SSR荧光标记毛细管电泳检测法在水稻DNA指纹鉴定中的应用 被引量：66

1

作者 程本义 夏俊辉 +1 位作者 龚俊义 杨仕华 《中国水稻科学》 CAS CSCD 北大核心 2011年第6期672-676,共5页

以16个杂交水稻不育系、恢复系及组合为材料,初步建立了水稻品种SSR荧光标记毛细管电泳检测方法。与常规凝胶电泳检测方法相比,荧光标记毛细管电泳检测方法可以读出目标DNA片段的准确大小,检测数据更为精确,检测效率更高。常规凝胶电泳... 以16个杂交水稻不育系、恢复系及组合为材料,初步建立了水稻品种SSR荧光标记毛细管电泳检测方法。与常规凝胶电泳检测方法相比,荧光标记毛细管电泳检测方法可以读出目标DNA片段的准确大小,检测数据更为精确,检测效率更高。常规凝胶电泳检测方法验证表明,利用SSR荧光标记毛细管电泳检测方法进行水稻品种DNA指纹鉴定,方法可行、结果可靠。 展开更多

关键词 水稻 ssr荧光标记 毛细管电泳 DNA指纹鉴定

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利用SSR荧光标记构建山东地方梨种质资源分子身份证 被引量：30

2

作者 冉昆 隋静 +5 位作者 王宏伟 魏树伟 张勇 董冉 董肖昌 王少敏 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第A01期71-78,共8页

【目的】利用SSR荧光标记构建45份山东地方梨种质资源的分子身份证。【方法】从SSR富集文库中开发并设计40对引物,从中筛选出10对多态性良好的引物,采用SSR荧光标记毛细管电泳技术检测扩增条带分子质量的方法对山东地方梨种质资源进行分... 【目的】利用SSR荧光标记构建45份山东地方梨种质资源的分子身份证。【方法】从SSR富集文库中开发并设计40对引物,从中筛选出10对多态性良好的引物,采用SSR荧光标记毛细管电泳技术检测扩增条带分子质量的方法对山东地方梨种质资源进行分析,获得相应的扩增条带。采用个位数字和小写英文字母对不同带型进行编码,按照10对引物扩增带型数由少到多顺序串联排序的方式构建供试样品的分子身份证。【结果】10对SSR引物共检测到111个SSR等位位点和189个带型,平均每对引物对品种扩增的等位位点11.1个,带型18.9个。采用个位数字和小写英文字母结合对不同带型进行编码,成功构建了45份山东地方梨种质资源的分子身份证,可以将材料完全区分开。【结论】构建了45份山东地方梨种质资源分子身份证,有利于山东地方梨种质资源的保护与利用。 展开更多

关键词 梨 种质资源 山东 ssr荧光标记 分子身份证

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利用SSR荧光标记构建20个高粱品种指纹图谱 被引量：31

3

作者 王瑞 张福耀 +2 位作者 程庆军 田承华 凌亮 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第4期658-665,共8页

为建立高粱种子纯度及真实性鉴定技术体系，构建高粱栽培品种DNA指纹图谱数据库是必要的。利用SSR荧光标记技术筛选出36对SSR荧光标记引物，构建我国高粱杂种优势利用以来中晚熟区主推的20个品种的SSR指纹图谱。36对SSR引物共扩增出235... 为建立高粱种子纯度及真实性鉴定技术体系，构建高粱栽培品种DNA指纹图谱数据库是必要的。利用SSR荧光标记技术筛选出36对SSR荧光标记引物，构建我国高粱杂种优势利用以来中晚熟区主推的20个品种的SSR指纹图谱。36对SSR引物共扩增出235个等位基因，平均每个等位基因检测到多态性位点7个，多态性位点变化范围为2～12个。20个高粱品种36个SSR位点的遗传多样性指数和多态性信息量的变化范围分别为0．3490～0．8813和0．3144-0．8696，平均值分别为O．6976和0．6571。从36对SSR引物中筛选到多态性丰富的2对引物作为高粱品种鉴定的特征引物，2对SSR特征引物组合可区分所有供试品种。20＋高粱品种的SSR指纹图谱互不相同，可以作为各品种特定的图谱，为品种鉴别提供依据。 展开更多

关键词 高粱 品种鉴定 ssr荧光标记 指纹图谱

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SSR荧光标记毛细管电泳法与国家冬油菜区试指纹鉴定平台的构建 被引量：22

