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SRAP标记技术在谷子及其近缘野生种青狗尾草的应用分析
被引量：
6
1
作者
李海权
智慧
+3 位作者
王永芳
李伟
刘小静
刁现民
《河北农业科学》
2010年第11期68-72,共5页
青狗尾草(Setaria viridis)被认为是谷子(S.italica)的祖先种,因此研究青狗尾草与谷子品种间的亲缘关系,对于野生有益基因的发掘利用有着深远意义。以来源于不同国家的谷子和青狗尾草共24个品种为试材,分析SRAP技术在谷子和青狗尾草中...
青狗尾草(Setaria viridis)被认为是谷子(S.italica)的祖先种,因此研究青狗尾草与谷子品种间的亲缘关系,对于野生有益基因的发掘利用有着深远意义。以来源于不同国家的谷子和青狗尾草共24个品种为试材,分析SRAP技术在谷子和青狗尾草中的适用性研究。结果表明:(1)用24个标记组合共产生127条多态性带,平均每个标记组合产生5.29条多态扩增带。每对引物组合产生的多态性带的比例为16.67%～37.90%,平均为28.30%。说明供试青狗尾草和谷子具有较为丰富的遗传多样性。(2)对所有材料进行聚类分析,遗传相似系数为0.56～0.90,平均遗传相似系数为0.79。相似系数为0.56时,可以将24份材料分成2大类群:第一类群全部为青狗尾草,第二类群则包括谷子和部分青狗尾草材料。综上所述,SRAP技术能够有效地对谷子和青狗尾草属进行多态性分析。
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关键词
srap标记技术
谷子
青狗尾草
多态性分析
聚类分析
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职称材料
基于DNA条形码和SRAP的太子参种质遗传多样性分析
被引量：
3
2
作者
李萍萍
王泽榕
+3 位作者
王丁
莫晶晶
陈美霞
叶祖云
《热带作物学报》
CSCD
北大核心
2022年第10期2037-2046,共10页
应用DNA条形码和SRAP分子标记技术,开展15份太子参种质资源遗传差异分析。太子参DNA条形码显示:ITS1序列的突变位点占比最多为2.16%,rbcL6序列的突变位点占比最少为1.23%;psbA-trnH序列缺失位点占比最多为4.88%;ITS1序列的GC含量最高,达...
应用DNA条形码和SRAP分子标记技术,开展15份太子参种质资源遗传差异分析。太子参DNA条形码显示:ITS1序列的突变位点占比最多为2.16%,rbcL6序列的突变位点占比最少为1.23%;psbA-trnH序列缺失位点占比最多为4.88%;ITS1序列的GC含量最高,达55.52%;psbA-trnH序列的GC含量最低,仅为24.71%。太子参SRAP标记筛选出9对引物,扩增出215个位点,其中42个为多态性位点,多态性位点百分率(PPL)为19.53%;从扩增位点总数看,多态性条带丰富、清晰,既有共同位点又有特异性位点;7个居群Nei’s遗传多样性指数(H)范围为0.3466~0.4985,Shannon信息指数(I)范围为0.5301~0.6917,显示出较高的遗传多样性水平,太子参种群基因多样性(H_(t))为0.4004,其中种群内基因多样性(H_(s))和遗传分化系数(G_(st))分别为0.0901、0.3103,分别占H_(t)的77.50%、22.50%。种源间G_(st)为0.7506,即有75.06%的遗传变异存在于种源间,24.94%的遗传变异存在于种源内,表明太子参种源间遗传变异大于种源内遗传变异,存在较低程度的遗传分化。太子参种源的平均基因流(N_(m))为0.1929,表明太子参各种源之间的基因交流顺利。15份太子参种质间的K2P遗传距离范围为0.0005~0.0056,而遗传相似系数在0.3913~0.8695之间,遗传相似系数在0.5900时,可将15份种质分为3个类群,其中杂交种质为独立类型。15份不同种质太子参DNA条形码和SRAP分子标记的遗传距离、遗传相似系数及聚类分析结果相近,以这2种方法相结合,能更准确有效鉴定太子参种质,这对太子参种质资源的利用及杂交新品种的选育具有重要意义。
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关键词
太子参
DNA条形码
技术
srap
分子
标记技术
遗传多样性
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职称材料
葡萄霜霉病菌遗传多样性和致病力分化研究
被引量：
4
3
作者
贾姝
于舒怡
+3 位作者
刘长远
赵奎华
王平
赵达
《沈阳农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第4期473-479,共7页
葡萄霜霉病是葡萄生产中最为严重的病害,为明确我国不同地区葡萄霜霉病菌致病力及遗传多样性,采用叶盘接种法测定采自19个省(市)的69株葡萄霜霉病菌的致病力,并使用SRAP标记技术对其遗传多样性进行分析。结果表明:不同地区的菌株间存在...
