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香蕉叶片低温胁迫下差异表达cDNA消减文库的构建
被引量:
2
1
作者
祁君凤
冯仁军
+3 位作者
程萍
袁克华
张丽丽
张银东
《热带生物学报》
2010年第2期110-113,共4页
为了解析香蕉寒害的分子机理,应用抑制性消减杂交技术(suppression subtractivehy bridization,SSH)成功构建了香蕉叶片在低温胁迫下与未处理的差异表达的cDNA消减文库,并通过经蓝、白斑筛选,克隆测序及序列分析,以及应用半定量PCR技术...
为了解析香蕉寒害的分子机理,应用抑制性消减杂交技术(suppression subtractivehy bridization,SSH)成功构建了香蕉叶片在低温胁迫下与未处理的差异表达的cDNA消减文库,并通过经蓝、白斑筛选,克隆测序及序列分析,以及应用半定量PCR技术对随机选取的No.28基因片段进行表达分析等方法,初步分析了实验所构建的cDNA消减文库。结果表明,实验所构建的cDNA消减文库为低温胁迫特异表达的cDNA消减文库;测序及序列分析的结果暗示可能有相当多的未知功能基因参与了香蕉抗寒的过程;随机选取的No.28的表达分析检测结果证实,通过对构建的cDNA消减文库的全面分析,有可能获得一批低温胁迫诱导特异表达的新基因,尤其对其功能的深入了解,将为全面解析香蕉寒害的分子机理、寒害过程中的信号转导打下理论基础。
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关键词
香蕉叶片
低温胁迫
ssh差减文库
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职称材料
乙烯利诱导橡胶树胶乳cDNA消减文库的构建
被引量:
15
2
作者
刘宽灿
杨云
+1 位作者
赵丽红
张治礼
《热带作物学报》
CSCD
2007年第3期1-4,共4页
为解析乙烯利刺激巴西橡胶树橡胶增产的分子机制,应用抑制性消减杂交技术(suppression subtractive hybridization,SSH)成功构建了乙烯利刺激条件下橡胶树胶乳与未处理橡胶树胶乳差异表达的cDNA消减文库。经蓝、白斑筛选,共得到了118个...
为解析乙烯利刺激巴西橡胶树橡胶增产的分子机制,应用抑制性消减杂交技术(suppression subtractive hybridization,SSH)成功构建了乙烯利刺激条件下橡胶树胶乳与未处理橡胶树胶乳差异表达的cDNA消减文库。经蓝、白斑筛选,共得到了118个阳性克隆。菌落PCR分析结果表明,92%左右的阳性克隆含有大小200~500bp的插入片段。随机选取25个克隆进行了测序,并用基因检索工具(Genbank)对获得的EST进行了Blastx分析,结果表明,5个EST属于无任何序列线索的未知序列,6个属于未知功能的推测蛋白基因,2个属于未知功能的蛋白基因,3个与已知功能基因具有较高的同源性。应用半定量PCR技术,对编号203片段进行的表达分析结果表明,该片段为乙烯利诱导特异表达基因,在乙烯利处理后24h范围内随处理时间的增加而表达量增强,叶片中没有检测到该基因的表达。
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关键词
乙烯利
橡胶树
胶乳
ssh差减文库
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职称材料
干旱胁迫下柠条锦鸡儿叶片SSH文库构建及CkWRKY1基因克隆
被引量:
20
3
作者
杨杞
张涛
+6 位作者
王颖
李高
尹佳佳
韩晓敏
齐力旺
李国婧
王瑞刚
《林业科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2013年第7期62-68,共7页
为研究柠条锦鸡儿抗旱的分子机制,挖掘干旱响应相关基因,成功构建干旱胁迫下柠条锦鸡儿叶片的抑制性差减杂交(SSH)文库,获得1286条高质量的EST序列,平均长度475bp,拼接得到Unigenes645条。对这些Unigenes进行Blast比对注释后发现很多抗...
为研究柠条锦鸡儿抗旱的分子机制,挖掘干旱响应相关基因,成功构建干旱胁迫下柠条锦鸡儿叶片的抑制性差减杂交(SSH)文库,获得1286条高质量的EST序列,平均长度475bp,拼接得到Unigenes645条。对这些Unigenes进行Blast比对注释后发现很多抗旱相关基因,例如LEA蛋白、DHN蛋白编码基因,MYB、bZIP、WRKY、NAC和bHLH转录因子等。通过RACE技术克隆其中1个WRKY转录因子的cDNA全长,命名为CkWRKY1,GenBank登录号为JX987095。CkWRKY1编码330个氨基酸的蛋白质,氨基酸序列中有1个"WRKYGQK"的WRKY转录因子家族保守序列,属于第Ⅱ类WRKY转录因子。利用实时荧光定量PCR技术检测发现,CkWRKY1基因在干旱处理后mRNA的表达水平明显上升,预示该转录因子可能与柠条锦鸡儿抗旱的分子机制相关。
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关键词
柠条锦鸡儿
干旱胁迫
抑制性
差
减
杂交(
ssh
)
文库
WRKY
基因克隆
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职称材料
UV-B辐射胁迫下桃蚜差异基因表达的分子生态初步研究
被引量:
7
4
作者
赵惠燕
都二霞
+4 位作者
郭剑文
张改生
王春平
胡祖庆
胡想顺
《西北农林科技大学学报(自然科学版)》
CSCD
北大核心
2010年第3期132-138,共7页
【目的】研究紫外线UV-B对蚜虫种下分化的影响,筛选、鉴别UV-B诱导条件下差异表达的基因,阐明蚜虫对UV的耐受和反应机理以及分子变异机制,为蚜虫UV-B胁迫条件下的分子生态遗传与进化研究提供理论依据。【方法】以UV-B胁迫桃蚜种群cDNA...