4

作者 许鲲 李锋 +8 位作者 吴金锋 谷铁城 陈碧云 高桂珍 闫贵欣 李俊 乔江伟 汪念 伍晓明 《中国油料作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第2期150-159,共10页

为了油菜品种指纹检测的精确性及未来构建大规模油菜新品种指纹数据库,应用SSR荧光标记毛细管电泳检测法构建国家冬油菜区试指纹鉴定平台。以40对荧光引物对2012-2013年度163份国家冬油菜区试参试品种（系）进行分析。结果共检测到42个... 为了油菜品种指纹检测的精确性及未来构建大规模油菜新品种指纹数据库,应用SSR荧光标记毛细管电泳检测法构建国家冬油菜区试指纹鉴定平台。以40对荧光引物对2012-2013年度163份国家冬油菜区试参试品种（系）进行分析。结果共检测到42个等位位点和131个等位变异。其中A基因组（n1～n10）检测位点25个,C基因组（n11～n19）检测位点17个。每个位点等位变异数从2到6不等,平均为3.02。42个检测位点的PIC值变化范围在0.10～0.69之间,平均值为0.36。其中引物BRGMS171的杂合度、PIC值分别高达0.67、0.70,可考虑作为以后区试杂交种纯度鉴定的核心标记。SSR位点的纯合度分析得出本年度18份常规种平均纯合度为81.9%,145份杂交种为57.9%。以131个等位变异计算品种（系）间DICE相似系数,163份品种（系）间平均遗传相似系数变幅为0.607～0.765,变幅最大的为品种（系）FC03（0.438～0.879）,变幅最小为品种（系）宜油21（0.611～0.806）。 展开更多

关键词 冬油菜新品种(系) ssr荧光标记 毛细管电泳法

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利用SSR荧光标记构建41份山东省苹果资源分子身份证 被引量：18

5

作者 李慧峰 王涛 冉昆 《沈阳农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第1期70-77,共8页

山东自古为中国苹果的栽培中心,苹果属植物资源较为丰富,种间杂交类型较多,资源分类难度大,相关研究较为滞后。本研究选取山东省果树研究所苹果资源圃保存的41份资源为试材,利用SSR荧光标记构建分子身份证,旨在探索建立应用分子技术进... 山东自古为中国苹果的栽培中心,苹果属植物资源较为丰富,种间杂交类型较多,资源分类难度大,相关研究较为滞后。本研究选取山东省果树研究所苹果资源圃保存的41份资源为试材,利用SSR荧光标记构建分子身份证,旨在探索建立应用分子技术进行资源分类鉴定的技术体系。从SSR富集文库中开发并设计59对引物,从中筛选出10对多态性良好的引物,利用SSR荧光标记毛细管电泳检测扩增条带分子量的方法对41份山东省原产的苹果属资源进行分析,获得相应的等位基因。采用个位数字和小写英文字母对不同等位基因进行编码,按照10对引物从小到大串联排序的方式构建供试样品的分子身份证。试验结果表明:10对SSR引物共检测到139个SSR等位位点,244种基因型,平均每对引物对品种扩增等位位点13.9个,基因型24.4种。利用PopGen32软件计算引物的多态性信息含量,10对引物的平均多态性信息含量为0.85。基于10对SSR引物的扩增结果,采用个位数字和小写英文字母对不同等位基因进行编码,成功构建了41份山东苹果种质资源的分子身份证,为山东省苹果资源的鉴定工作提供了重要依据。 展开更多

关键词 种质资源 苹果属 分子身份证 山东省 ssr荧光标记

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秋子梨基于SSR荧光标记的分子身份证构建及亲缘关系分析 被引量：11

