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SOX12基因在Vero细胞感染猪流行性腹泻病毒过程中的功能研究
1
作者
向娇娇
元娜
+6 位作者
李慧慧
邵明珠
赵福平
张龙超
王立贤
石丽君
陈斌
《中国畜牧兽医》
北大核心
2025年第1期289-297,共9页
[目的]探究SOX12基因对猪流行性腹泻病毒(Porcine epidemic diarrhea virus, PEDV)复制的影响,以期为抗PEDV育种提供有效分子标记。[方法]本研究合成3条SOX12基因干扰序列(siRNA1、siRNA2、siRNA3)及其阴性对照(siNC)并转染至非洲绿猴...
[目的]探究SOX12基因对猪流行性腹泻病毒(Porcine epidemic diarrhea virus, PEDV)复制的影响,以期为抗PEDV育种提供有效分子标记。[方法]本研究合成3条SOX12基因干扰序列(siRNA1、siRNA2、siRNA3)及其阴性对照(siNC)并转染至非洲绿猴肾细胞(Vero细胞),转染48 h后收集细胞,利用实时荧光定量PCR检测干扰效率。将有效的干扰片段和siNC分别转染至Vero细胞24 h后,用感染复数为0.05的PEDV感染细胞,分为4组:感染PEDV 12 h试验组(12 hpi-siRNA)、感染PEDV 12 h对照组(12 hpi-siNC)、感染PEDV 24 h试验组(24 hpi-siRNA)及感染PEDV 24 h对照组(24 hpi-siNC),利用实时荧光定量PCR检测PEDV N及SOX12基因的表达水平,通过Western blotting检测各组细胞PEDV N蛋白表达水平,利用组织半数感染量(50%tissue culture infective dose, TCID_(50))检测PEDV的病毒滴度,并利用间接免疫荧光(indirect immunofluorescence assay, IFA)法检测各组细胞中PEDV复制情况。通过GeneMANIA网站预测SOX12基因的互作基因,利用实时荧光定量PCR检测抑制SOX12基因表达后其互作基因的表达变化。[结果]SOX12基因3条干扰片段的干扰效率为30%~60%,其中siRNA3干扰效率最高,可达60%。与12 hpi-siNC和24 hpi-siNC组相比,12 hpi-siRNA和24 hpi-siRNA组PEDV N基因的转录和蛋白表达水平均显著降低(P<0.05)。病毒滴度表型测定结果表明,12 hpi-siRNA和24 hpi-siRNA组的PEDV病毒滴度显著低于各自对照组(P<0.05);IFA结果也表明,12 hpi-siRNA和24 hpi-siRNA组的PEDV复制明显少于对照组。基因互作预测及实时荧光定量PCR检测结果显示,与siNC组相比,干扰SOX12基因的表达后,其互作基因SOX17、DDX51、ZMIZ2、SSRP1、TAF6和ABCB8的表达水平均显著降低(P<0.05)。[结论]本研究揭示了SOX12基因在PEDV感染Vero细胞过程中的调控作用,发现SOX12基因的下调表达能显著抑制PEDV复制和其互作基因SOX17、DDX51、ZMIZ2、SSRP1、TAF6和ABCB8的表达。
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关键词
猪流行性腹泻病毒(PEDV)
sox12
基因
VERO细胞
基因干扰
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职称材料
基于生物信息学分析SOX12在口腔鳞状细胞癌中的表达及验证
被引量：
5
2
作者
王珍珍
杜文治
+2 位作者
贾如
刘洁
逯宜
《西安交通大学学报（医学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第1期64-68,共5页
目的通过生物信息学分析转录因子SOX12在口腔鳞状细胞癌(OSCC)中的表达,进一步探讨其与OSCC临床病理特征的关系,阐明SOX12对OSCC早期诊断及预后的影响。方法运用GEPIA数据库结合TCGA数据库分析SOX12在OSCC组织中的表达水平,并通过qRT-PC...
目的通过生物信息学分析转录因子SOX12在口腔鳞状细胞癌(OSCC)中的表达,进一步探讨其与OSCC临床病理特征的关系,阐明SOX12对OSCC早期诊断及预后的影响。方法运用GEPIA数据库结合TCGA数据库分析SOX12在OSCC组织中的表达水平,并通过qRT-PCR进行体外验证;利用LinkedOmics数据库描述SOX12表达与OSCC临床病理学参数的相关性及对预后的影响;从String-DB数据库中分析SOX12在信号转导中的位置及与其关系密切的上下游基因。结果SOX12在OSCC中呈高表达,且与OSCC病理分级、T分期、N分期呈正相关;TCGA分析显示,SOX12的表达与OSCC患者术后总体生存率有关;与SOX12相互作用的蛋白有POU3F1、POU3F2、POU3F3、MYT1L、NRSN2等,主要参与神经元的分化和发育等功能。结论SOX12在OSCC中呈高表达,并与OSCC多个病理性指标相关。
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关键词
口腔鳞癌
sox12
数据库分析
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职称材料
SOX12、CDK4在肝细胞中的表达及意义
被引量：
1
3
作者
周鹏
孙玉岭
《河南医学研究》
CAS
2019年第11期1921-1923,共3页
目的观察SOX12、CDK4在肝癌细胞(HepG2)与正常肝细胞(HB611)中的表达情况,分析SOX12与肝细胞癌的关系。方法采用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)法检测HepG2、HB611细胞中SOX12 mRNA、CDK4 mRNA的表达水平,采用Western blot法检测HepG2、HB...