【目的】研究紫外线UV-B对蚜虫种下分化的影响,筛选、鉴别UV-B诱导条件下差异表达的基因,阐明蚜虫对UV的耐受和反应机理以及分子变异机制,为蚜虫UV-B胁迫条件下的分子生态遗传与进化研究提供理论依据。【方法】以UV-B胁迫桃蚜种群cDNA为试验方(Tester),以正常条件下桃蚜种群cDNA为驱动方(Driver),应用抑制差减杂交(SSH)技术,研究了UV-B胁迫下桃蚜特异基因的表达,并随机选取100个EST克隆测序,分析差异基因的功能。【结果】蚜虫体内参与紫外胁迫的相关基因有6类,其中胁迫诱导相关基因占总基因的10.64%,核酸、脂肪酸代谢相关基因占14.89%,转录相关基因占9.57%,结构蛋白和蛋白合成相关基因占9.57%,共生菌相关基因占8.51%,未知功能基因占19.15%,未知基因占27.66%。半定量RT-PCR扩增结果显示,热休克蛋白70、辅酶NADH、氧化还原酶、表皮蛋白在处理和对照之间的差异均达极显著水平(P<0.01),而看家基因在对照和处理间无显著差异。【结论】蚜虫种群对紫外线胁迫的反应不仅依赖于抗氧化作用,还是一个多种抗性途径和多基因协同作用的复杂体系。
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关键词
桃蚜
紫外线胁迫
分子生态遗传
ssh差减文库
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职称材料
题名
香蕉叶片低温胁迫下差异表达cDNA消减文库的构建
被引量:
2
1
作者
祁君凤
冯仁军
程萍
袁克华
张丽丽
张银东
机构
海南大学农学院
中国热带农业科学院热带生物技术研究所农业部热带作物生物技术重点开放实验室
出处
《热带生物学报》
2010年第2期110-113,共4页
文摘
为了解析香蕉寒害的分子机理,应用抑制性消减杂交技术(suppression subtractivehy bridization,SSH)成功构建了香蕉叶片在低温胁迫下与未处理的差异表达的cDNA消减文库,并通过经蓝、白斑筛选,克隆测序及序列分析,以及应用半定量PCR技术对随机选取的No.28基因片段进行表达分析等方法,初步分析了实验所构建的cDNA消减文库。结果表明,实验所构建的cDNA消减文库为低温胁迫特异表达的cDNA消减文库;测序及序列分析的结果暗示可能有相当多的未知功能基因参与了香蕉抗寒的过程;随机选取的No.28的表达分析检测结果证实,通过对构建的cDNA消减文库的全面分析,有可能获得一批低温胁迫诱导特异表达的新基因,尤其对其功能的深入了解,将为全面解析香蕉寒害的分子机理、寒害过程中的信号转导打下理论基础。
关键词
香蕉叶片
低温胁迫
ssh差减文库
Keywords
banana leaf
low temperature stress
ssh
subtractive library
分类号
Q786 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
乙烯利诱导橡胶树胶乳cDNA消减文库的构建
被引量:
15
2
作者
刘宽灿
杨云
赵丽红
张治礼
机构
中国热带农业科学院热带生物技术研究所
出处
《热带作物学报》
CSCD
2007年第3期1-4,共4页
基金
中国博士后基金(200503190)
中国热带农业科学院科技基金(Rky0523)资助
文摘
为解析乙烯利刺激巴西橡胶树橡胶增产的分子机制,应用抑制性消减杂交技术(suppression subtractive hybridization,SSH)成功构建了乙烯利刺激条件下橡胶树胶乳与未处理橡胶树胶乳差异表达的cDNA消减文库。经蓝、白斑筛选,共得到了118个阳性克隆。菌落PCR分析结果表明,92%左右的阳性克隆含有大小200~500bp的插入片段。随机选取25个克隆进行了测序,并用基因检索工具(Genbank)对获得的EST进行了Blastx分析,结果表明,5个EST属于无任何序列线索的未知序列,6个属于未知功能的推测蛋白基因,2个属于未知功能的蛋白基因,3个与已知功能基因具有较高的同源性。应用半定量PCR技术,对编号203片段进行的表达分析结果表明,该片段为乙烯利诱导特异表达基因,在乙烯利处理后24h范围内随处理时间的增加而表达量增强,叶片中没有检测到该基因的表达。
关键词
乙烯利
橡胶树
胶乳
ssh差减文库
Keywords
ethephon rubber tree(Hevea brasiliensis) latex supression subtractive hybridization cDNA library
分类号
S794.104 [农业科学—林木遗传育种]
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职称材料
题名
干旱胁迫下柠条锦鸡儿叶片SSH文库构建及CkWRKY1基因克隆
被引量:
20
3
作者
杨杞
张涛
王颖
李高
尹佳佳
韩晓敏
齐力旺
李国婧
王瑞刚
机构
内蒙古农业大学生命科学学院
北京市颐和园管理处
