期刊导航
期刊开放获取
上海教育软件发展有限公..
期刊文献
+
任意字段
题名或关键词
题名
关键词
文摘
作者
第一作者
机构
刊名
分类号
参考文献
作者简介
基金资助
栏目信息
任意字段
题名或关键词
题名
关键词
文摘
作者
第一作者
机构
刊名
分类号
参考文献
作者简介
基金资助
栏目信息
检索
高级检索
期刊导航
共找到
1
篇文章
<
1
>
每页显示
20
50
100
已选择
0
条
导出题录
引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
检索结果
已选文献
显示方式：
文摘
详细
列表
相关度排序
被引量排序
时效性排序
Rv3435c重组耻垢分枝杆菌感染小鼠RAW264.7巨噬细胞的转录组分析
1
作者
刘昕玥
李丹妮
+5 位作者
宗颖
时坤
李健明
刁乃超
曾范利
杜锐
《畜牧兽医学报》
北大核心
2025年第9期4657-4672,共16页
前期研究发现,异源表达Rv3435c基因的耻垢分枝杆菌显著抑制巨噬细胞的炎症表达,为了探究Rv3435c基因在该过程行使的功能,使用二代测序分析Rv3435c重组耻垢分枝杆菌感染RAW264.7细胞的转录组差异。结果显示:通过RT-qPCR检测6、12、24、4...
前期研究发现,异源表达Rv3435c基因的耻垢分枝杆菌显著抑制巨噬细胞的炎症表达,为了探究Rv3435c基因在该过程行使的功能,使用二代测序分析Rv3435c重组耻垢分枝杆菌感染RAW264.7细胞的转录组差异。结果显示:通过RT-qPCR检测6、12、24、48 h的IL-1β、TNF-α、IL-6 mRNA表达水平,选择表达量最高的12 h作为转录组测序时间点。将测序获得的原始数据进行数据质量分析及比对结果统计,确定数据质量良好,进行样本关系分析,提示Rv3435c显著改变了小鼠巨噬细胞的基因表达情况。将数据过滤比对共得到14077个差异基因,其中,有278个显著上调表达基因和118个显著下调表达基因。对差异基因进行GO注释,得到的差异基因主要富集在免疫系统过程、对外部刺激的反应、防御响应等方面。对差异基因进行KEGG通路富集分析,主要富集在环境信息处理、细胞过程、人类疾病、有机体系统几方面。通过蛋白互作分析筛选出核心基因10个,分别为IL-6、IL-1β、CCL2、Mmp9、Spp1、Itgam、Cdc20、Ccna2、Kif11、Ccnb2。对差异基因进行荧光定量PCR试验,验证转录组结果可信,根据筛选出的DEGs和RT-qPCR结果,推测SPP1是Rv3435c行使功能的潜在靶点,并通过RT-qPCR、ELISA、Western blot验证结果。本文为结核分枝杆菌Rv3435c基因的功能探索提供了重要的数据支持。
展开更多
关键词
结核分枝杆菌
rv3435c基因
耻垢分枝杆菌
基因
注释
转录组
在线阅读
下载PDF
职称材料
题名
Rv3435c重组耻垢分枝杆菌感染小鼠RAW264.7巨噬细胞的转录组分析
1
作者
刘昕玥
李丹妮
宗颖
时坤
李健明
刁乃超
曾范利
杜锐
机构
吉林农业大学动物医学院/动物科技学院
吉林农业大学中药材学院
梅花鹿药用资源利用关键技术研究室
吉林省梅花鹿高效养殖和产品开发技术工程研究中心
教育部动物生产及产品质量安全重点实验室
出处
《畜牧兽医学报》
北大核心
2025年第9期4657-4672,共16页
基金
国家自然科学基金联合基金项目(U23A20237)。
文摘
前期研究发现,异源表达Rv3435c基因的耻垢分枝杆菌显著抑制巨噬细胞的炎症表达,为了探究Rv3435c基因在该过程行使的功能,使用二代测序分析Rv3435c重组耻垢分枝杆菌感染RAW264.7细胞的转录组差异。结果显示:通过RT-qPCR检测6、12、24、48 h的IL-1β、TNF-α、IL-6 mRNA表达水平,选择表达量最高的12 h作为转录组测序时间点。将测序获得的原始数据进行数据质量分析及比对结果统计,确定数据质量良好,进行样本关系分析,提示Rv3435c显著改变了小鼠巨噬细胞的基因表达情况。将数据过滤比对共得到14077个差异基因,其中,有278个显著上调表达基因和118个显著下调表达基因。对差异基因进行GO注释,得到的差异基因主要富集在免疫系统过程、对外部刺激的反应、防御响应等方面。对差异基因进行KEGG通路富集分析,主要富集在环境信息处理、细胞过程、人类疾病、有机体系统几方面。通过蛋白互作分析筛选出核心基因10个,分别为IL-6、IL-1β、CCL2、Mmp9、Spp1、Itgam、Cdc20、Ccna2、Kif11、Ccnb2。对差异基因进行荧光定量PCR试验,验证转录组结果可信,根据筛选出的DEGs和RT-qPCR结果,推测SPP1是Rv3435c行使功能的潜在靶点,并通过RT-qPCR、ELISA、Western blot验证结果。本文为结核分枝杆菌Rv3435c基因的功能探索提供了重要的数据支持。
关键词
结核分枝杆菌
rv3435c基因
耻垢分枝杆菌
基因
注释
转录组
Keywords
My
c
oba
c
terium tuber
c
ulosis
rv
3435
c
gene
My
c
oba
c
terium smegmatis
gene annotation
trans
c
riptome
分类号
S852.618 [农业科学—基础兽医学]
在线阅读
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
Rv3435c重组耻垢分枝杆菌感染小鼠RAW264.7巨噬细胞的转录组分析
刘昕玥
李丹妮
宗颖
时坤
李健明
刁乃超
曾范利
杜锐
《畜牧兽医学报》
北大核心
2025
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
已选择
0
条
导出题录
引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
检索结果
已选文献
上一页
1
下一页
到第
页
确定
用户登录
登录
IP登录
使用帮助
返回顶部