目的观察SOX12、CDK4在肝癌细胞(HepG2)与正常肝细胞(HB611)中的表达情况,分析SOX12与肝细胞癌的关系。方法采用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)法检测HepG2、HB611细胞中SOX12 mRNA、CDK4 mRNA的表达水平,采用Western blot法检测HepG2、HB611细胞中SOX12蛋白、CDK4蛋白的表达水平,采用基因抑制剂shRNA抑制两种细胞中的SOX12基因,采用RT-PCR法检测两种细胞中SOX12 mRNA与CDK4 mRNA的表达情况,分析SOX12与肝细胞癌的关系。结果 SOX12 mRNA在HepG2细胞中表达水平高于HB611细胞,CDK4 mRNA在HepG2细胞中表达水平低于HB611细胞,差异有统计学意义(均P<0.05)。两种细胞中SOX12蛋白表达水平比较,差异无统计学意义(P>0.05),CDK4蛋白在HB611细胞中的表达水平高于HepG2细胞,差异有统计学意义(P<0.05)。抑制SOX12基因后,两种细胞SOX12 mRNA的表达水平较抑制前降低,CDK4 mRNA表达水平也较抑制前降低,差异有统计学意义(均P<0.05)。结论 SOX12与CDK4在HepG2、HB611细胞中均有表达,在两种细胞中SOX12 mRNA、CDK4 mRNA的表达水平存在差异,SOX12蛋白表达水平相近,CDK4蛋白表达水平存在差异。SOX12可能通过影响CDK4的表达参与肝细胞癌的发展进程,可能成为治疗与预测肝细胞癌预后新的标志物。
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关键词
sox12
CDK4
肝细胞癌
逆转录-聚合酶链反应
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职称材料
题名
SOX12基因在Vero细胞感染猪流行性腹泻病毒过程中的功能研究
1
作者
向娇娇
元娜
李慧慧
邵明珠
赵福平
张龙超
王立贤
石丽君
陈斌
机构
湖南农业大学动物科技学院
中国农业科学院北京畜牧兽医研究所
北京大伟嘉生物技术股份有限公司
出处
《中国畜牧兽医》
北大核心
2025年第1期289-297,共9页
基金
国家重点研发计划(2021YFD1301101)
中国农业科学院科技创新工程(CAAS-ZDRW202006-04)
+1 种基金
农业重大专项猪抗病育种与全基因组选育技术研究(2020JH1/10200003)
云南省陈斌专家工作站(202205AF150074)。
文摘
[目的]探究SOX12基因对猪流行性腹泻病毒(Porcine epidemic diarrhea virus, PEDV)复制的影响,以期为抗PEDV育种提供有效分子标记。[方法]本研究合成3条SOX12基因干扰序列(siRNA1、siRNA2、siRNA3)及其阴性对照(siNC)并转染至非洲绿猴肾细胞(Vero细胞),转染48 h后收集细胞,利用实时荧光定量PCR检测干扰效率。将有效的干扰片段和siNC分别转染至Vero细胞24 h后,用感染复数为0.05的PEDV感染细胞,分为4组:感染PEDV 12 h试验组(12 hpi-siRNA)、感染PEDV 12 h对照组(12 hpi-siNC)、感染PEDV 24 h试验组(24 hpi-siRNA)及感染PEDV 24 h对照组(24 hpi-siNC),利用实时荧光定量PCR检测PEDV N及SOX12基因的表达水平,通过Western blotting检测各组细胞PEDV N蛋白表达水平,利用组织半数感染量(50%tissue culture infective dose, TCID_(50))检测PEDV的病毒滴度,并利用间接免疫荧光(indirect immunofluorescence assay, IFA)法检测各组细胞中PEDV复制情况。通过GeneMANIA网站预测SOX12基因的互作基因,利用实时荧光定量PCR检测抑制SOX12基因表达后其互作基因的表达变化。[结果]SOX12基因3条干扰片段的干扰效率为30%~60%,其中siRNA3干扰效率最高,可达60%。与12 hpi-siNC和24 hpi-siNC组相比,12 hpi-siRNA和24 hpi-siRNA组PEDV N基因的转录和蛋白表达水平均显著降低(P<0.05)。病毒滴度表型测定结果表明,12 hpi-siRNA和24 hpi-siRNA组的PEDV病毒滴度显著低于各自对照组(P<0.05);IFA结果也表明,12 hpi-siRNA和24 hpi-siRNA组的PEDV复制明显少于对照组。基因互作预测及实时荧光定量PCR检测结果显示,与siNC组相比,干扰SOX12基因的表达后,其互作基因SOX17、DDX51、ZMIZ2、SSRP1、TAF6和ABCB8的表达水平均显著降低(P<0.05)。[结论]本研究揭示了SOX12基因在PEDV感染Vero细胞过程中的调控作用,发现SOX12基因的下调表达能显著抑制PEDV复制和其互作基因SOX17、DDX51、ZMIZ2、SSRP1、TAF6和ABCB8的表达。
关键词
猪流行性腹泻病毒(PEDV)
sox12
基因
VERO细胞
基因干扰
Keywords
Porcine epidemic diarrhea virus(PEDV)
SOX 12 gene
