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猕猴桃模板DNA的提取及RAPD-PCR最佳反应体系的建立 被引量:23
1
作者 陈万秋 李思光 +1 位作者 罗玉萍 陈少风 《生物技术通报》 CAS CSCD 2003年第3期40-43,共4页
以改良CTAB法从猕猴桃叶片中制备模板DNA ,优化了PCR热循环参数 ,建立了RAPD PCR扩增的最佳反应体系。实验结果表明 ,CTAB提取液中EDTA组分的浓度对模板提取影响很大 ,其最适浓度为 80mmol/L ;用异丙醇沉淀后不经乙醇洗涤纯化的DNA不会... 以改良CTAB法从猕猴桃叶片中制备模板DNA ,优化了PCR热循环参数 ,建立了RAPD PCR扩增的最佳反应体系。实验结果表明 ,CTAB提取液中EDTA组分的浓度对模板提取影响很大 ,其最适浓度为 80mmol/L ;用异丙醇沉淀后不经乙醇洗涤纯化的DNA不会影响扩增效果。PCR热循环参数为 :94℃预变性 5min ;94℃变性 1min ,37℃退火 1min ,72℃延伸 2min ,循环 4 0次 ;最后在 72℃延伸 6min。 展开更多
关键词 猕猴桃 模板DNA 提取 rapd-pcr 最佳反应体系
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RAPD-PCR对梨属植物品种鉴定的研究 被引量:13
2
作者 马兵钢 牛建新 +2 位作者 潘立忠 鲁晓燕 冯建荣 《西北农业学报》 CAS CSCD 2004年第1期84-88,共5页
用RAPD-PCR技术分析鉴定了梨属的18份品种材料(包括不同品种、杂交种和芽变种材料)。从OP系列8组共160个10碱基随机引物中,筛选出12种能很好地用于梨品种鉴定的引物。
关键词 rapd-pcr 梨属 品种鉴定 分子标记
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利用正交设计优化兴安落叶松RAPD-PCR反应体系 被引量:11
3
作者 李雪峰 张含国 +1 位作者 贯春雨 张瑶 《植物研究》 CAS CSCD 北大核心 2009年第1期80-85,共6页
以兴安落叶松针叶DNA为模板,对影响落叶松RAPD-PCR扩增的重要参数进行了优化试验,以期建立兴安落叶松RAPD-PCR反应的最佳体系。通过采用正交设计L16(45)对兴安落叶松RAPD-PCR反应的5因素(Taq酶、Mg2+、dNTP、模板DNA、引物)在4个水平上... 以兴安落叶松针叶DNA为模板,对影响落叶松RAPD-PCR扩增的重要参数进行了优化试验,以期建立兴安落叶松RAPD-PCR反应的最佳体系。通过采用正交设计L16(45)对兴安落叶松RAPD-PCR反应的5因素(Taq酶、Mg2+、dNTP、模板DNA、引物)在4个水平上进行优化试验,结果表明兴安落叶松最佳的RAPD-PCR的反应体系(20μL)中含有模板90ng,0.5μmol·L-1的引物,1×反应缓冲液,DNTP各为0.25mmol·L-1,1U的TaqDNA聚合酶,Mg2+2.5mmol·L-1。在此基础上筛选出20个扩增稳定、多态性丰富的RAPD引物,并通过梯度PCR试验,确定了引物最佳退火温度。 展开更多
关键词 兴安落叶松 rapd-pcr 正交设计 反应体系
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枯萎病尖孢镰刀菌的RAPD-PCR多态性分析 被引量:14
4
作者 曹宜 刘波 +2 位作者 林营志 朱育菁 周涵韬 《厦门大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2004年第B08期74-79,共6页
