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题名利用混沌差分进化算法预测RNA二级结构
被引量:3
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作者
胡桂武
彭宏
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机构
广东商学院数学与计算科学系
华南理工大学计算机科学与工程学院
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出处
《计算机科学》
CSCD
北大核心
2007年第9期163-166,共4页
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基金
国家自然科学基金重点项目(编号:30230350)资助
广东省自然科学基金(编号:06301003)资助
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文摘
RNA二级结构预测在生物信息学中具有重要意义。本文针对RNA二级结构预测,提出了一种混沌差分进化算法。算法对种群进行混沌初始化,利用混沌扰动产生新的个体,缩小搜索空间;根据个体的适应值和种群密度自适应地对个体进行混沌更新,改善了种群的多样性。该算法充分利用了差分进化算法速度快以及混沌的遍历性、随机性和规律性等特点,有效克服了早熟现象,提高了算法的全局搜索能力。实验证明了算法的有效性。
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关键词
rna二级结构
生物信息学
差分进化算法
混沌
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Keywords
rna secondary structure, bioinformatics, differential evolution(de),chaos
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分类号
O234
[理学—运筹学与控制论]
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