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阿留申病毒大连株非结构蛋白基因的克隆与序列分析 被引量:5
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作者 李杨 曾祥伟 +1 位作者 马建 华育平 《东北林业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第3期73-75,共3页
根据Genbank上发表的水貂阿留申病毒基因序列数据,设计了3对引物,采用PCR的方法分别对ADV—DL1、ADV—DL2株非结构蛋白基因进行扩增,将各片断克隆至pMD18-T载体,经PCR鉴定后进行了序列测定和分析。结果显示,ADV—DL1、ADV—DL2与Ge... 根据Genbank上发表的水貂阿留申病毒基因序列数据,设计了3对引物,采用PCR的方法分别对ADV—DL1、ADV—DL2株非结构蛋白基因进行扩增,将各片断克隆至pMD18-T载体,经PCR鉴定后进行了序列测定和分析。结果显示,ADV—DL1、ADV—DL2与GenBank上公布的ADV毒株相比,核苷酸序列同源率NS1为85.9%-90.0%.Ns2为85.1%-92.7%.NS3为83.0%~95.1%。ADV—DL1与ADV—DL2同源率NS1为93.7%,NS2为95.6%,NS3为98.5%。氨基酸同源率NS1为82.8%-85.8%,NS2为80.7%~92.1%,Ns3为72.9%~95.4%。ADV—DL1与ADV—DL2同源率NS1为90.3%,NS2为92.1%,NS3为95.4%。 展开更多
关键词 阿留申病毒 结构蛋白 克隆 序列分析
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阿留申病毒强致病性毒株非结构蛋白基因的克隆及序列分析 被引量:2
2
作者 张瑞 李艳伍 +5 位作者 许兰菊 贾赟 蒋大伟 张秀云 李炜 宋海霞 《中国动物检疫》 CAS 2010年第2期27-31,共5页
根据Genbank公布的全基因序列设计两对引物,利用PCR扩增技术,得到阿留申病毒非结构蛋白基因ADV-LN1、ADV-LN2,将其克隆至pMD18-T载体中进行序列测定,并与其它国内外毒株的非结构蛋白进行序列比较和分析。序列分析表明,同国外毒株相比核... 根据Genbank公布的全基因序列设计两对引物,利用PCR扩增技术,得到阿留申病毒非结构蛋白基因ADV-LN1、ADV-LN2,将其克隆至pMD18-T载体中进行序列测定,并与其它国内外毒株的非结构蛋白进行序列比较和分析。序列分析表明,同国外毒株相比核苷酸序列同源率NS1为87.8%~99.1%,NS2为87.7%~98.5%,NS3为85.4%~99.2%;氨基酸序列同源率NS1为82.5%~98.0%,NS2为81.6%~96.5%,NS3为78.2%~98.9%;与国内毒株相比核苷酸序列同源率NS1为91.5%~93.8%,NS2为93.0%~94.7%,NS3为93.5%~96.6%;氨基酸序列同源率NS1为87.4%~89.9%,NS2为87.7%~90.4%,NS3为88.5%~94.3%。系统进化树分析表明:国内流行毒株之间与欧美毒株之间,差异逐渐缩小,遗传变异趋势更加复杂。 展开更多
关键词 阿留申病毒 结构蛋白 克隆 序列分析
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禽流感病毒新疆分离株1/96(H14N5)非结构蛋白基因克隆及序列分析 被引量:2
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作者 邓国华 于康震 +4 位作者 王秀荣 姜永萍 田国斌 乔传玲 陈化兰 《动物医学进展》 CSCD 2004年第1期103-106,共4页