利用随机扩增多态性DNA(RAPD PCR),对采自我省不同地区、不同寄主和同一寄主不同植株的瓜类枯萎病原菌尖孢镰刀菌进行遗传多样性分析,筛选到6个多态性随机引物,共产生了72条RAPD带,其中86.11%具有多态性;通过聚类分析,将供试菌株分为4个... 利用随机扩增多态性DNA(RAPD PCR),对采自我省不同地区、不同寄主和同一寄主不同植株的瓜类枯萎病原菌尖孢镰刀菌进行遗传多样性分析,筛选到6个多态性随机引物,共产生了72条RAPD带,其中86.11%具有多态性;通过聚类分析,将供试菌株分为4个RAPD组,确定了菌株间的亲缘关系,为瓜类枯萎病原菌尖孢镰刀菌的分类提供有利的分子证据. 展开更多
关键词 枯萎病 尖孢镰刀菌 rapd-pcr 多态性分析 随机扩增多态性DNA 瓜类
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洋葱(Alliumcepa L.)RAPD-PCR反应体系及扩增程序的优化 被引量:7
5
作者 陈沁滨 侯喜林 +3 位作者 王建军 冷月强 蒋芳玲 薛萍 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2006年第4期434-438,共5页
为建立多态性高、稳定性好的洋葱RAPD-PCR反应体系,采用正交设计,研究了Taq酶、Mg2+、引物和dNTP 4种RAPD-PCR反应组分浓度变化对扩增结果的影响,在此基础上对模板DNA用量、扩增程序中退火温度和反应循环次数进行了筛选。试验结果表明,... 为建立多态性高、稳定性好的洋葱RAPD-PCR反应体系,采用正交设计,研究了Taq酶、Mg2+、引物和dNTP 4种RAPD-PCR反应组分浓度变化对扩增结果的影响,在此基础上对模板DNA用量、扩增程序中退火温度和反应循环次数进行了筛选。试验结果表明,洋葱20μl RAPD-PCR优化反应体系为1×Buffer、2.0 mmo1/L Mg2+、1.0 UTaqDNA聚合酶、200μmo1/L dNTP、0.6μmo1/L引物、2%甘油和15 ng DNA模板;PCR扩增程序为94℃预变性4 m in;94℃变性30 s,35℃退火40 s,72℃延长1.5 m in,45个循环;72℃保温延伸7 m in。 展开更多
关键词 洋葱 rapd-pcr反应体系 扩增程序 正交设计
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11种兰属植物DNA的提取及RAPD-PCR实验体系的建立与优化 被引量:7
6
作者 王国鼎 文晓鹏 +2 位作者 季祥彪 乔光 胡鹏 《种子》 CSCD 北大核心 2007年第3期24-27,共4页
采用改进的CTAB-DNA提取方法,从11种兰属植物的嫩叶中提取总DNA。所得的DNA样品的A260/A280值在1.7~1.9之间,琼脂糖凝胶上主带清晰,较少降解,样品纯度高,DNA量大。另外,对影响RAPD-PCR的Mg^2+、dNTPs、Taq酶、引物浓度等因... 采用改进的CTAB-DNA提取方法,从11种兰属植物的嫩叶中提取总DNA。所得的DNA样品的A260/A280值在1.7~1.9之间,琼脂糖凝胶上主带清晰,较少降解,样品纯度高,DNA量大。另外,对影响RAPD-PCR的Mg^2+、dNTPs、Taq酶、引物浓度等因素进行了优化。确定优化的反应体系为:75ng模板DNA,1×Buffer,2.5mmol/LMg^2+,0.15mmol/LdNTPs,0.75UTaq酶,引物浓度0.4μmol/L,反应总体积为25山。该体系在20个供试兰属实验材料中获得较好的扩增结果。 展开更多
关键词 兰属植物 DNA提取 rapd-pcr
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濒危竹种小蓬竹(Drepanostachyum luodianense)RAPD-PCR反应体系优化 被引量:4
7
作者 刘济明 王敏 +5 位作者 闫国华 赵小鹏 文萍 池馨 颜强 李鹏 《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2014年第3期667-674,共8页
