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GNU PATTERN:基于SPLASH算法的开源生物序列模式识别程序
被引量：
1
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作者
许颖
李亦学
孔祥银
《中国医学科学院学报》
CAS
CSCD
北大核心
2005年第3期265-269,共5页
目的获取IBMSPLASH算法核心代码,为进一步开展生物序列模式识别研究提供一个高效算法引擎。方法基于SPLASH算法开发核心代码,运用开源软件工具,开发、调试和优化程序。结果开发出GNUPattern(Gpat)程序,高效实现了SPLASH算法的核心部分,...
目的获取IBMSPLASH算法核心代码,为进一步开展生物序列模式识别研究提供一个高效算法引擎。方法基于SPLASH算法开发核心代码,运用开源软件工具,开发、调试和优化程序。结果开发出GNUPattern(Gpat)程序,高效实现了SPLASH算法的核心部分,并提供全部源码,其他研究人员可以在GNU许可协议下修改该程序。结论Gpat成功地实现了SPLASH算法,并为下游生物序列模式识别研究提供铺垫。
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关键词
GNU
PATFERN
splash算法
模式识别
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职称材料
题名
GNU PATTERN:基于SPLASH算法的开源生物序列模式识别程序
被引量：
1
1
作者
许颖
李亦学
孔祥银
机构
中国科学院上海生命科学研究院上海第二医科大学健康科学中心中国科学院研究生院
Bioinformatics Center
出处
《中国医学科学院学报》
CAS
CSCD
北大核心
2005年第3期265-269,共5页
基金
国家科技攻关课题(2002BA711A07)~~
文摘
目的获取IBMSPLASH算法核心代码,为进一步开展生物序列模式识别研究提供一个高效算法引擎。方法基于SPLASH算法开发核心代码,运用开源软件工具,开发、调试和优化程序。结果开发出GNUPattern(Gpat)程序,高效实现了SPLASH算法的核心部分,并提供全部源码,其他研究人员可以在GNU许可协议下修改该程序。结论Gpat成功地实现了SPLASH算法,并为下游生物序列模式识别研究提供铺垫。
关键词
GNU
PATFERN
splash算法
模式识别
Keywords
GNU PATTERN
splash
algorithm
pattern discovery
分类号
Q61 [生物学—生物物理学]
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作者
出处
发文年
被引量
操作
1
GNU PATTERN:基于SPLASH算法的开源生物序列模式识别程序
许颖
李亦学
孔祥银
《中国医学科学院学报》
CAS
CSCD
北大核心
2005
1
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