研究应用无特定病原体 (SPF)鸡胚增殖禽流感病毒分离株 A/ Chicken/ Xinjiang/ 1 / 96(H1 4 N5) ,提取病毒基因组及病毒感染鸡胚绒毛尿囊膜细胞信使 RNA,运用 RT-PCR技术扩增病毒分离株的 NS1和 NS2基因 c DNA,克隆后进行序列测定。序... 研究应用无特定病原体 (SPF)鸡胚增殖禽流感病毒分离株 A/ Chicken/ Xinjiang/ 1 / 96(H1 4 N5) ,提取病毒基因组及病毒感染鸡胚绒毛尿囊膜细胞信使 RNA,运用 RT-PCR技术扩增病毒分离株的 NS1和 NS2基因 c DNA,克隆后进行序列测定。序列测定后分析结果表明 。 展开更多
关键词 禽流感病毒 新疆分离株 1/96 H14N5 结构蛋白基因 克隆 序列分析
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禽呼肠病毒P10、P17非结构蛋白基因的克隆及序列分析 被引量:3
4
作者 秦春香 谢芝勋 谢丽基 《动物医学进展》 CSCD 2006年第12期70-74,共5页
根据GenBank上的禽呼肠病毒(ARV)S1基因序列,设计并合成了一对跨越P10和P17非结构蛋白基因的特异性引物,对13个ARV毒株进行RT—PCR扩增、克隆及序列测定。结果显示,13个ARV毒株的P10蛋白基因ORF全长均为297bp,编码98个氨基酸;P1... 根据GenBank上的禽呼肠病毒(ARV)S1基因序列,设计并合成了一对跨越P10和P17非结构蛋白基因的特异性引物,对13个ARV毒株进行RT—PCR扩增、克隆及序列测定。结果显示,13个ARV毒株的P10蛋白基因ORF全长均为297bp,编码98个氨基酸;P17蛋白基因ORF全长为441bp,编码146个氨基酸。这13个ARV毒株P10、P17蛋白基因核苷酸同源性分别在96.6%~100%和95.2%~99.3%之间,推导的氨基酸同源性分别在98.2%~100%和91.9%~99.0%之间。将这13个ARV毒株与Gen Bank上其他正呼肠病毒毒株,包括番鸭株(DRV)和飞狐上分离到的内尔森海湾病毒(Nelson Bay Vir US,NBV)及两个澳洲分离株(ARM—1和SOM-4)进行同源性比较和遗传进化树分析,结果表明,呼肠病毒有地域和种类的差别。 展开更多
关键词 禽呼肠病毒 P10、P17结构蛋白 克隆 序列分析
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猪流感病毒H1N1亚型天津分离株核蛋白、基质蛋白、非结构蛋白基因克隆与序列分析
5
作者 孙英峰 鄢明华 +5 位作者 路超 李秀丽 张莉 韩伟 任卫科 田向学 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2014年第4期61-66,共6页
从天津地区不同猪场分离到6株H1N1亚型猪源流感病毒(SIV)。根据GenBank发表的H1N1亚型SIV的核蛋白(NP)、基质蛋白(M)及非结构蛋白(NS)基因序列,分别设计3对引物,将RT-PCR产物克隆至pMD18-T载体,进行测序分析。遗传进化分析结果表明:A/sw... 从天津地区不同猪场分离到6株H1N1亚型猪源流感病毒(SIV)。根据GenBank发表的H1N1亚型SIV的核蛋白(NP)、基质蛋白(M)及非结构蛋白(NS)基因序列,分别设计3对引物,将RT-PCR产物克隆至pMD18-T载体,进行测序分析。遗传进化分析结果表明:A/swine/Tianjin/TJ2/2005(H1N1)与A/swine/Tianjin/TJ4/2006(H1N1)的NP、M及NS基因核苷酸序列在遗传进化树中均与A/swine/Guangdong/33/2006(H1N1)位于同一分支上,属于古典型H1N1猪谱系;A/swine/Tianjin/TJ3/2006(H1N1)与A/swine/Tianjin/TJ8/2006(H1N1)的NP、M及NS基因核苷酸在遗传进化树中均与A/Dunedin/2/2000(H1N1)组成一个大分支,可能起源于人谱系;A/swine/Tianjin/TJ6/2009(H1N1)与A/swine/Tianjin/TJ7/2009(H1N1)NP、M及NS基因核苷酸序列在遗传进化树中均与A/swine/Jiangsu/s15/2011(H1N1)位于同一分支上,属于类禽H1N1猪谱系。本试验对6株H1N1亚型SIV的NP、M及NS全基因序列进行分析,在一定程度上揭示了天津地区H1N1亚型SIV的基因进化与流行情况。 展开更多