为了建立小蓬竹(Drepanostachyum luodianense)RAPD-PCR反应的最优体系,以小蓬竹基因组DNA为模板,对影响其RAPD扩增的dNTPs浓度、模板DNA浓度、Taq DNA聚合酶量、引物浓度、Mg2+浓度等重要参数进行了单因子和正交试验。试验得出小蓬竹R... 为了建立小蓬竹(Drepanostachyum luodianense)RAPD-PCR反应的最优体系,以小蓬竹基因组DNA为模板,对影响其RAPD扩增的dNTPs浓度、模板DNA浓度、Taq DNA聚合酶量、引物浓度、Mg2+浓度等重要参数进行了单因子和正交试验。试验得出小蓬竹RAPD最优反应体系为:20μL反应体系,10×PCR buffer为1/10体积,dNTPs为100μmol·L-1,模板DNA量为30 ng,Taq DNA聚合酶为1.0 U,引物浓度为0.2μmol·L-1,Mg2+浓度为1.5 mmol·L-1。优化后的RAPD-PCR反应程序为:94℃预变性5 min,然后进入35个循环,即94℃变性1 min,35℃退火30 s,72℃延伸90 s,循环完毕后于72℃延伸7 min,最后在4℃保持。 展开更多
关键词 小蓬竹 rapd-pcr 引物 dNTPs TAQ DNA聚合酶
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黄瓜DNA提取及其RAPD-PCR反应体系的优化 被引量:6
8
作者 孙敏 乔爱民 +1 位作者 王和勇 曾建军 《种子》 CSCD 北大核心 2004年第6期9-14,共6页
利用改良的 SDS方法提取黄瓜干种子与一步法提取的黄花苗总 DNA进行 RAPD扩增 ,其结果与传统的 CTAB和 SDS的结果一样。这两种方法不仅节约成本 ,且简单快速 ,大大降低了 DNA的提取难度 ,适宜黄瓜杂交种子纯度鉴定。不同组织材料对 RAP... 利用改良的 SDS方法提取黄瓜干种子与一步法提取的黄花苗总 DNA进行 RAPD扩增 ,其结果与传统的 CTAB和 SDS的结果一样。这两种方法不仅节约成本 ,且简单快速 ,大大降低了 DNA的提取难度 ,适宜黄瓜杂交种子纯度鉴定。不同组织材料对 RAPD无影响。研究了 RAPD的影响因素 ,改进及优化了 RAPD反应程序。结果表明 :Mg2 +浓度的范围为 1.5~ 3.0 mmol· L- 1 ,d NTPs浓度范围为 0 .15~ 0 .2 5 mmol· L- 1 ,Taq聚合酶浓度范围为 0 .5~ 1.5 U,模板DNA浓度为 2 0~ 10 0 ng,反应以及引物浓度为 0 .2~ 0 .4μmol· L- 1 。引物的碱基组成以及不同存放时间的引物对 RAPD扩增也有影响。 DNA预变性 94℃进行 4 min,94℃变性 30 s,37℃退火 30 s,72℃延伸 1min,循环 35次后 展开更多
关键词 黄瓜 DNA提取 rapd-pcr反应体系 优化
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天牛干标本DNA的提取及RAPD-PCR扩增反应 被引量:10
9
作者 徐光勇 陈斌 +2 位作者 吴蔚文 刘彦群 鲁成 《西南农业大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2003年第2期95-97,共3页
对标本馆保存多年的天牛标本进行基因组DNA的提取,并成功用于PAPD-PCR的扩增。结果显示基因组DNA的提取与标本的保存时间无直接的联系,而与标本保存的质量关系密切。用同一引物扩增,不同种天牛的扩增片段呈现多态性。
关键词 天牛标本 DNA提取 rapd-pcr 干标本
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河鲈RAPD-PCR反应体系的建立与优化及引物筛选 被引量:4
10
作者 董艳艳 胡文革 +4 位作者 路李鹏 陈登稳 杨迪 王艳萍 韩晶 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第9期114-118,共5页