中国林业科学研究院林业研究所
出处
《林业科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2013年第7期62-68,共7页
基金
教育部博士学科点基金项目(20111515110001)
内蒙古农业大学科技创新团队培育计划(NDPYTD2010-3)
文摘
为研究柠条锦鸡儿抗旱的分子机制,挖掘干旱响应相关基因,成功构建干旱胁迫下柠条锦鸡儿叶片的抑制性差减杂交(SSH)文库,获得1286条高质量的EST序列,平均长度475bp,拼接得到Unigenes645条。对这些Unigenes进行Blast比对注释后发现很多抗旱相关基因,例如LEA蛋白、DHN蛋白编码基因,MYB、bZIP、WRKY、NAC和bHLH转录因子等。通过RACE技术克隆其中1个WRKY转录因子的cDNA全长,命名为CkWRKY1,GenBank登录号为JX987095。CkWRKY1编码330个氨基酸的蛋白质,氨基酸序列中有1个"WRKYGQK"的WRKY转录因子家族保守序列,属于第Ⅱ类WRKY转录因子。利用实时荧光定量PCR技术检测发现,CkWRKY1基因在干旱处理后mRNA的表达水平明显上升,预示该转录因子可能与柠条锦鸡儿抗旱的分子机制相关。
关键词
柠条锦鸡儿
干旱胁迫
抑制性
差
减
杂交(
ssh
)
文库
WRKY
基因克隆
Keywords
Caragana korshinskii
drought stress
suppression subtractive hybridization (
ssh
) library
WRKY
gene cloning
分类号
S718.46 [农业科学—林学]
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职称材料
题名
UV-B辐射胁迫下桃蚜差异基因表达的分子生态初步研究
被引量:
7
4
作者
赵惠燕
都二霞
郭剑文
张改生
王春平
胡祖庆
胡想顺
机构
西北农林科技大学植物保护学院
出处
《西北农林科技大学学报(自然科学版)》
CSCD
北大核心
2010年第3期132-138,共7页
基金
国家自然科学基金项目(30470268)
文摘
【目的】研究紫外线UV-B对蚜虫种下分化的影响,筛选、鉴别UV-B诱导条件下差异表达的基因,阐明蚜虫对UV的耐受和反应机理以及分子变异机制,为蚜虫UV-B胁迫条件下的分子生态遗传与进化研究提供理论依据。【方法】以UV-B胁迫桃蚜种群cDNA为试验方(Tester),以正常条件下桃蚜种群cDNA为驱动方(Driver),应用抑制差减杂交(SSH)技术,研究了UV-B胁迫下桃蚜特异基因的表达,并随机选取100个EST克隆测序,分析差异基因的功能。【结果】蚜虫体内参与紫外胁迫的相关基因有6类,其中胁迫诱导相关基因占总基因的10.64%,核酸、脂肪酸代谢相关基因占14.89%,转录相关基因占9.57%,结构蛋白和蛋白合成相关基因占9.57%,共生菌相关基因占8.51%,未知功能基因占19.15%,未知基因占27.66%。半定量RT-PCR扩增结果显示,热休克蛋白70、辅酶NADH、氧化还原酶、表皮蛋白在处理和对照之间的差异均达极显著水平(P<0.01),而看家基因在对照和处理间无显著差异。【结论】蚜虫种群对紫外线胁迫的反应不仅依赖于抗氧化作用,还是一个多种抗性途径和多基因协同作用的复杂体系。
关键词
桃蚜
紫外线胁迫
分子生态遗传
ssh差减文库
Keywords
Myzus persicae
UV-B stress
molecular ecological genetics
suppression substraction hybridization
分类号
S433 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
香蕉叶片低温胁迫下差异表达cDNA消减文库的构建
祁君凤
冯仁军
程萍
袁克华
张丽丽
张银东
《热带生物学报》
2010
2
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职称材料
2
乙烯利诱导橡胶树胶乳cDNA消减文库的构建
刘宽灿
杨云
赵丽红
张治礼
《热带作物学报》
CSCD
2007
15
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
干旱胁迫下柠条锦鸡儿叶片SSH文库构建及CkWRKY1基因克隆
杨杞
张涛
王颖
李高
尹佳佳
韩晓敏
齐力旺
李国婧
王瑞刚
《林业科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2013
20
在线阅读
下载PDF
职称材料
4
UV-B辐射胁迫下桃蚜差异基因表达的分子生态初步研究
赵惠燕
都二霞
郭剑文
张改生
王春平
胡祖庆
胡想顺
《西北农林科技大学学报(自然科学版)》
CSCD
北大核心
2010
7
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