6

作者 张小双 曹玉芬 +6 位作者 齐丹 张莹 田路明 董星光 霍宏亮 徐家玉 刘超 《中国南方果树》 北大核心 2018年第4期92-98,共7页

以国家果树种质兴城梨、苹果圃保存的53份秋子梨种质为试材,利用位于梨基因组17条染色体上多态性好的17对SSR荧光引物构建秋子梨分子身份证,建立每份种质的条形码标识,并探讨种质之间的亲缘关系。结果表明,17对SSR引物在53份秋子梨种质... 以国家果树种质兴城梨、苹果圃保存的53份秋子梨种质为试材,利用位于梨基因组17条染色体上多态性好的17对SSR荧光引物构建秋子梨分子身份证,建立每份种质的条形码标识,并探讨种质之间的亲缘关系。结果表明,17对SSR引物在53份秋子梨种质中共检测到267个等位基因,平均每对引物检测到15.7个等位基因。引物NAUpy45b检测到的等位基因数最多,为23个;NAUpy54b检测到的等位基因数最少,为10个。所有引物的香农信息指数平均为2.311,其中,NAUpy45b的香农信息指数最高,为2.673;NAUpy86c的香农信息指数最低,为1.493。聚类分析将53份秋子梨划分成2个组,与地理相关：长白山及小兴安岭的秋子梨野生资源单独聚类,与栽培品种亲缘关系较远。＂热梨＂和＂白八里香＂可能为同物异名品种。所选SSR标记可以区分芽变品种,可用于梨种质资源鉴别和保护。 展开更多

关键词 秋子梨 种质资源 ssr荧光标记 分子身份证 亲缘关系

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应用SSR荧光标记法构建山东地方桃种质资源分子身份证 被引量：14

7

作者 刘伟 李淼 +3 位作者 李桂祥 董晓民 高晓兰 张安宁 《山东农业科学》 北大核心 2022年第2期6-13,共8页

为构建山东省地方桃种质资源分子身份证,本研究以60份山东省地方桃品种、名优特品种、选育品种为材料,从桃种质的SSR富集文库中开发并设计30对引物,选出10对具有良好多态性的引物进行PCR扩增,采用SSR荧光标记毛细管电泳技术检测扩增条... 为构建山东省地方桃种质资源分子身份证,本研究以60份山东省地方桃品种、名优特品种、选育品种为材料,从桃种质的SSR富集文库中开发并设计30对引物,选出10对具有良好多态性的引物进行PCR扩增,采用SSR荧光标记毛细管电泳技术检测扩增条带分子质量的方法进行带型分析,采用阿拉伯数字1~9和小写英文字母对不同带型进行编码,无带编码为0,按照10对引物扩增带型数由少到多的顺序将编码串联,构建供试样品的分子身份证。结果表明,10对SSR引物共检测到58个SSR等位位点和116个带型,平均每对引物扩增的等位位点为5.8个,带型11.6个;多态性信息含量变幅为0.2044~0.7378,平均0.5699,说明引物的多态性较高,能够有效揭示60份桃种质的遗传多样性。通过对扩增带型的分析并编码,成功构建了60份桃种质的分子身份证。遗传聚类分析的结果与分子身份证结果一致。本研究结果可为山东省桃种质资源的保护和利用奠定基础,对于桃产业的发展具有重要意义。 展开更多

关键词 桃 种质资源 山东省 ssr荧光标记 分子身份证

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基于SSR荧光标记的吉单系列玉米品种遗传分析 被引量：7

8

作者 刘文国 张志军 +2 位作者 赵万庆 杨伟光 路明 《西北农林科技大学学报（自然科学版）》 CSCD 北大核心 2016年第10期25-36,44,共13页

【目的】利用分子标记技术对吉单系列玉米品种亲本自交系的遗传关系进行剖析,为今后自交系类群划分和杂交种组配奠定基础。【方法】利用49对SSR荧光标记对2000-2009年审定的吉单系列玉米品种亲本自交系进行分析,根据Nei’s遗传距离,利用... 【目的】利用分子标记技术对吉单系列玉米品种亲本自交系的遗传关系进行剖析,为今后自交系类群划分和杂交种组配奠定基础。【方法】利用49对SSR荧光标记对2000-2009年审定的吉单系列玉米品种亲本自交系进行分析,根据Nei’s遗传距离,利用UMGMA聚类法和主成分分析法进行分析。【结果】49对标记在65份自交系间共检测出340个等位基因变异,每对引物检测出3~12个等位基因,平均6.94个,平均多态性信息量0.601,平均基因多样性指数0.644。Nei’s遗传距离变化于0.15~2.26,平均1.05。将65份自交系划分为Reid群、兰卡斯特、PB、四平头、旅大红骨、Volga和其他等7个类群,其中以Reid群、兰卡斯特、四平头、PB和Volga这5个类群为主。主要应用的杂种优势模式有Reid群×四平头群、兰卡斯特群×四平头群、Reid群×Volga群、兰卡斯特群×PB群、Reid群×兰卡斯特群和Reid群×PB群等6种,尤其以Reid群×四平头群、兰卡斯特群×四平头群和Reid群×Volga群这3种杂种优势模式占优势。确定了以吉V022、吉V993为代表的欧洲Volag种质与我国的Reid群、兰卡斯特、四平头等类群存在距离,并独立成群,建立了Reid群×Volga和四平头群×Volga 2个新的杂种优势模式,育成吉单519、吉单535、吉单522、吉单505、吉单517等一系列玉米品种并大面积推广应用。【结论】2000-2009年的吉单系列玉米品种具有较丰富的遗传多样性,在涵盖我国主要玉米类群的基础上,还具有Volag这一独特类群。 展开更多