以河鲈为研究材料,对河鲈RAPD-PCR的反应体系进行优化和适用引物的筛选,采用正交设计方法,选用L17(54)正交表,以河鲈基因组DNA为模板,对影响PCR反应较大的4个因素:Taq酶、Mg2+、dNTPs、引物在5个水平上进行优化试验,得到河鲈最优RAPD-PC... 以河鲈为研究材料,对河鲈RAPD-PCR的反应体系进行优化和适用引物的筛选,采用正交设计方法,选用L17(54)正交表,以河鲈基因组DNA为模板,对影响PCR反应较大的4个因素:Taq酶、Mg2+、dNTPs、引物在5个水平上进行优化试验,得到河鲈最优RAPD-PCR反应体系:25μL反应体系中含有30 ng DNA模板1.5μL,10μmol/L引物0.7μL,10×buffer 2.5μL,25μmol/L dNTPs 0.4μL,5 U Taq酶0.2μL,2.5 mmol/L MgCl23.0μL;利用优化体系从50条引物中筛选得到10条适用引物,并确定了引物的最佳退火温度。 展开更多
关键词 河鲈 rapd-pcr 条件优化 适用引物 退火温度
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利用RAPD-PCR技术区分4种仓虫幼虫的初步研究 被引量:13
11
作者 陈乃中 汤德良 刘永平 《植物保护》 CAS CSCD 北大核心 1997年第3期20-21,共2页
以花斑皮蠹、谷斑皮蠹、黑毛皮蠹和印度谷螟等4种仓储害虫的幼虫为材料,借用小麦DNA提取方法提取了虫体的DNA,用E12、E15、E18、G10和G14等5种引物采用RAPDI程序进行扩增。电泳检测结果显示,5种引物均... 以花斑皮蠹、谷斑皮蠹、黑毛皮蠹和印度谷螟等4种仓储害虫的幼虫为材料,借用小麦DNA提取方法提取了虫体的DNA,用E12、E15、E18、G10和G14等5种引物采用RAPDI程序进行扩增。电泳检测结果显示,5种引物均产生可用以区分这4种仓虫的扩增谱带。从DNA提取到获得结果,只需48h。 展开更多
关键词 rapd-pcr 仓储 害虫 植物检疫
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日本弓背蚁亲系识别的研究:攻击行为测试与RAPD-PCR分析 被引量:8
12
作者 谭声江 陈晓峰 +1 位作者 王正军 刘志斌 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2001年第3期373-377,共5页
关键词 日本弓背蚁 亲系识别 攻击行为 rapd-pcr
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南瓜属植物RAPD-PCR反应体系的建立与应用 被引量:5
13
作者 庄东红 黄秀丽 +2 位作者 吴奕瑞 林奕韩 郑汉藩 《武汉植物学研究》 CAS CSCD 北大核心 2005年第5期422-426,共5页
采用混合DNA样品池,利用正交法对南瓜属植物RAPD反应条件进行了探讨,并利用建立起来的优化体系,从35条引物中筛选出7条引物,对供试中国南瓜、印度南瓜和黑籽南瓜3个栽培种的7个品种进行了RAPD分析,结果均获得了较多的多态性位点。RAPD-... 采用混合DNA样品池,利用正交法对南瓜属植物RAPD反应条件进行了探讨,并利用建立起来的优化体系,从35条引物中筛选出7条引物,对供试中国南瓜、印度南瓜和黑籽南瓜3个栽培种的7个品种进行了RAPD分析,结果均获得了较多的多态性位点。RAPD-PCR反应扩增结果还显示,日本南瓜兼有中国南瓜和印度南瓜的特征带,聚类分析的结果则表明,它与中国南瓜的亲缘关系更近。 展开更多
关键词 南瓜属 rapd-pcr 混合DNA样品池 聚类分析
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正交优化法建立奶牛基因组DNA RAPD-PCR最佳反应体系 被引量:10
14
作者 万海伟 张传生 杜立新 《生物技术通报》 CAS CSCD 2004年第3期45-47,共3页
从 36头荷斯坦奶牛血样中提取基因组DNA ,以相同DNA浓度混成DNA池。以其为模板 ,通过正交设计试验 ,建立了RAPD PCR最佳反应体系。