葡萄霜霉病是葡萄生产中最为严重的病害,为明确我国不同地区葡萄霜霉病菌致病力及遗传多样性,采用叶盘接种法测定采自19个省(市)的69株葡萄霜霉病菌的致病力,并使用SRAP标记技术对其遗传多样性进行分析。结果表明:不同地区的菌株间存在一定致病力分化现象,供试的69株病原菌中55%属于弱致病力菌株,36%属于中等致病力菌株,经接种后,3个寄主品种病情指数范围为0.56~88.89。根据病原菌对不同寄主的致病力,将菌株划分为弱、中、强、最强致病力4类,东北、西南和西北地区的弱致病力菌株占总数比例58%以上,华北、华东和华中地区中等致病力菌株为优势病原群体,华北和华中地区未出现强致病力菌株。对供试的69株葡萄霜霉病菌进行遗传多样分析,分析结果表明:SRAP标记扩增共得到条带269条,其中多态性条带267条,多态性比率达99.19%。聚类分析结果表明:供试菌株之间存在遗传变异现象,在相似性系数0.622处,69个菌株被聚类为5个类群,但未发现遗传分化与地理分布具有明显相关性。通过对全国19个省(市)的葡萄霜霉病菌的致病性和遗传变异情况进行综合分析,发现葡萄霜霉病菌致病力与遗传变异之间的关系较为复杂,并不是互相对应的关系,有关葡萄霜霉病菌致病力与遗传分化之间的关系尚需进一步研究。
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关键词
葡萄霜霉病菌
致病性分化
遗传多样性
srap标记技术
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职称材料
题名
SRAP标记技术在谷子及其近缘野生种青狗尾草的应用分析
被引量：
6
1
作者
李海权
智慧
王永芳
李伟
刘小静
刁现民
机构
河北省农林科学院谷子研究所国家谷子改良中心河北省杂粮研究实验室
中国农业科学院作物科学研究所
出处
《河北农业科学》
2010年第11期68-72,共5页
基金
国家自然科学基金重点项目(30630045)
国家自然科学基金项目(30771166)
+2 种基金
河北省自然科学基金项目(C2009001295)
河北省自然科学基金作物抗逆抗病虫基地专项(08B026)
河北省农林科学院青年基金(A09030101)
文摘
青狗尾草(Setaria viridis)被认为是谷子(S.italica)的祖先种,因此研究青狗尾草与谷子品种间的亲缘关系,对于野生有益基因的发掘利用有着深远意义。以来源于不同国家的谷子和青狗尾草共24个品种为试材,分析SRAP技术在谷子和青狗尾草中的适用性研究。结果表明:(1)用24个标记组合共产生127条多态性带,平均每个标记组合产生5.29条多态扩增带。每对引物组合产生的多态性带的比例为16.67%～37.90%,平均为28.30%。说明供试青狗尾草和谷子具有较为丰富的遗传多样性。(2)对所有材料进行聚类分析,遗传相似系数为0.56～0.90,平均遗传相似系数为0.79。相似系数为0.56时,可以将24份材料分成2大类群:第一类群全部为青狗尾草,第二类群则包括谷子和部分青狗尾草材料。综上所述,SRAP技术能够有效地对谷子和青狗尾草属进行多态性分析。
关键词
srap标记技术
谷子
青狗尾草
多态性分析
聚类分析
Keywords
srap
technology
Foxtail millet
Green foxtail
Polymorphic analysis
Cluster analysis
分类号
S515 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
基于DNA条形码和SRAP的太子参种质遗传多样性分析
被引量：
3
2
作者
李萍萍
王泽榕
王丁
莫晶晶
陈美霞
叶祖云
机构
宁德师范学院生命科学学院
福建农林大学农学院
福建省特色药用植物工程技术研究中心
出处
《热带作物学报》
CSCD
北大核心
2022年第10期2037-2046,共10页
基金
国家重点研发计划中医药现代化研究专项(No.2019YFC1710500)
中央引导地方科技发展专项(No.2021L3030)
宁德师范学院科研项目(No.2019FZ04)。
文摘
应用DNA条形码和SRAP分子标记技术,开展15份太子参种质资源遗传差异分析。太子参DNA条形码显示:ITS1序列的突变位点占比最多为2.16%,rbcL6序列的突变位点占比最少为1.23%;psbA-trnH序列缺失位点占比最多为4.88%;ITS1序列的GC含量最高,达55.52%;psbA-trnH序列的GC含量最低,仅为24.71%。太子参SRAP标记筛选出9对引物,扩增出215个位点,其中42个为多态性位点,多态性位点百分率(PPL)为19.53%;从扩增位点总数看,多态性条带丰富、清晰,既有共同位点又有特异性位点;7个居群Nei’s遗传多样性指数(H)范围为0.3466~0.4985,Shannon信息指数(I)范围为0.5301~0.6917,显示出较高的遗传多样性水平,太子参种群基因多样性(H_(t))为0.4004,其中种群内基因多样性(H_(s))和遗传分化系数(G_(st))分别为0.0901、0.3103,分别占H_(t)的77.50%、22.50%。