关键词 猪流感 HINl亚型 蛋白基因 基质蛋白基因 结构蛋白基因 序列分析
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一种快速比对非编码RNA序列-结构的算法
6
作者 宋佳 许力 孙洪 《江苏大学学报(自然科学版)》 EI CAS CSCD 北大核心 2014年第1期69-74,共6页
针对目前基于共变模型的非编码RNA序列搜索软件计算效率低的缺点,对非编码RNA家族的成员序列与家族共变模型的比对结果进行了分析.在传统共变模型中加入了RNA二级结构中结构单元的长度分布信息,设计了一种结构单元的长度限制算法,并根... 针对目前基于共变模型的非编码RNA序列搜索软件计算效率低的缺点,对非编码RNA家族的成员序列与家族共变模型的比对结果进行了分析.在传统共变模型中加入了RNA二级结构中结构单元的长度分布信息,设计了一种结构单元的长度限制算法,并根据各个结构单元的长度分布对家族中的序列在进化过程中出现插入和删除的次数进行了限定,从而显著降低了序列结构比对的计算时间.应用C++编写程序实现该方法并对非编码RNA进行搜索.测试结果表明,与基于传统共变模型的搜索方法相比,本方法在不影响搜索精度的同时,能够显著减少序列结构比对所需的计算时间.特别是对于包含大量核苷酸的序列,计算速度的提高更加明显,在对Lin-4家族搜索时,可获得90.76倍的加速效果. 展开更多
关键词 编码rna 序列结构比对 共变模型 结构单元 改进的共变模型
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鼠肝炎冠状病毒非结构蛋白1内保守序列LLRKxGxKG的功能研究
7
作者 林磊 吴晓燕 +1 位作者 常国辉 祝庆余 《解放军医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2010年第5期508-512,共5页
目的研究鼠肝炎冠状病毒(MHV)非结构蛋白1(NSP1)内的保守氨基酸序列LLRKxGxKG的功能。方法扩增并构建MHVNSP1正常基因及LLRKxGxKG序列缺失突变的NSP1基因,分别将其插入真核表达载体pcDNA3.1中,获得真核表达质粒。用所构建的真核表达质... 目的研究鼠肝炎冠状病毒(MHV)非结构蛋白1(NSP1)内的保守氨基酸序列LLRKxGxKG的功能。方法扩增并构建MHVNSP1正常基因及LLRKxGxKG序列缺失突变的NSP1基因,分别将其插入真核表达载体pcDNA3.1中,获得真核表达质粒。用所构建的真核表达质粒转染L929细胞,经新城疫病毒(NDV)刺激诱导后,采用ELISA法检测IFN-β的表达水平,观察NSP1正常或突变蛋白对IFN-β表达的影响。通过与含CAT和Luc报告基因的重组质粒进行共转染,观察NSP1正常或突变蛋白对IFN-β启动子活性和干扰素刺激应答元件(ISRE)活性的影响。通过与三种报告基因(pRLuc-CMV、pGL3-basic、pGL3-control)共转染,观察NSP1正常或突变蛋白对共转染基因表达的影响。结果MHVNSP1对真核细胞产生干扰素有一定的影响,并可显著抑制IFN-β启动子或ISRE应答元件的活性,且该抑制作用不受LLRKxGxKG序列缺失的影响。同时,MHVNSP1还可强烈抑制多种共转染报告基因的表达。该抑制作用在LLRKxGxKG序列缺失后显著降低。结论MHVNSP1对Ⅰ型干扰素信号通路有特异的抑制作用。LLRKxGxKG序列是MHVNSP1的一个重要功能域,在抑制共转染基因表达过程中发挥着重要作用。 展开更多
