虫分子鉴定与系统进化分析 被引量：2

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作者 池洪树 江秋欢 +1 位作者 潘滢 林能锋 《福建畜牧兽医》 2023年第4期1-6,共6页

在大黄鱼稚鱼上发现一种可侵入患鱼体表、肌肉、腹腔和脑的盾纤毛虫,为了进一步明确该盾纤毛虫的分类地位,提取患鱼样品总DNA,对该虫株SSU rDNA和线粒体cox1部分序列进行PCR扩增、测序,与GenBank中纤毛虫的SSU rDNA和线粒体cox1序列进... 在大黄鱼稚鱼上发现一种可侵入患鱼体表、肌肉、腹腔和脑的盾纤毛虫,为了进一步明确该盾纤毛虫的分类地位,提取患鱼样品总DNA,对该虫株SSU rDNA和线粒体cox1部分序列进行PCR扩增、测序,与GenBank中纤毛虫的SSU rDNA和线粒体cox1序列进行同源性分析并构建系统发育树。结果显示,该盾纤毛虫874 bp的SSU rDNA部分序列与显赫针口虫(Porpostoma notata)同源性最高,相似性为98.97%。在基于SSU rDNA构建系统发育树中与显赫针口虫(P.notata)聚为一支,并独立于嗜污科(Philasteridae)的分支;获得该虫1 086 bp的cox1部分序列,与其SSU rDNA序列相比表现出更大的遗传变异度,在基于cox1部分序列构建系统发育树中,该虫株与嗜污科(Philasteridae)、尾丝虫科(Uronematidae)的分支也有一定距离。综上,该盾纤毛虫应是嗜污目(Philasterida)、针口虫属(Porpostoma)的显赫针口虫(P.notata)或其近缘种。 展开更多

关键词 盾纤毛虫 核糖体小亚基基因序列 线粒体细胞色素c氧化酶第I亚基 大黄鱼

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中国南海两种无节珊瑚藻——新角石藻和圆锥呼叶藻的形态解剖学和分子生物学鉴定 被引量：1

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作者 胡群菊 杨芳芳 +4 位作者 韦章良 莫嘉豪 龙超 田新朋 龙丽娟 《海洋通报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第4期387-399,共13页

珊瑚藻是一类在细胞间沉积碳酸钙的底栖红藻,在海洋生态系统中广泛分布。然而,在当前全球变暖、海洋酸化等环境变化和人类活动的双重影响下,珊瑚藻的物种多样性已出现逐渐降低的趋势,因此,迫切需要开展对珊瑚藻的种类鉴定工作。本文选... 珊瑚藻是一类在细胞间沉积碳酸钙的底栖红藻,在海洋生态系统中广泛分布。然而,在当前全球变暖、海洋酸化等环境变化和人类活动的双重影响下,珊瑚藻的物种多样性已出现逐渐降低的趋势,因此,迫切需要开展对珊瑚藻的种类鉴定工作。本文选用两种在中国南海广泛分布的无节珊瑚藻,通过形态解剖学观察,发现两种藻均具有一组织性构造,髓部藻丝共轴,相邻藻丝间通过细胞融合相连。两种藻均具有单孔的锥形生殖窝,生殖窝明显地突出于体表,其中,藻种SCSIO C004的生殖窝直径为830~1 000μm,且数量较少,藻种SCSIO C005的生殖窝的直径为350~450μm,且数量较多。这些形态学和解剖学特征表明这两种藻均为宽珊藻亚科的种类。基于SSU r DNA和psb A基因序列对两种藻的系统发育关系进一步分析,确定了SCSIO C004为新角石藻(Neogoniolithon brassica-florida (Harvey)),SCSIO C005为圆锥呼叶藻(Pneophyllum conicum (Dawson) Keats),并明确了它们的分类地位。本实验研究结果可为深入探究珊瑚藻的生态功能和生物资源的保护、利用工作提供理论基础。 展开更多

关键词 珊瑚藻 新角石藻 圆锥呼叶藻 形态解剖学 ssu rdna PSBA

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淡水刚毛藻目一新组合种及其系统发育分析 被引量：2

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作者 赵志娟 刘国祥 胡征宇 《植物科学学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第3期281-290,共10页

作者于2012-2014年先后在湖北省采集到4株刚毛藻目的丝状绿藻。经鉴定,其形态特征和莫拉瓦刚毛藻Cladophora moravica Gardavsk(1986)非常相似;但相较于刚毛藻属各个种的形态,4株藻体更接近黑孢藻科的分类特征。基于SSU和LSU rDNA序... 作者于2012-2014年先后在湖北省采集到4株刚毛藻目的丝状绿藻。经鉴定,其形态特征和莫拉瓦刚毛藻Cladophora moravica Gardavsk(1986)非常相似;但相较于刚毛藻属各个种的形态,4株藻体更接近黑孢藻科的分类特征。基于SSU和LSU rDNA序列构建的系统发育树显示,4株刚毛藻目的丝状绿藻均属于黑孢藻科拟湖球藻属(Aegagropilopsis)。据此,作者建议将该种名称作为一个新组合处理,即莫拉瓦拟湖球藻Aegagropilopsis moravica(Dvoˇrák)Zhao et Liu com.nov。拟湖球藻属仅含有3个种:莫拉瓦拟湖球藻、硬枝拟湖球藻和棒状拟湖球藻,其形态特征与湖球藻相近且易混淆,故采用核基因组序列分析方法区分二者是非常有效的。 展开更多

关键词 莫拉瓦拟湖球藻 湖球藻属 ssu-LSU rdna 系统发育 刚毛藻目 新组合

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