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水稻白叶枯病候选抗性基因SHNLR的RGAs克隆及分析
被引量：
1
1
作者
张颖
王长春
+3 位作者
胡海涛
张维林
严成其
杨玲
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第4期51-57,共7页
旨在从含有疣粒野生稻抗白叶枯病基因的新种质SH5、SH76基因组中克隆抗病基因。利用RGAs法得到1个NBS-LRR类同源基因,暂命名为SHNLR(登录号为JF934724)。结果表明,SHNLR的开放阅读框长度为3 105 bp,编码1 034个氨基酸,含有CC、NB-ARC与...
旨在从含有疣粒野生稻抗白叶枯病基因的新种质SH5、SH76基因组中克隆抗病基因。利用RGAs法得到1个NBS-LRR类同源基因,暂命名为SHNLR(登录号为JF934724)。结果表明,SHNLR的开放阅读框长度为3 105 bp,编码1 034个氨基酸,含有CC、NB-ARC与LRR结构域,具备CC-NBS-LRR类植物抗病基因的结构特征。BLASTn和BLASTp比对显示SHNLR是单拷贝基因,未发现同源性较高且功能已知的基因,仅NBS保守域序列与番茄Prf基因的相似度最高。对SHNLR基因电子定位,发现其位于水稻第11号染色体的长臂末端,但与11号染色体上已定位或克隆的8个白叶枯病抗性基因具有不同序列或处于不同的位置。半定量RT-PCR分析表明,SHNLR在抗病新种质叶片中的表达明显受到白叶枯病菌Zhe173的诱导。因此推测SHNLR可能是1个与抗白叶枯病相关的R基因。
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关键词
rgas
法
水稻
白叶枯病抗性基因
克隆
表达分析
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职称材料
题名
水稻白叶枯病候选抗性基因SHNLR的RGAs克隆及分析
被引量：
1
1
作者
张颖
王长春
胡海涛
张维林
严成其
杨玲
机构
浙江师范大学化学与生命科学学院
浙江省农业科学院病毒学与生物技术研究所
出处
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第4期51-57,共7页
基金
国家自然科学基金项目(30471074)
浙江省重大科技专项(优先主题)资助项目(2007C12039)
文摘
旨在从含有疣粒野生稻抗白叶枯病基因的新种质SH5、SH76基因组中克隆抗病基因。利用RGAs法得到1个NBS-LRR类同源基因,暂命名为SHNLR(登录号为JF934724)。结果表明,SHNLR的开放阅读框长度为3 105 bp,编码1 034个氨基酸,含有CC、NB-ARC与LRR结构域,具备CC-NBS-LRR类植物抗病基因的结构特征。BLASTn和BLASTp比对显示SHNLR是单拷贝基因,未发现同源性较高且功能已知的基因,仅NBS保守域序列与番茄Prf基因的相似度最高。对SHNLR基因电子定位,发现其位于水稻第11号染色体的长臂末端,但与11号染色体上已定位或克隆的8个白叶枯病抗性基因具有不同序列或处于不同的位置。半定量RT-PCR分析表明,SHNLR在抗病新种质叶片中的表达明显受到白叶枯病菌Zhe173的诱导。因此推测SHNLR可能是1个与抗白叶枯病相关的R基因。
关键词
rgas
法
水稻
白叶枯病抗性基因
克隆
表达分析
Keywords
rgas rice bacterial blight resistance gene cloning expression analysis
分类号
S511 [农业科学—作物学]
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作者
出处
发文年
被引量
操作
1
水稻白叶枯病候选抗性基因SHNLR的RGAs克隆及分析
张颖
王长春
胡海涛
张维林
严成其
杨玲
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2012
1
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