关键词 冠状病毒属 肝炎病毒 病毒结构蛋白质类 保守序列
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GPV YZ株非结构蛋白1基因的克隆及序列分析 被引量:1
8
作者 吕春伟 朱峰伟 +1 位作者 杨丽金 朱新产 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2014年第2期27-37,共11页
对鹅细小病毒YZ株非结构蛋白1的基因进行克隆、测序、比对及蛋白质结构和功能等生物信息学分析,探究了非结构蛋白1的基因分子特征和理化特性及病理学相关致病机理。通过PCR、质粒克隆及核苷酸序列测定方法获得病毒YZ株非结构蛋白1基因序... 对鹅细小病毒YZ株非结构蛋白1的基因进行克隆、测序、比对及蛋白质结构和功能等生物信息学分析,探究了非结构蛋白1的基因分子特征和理化特性及病理学相关致病机理。通过PCR、质粒克隆及核苷酸序列测定方法获得病毒YZ株非结构蛋白1基因序列,采用DNAsis、Mega 5.10、Blast等多种生物学软件完成核苷酸序列及氨基酸序列和系统进化分析。结果显示,鹅细小病毒YZ株非结构蛋白1的基因全长1 881个核苷酸,编码627个氨基酸。与GPV-GB标准株、MDPV、ChPV、AAV的NS1基因序列存在很高的同源相似性,与MDPV的亲缘关系最近,提示番鸭和鹅细小病毒来自共同的祖先,其宿主的不同而演化为不同的分支。对应GPVNS1-YZ的同源区段序列(293-524)含231个氨基酸,分子量为26.446 kDa、PI=6.04,带负电的氨基酸30个,带正电的氨基酸28个,体外表达半衰期为5.5 h时,不稳定系数为40.23,脂肪系数为78.01,平均疏水值为-0.43,表明这一蛋白质为亲水性蛋白;该蛋白还存在9个抗原肽的位置:55-69,185-195,94-129,156-167,19-30,76-83,6-12,205-210,40-45,出现16个可能的B细胞抗原表位,表明它具有较高的免疫原性;但不存在跨膜片段,也不含信号肽和二硫键,可能不会分泌到宿主细胞的细胞膜外发生作用;其二级结构包含α-螺旋占30.74%,β-折叠占17.32%,无规则卷曲占51.95%,三级结构近似球状,包含一个SF3解旋酶超家族的DNA病毒解旋酶功能域(AA17-AA173),提示鹅细小病毒的非结构蛋白1可能在感染发生后参与病毒DNA自我复制中的DNA解旋过程。 展开更多
关键词 鹅细小病毒 结构蛋白基因 结构蛋白1 序列分析
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HCV非结构蛋白5A对HIV长末端重复序列影响的初步探讨
9
作者 彭米林 肖新强 +6 位作者 蒋永芳 田沂 许允 张旻 王文龙 彭锋 龚国忠 《临床肝胆病杂志》 CAS 2014年第2期136-140,共5页
目的本研究拟探讨HCV非结构蛋白5A(NS5A)对HIV长末端重复序列(long terminal repeat,LTR)影响,从而为HCV对HIV的影响提供实验依据。方法将构建的LTR启动子驱动的荧光素酶(Luc)报告基因表达质粒(pGL3-LTR-Luc)和含HCV NS5A基因的表达质粒... 目的本研究拟探讨HCV非结构蛋白5A(NS5A)对HIV长末端重复序列(long terminal repeat,LTR)影响,从而为HCV对HIV的影响提供实验依据。方法将构建的LTR启动子驱动的荧光素酶(Luc)报告基因表达质粒(pGL3-LTR-Luc)和含HCV NS5A基因的表达质粒pCNS5A共转染肝癌细胞株(Huh7细胞),采用免疫细胞化学技术、Western Blot及逆转录聚合酶链反应检测HCV NS5A蛋白及mRNA的表达;本实验分三组,将质粒pGL3-LTR-Luc(空白组)、质粒pRc/CMV+pGL3-LTR-Luc(对照组)、质粒pCNS5A+pGL3-LTR-Luc(实验组)分别转染Huh7细胞,48 h后收集细胞,采用Luc活性检测LTR的活性,以观察HCV NS5A对LTR的调控影响。