关键词 吉单系列玉米 ssr荧光标记 遗传基础

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42份云南玉米自交系基于SSR荧光标记的遗传多样性分析 被引量：10

9

作者 张鹏 管俊娇 +5 位作者 黄清梅 王江民 杨晓洪 刘艳芳 张建华 毛进 《江西农业学报》 CAS 2019年第10期29-33,共5页

通过分析云南常用42份玉米自交系品种的遗传多样性,以及云南近些年新育成自交系的遗传背景,为云南地区玉米育种提供参考依据。利用30对SSR多态性引物,对42个玉米自交系品种进行等位基因多样性和聚类分析,共检测到277个等位基因变异,平... 通过分析云南常用42份玉米自交系品种的遗传多样性,以及云南近些年新育成自交系的遗传背景,为云南地区玉米育种提供参考依据。利用30对SSR多态性引物,对42个玉米自交系品种进行等位基因多样性和聚类分析,共检测到277个等位基因变异,平均每个位点检测到的等位基因数为9.2个,变化范围4~17个,片段大小介于86~434 bp之间,每个SSR位点的多肽信息量(PIC)在0.7008~0.9979之间,平均为0.9712。基于UPGMA进行遗传聚类分析,供试材料分类不明显,遗传相似系数均大于0.82,遗传相似度较高。目前由于大部分的玉米自交系品种都由骨干自交系而来,品种资源狭窄、遗传多样性不够丰富,导致新育成的玉米品种遗传背景相似,血缘关系相近,因此亟需在品种资源的有效利用、资源评价、材料共享和交流等方面开展相关工作,促进玉米种业发展。 展开更多

关键词 玉米 ssr荧光标记 遗传多样性

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基于SSR荧光标记分析我国主要审(认)定烤烟及白肋烟品种遗传多样性 被引量：5

10

作者 陈雅琼 王卫峰 +4 位作者 丁安明 宗鹏 李凤霞 张磊 孙玉合 《中国烟草学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2013年第2期98-105,共8页

将毛细管电泳荧光检测技术应用于烟草SSR标记研究，分析我国审（认）定通过的63份烤烟与8份白肋烟种质的遗传多样性。选取36对SSR引物，共扩增产生多态性带205条。运用NTSYS-pc2．10e软件计算Dice遗传相似系数，结果显示71份烟草种质的... 将毛细管电泳荧光检测技术应用于烟草SSR标记研究，分析我国审（认）定通过的63份烤烟与8份白肋烟种质的遗传多样性。选取36对SSR引物，共扩增产生多态性带205条。运用NTSYS-pc2．10e软件计算Dice遗传相似系数，结果显示71份烟草种质的遗传相似系数介于0．223-0．924之间，平均为0．658。表明我国审（认）定通过的烟草栽培种间的遗传基础狭窄、遗传多样性不丰富。 展开更多

关键词 烟草 审(认)定品种 ssr荧光标记 遗传多样性

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利用SSR荧光标记构建37个中国橡胶树栽培品种指纹图谱 被引量：8

11

作者 位明明 黄肖 +1 位作者 李维国 黄华孙 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2022年第8期1565-1576,共12页

