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八角RAPD-PCR反应体系的建立及引物筛选研究 被引量:2
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作者 陈海云 陈少瑜 +5 位作者 宁德鲁 吴涛 耿树香 谷丽萍 白平 李勇杰 《西部林业科学》 CAS 北大核心 2012年第4期65-69,共5页
在提取高质量八角基因组DNA的基础上,通过对其RAPD反应体系的Taq DNA聚合酶、dNTPs浓度、Mg2+浓度、引物浓度等因子的优化,建立了稳定、重复性高的八角RAPD-PCR反应体系。研究结果表明,在25μL PCR反应体系中,含1.0 UTaq DNA聚合酶,0.15... 在提取高质量八角基因组DNA的基础上,通过对其RAPD反应体系的Taq DNA聚合酶、dNTPs浓度、Mg2+浓度、引物浓度等因子的优化,建立了稳定、重复性高的八角RAPD-PCR反应体系。研究结果表明,在25μL PCR反应体系中,含1.0 UTaq DNA聚合酶,0.15 mmol.L-1 dNTPs,2.0 mmol.L-1 Mg2+,2.0μmol.L-1引物,20~80 ng模板。最佳反应程序为,94℃预变性5 min,扩增后94℃变性30 s,31~37℃退火30 s,72℃延伸30 s,35个循环;72℃完全延伸7 min,4℃保存。在建立RAPD-PCR反应体系的基础上,从240条RAPD引物中筛选出15条扩增条带清晰、稳定性好的引物,并通过各引物的退火温度梯度实验,确定了各引物的最适退火温度。 展开更多
关键词 八角 rapd-pcr 反应体系 优化 引物
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黄皮RAPD-PCR反应体系的优化 被引量:2
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作者 刘小梅 潘建平 姜玲 《广东农业科学》 CAS CSCD 2006年第3期28-31,共4页
以5′-GTCGTTCCTG-3′为随机引物,以酸黄皮为试材,对黄皮RAPD反应体系进行了优化研究,结果表明:20μL反应体系中,Taq DNA聚合酶、Mg2+、随机引物、模板DNA和dNTPs 5种主要成分的适宜浓度和用量分别为2.0 U、2.5 mmol/L、0.5 umol/L、50... 以5′-GTCGTTCCTG-3′为随机引物,以酸黄皮为试材,对黄皮RAPD反应体系进行了优化研究,结果表明:20μL反应体系中,Taq DNA聚合酶、Mg2+、随机引物、模板DNA和dNTPs 5种主要成分的适宜浓度和用量分别为2.0 U、2.5 mmol/L、0.5 umol/L、50 ng、0.20 mmol/L。适宜的扩增程序为94℃预变性3 min,1个循环;94℃变性45 s,36℃退火45 s,72℃延伸1 min,38个循环;72℃后延伸7 min。 展开更多
关键词 黄皮 rapdpcr 反应体系 优化
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甘薯RAPD-PCR反应条件的优化 被引量:5
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作者 雷剑 杨新笋 《湖北农业科学》 北大核心 2009年第10期2343-2346,共4页
以徐薯22的基因组DNA作为PCR反应模板,以随机引物进行RAPD-PCR反应,通过设置TaqDNA聚合酶加量、MgCl2浓度、dNTPs浓度、模板DNA加量、引物加量的不同梯度,探索出一套适合甘薯RAPD-PCR的最优反应条件。试验结果表明,最优反应条件为反应体... 以徐薯22的基因组DNA作为PCR反应模板,以随机引物进行RAPD-PCR反应,通过设置TaqDNA聚合酶加量、MgCl2浓度、dNTPs浓度、模板DNA加量、引物加量的不同梯度,探索出一套适合甘薯RAPD-PCR的最优反应条件。试验结果表明,最优反应条件为反应体系25.0μL,2.5μL的PCR 10×Buffer、0.15U的Taq DNA聚合酶、3.0 nmol·μL-1的MgCl2、0.6 nmol·μL-1的dNTPs、40 ng的DNA模板、40 ng的RAPD引物。 展开更多
关键词 甘薯 rapdpcr 反应条件 优化