所得荧光活性值以均数±标准差表示,采用Levene's方差齐性检验,多组间比较采用单因素方差分析,两两比较行LSD-t检验。结果转染pcNS5A质粒的Huh7细胞质经RT-PCR及Western Blot检测,HCV NS5A mRNA及蛋白在细胞中获得表达。方差分析结果提示LTR荧光活性在三组间有明显的差异(F=7.876,P=0.002),进一步比较各组间的差异,结果提示共转染质粒pcNS5A+pGL3-LTR-Luc组的Huh7细胞中Luc相对活性(22 476±4471)明显高于单转染pGL3-LTR-Luc组(15 887±3039,P=0.002)及共转染质粒pRc/CMV+pGL3-LTR-Luc组(16 321±4162,P=0.008),差异有统计学意义。结论表达HCV NS5A的质粒pCNS5A成功转染至Huh7细胞;HCV NS5A蛋白能激活HIV LTR,提示HCV NS5A可能为HCV促进HIV复制的分子机制之一。 展开更多
关键词 肝炎病毒属 HIV 病毒结构蛋白质类 HIV长末端重复序列
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口蹄疫病毒O/Laos/00株非结构蛋白3A基因特征分析 被引量:2
10
作者 信爱国 朱建波 +2 位作者 赵文华 李乐 张念祖 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第4期283-286,共4页
经反转录聚合酶链式反应(RT_PCR)技术扩增得到口蹄疫病毒O/Laos/00株的非结构蛋白3A基因核苷酸序列,与其他8株代表性参考毒株的3A基因进行比较,分析口蹄疫病毒3A基因的特征。结果表明:O/Laos/00株3A基因含有429核苷酸,编码143氨基酸残基... 经反转录聚合酶链式反应(RT_PCR)技术扩增得到口蹄疫病毒O/Laos/00株的非结构蛋白3A基因核苷酸序列,与其他8株代表性参考毒株的3A基因进行比较,分析口蹄疫病毒3A基因的特征。结果表明:O/Laos/00株3A基因含有429核苷酸,编码143氨基酸残基。9株病毒3A氨基酸序列相比较,可分成3种不同的类型:一类是具有全长3A的毒株,一类是具有133~143位氨基酸缺失的毒株,这两类毒株均来源于牛体,核苷酸差异小(<15%);另一类是具有93~102位氨基酸缺失的毒株,毒株相互之间核苷酸差异较大(7.25%~22.2%)。 展开更多
关键词 口蹄疫病毒 结构蛋白3A 序列分析 宿主
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猪博卡病毒非结构蛋白NP1基因的克隆及基因分型研究 被引量:2
11
作者 陈如敬 吴学敏 +5 位作者 车勇良 王隆柏 严山 魏宏 刘玉涛 周伦江 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2015年第2期292-297,共6页
为明确猪博卡病毒福建株非结构蛋白NP1的特征,本研究根据GenBank中登录的非结构蛋白NP1的基因特征,设计特异性引物从一份患有断奶仔猪多系统衰竭综合征的仔猪肺脏和淋巴结基因组DNA中扩增到猪博卡病毒非结构蛋白NP1的全长基因序列。测... 为明确猪博卡病毒福建株非结构蛋白NP1的特征,本研究根据GenBank中登录的非结构蛋白NP1的基因特征,设计特异性引物从一份患有断奶仔猪多系统衰竭综合征的仔猪肺脏和淋巴结基因组DNA中扩增到猪博卡病毒非结构蛋白NP1的全长基因序列。测序结果显示,本试验克隆的猪博卡病毒非结构蛋白NP1的基因全长为675bp,编码有224个氨基酸,其与美国株猪博卡病毒(OH110株)核苷酸同源性最高,达97.3%,但与美国株猪博卡病毒(IN109-1株)核苷酸同源性仅为81.8%;与英国北爱尔兰野猪博卡病毒(F41株和64-1株)同源性均不高,分别为82.5%和80.9%;与猪博卡病毒(H18株)核苷酸同源性最低,仅为43.8%。通过对猪博卡病毒代表株进行核苷酸同源性比对分析发现,猪博卡病毒存在3个主要的基因群,不同基因群非结构蛋白NP1的核苷酸同源性均低于50.0%。结果提示需对猪博卡病毒进行明确的划分,不同来源的猪博卡病毒可细分为3个明显的代表种。 展开更多