以37个橡胶树栽培品种为材料,利用SSR荧光标记技术进行DNA指纹图谱的构建和遗传关系分析,构建我国橡胶树栽培品种的SSR指纹图谱。共计筛选和确定出34对SSR引物作为构建橡胶树品种DNA指纹图谱库的核心引物,其中30对SSR引物可用于品种鉴... 以37个橡胶树栽培品种为材料,利用SSR荧光标记技术进行DNA指纹图谱的构建和遗传关系分析,构建我国橡胶树栽培品种的SSR指纹图谱。共计筛选和确定出34对SSR引物作为构建橡胶树品种DNA指纹图谱库的核心引物,其中30对SSR引物可用于品种鉴定,4对SSR引物可作为备选引物用于后续新选育品种的鉴定。筛选和确定出的核心SSR引物表现出较高的多态性信息含量(PIC值),其中PIC值高于0.5的引物高达97%,PIC值大于0.7的引物多达12对,PIC值大于0.8的引物有2对。引物rbm28的多态性最高,可作为最佳引物用于鉴定中国橡胶树主栽品系的遗传多样性,其他4条引物HESR025、HESR163、H-084、H-122同时具备较高的杂合率和多态性,可考虑作为备选引物。34对核心SSR引物在37个橡胶树品种中共检测到161个等位变异,平均每对引物检测到5.4个等位基因,平均PIC值为0.65,表现出高度多态性。利用30对核心SSR引物对37份橡胶树品种进行扩增,得到相关品种的准确SSR位点信息,获得包含37个橡胶树品种的标准DNA指纹图谱库,其中33个橡胶树品种均具有唯一的DNA特征指纹,可作为各品种特定的图谱,为橡胶树品种鉴定和育种实践提供依据。 展开更多

关键词 巴西橡胶树 品种鉴定 ssr荧光标记 DNA指纹图谱

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利用SSR荧光标记分析山西糯玉米农家种的遗传多样性 被引量：4

12

作者 李锐 白建荣 +3 位作者 张丛卓 张效梅 闫蕾 杨瑞娟 《山西农业科学》 2016年第10期1433-1436,共4页

采取混合取样策略,利用荧光SSR技术对来源于山西省的45份糯玉米地方品种和40个位点进行了分析。结果表明,在45个糯玉米地方品种中,共检测出等位变异241个,每个位点检测出3~11个等位变异,平均每个位点6个;多态性信息量（PIC）变化范围在0... 采取混合取样策略,利用荧光SSR技术对来源于山西省的45份糯玉米地方品种和40个位点进行了分析。结果表明,在45个糯玉米地方品种中,共检测出等位变异241个,每个位点检测出3~11个等位变异,平均每个位点6个;多态性信息量（PIC）变化范围在0.27~0.87,平均每个位点0.71;标记索引指数（MI）变化范围在1.35~9.53,平均每个位点4.42;聚类分析可将45份糯玉米地方品种划分为4个类群。结果显示,部分品种有许多特有的等位变异,应引起特别的注意,需作进一步的分析与研究。 展开更多

关键词 ssr荧光标记 糯玉米 地方品种 遗传多样性 山西

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SSR荧光标记技术分析东四省典型绿豆品种的遗传多样性 被引量：2

13

作者 赵雅楠 王颖 张东杰 《食品工业科技》 CAS CSCD 北大核心 2017年第10期96-102,共7页

东北是我国绿豆主产区之一,品种资源相对丰富。分析不同绿豆品种间遗传背景差异,明确其群体遗传结构,有助于提高品种资源在育种中的利用效率。本研究利用8对SSR引物对东四省40份绿豆品种进行荧光标记毛细管检测分析,共检测出43个等位变... 东北是我国绿豆主产区之一,品种资源相对丰富。分析不同绿豆品种间遗传背景差异,明确其群体遗传结构,有助于提高品种资源在育种中的利用效率。本研究利用8对SSR引物对东四省40份绿豆品种进行荧光标记毛细管检测分析,共检测出43个等位变异,平均为5.4个,多态信息含量(PIC)变幅介于0.40~0.75之间,平均为0.55。比较分析发现,平均等位变异数目的分布为:黑龙江省(3.63)=辽宁省(3.63)>内蒙古自治区(3.50)>吉林省(2.88);多态信息含量(PIC)的分布为:黑龙江省(0.530)>辽宁省(0.527)>内蒙古自治区(0.469)>吉林省(0.382),即黑龙江省遗传变异水平最高,吉林省最低。聚类分析表明,黑龙江和辽宁的绿豆种质为组群Ⅰ,内蒙古和吉林为组群Ⅱ。本研究初步明确了东北各省(区)绿豆品种的遗传多样性水平,为资源的再收集及育种利用提供了参考,并为绿豆资源的深入利用奠定了基础。 展开更多