关键词 rapd-pcr 基因组 DNA 正交优化 奶牛 分子标记
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八角RAPD-PCR反应体系的建立及引物筛选研究 被引量:2
15
作者 陈海云 陈少瑜 +5 位作者 宁德鲁 吴涛 耿树香 谷丽萍 白平 李勇杰 《西部林业科学》 CAS 北大核心 2012年第4期65-69,共5页
在提取高质量八角基因组DNA的基础上,通过对其RAPD反应体系的Taq DNA聚合酶、dNTPs浓度、Mg2+浓度、引物浓度等因子的优化,建立了稳定、重复性高的八角RAPD-PCR反应体系。研究结果表明,在25μL PCR反应体系中,含1.0 UTaq DNA聚合酶,0.15... 在提取高质量八角基因组DNA的基础上,通过对其RAPD反应体系的Taq DNA聚合酶、dNTPs浓度、Mg2+浓度、引物浓度等因子的优化,建立了稳定、重复性高的八角RAPD-PCR反应体系。研究结果表明,在25μL PCR反应体系中,含1.0 UTaq DNA聚合酶,0.15 mmol.L-1 dNTPs,2.0 mmol.L-1 Mg2+,2.0μmol.L-1引物,20~80 ng模板。最佳反应程序为,94℃预变性5 min,扩增后94℃变性30 s,31~37℃退火30 s,72℃延伸30 s,35个循环;72℃完全延伸7 min,4℃保存。在建立RAPD-PCR反应体系的基础上,从240条RAPD引物中筛选出15条扩增条带清晰、稳定性好的引物,并通过各引物的退火温度梯度实验,确定了各引物的最适退火温度。 展开更多
关键词 八角 rapd-pcr 反应体系 优化 引物
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棉铃虫Bt抗性种群的RAPD-PCR初步分析 被引量:9
16
作者 梁革梅 谭维嘉 郭予元 《植物保护》 CAS CSCD 北大核心 2000年第3期4-6,共3页
经室内筛选获得了棉铃虫对Bt杀虫剂、Bt毒蛋白和转Bt基因棉的抗性种群。利用RAPD技术 ,成功地扩增得到 10 5条多态性条带 ,经过聚类分析发现 ,棉铃虫对Bt产生抗性后在基因水平发生了变异。RAPD技术不仅可以用来鉴定棉铃虫对Bt是否产生抗... 经室内筛选获得了棉铃虫对Bt杀虫剂、Bt毒蛋白和转Bt基因棉的抗性种群。利用RAPD技术 ,成功地扩增得到 10 5条多态性条带 ,经过聚类分析发现 ,棉铃虫对Bt产生抗性后在基因水平发生了变异。RAPD技术不仅可以用来鉴定棉铃虫对Bt是否产生抗性 。 展开更多
关键词 棉铃虫 Bt抗性种群 rapd-pcr 抗性机制
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茄子基因组DNA提取及RAPD-PCR体系的优化 被引量:7
17
作者 易金鑫 侯喜林 冷月祥 《江苏农业科学》 CSCD 北大核心 2004年第3期50-52,共3页
在CTAB基础上 ,系统地比较了提取缓冲液主要成分浓度的变化对提取茄子基因组DNA的质量及得率的影响 ,并以SDS法为对照 ,提出了一种适用于茄子基因组DNA的提取方法。进一步利用梯度PCR比较了RAPD -PCR反应体系中几个重要成分的浓度对PCR... 在CTAB基础上 ,系统地比较了提取缓冲液主要成分浓度的变化对提取茄子基因组DNA的质量及得率的影响 ,并以SDS法为对照 ,提出了一种适用于茄子基因组DNA的提取方法。进一步利用梯度PCR比较了RAPD -PCR反应体系中几个重要成分的浓度对PCR产物的影响 ,优化茄子RAPD -PCR反应体系 ,建立了茄子基因组适用的简单、稳定和重复性较好的RAPD 展开更多
关键词 茄子 DNA提取 梯度PCR rapd-pcr体系优化
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小鼠RAPD-PCR反应体系及扩增程序的筛选 被引量:7
18
作者 吴丰春 魏泓 《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 1999年第1期19-21,共3页