关键词 猪博卡病毒 结构蛋白NP1 克隆 序列分析 基因分型
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A型流感病毒非结构蛋白NS1的研究进展 被引量:3
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作者 杨威 王春凤 《中国兽医杂志》 CAS 北大核心 2016年第7期61-63,共3页
A型流感病毒是引发人类和其他动物的高度接触性呼吸道感染的一种重要病原体,对公共健康是造成了持续性威胁。由于其分段RNA的快速变化,导致了新的、未知的亚型出现,其中部分亚型可能造成流感大流行,给人类和畜禽造成巨大损失。A型流感... A型流感病毒是引发人类和其他动物的高度接触性呼吸道感染的一种重要病原体,对公共健康是造成了持续性威胁。由于其分段RNA的快速变化,导致了新的、未知的亚型出现,其中部分亚型可能造成流感大流行,给人类和畜禽造成巨大损失。A型流感病毒属正黏病毒科,血清学上可分为18个血凝素(HA,H1-H18)亚型和11个神经氨酸酶(NA,N1-N11)亚型[1],其基因组由8个单链负股RNA片段构成, 展开更多
关键词 A型流感病毒 结构蛋白 rna片段 呼吸道感染 神经氨酸酶 公共健康 亚型 病原体
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牦牛FMDV持续感染分离株非结构蛋白P2的克隆及基因特征分析
13
作者 魏小娟 常惠芸 +2 位作者 张继瑜 丛国政 唐江山 《甘肃农业大学学报》 CAS CSCD 2007年第5期16-19,共4页
以FMDV持续感染模型动物牦牛的食道/咽部分离物(O/P液)为反转录模板,用1对特异性引物扩增目的cDNA,然后与pMD18-T载体连接并转化JM109菌株,再经重组质粒电泳、PCR和EcoRⅠ酶切鉴定.序列测定和分析结果表明,分离株与China/99的同源性最高... 以FMDV持续感染模型动物牦牛的食道/咽部分离物(O/P液)为反转录模板,用1对特异性引物扩增目的cDNA,然后与pMD18-T载体连接并转化JM109菌株,再经重组质粒电泳、PCR和EcoRⅠ酶切鉴定.序列测定和分析结果表明,分离株与China/99的同源性最高达93.4%,而与Akesu/58序列的同源性为90.3%;推导的氨基酸序列同源性分别为97.8%、96.7%. 展开更多
关键词 FMDV 持续感染 P2结构蛋白 克隆 序列分析
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亚洲1型口蹄疫病毒RS株非结构蛋白P3区基因特征分析
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作者 信爱国 李华春 +4 位作者 李乐 朱建波 杨永钦 廖德芳 张念祖 《动物医学进展》 CSCD 2007年第2期1-5,共5页
经RT-PCR扩增得到一株口蹄疫亚洲1型流行毒株的非结构蛋白P3基因核苷酸序列,与其他代表性参考毒株的P3基因进行比较,分析该毒株P3区基因特征。结果表明,该毒株P3基因含有2721个核苷酸,编码907个氨基酸;其中非结构蛋白3A的基因长度为459... 经RT-PCR扩增得到一株口蹄疫亚洲1型流行毒株的非结构蛋白P3基因核苷酸序列,与其他代表性参考毒株的P3基因进行比较,分析该毒株P3区基因特征。结果表明,该毒株P3基因含有2721个核苷酸,编码907个氨基酸;其中非结构蛋白3A的基因长度为459bp,编码153个氨基酸;3个3B(VPg)基因长度分别是69、72、72bp,分别编码23、24、24个氨基酸;3C基因长度为639bp,编码213个氨基酸;3D基因长度为1410bp,编码470个氨基酸。氨基酸序列比较分析显示,3A基因C末端比其他基因更容易变异,根据3A基因构建的系统进化分析提示该流行毒株与YNBS/58和IND 321/01亲缘关系较近,属同一亚系谱。 展开更多