关键词 绿豆 ssr荧光标记 毛细管电泳 遗传多样性

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利用SSR荧光标记鉴定玉米杂交种纯度的研究 被引量：7

14

作者 尹祥佳 焦珍珍 +6 位作者 赵慧军 李艳玫 贾国军 郝楠 南铭 李世风 张东峰 《中国种业》 2018年第9期56-63,共8页

玉米种子作为我国种业的主导产品,种子质量直接影响着玉米生产的产量和质量。为有效开展玉米种子纯度鉴定研究,选用甘肃推广的5份玉米杂交种,采用15个单株混合取样提取DNA的方法,用4种荧光标记的20对SSR核心引物,筛选出了7对引物,分别为... 玉米种子作为我国种业的主导产品,种子质量直接影响着玉米生产的产量和质量。为有效开展玉米种子纯度鉴定研究,选用甘肃推广的5份玉米杂交种,采用15个单株混合取样提取DNA的方法,用4种荧光标记的20对SSR核心引物,筛选出了7对引物,分别为bnlg439w1、umc1705w1、umc2007y4、umc1506k12、bnlg2291k4、phi080k15、umc2015k3。纯度鉴定研究结果在96.88%~98.44%之间,达到了国家规定的96%的玉米杂交种纯度标准。为快速鉴定玉米杂交种纯度提供了参考,为逐步完善玉米纯度鉴定方法奠定了基础。 展开更多

关键词 ssr荧光标记 玉米纯度 鉴定研究

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基于SSR荧光标记的MCID快速鉴定13个湖北茶树品种 被引量：14

15

作者 黄丹娟 马建强 +4 位作者 马春雷 王松琳 陈亮 毛迎新 陈勋 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第6期1045-1052,共8页

【目的】通过人工绘制品种鉴别图(Manual cultivar identification diagram,MCID)快速区分鉴别湖北茶树品种,为湖北茶树种质资源评价、品种保护及苗木纯度早期鉴定提供技术支持。【方法】以湖北省13个优良茶树品种为材料,利用30对均匀... 【目的】通过人工绘制品种鉴别图(Manual cultivar identification diagram,MCID)快速区分鉴别湖北茶树品种,为湖北茶树种质资源评价、品种保护及苗木纯度早期鉴定提供技术支持。【方法】以湖北省13个优良茶树品种为材料,利用30对均匀分布于遗传连锁图谱上的SSR荧光引物进行PCR扩增,并用荧光标记毛细管电泳检测扩增产物以筛选出核心引物,利用MCID法构建CID图谱。【结果】30对SSR引物共扩增出145个等位基因,各引物等位基因数为3~9个,平均每对引物为4.83个;共检测到194个基因型,各引物检测出的基因型为3~12个,平均每对引物6.47个;多态性信息量(PIC)为0.29~0.85,平均为0.58。13个茶树品种的Nei’s遗传距离为0.19~0.44。基于Nei’s遗传距离,采用Neighbor-Joining(NJ)法可将13个品种分为三大类(Nei’s遗传距离为0.16),结果表明地理来源相同的品种可能因为具有相似的遗传背景而聚在一起,也可能因为亲本来源不同而存在明显的遗传差异。利用筛选出的3对核心引物(TM547、TM552和TM107)可快速鉴别所有参试品种,通过MCID法构建的CID图谱可直观看出各参试茶树品种鉴定所需要的引物及其对应的基因型。【结论】基于SSR荧光标记的茶树品种MCID鉴定方法具有快速、准确、高效的特点,可用于湖北茶树良种知识产权保护、苗期鉴定及品种区分。 展开更多

关键词 茶树 品种鉴定 ssr荧光标记 人工绘制品种鉴别图(MCID) 湖北

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SSR荧光标记毛细管电泳分析24个广西常规香稻品种的遗传多样性 被引量：8

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作者 唐梅 孙富 +6 位作者 何聪 卢宏琮 黄鹂 夏秀忠 唐忠平 钟志坚 陆桂耀 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2023年第3期506-515,共10页