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马铃薯早疫病菌RAPD-PCR反应体系优化 被引量:1
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作者 台莲梅 左豫虎 +3 位作者 张亚玲 金永玲 郑雯 李海燕 《黑龙江农业科学》 2016年第5期4-7,共4页
为了应用RAPD分子标记技术分析马铃薯早疫病菌遗传多样性,采用单因素水平对影响RAPD反应的Mg^(2+),dNTPs、Taq DNA聚合酶、引物浓度及引物退火温度等条件进行了优化。结果表明:建立了适宜于早疫病菌的RAPD最佳反应体系,25μL的反应体系... 为了应用RAPD分子标记技术分析马铃薯早疫病菌遗传多样性,采用单因素水平对影响RAPD反应的Mg^(2+),dNTPs、Taq DNA聚合酶、引物浓度及引物退火温度等条件进行了优化。结果表明:建立了适宜于早疫病菌的RAPD最佳反应体系,25μL的反应体系中,Mg^(2+)2.5mmo1·L^(-1),dNTPs 0.20mmol·L^(-1),Taq DNA聚合酶1U,引物0.40μmol·L~(^(-1))。 展开更多
关键词 马铃薯 马铃薯早疫病 rapd-pcr 体系优化
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甘草RAPD-PCR反应体系正交优化研究 被引量:2
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作者 张增福 董建力 李明 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2011年第29期17788-17789,17818,共3页
[目的]建立一套适合甘草分子学研究的RAPD-PCR反应体系。[方法]以甘草种质为试材,采用正交试验法设计,对影响RAPD-PCR扩增的主要因素dNTPs、引物、Taq酶和DNA模板进行优化筛选。[结果]总体积25μl的甘草RAPD-PCR最佳反应体系为:10×... [目的]建立一套适合甘草分子学研究的RAPD-PCR反应体系。[方法]以甘草种质为试材,采用正交试验法设计,对影响RAPD-PCR扩增的主要因素dNTPs、引物、Taq酶和DNA模板进行优化筛选。[结果]总体积25μl的甘草RAPD-PCR最佳反应体系为:10×PCR缓冲液(含MgCl2)2.5μl,10 mmol/L dNTPs 2.5μl,50 ng DNA 2.0μl,10μmol/L引物2.0μl,5 U/μl Taq酶0.4μl。对引物的退火温度进行了梯度筛选,34℃时扩增效果较好。[结论]进行甘草RAPD-PCR反应体系的正交优化非常有效。 展开更多
关键词 甘草 DNA rapd-pcr 反应体系 优化 正交试验
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水稻RAPD反应体系的正交优化 被引量:7
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作者 张安世 邢智峰 +2 位作者 徐九文 张利民 韦慧彦 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第12期92-95,101,共5页
以焦旱1号总DNA为材料,首先对影响RAPD-PCR反应的模板DNA、Mg2+、dNTP、引物和TaqDNA聚合酶浓度等因素进行了初步优化,分析了各因素对RAPD-PCR扩增结果的影响。在此基础上对影响RAPD-PCR反应的Mg2+、dNTP、引物和TaqDNA聚合酶浓度等4个... 以焦旱1号总DNA为材料,首先对影响RAPD-PCR反应的模板DNA、Mg2+、dNTP、引物和TaqDNA聚合酶浓度等因素进行了初步优化,分析了各因素对RAPD-PCR扩增结果的影响。在此基础上对影响RAPD-PCR反应的Mg2+、dNTP、引物和TaqDNA聚合酶浓度等4个主要因素进行正交优化,研究结果表明:在25μlRAPD-PCR反应体系中,模板DNA20ng;Mg2+浓度1.5mmol/L;dNTP的浓度0.2mmol/L;引物量15pmol;TaqDNA聚合酶1.0U。在此最佳条件下,利用引物B8对18个北方粳稻品种进行了成功的扩增。 展开更多
关键词 水稻rapd pcr 优化反应体系
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牛血清白蛋白对连香树PCR反应体系的优化 被引量:6