目的:筛选优化小鼠RAPD-PCR反应体系及扩增程序。方法:以40条引物对9个品系的小鼠基因组DNA在各种不同条件下进行RAPD-PCR,分析比较扩增结果。结果:在下列反应体系及扩增程序下结果较好:在25μl的反应体... 目的:筛选优化小鼠RAPD-PCR反应体系及扩增程序。方法:以40条引物对9个品系的小鼠基因组DNA在各种不同条件下进行RAPD-PCR,分析比较扩增结果。结果:在下列反应体系及扩增程序下结果较好:在25μl的反应体系中含有10×bufer2.5μl,dNTP200μmol/L,Mg2+2.5mmol/L,引物0.2μmol/L,Taq酶1.5U,模板DNA20ng,扩增程序为94℃变性1min,38℃退火1min,72℃延伸2min,40个循环后接10min延伸。结论:以上述反应体系及扩增程序进行小鼠RAPD-PCR,扩增结果稳定。 展开更多
关键词 DNA 筛选 rapd-pcr 小鼠 扩增程序
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海绵共附生微生物基因多态性的RAPD-PCR分析 被引量:1
19
作者 李志勇 秦恩昊 +1 位作者 何丽明 黄艳琴 《海洋科学》 CAS CSCD 北大核心 2006年第7期15-20,共6页
采用传统分离手段对中国南海海域的细薄星芒海绵(Stellettatenui(Lindgren,1897))、皱皮软海绵(Halichondriarugosa(Ridley&Dendy))、澳大利亚厚皮海绵(Craniellaaustraliensis(Carter))、贪婪倔海绵(Dysideaavara(Schmidt))4种海... 采用传统分离手段对中国南海海域的细薄星芒海绵(Stellettatenui(Lindgren,1897))、皱皮软海绵(Halichondriarugosa(Ridley&Dendy))、澳大利亚厚皮海绵(Craniellaaustraliensis(Carter))、贪婪倔海绵(Dysideaavara(Schmidt))4种海绵体内的微生物进行了分离培养,随机挑选64株芽孢杆菌属细菌(每种海绵16株)进行了RAPD-PCR基因多态性分析。研究表明,一些海绵微生物是可以通过传统分离手段得到的,来自同一或者不同海绵的微生物均具有丰富的基因多态性。 展开更多
关键词 海绵 芽孢杆菌 rapd-pcr 聚类分析
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花椰菜RAPD-PCR反应体系的优化 被引量:1
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作者 陈阳 周先治 +2 位作者 吴宇芬 陈晟 赵依杰 《江西农业学报》 CAS 2010年第11期5-7,共3页
采用正交法对影响花椰菜RAPD-PCR反应的5个实验因素进行了优化,结果表明,花椰菜RAPD反应的优化体系为:dNTPs 0.12 mmol/L.引物0.8~1.6 μmol/L,模板DNA为20~80 ng,Taq酶为0.75 U,退火温度34~36℃.试验证明,Taq酶用量对RAPD-PCR反应... 采用正交法对影响花椰菜RAPD-PCR反应的5个实验因素进行了优化,结果表明,花椰菜RAPD反应的优化体系为:dNTPs 0.12 mmol/L.引物0.8~1.6 μmol/L,模板DNA为20~80 ng,Taq酶为0.75 U,退火温度34~36℃.试验证明,Taq酶用量对RAPD-PCR反应体系的影响最大,退火温度、引物浓度、dNTPs用量对RAPD-PCR反应结果影响均小于Taq用量,但相差不大.模板浓度的影响最小. 展开更多
关键词 花椰菜 rapd-pcr 反应体系 退火温度 浓度的影响 Taq酶 优化体系 引物 模板 结果影响 正交法 证明 相差 试验 实验 DNA
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