种源间G_(st)为0.7506,即有75.06%的遗传变异存在于种源间,24.94%的遗传变异存在于种源内,表明太子参种源间遗传变异大于种源内遗传变异,存在较低程度的遗传分化。太子参种源的平均基因流(N_(m))为0.1929,表明太子参各种源之间的基因交流顺利。15份太子参种质间的K2P遗传距离范围为0.0005~0.0056,而遗传相似系数在0.3913~0.8695之间,遗传相似系数在0.5900时,可将15份种质分为3个类群,其中杂交种质为独立类型。15份不同种质太子参DNA条形码和SRAP分子标记的遗传距离、遗传相似系数及聚类分析结果相近,以这2种方法相结合,能更准确有效鉴定太子参种质,这对太子参种质资源的利用及杂交新品种的选育具有重要意义。
关键词
太子参
DNA条形码
技术
srap
分子
标记技术
遗传多样性
Keywords
P.heterophylla
DNA barcoding technology
srap
molecular marker technology
genetic diversity
分类号
S567.21 [农业科学—中草药栽培]
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职称材料
题名
葡萄霜霉病菌遗传多样性和致病力分化研究
被引量：
4
3
作者
贾姝
于舒怡
刘长远
赵奎华
王平
赵达
机构
辽宁省蚕业科学研究所
辽宁省农业科学院植物保护研究所
辽宁省农业科学院高粱研究所
沈阳大学
出处
《沈阳农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第4期473-479,共7页
基金
沈阳市中青年科技创新人才支持计划项目(PC180113)
公益性行业(农业)科研专项项目(201203035)
辽宁省农业攻关及产业化项目(2018103003)。
文摘
葡萄霜霉病是葡萄生产中最为严重的病害,为明确我国不同地区葡萄霜霉病菌致病力及遗传多样性,采用叶盘接种法测定采自19个省(市)的69株葡萄霜霉病菌的致病力,并使用SRAP标记技术对其遗传多样性进行分析。结果表明:不同地区的菌株间存在一定致病力分化现象,供试的69株病原菌中55%属于弱致病力菌株,36%属于中等致病力菌株,经接种后,3个寄主品种病情指数范围为0.56~88.89。根据病原菌对不同寄主的致病力,将菌株划分为弱、中、强、最强致病力4类,东北、西南和西北地区的弱致病力菌株占总数比例58%以上,华北、华东和华中地区中等致病力菌株为优势病原群体,华北和华中地区未出现强致病力菌株。对供试的69株葡萄霜霉病菌进行遗传多样分析,分析结果表明:SRAP标记扩增共得到条带269条,其中多态性条带267条,多态性比率达99.19%。聚类分析结果表明:供试菌株之间存在遗传变异现象,在相似性系数0.622处,69个菌株被聚类为5个类群,但未发现遗传分化与地理分布具有明显相关性。通过对全国19个省(市)的葡萄霜霉病菌的致病性和遗传变异情况进行综合分析,发现葡萄霜霉病菌致病力与遗传变异之间的关系较为复杂,并不是互相对应的关系,有关葡萄霜霉病菌致病力与遗传分化之间的关系尚需进一步研究。
关键词
葡萄霜霉病菌
致病性分化
遗传多样性
srap标记技术
Keywords
Plasmopara viticola
differentiation of the pathogenicity
genetic diversity
srap
marker
分类号
S432.1 [农业科学—植物病理学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
SRAP标记技术在谷子及其近缘野生种青狗尾草的应用分析
李海权
智慧
王永芳
李伟
刘小静
刁现民
《河北农业科学》
2010
6
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
基于DNA条形码和SRAP的太子参种质遗传多样性分析
李萍萍
王泽榕
王丁
莫晶晶
陈美霞
叶祖云
《热带作物学报》
CSCD
北大核心
2022
3
在线阅读
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职称材料
3
葡萄霜霉病菌遗传多样性和致病力分化研究
贾姝
于舒怡
刘长远
赵奎华
王平
赵达
《沈阳农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021
4
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