7
作者 黄绍辉 方炎明 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2010年第26期14260-14261,共2页
[目的]为了取得更好的PCR扩增效果,建立高效的PCR反应体系。[方法]首先通过6因素5水平的正交试验对连香树RAPD-PCR反应体系优化组合,然后不再改变该结果中的其他条件,而仅改变Taq酶的浓度及在反应体系中加入不同浓度的牛血清白蛋白(BSA)... [目的]为了取得更好的PCR扩增效果,建立高效的PCR反应体系。[方法]首先通过6因素5水平的正交试验对连香树RAPD-PCR反应体系优化组合,然后不再改变该结果中的其他条件,而仅改变Taq酶的浓度及在反应体系中加入不同浓度的牛血清白蛋白(BSA)。[结果]在25组Taq酶和BSA浓度组合中,BSA改善连香树RAPD-PCR反应的最佳浓度为0.6μg/μl,Taq酶浓度可由1.0μg/μl减少至0.4μg/μl。最后优化得到的20.0μl连香树RAPD反应体系为:25mmol/LMg2+2.0μl,dNTPs0.4μl,1U的TaqDNA酶1.0μl,10×Buffer缓冲液2.5μl,0.5OD引物0.8μl,约25ng模板0.6μl。[结论]BSA的适当加入减少了Taq酶的用量,在保证更好的试验效果前提下,节约了试验成本。 展开更多
关键词 牛血清白蛋白 连香树 rapd-pcr 反应体系优化
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旱稻65及其杂交后代的RAPD分析
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作者 郭晓丽 白丽荣 《湖北农业科学》 北大核心 2013年第18期4519-4521,共3页
利用随机扩增多态性DNA标记(RAPD)从分子水平检测旱稻65(Oryza.sativa L.cv.upland rice 65)及杂交后代间的遗传差异。采用20对随机引物对两者基因组DNA进行RAPD-PCR扩增。结果表明,RAPD共扩增出159个位点,其中多态性位点有33个,占总位... 利用随机扩增多态性DNA标记(RAPD)从分子水平检测旱稻65(Oryza.sativa L.cv.upland rice 65)及杂交后代间的遗传差异。采用20对随机引物对两者基因组DNA进行RAPD-PCR扩增。结果表明,RAPD共扩增出159个位点,其中多态性位点有33个,占总位点的20.75%。旱稻65和杂交后代之间存在RAPD多态性,表明旱稻65和杂交后代之间DNA水平存在差异。 展开更多
关键词 旱稻65(Oryza SATIVA L cv UPLAND rice 65) 杂交后代 随机扩增多态性DNA标记(rapd) 聚合酶链式反应式(pcr)
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发酵肉制品总微生物RAPD扩增条件的优化 被引量:1
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作者 秦丹 杨勇 +1 位作者 周小平 程燕 《中国酿造》 CAS 北大核心 2011年第6期92-96,共5页
以改进的氯化苄法抽提发酵肉制品总微生物DNA,进行随机扩增多态DNA(random amplified polymorphic DNA,RAPD)分析。采用单因子梯度试验法对影响发酵肉制品微生物RAPD反应的反应体系、Mg2+浓度、dNTPs浓度、引物浓度、Taq DNA聚合酶的用... 以改进的氯化苄法抽提发酵肉制品总微生物DNA,进行随机扩增多态DNA(random amplified polymorphic DNA,RAPD)分析。采用单因子梯度试验法对影响发酵肉制品微生物RAPD反应的反应体系、Mg2+浓度、dNTPs浓度、引物浓度、Taq DNA聚合酶的用量及DNA模板浓度进行了筛选。结果表明,发酵肉制品微生物RAPD扩增条件为25μL PCR反应体积中,2.5mmol/L MgCl2,0.15mmol/LdNTPs,15pmol引物,50ng模板DNA,1.0U Taq DNA聚合酶。 展开更多
关键词 发酵肉制品 总微生物 随机扩增多态DNA pcr反应体系优化
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