关键词 口蹄疫病毒 结构蛋白 P3区基因 序列分析
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口蹄疫病毒非结构蛋白3C真核表达载体的构建及表达
15
作者 刘萍 丛国正 +1 位作者 常惠芸 杨孝朴 《中国兽医杂志》 CAS 北大核心 2007年第6期25-26,共2页
关键词 口蹄疫病毒 结构蛋白 真核表达载体 3C rna病毒 脊髓灰质炎病毒 宿主细胞 FMDV
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丙型肝炎病毒非结构蛋白NS3致肝癌机制的研究进展
16
作者 李琪 徐可树 《临床肝胆病杂志》 CAS 2005年第4期257-259,共3页
大量研究显示丙型肝炎病毒(hepatitis C virus,HCV)持续感染肝细胞能导致肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC),但其致癌机制目前还不十分清楚.HCV是一种RNA病毒,其基因组不能整合到宿主染色体中引起基因突变,可能是通过其表达的蛋... 大量研究显示丙型肝炎病毒(hepatitis C virus,HCV)持续感染肝细胞能导致肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC),但其致癌机制目前还不十分清楚.HCV是一种RNA病毒,其基因组不能整合到宿主染色体中引起基因突变,可能是通过其表达的蛋白质引起细胞转化.由于HCV NS3含有多种蛋白酶活性,因而推测HCV NS3在肝细胞癌的形成过程中具有重要作用,本文就HCV NS3致癌机制的研究进展作一综述. 展开更多
关键词 结构蛋白NS3 丙型肝炎病毒 carcinoma 肝癌 肝细胞癌 致癌机制 rna病毒 蛋白酶活性 HCV
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一株H9N2亚型禽流感病毒非结构蛋白基因的克隆及分子特征
17
作者 易华山 侯顺利 +2 位作者 独军政 胡永浩 常惠芸 《浙江农业科学》 2009年第3期600-603,共4页
采用RT-PCR方法对H9N2亚型禽流感病毒Ck/GS/2/99株非结构蛋白NS基因进行了扩增,将其克隆到pGEM-T easy载体后进行序列测定与分析。结果表明,该株病毒NS基因开放阅读框(ORF)由890个碱基组成,编码272个氨基酸。经同源性与系统发生树分析表... 采用RT-PCR方法对H9N2亚型禽流感病毒Ck/GS/2/99株非结构蛋白NS基因进行了扩增,将其克隆到pGEM-T easy载体后进行序列测定与分析。结果表明,该株病毒NS基因开放阅读框(ORF)由890个碱基组成,编码272个氨基酸。经同源性与系统发生树分析表明,该毒株NS基因都与Ck/NX/4/99株的核苷酸和氨基酸同源性在99%以上,与Ck/HB/31/00、Ck/SD/6/96和Sw/HK/10/98关系密切。 展开更多
关键词 禽流感病毒 H9N2亚型 A/Ckicken/Gansu/2/99 结构蛋白 序列分析
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A型流感病毒非结构蛋白NS1主要功能的研究进展 被引量:5
18
作者 余树芳 魏凡华 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第1期96-100,共5页