Vero cells
gene interference
分类号
S852.651 [农业科学—基础兽医学]
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职称材料
题名
基于生物信息学分析SOX12在口腔鳞状细胞癌中的表达及验证
被引量：
5
2
作者
王珍珍
杜文治
贾如
刘洁
逯宜
机构
西安交通大学口腔医学院陕西省颅颌面精准医学研究重点实验室
出处
《西安交通大学学报（医学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第1期64-68,共5页
基金
西安交通大学基本科研项目(No.xzy012019088)~~
文摘
目的通过生物信息学分析转录因子SOX12在口腔鳞状细胞癌(OSCC)中的表达,进一步探讨其与OSCC临床病理特征的关系,阐明SOX12对OSCC早期诊断及预后的影响。方法运用GEPIA数据库结合TCGA数据库分析SOX12在OSCC组织中的表达水平,并通过qRT-PCR进行体外验证;利用LinkedOmics数据库描述SOX12表达与OSCC临床病理学参数的相关性及对预后的影响;从String-DB数据库中分析SOX12在信号转导中的位置及与其关系密切的上下游基因。结果SOX12在OSCC中呈高表达,且与OSCC病理分级、T分期、N分期呈正相关;TCGA分析显示,SOX12的表达与OSCC患者术后总体生存率有关;与SOX12相互作用的蛋白有POU3F1、POU3F2、POU3F3、MYT1L、NRSN2等,主要参与神经元的分化和发育等功能。结论SOX12在OSCC中呈高表达,并与OSCC多个病理性指标相关。
关键词
口腔鳞癌
sox12
数据库分析
Keywords
oral squamous cell carcinoma(OSCC)
sox12
database analysis
分类号
R739.8 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
SOX12、CDK4在肝细胞中的表达及意义
被引量：
1
3
作者
周鹏
孙玉岭
机构
郑州大学第一附属医院肝胆胰外科
出处
《河南医学研究》
CAS
2019年第11期1921-1923,共3页
基金
国家自然科学基金项目(81870457)
文摘
目的观察SOX12、CDK4在肝癌细胞(HepG2)与正常肝细胞(HB611)中的表达情况,分析SOX12与肝细胞癌的关系。方法采用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)法检测HepG2、HB611细胞中SOX12 mRNA、CDK4 mRNA的表达水平,采用Western blot法检测HepG2、HB611细胞中SOX12蛋白、CDK4蛋白的表达水平,采用基因抑制剂shRNA抑制两种细胞中的SOX12基因,采用RT-PCR法检测两种细胞中SOX12 mRNA与CDK4 mRNA的表达情况,分析SOX12与肝细胞癌的关系。结果 SOX12 mRNA在HepG2细胞中表达水平高于HB611细胞,CDK4 mRNA在HepG2细胞中表达水平低于HB611细胞,差异有统计学意义(均P<0.05)。两种细胞中SOX12蛋白表达水平比较,差异无统计学意义(P>0.05),CDK4蛋白在HB611细胞中的表达水平高于HepG2细胞,差异有统计学意义(P<0.05)。抑制SOX12基因后,两种细胞SOX12 mRNA的表达水平较抑制前降低,CDK4 mRNA表达水平也较抑制前降低,差异有统计学意义(均P<0.05)。结论 SOX12与CDK4在HepG2、HB611细胞中均有表达,在两种细胞中SOX12 mRNA、CDK4 mRNA的表达水平存在差异,SOX12蛋白表达水平相近,CDK4蛋白表达水平存在差异。SOX12可能通过影响CDK4的表达参与肝细胞癌的发展进程,可能成为治疗与预测肝细胞癌预后新的标志物。
关键词
sox12
CDK4
肝细胞癌
逆转录-聚合酶链反应
Keywords
sox12
CDK4
hepatocellular carcinoma
reverse transcription-polymerase chain reaction
分类号
R735.7 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
SOX12基因在Vero细胞感染猪流行性腹泻病毒过程中的功能研究
向娇娇
元娜
李慧慧
邵明珠
赵福平
张龙超
王立贤
石丽君
陈斌
《中国畜牧兽医》
北大核心
2025
0
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职称材料
2
基于生物信息学分析SOX12在口腔鳞状细胞癌中的表达及验证
王珍珍
杜文治
贾如
刘洁
逯宜
《西安交通大学学报（医学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2020
5
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
SOX12、CDK4在肝细胞中的表达及意义
周鹏
孙玉岭
《河南医学研究》
CAS
2019
1
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