分析香稻品种的遗传多样性和理清香稻品种之间的亲缘关系,可为选育优质香稻品种提供参考。为分析广西审定的24个常规香稻品种的遗传多样性,明确其遗传差异,本研究利用SSR荧光标记毛细管电泳技术对24个广西常规香稻品种进行遗传多样性分... 分析香稻品种的遗传多样性和理清香稻品种之间的亲缘关系,可为选育优质香稻品种提供参考。为分析广西审定的24个常规香稻品种的遗传多样性,明确其遗传差异,本研究利用SSR荧光标记毛细管电泳技术对24个广西常规香稻品种进行遗传多样性分析。结果表明,48对SSR引物共检测出170个等位基因位点;遗传多样性参数中观测等位基因数(Na)变化幅度为1~9,平均为3.54;有效等位基因数(Ne)的变化幅度为1~4.5534,平均为2.0736,其中有效等位基因数最高是RM21,其次是RM481、RM493和RM258,说明这4对引物有较高的检测效率;Shannon’s指数(I)的变化幅度为0~1.7942,平均为0.7726;多态信息含量(PIC)值的变化幅度为0~0.7541,平均为0.3732,属于中度多态位点,说明24个广西常规香稻品种具有一定的遗传变异。24个品种遗传相似系数范围为0.3299~0.9600,其中‘三香628’与‘农香32’遗传相似系数最小,说明这2个品种遗传基础差异最大,亲缘关系最远,‘万香696’与‘广粮香2号’遗传相似性系数最大,说明这2个品种遗传基础差异较小,亲缘关系接近。聚类分析结果显示24个广西常规香稻品种在相似系数0.504处可以分为3个大类群和4个亚类群,第Ⅰ大类2个品种,第Ⅱ大类19个品种,第Ⅲ大类3个品种;第Ⅱ大类在相似系数0.624处可分为4个亚类,第ⅰ亚类1个品种,第ⅱ亚类14个品种,第ⅲ亚类3个品种,第ⅳ亚类1个品种。研究结果表明24个广西常规香稻品种具有一定的遗传多样性,但不够丰富。以数字编码形式构建24个广西常规香稻品种的DNA指纹图谱。其分析结果可为广西常规香稻品种选育和鉴定提供参考。 展开更多

关键词 广西 常规香稻 ssr荧光标记 毛细管电泳 遗传多样性

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雄性榧树遗传多样性的SSR荧光标记分析 被引量：6

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作者 郑刘辉 詹利云 +3 位作者 侯宇 喻卫武 曾燕如 戴文圣 《浙江农林大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第2期329-337,共9页

【目的】旨在利用SSR荧光标记对榧树雄株5个野生居群的121个单株进行遗传多样性及群体遗传结构分析,为榧树雄株遗传背景、种质资源评价和优良种质筛选提供参考。【方法】采用CTAB法提取榧树基因组DNA,设计引物,通过荧光引物PCR扩增方法... 【目的】旨在利用SSR荧光标记对榧树雄株5个野生居群的121个单株进行遗传多样性及群体遗传结构分析,为榧树雄株遗传背景、种质资源评价和优良种质筛选提供参考。【方法】采用CTAB法提取榧树基因组DNA,设计引物,通过荧光引物PCR扩增方法,利用毛细管电泳检测技术检测榧树雄株的多态位点。【结果】24对引物共检测到85个等位基因,变幅为2~7个,平均每个标记有3.542个,其中平均有效等位基因有1.915个。5个居群的平均Nei’s遗传多样性指数为0.365,平均Shannon’s信息指数为0.608。5个居群中,多态位点百分比为75.00%~95.83%,平均为82.50%,居群遗传多样性从大到小依次为嵊州居群、临安居群、富阳居群、黄山居群、淳安居群。居群间的基因流为4.172,遗传分化系数为0.096,遗传分化程度很低。聚类分析结果表明:5个居群的遗传相似度为0.865~0.978,平均为0.932。【结论】雄性榧树居群的遗传多样性较丰富。榧树雄株的遗传变异主要存在于居群内,但居群间也存在一定的基因交流。5个居群可以分为3大类群,这与表型的遗传多样性分析结果比较相似。 展开更多

关键词 ssr荧光标记 榧树 雄性 居群 遗传多样性

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基于SSR荧光标记法的桃同名异物品种鉴定技术与应用 被引量：2

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作者 徐孟琪 李勇 王力荣 《果农之友》 2024年第11期1-6,共6页

