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基于贝叶斯方法的蛋白质界面残基预测
被引量：
2
1
作者
王池社
程家兴
汪世义
《计算机应用与软件》
CSCD
2009年第9期75-77,共3页
蛋白质界面残基预测是蛋白质相互作用研究中的一项基本工作,在生物制药及蛋白质功能研究方面有着重要的应用。以蛋白质中的氨基酸残基为研究对象,使用残基的溶剂可及表面积及残基的序列谱为特征集,构建了基于贝叶斯方法的蛋白质界面残...
蛋白质界面残基预测是蛋白质相互作用研究中的一项基本工作,在生物制药及蛋白质功能研究方面有着重要的应用。以蛋白质中的氨基酸残基为研究对象,使用残基的溶剂可及表面积及残基的序列谱为特征集,构建了基于贝叶斯方法的蛋白质界面残基预测器。方法有效地结合了蛋白质残基特征集的条件独立性假设及贝叶斯方法在处理不确定性数据方面的优点,通过对含77个蛋白质的数据集进行实验,结果比其它方法获得了6%的准确率的提高,三维可视化的结果也表明分类器预测的有效性。
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关键词
蛋白质
朴素贝叶斯分类器
氨基酸残基
序列谱
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职称材料
题名
基于贝叶斯方法的蛋白质界面残基预测
被引量：
2
1
作者
王池社
程家兴
汪世义
机构
安徽大学智能与信号处理教育部重点实验室
巢湖学院计算机系
出处
《计算机应用与软件》
CSCD
2009年第9期75-77,共3页
基金
安徽省高校青年教师科研资助计划(2007jq1140)
安徽省高校省级自然科学研究项目(KJ2007B066)
文摘
蛋白质界面残基预测是蛋白质相互作用研究中的一项基本工作,在生物制药及蛋白质功能研究方面有着重要的应用。以蛋白质中的氨基酸残基为研究对象,使用残基的溶剂可及表面积及残基的序列谱为特征集,构建了基于贝叶斯方法的蛋白质界面残基预测器。方法有效地结合了蛋白质残基特征集的条件独立性假设及贝叶斯方法在处理不确定性数据方面的优点,通过对含77个蛋白质的数据集进行实验,结果比其它方法获得了6%的准确率的提高,三维可视化的结果也表明分类器预测的有效性。
关键词
蛋白质
朴素贝叶斯分类器
氨基酸残基
序列谱
Keywords
protein nayve bayesian classifier residue of amino acid profile
分类号
TP273 [自动化与计算机技术—检测技术与自动化装置]
Q51 [生物学—生物化学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于贝叶斯方法的蛋白质界面残基预测
王池社
程家兴
汪世义
《计算机应用与软件》
CSCD
2009
2
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