A型流感病毒(Influenza A virus,IAV)是一种具有包膜的、基因组分节段的负链RNA病毒,基因组大小约为14 kb。IAV基因组由8个RNA节段组成,大小从890个碱基到2 341个碱基不等,可编码最多14种蛋白:血凝素(HA)、神经氨酸酶(NA)、聚合酶蛋白(P... A型流感病毒(Influenza A virus,IAV)是一种具有包膜的、基因组分节段的负链RNA病毒,基因组大小约为14 kb。IAV基因组由8个RNA节段组成,大小从890个碱基到2 341个碱基不等,可编码最多14种蛋白:血凝素(HA)、神经氨酸酶(NA)、聚合酶蛋白(PA、PB1和PB2)、核蛋白(NP)、基质蛋白(M1)、离子通道蛋白(M2)和非结构蛋白(NS1、NS2、PA-X和PB2-F2)^([1])。 展开更多
关键词 A型流感病毒 基因组大小 结构蛋白 负链rna病毒 基质蛋白 NS1 PB2 V基因
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番茄斑萎病毒属病毒SRNA序列比对 被引量:3
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作者 徐小刚 刘雅婷 +3 位作者 李永忠 何婷婷 韩毅 孙文涛 《湖南农业大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2010年第2期142-146,共5页
从生物信息数据库NCBI中搜索并下载最新有关番茄萎斑病毒属Tospovirus各种间SRNA片段全长序列以及该片段上NSs、N的核酸和蛋白质序列着手,运用DNAstar和DNAMAN以及NPSA等生物信息软件对其进行比对分析,结果发现,以NSs蛋白序列建立的系... 从生物信息数据库NCBI中搜索并下载最新有关番茄萎斑病毒属Tospovirus各种间SRNA片段全长序列以及该片段上NSs、N的核酸和蛋白质序列着手,运用DNAstar和DNAMAN以及NPSA等生物信息软件对其进行比对分析,结果发现,以NSs蛋白序列建立的系统进化树显示CCSV和TZSV之间的同源性为85.8%,IYSV和TYRV之间的同源性达90%,MYSV和PSMV间的同源性为97.5%;通过N蛋白序列分析显示,Tospovirus属中有7组同源性较高的种;在Tospovirus属病毒中非极性氨基酸含量最高,极性酸性氨基酸最少,比较TSWV中抗性破坏RB株系与普通株系在NSs、N核酸、蛋白质序列、氨基酸含量和蛋白质二级结构之间的差异,发现差异不显著. 展开更多
关键词 番茄斑萎病毒属 核壳体序列 S rna上的非结构蛋白序列 抗性破坏
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拟南芥细胞核中RNA-蛋白相互作用与RNA二级结构呈负相关关系
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作者 徐俊芳 王品 +2 位作者 Gosai SJ Foley SW Wang D 《中国肿瘤生物治疗杂志》 CAS CSCD 北大核心 2015年第6期728-728,共1页
真核细胞中,转录后调控需要顺式作用元件和反式作用因子共同发挥作用,而其中RNA的二级结构以及RNA-蛋白相互作用直接影响了RNA在转录后的被调控以及RNA行使功能。因此,研究任何物种中RNA的二级结构以及RNA-蛋白相互作用,并探究这两者之... 真核细胞中,转录后调控需要顺式作用元件和反式作用因子共同发挥作用,而其中RNA的二级结构以及RNA-蛋白相互作用直接影响了RNA在转录后的被调控以及RNA行使功能。因此,研究任何物种中RNA的二级结构以及RNA-蛋白相互作用,并探究这两者之间的联系具有重要的科学意义,但目前尚无相关文献报道这两者之间的关系。该文作者利用了可以分别特异性识别并降解单链RNA、双链RNA的RNA酶, 展开更多
关键词 rna二级结构 反式作用因子 蛋白结合 转录后调控 负相关 顺式作用元件 特异性识别 文献报道 多聚腺苷酸 序列片段
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