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题名谷子SiSAP基因家族的鉴定与表达分析
被引量：1
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作者
李禹欣
李苗
杜晓芬
韩康妮
连世超
王军
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机构
山西农业大学谷子研究所山西省后稷实验室
山西农业大学农学院
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出处
《生物技术通报》
北大核心
2025年第1期143-156,共14页
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基金
山西省基础研究计划(202203021212462)
国家自然科学基金项目(32001609)
+2 种基金
山西省农业关键核心技术攻关子项目(NYGG19-2)
山西省现代农业产业技术体系建设项目(2024CYJSTX04-01)
山西省后稷实验室自主立项课题(202304010930003-16)。
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文摘
【目的】胁迫相关蛋白(stress associated protein, SAP)是一类具有A20/AN1锌指结构域的蛋白,在植物抵御非生物胁迫方面发挥重要作用,目前,谷子SiSAP基因家族的功能尚不明晰。对SiSAP基因家族进行鉴定和表达模式分析,为探究SiSAP基因的功能奠定基础。【方法】通过生物信息学方法对该基因家族进行鉴定及分析,经实时荧光定量PCR(RT-qPCR)验证SiSAP基因家族成员在非生物胁迫和激素处理下的表达模式。【结果】谷子SiSAP基因家族有17个成员,不均匀分布在6条染色体上,15个成员没有内含子,另外2个成员均含有1个内含子;氨基酸序列长度为150-291 aa,分子量介于15.05-32.12 kD,等电点为6.62-9.36;SiSAP基因家族成员与单子叶植物的亲缘关系更近;所有成员启动子序列均含有逆境胁迫和激素响应相关作用元件,以及ERF、Dof、C2H2等转录因子结合位点;转录组数据显示,SiSAP1、SiSAP2、SiSAP3、SiSAP4、SiSAP6、SiSAP7、SiSAP8、SiSAP11和SiSAP14等9个基因在各个组织器官中都有表达,其余8个基因几乎不表达;RT-qPCR结果证实,以上9个基因对低温、高盐和干旱3种非生物胁迫,以及脱落酸、茉莉酸甲酯、生长素和赤霉素4种激素处理的响应模式不同。【结论】SiSAP基因家族可能参与谷子抗旱、耐盐和耐低温胁迫的应答。
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关键词
谷子
sap基因家族
非生物胁迫
激素响应
表达分析
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Keywords
foxtail millet
sap gene family
abiotic stress
hormone response
expression analysis
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分类号
Q943.2
[生物学—植物学]
S515
[农业科学—作物学]
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