为高效鉴别桃种质遗传差异及区分同名异物品种,建立了基于SSR荧光标记法的桃同名异物鉴定技术,利用10对SSR核心引物,通过SSR荧光标记毛细管电泳技术检测扩增条带确定基因型,并对基因型进行分析和赋值,构建分子身份证。利用该鉴定技术进... 为高效鉴别桃种质遗传差异及区分同名异物品种,建立了基于SSR荧光标记法的桃同名异物鉴定技术,利用10对SSR核心引物,通过SSR荧光标记毛细管电泳技术检测扩增条带确定基因型,并对基因型进行分析和赋值,构建分子身份证。利用该鉴定技术进行同名异物品种鉴定、苗木纯度分析和种质资源剔重,鉴定3对疑似同名异物桃品种、50份中油蟠9号桃苗木和102份新收集种质资源,结果表明,突围和春美、8D35和HBZZ10引物差异位点数目为0,分别判定为同名异物品种;50份中油蟠9号苗木差异位点数目为0,且与中油蟠9号相比差异位点数目为0,判定为同一品种,说明苗木纯度为100%;莎车白肉桃2号、莎车绿肉桃9号2份种质差异位点数目为0,莎车白肉桃4号、莎车白肉桃6号和莎车绿肉桃5号3份种质差异位点数目为0,说明上述5份种质保存2份即可。该技术的应用对知识产权保护和种质资源的高效保存具有重要意义。 展开更多

关键词 桃 种质资源 ssr荧光标记 分子身份证

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应用SSR荧光标记法构建22个柚类品种的分子身份证 被引量：12

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作者 吴仕蔓 娄兵海 +3 位作者 陈传武 唐艳 邓崇岭 武晓晓 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第4期605-614,共10页

【目的】应用荧光SSR分子标记构建柚类种质分子身份证,用于品种资源鉴定。【方法】收集22份柚类材料,筛选SSR荧光标记引物,采用荧光毛细管电泳检测技术分析扩增条带分子质量和等位基因,获得相应的扩增带型,从而对每份柚材料进行标记。... 【目的】应用荧光SSR分子标记构建柚类种质分子身份证,用于品种资源鉴定。【方法】收集22份柚类材料,筛选SSR荧光标记引物,采用荧光毛细管电泳检测技术分析扩增条带分子质量和等位基因,获得相应的扩增带型,从而对每份柚材料进行标记。采用个位阿拉伯数字和小写英文字母对不同等位基因分子质量大小进行编码,再按照引物扩增带型数由大到小顺序将各位点赋值编码的数字串联排序,构建供试样品的分子身份证。【结果】筛选出4对多态性较好的引物,使用这4对引物共检测到49个扩增带型和41个SSR等位位点,平均每对引物的有关带型数12.25个、位点数10.25个。【结论】通过扩增带型分析,构建了22份柚类种质的分子身份证,包括12条信息独特的身份证。遗传聚类与分子身份证分析结果一致,为柚类品种鉴定和保护提供了重要依据。 展开更多

关键词 柚类 种质资源 ssr荧光标记 分子身份证

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基于SSR荧光标记的121份野生枸杞种质遗传结构解析 被引量：2

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作者 戴国礼 刘娜 +4 位作者 秦垦 张波 尹跃 米佳 何昕孺 《湖北农业科学》 2024年第5期207-214,共8页

以采集的121份野生枸杞(Lycium barbarum L.)种质为材料,用9对SSR引物进行扩增,采用GeneALEX、Power Marker软件进行多态性分析,利用NTSYS、STRUC-TURE软件进行遗传多样性分析、聚类分析和主成分分析。结果表明,9对SSR引物共检测到108... 以采集的121份野生枸杞(Lycium barbarum L.)种质为材料,用9对SSR引物进行扩增,采用GeneALEX、Power Marker软件进行多态性分析,利用NTSYS、STRUC-TURE软件进行遗传多样性分析、聚类分析和主成分分析。结果表明,9对SSR引物共检测到108个等位基因,等位基因数(Na)、有效等位基因数(Ne)、观测杂合度(Ho)、期望杂合度(He)、多态信息含量(PIC)、Shannon’s信息指数分别为12个、4.620个、0.678、0.651、0.629、1.568;聚类结果显示121份野生枸杞种质可划分为5个亚群,群体遗传结构表明当K=5时,121个种质划分为5个亚群,来自宁夏的NXGY-02、NXGY-032个种质与来自内蒙古的6个种质之间的遗传距离最远,亲缘关系较远,来自青海省、新疆、甘肃省及内蒙古的其余野生枸杞种质之间存在广泛的基因交流现象;宁夏、内蒙古的野生枸杞种质具有独立起源进化的可能,而新疆、甘肃省、青海省的种质与宁夏种质亲缘关系较近,很可能属于同一起源。 展开更多

关键词 野生枸杞(Lycium barbarum L.) 种质 ssr荧光标记 遗传结构

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