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SD-PMA-ddPCR检测食品中沙门氏菌的研究 被引量:16
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作者 王静 张慧敏 +3 位作者 魏玮 贾俊涛 李春喜 秦燕 《食品工业科技》 CAS CSCD 北大核心 2016年第10期67-71,共5页
研究将叠氮溴化丙锭(PMA)与微滴数字PCR(dd PCR)技术相结合,建立一种沙门氏菌活菌的检测方法。结果表明,PMA不能完全有效抑制108CFU/m L的沙门氏菌死菌DNA的PCR扩增,0.1%脱氧胆酸钠(SD)和40.0μg/m L PMA协同作用,可以有效抑制108CFU/m ... 研究将叠氮溴化丙锭(PMA)与微滴数字PCR(dd PCR)技术相结合,建立一种沙门氏菌活菌的检测方法。结果表明,PMA不能完全有效抑制108CFU/m L的沙门氏菌死菌DNA的PCR扩增,0.1%脱氧胆酸钠(SD)和40.0μg/m L PMA协同作用,可以有效抑制108CFU/m L的沙门氏菌死菌DNA的PCR扩增,不抑制沙门氏菌活菌DNA扩增的PMA最高浓度是40.0μg/m L。经过SD和PMA对样品预处理,在不同死、活菌比例下,PMA-dd PCR可以定量检测活菌,避免了死菌DNA的干扰。本方法的检出限为8.0 copy/20μL。利用PMA-dd PCR检测人工污染鸡肉样品,最低可检出102CFU/m L的沙门氏菌。实验结果证明PMA-dd PCR方法的特异性、精确度、稳定性良好。 展开更多
关键词 叠氮溴化丙锭 脱氧胆酸钠 数字PCR 活菌
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PMA结合ddPCR检测食品中沙门氏菌 被引量:4
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作者 王静 秦燕 +3 位作者 张慧敏 刘玉敏 魏玮 贾俊涛 《食品与生物技术学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第10期1059-1063,共5页
建立一种快速、灵敏的微滴式数字PCR方法,用于检测食品中沙门氏菌活菌。利用叠氮溴化丙锭(PMA)对死菌预处理,PMA可以选择性穿过死菌细胞膜,在光照条件下与死菌DNA发生共价交联反应,进而阻止其DNA进行PCR扩增,提取细菌基因组DNA进行微滴... 建立一种快速、灵敏的微滴式数字PCR方法,用于检测食品中沙门氏菌活菌。利用叠氮溴化丙锭(PMA)对死菌预处理,PMA可以选择性穿过死菌细胞膜,在光照条件下与死菌DNA发生共价交联反应,进而阻止其DNA进行PCR扩增,提取细菌基因组DNA进行微滴式数字PCR(dd PCR)检测。结果表明,强烈光照15.0 min,可以使PMA与死菌DNA共价交联,同时钝化游离的PMA;PMA终质量浓度为40.0μg/m L可以有效抑制105CFU/m L的沙门氏菌死菌DNA的PCR扩增;不抑制活菌DNA扩增的PMA最高浓度是50.0μg/m L。利用PMA处理死活菌混合液时,PMA-dd PCR可以在死菌存在的条件下,定量检测活菌,降低了"假阳性"结果的出现。灵敏度检测结果显示:PMA-dd PCR灵敏度是0.4 copy/μL。利用PMA-dd PCR检测人工污染的鳕鱼样品,最低可检出102CFU/m L的沙门氏菌,精密度和稳定性良好。 展开更多
关键词 叠氮溴化丙锭 微滴式数字PCR 沙门氏菌 活菌
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基于PMA-qPCR检测青枯菌5号生理小种活菌的方法 被引量:8
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作者 曹梦琪 王旭东 +2 位作者 王俊 盛晟 吴福安 《蚕业科学》 CAS CSCD 北大核心 2015年第6期1004-1010,共7页
青枯菌5号生理小种(Ralstonia solanacearum race 5)是引发桑青枯病的病原菌。为了改进常规PCR方法不能对活体病原菌进行准确鉴别和定量分析的不足,建立叠氮溴化丙锭(PMA)预处理结合荧光定量PCR(q PCR)检测青枯菌5号生理小种活菌的方法... 青枯菌5号生理小种(Ralstonia solanacearum race 5)是引发桑青枯病的病原菌。为了改进常规PCR方法不能对活体病原菌进行准确鉴别和定量分析的不足,建立叠氮溴化丙锭(PMA)预处理结合荧光定量PCR(q PCR)检测青枯菌5号生理小种活菌的方法。该方法首先将待检测样品的病原菌细胞用质量浓度为15 ng/μL的PMA暗孵育10 min后,在卤钨灯下曝光5min,以消除死菌细胞DNA的PCR扩增信号。用PMA-q PCR方法对含青枯菌5号生理小种活菌和死菌的混合样本的检测结果表明,死菌的存在不会对活菌细胞DNA的扩增产生影响。建立的PMA-q PCR标准曲线显示,在菌液浓度为103~107CFU/m L的范围内,qPCR循环阈值(Ct)与菌液浓度的对数值之间呈良好的线性关系,线性方程为y=-3.477x+47.489,R^2=0.997。建立的PMA-q PCR方法能更为准确地检测复杂样本中的青枯菌5号生理小种活菌数量,有助于对桑树青枯病的早期诊断和及时制定病害防控措施。 展开更多
关键词 桑树青枯病 青枯菌5号生理小种 叠氮溴化丙锭 荧光定量PCR 活细胞
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肉及肉制品中沙门氏菌活细胞的PCR检测研究 被引量:7
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作者 祝儒刚 宋立峰 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2012年第16期199-203,共5页
将荧光染料叠氮溴化丙锭(propidium monoazide,PMA)与普通聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)结合,通过对PMA的曝光时间、浓度进行优化,确定PMA-PCR区别死活细胞的最佳条件,并制作活细胞定量标准曲线,建立肉及肉制品中沙门... 将荧光染料叠氮溴化丙锭(propidium monoazide,PMA)与普通聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)结合,通过对PMA的曝光时间、浓度进行优化,确定PMA-PCR区别死活细胞的最佳条件,并制作活细胞定量标准曲线,建立肉及肉制品中沙门氏菌活细胞的PMA-PCR检测方法。结果表明:使插入死细胞DNA中的PMA活化并且光解溶液中游离PMA的最佳曝光时间为15min;不抑制沙门氏菌活细胞DNA扩增的最大PMA质量浓度为10μg/mL;完全抑制热致死细胞DNA扩增的最小PMA质量浓度为4μg/mL。经PMA处理,含有不同比例的沙门氏菌热致死细胞和活细胞的混合液中活的沙门氏菌能够通过PCR被选择性的检测,最小检测限为20CFU/PCR。而且,经研究发现在20~2×105CFU/PCR范围内,电泳条带相对荧光强度与活细胞数的对数具有线性关系。采集30份肉及肉制品样品,利用PMA-PCR方法检测出两份生肉样品中存在沙门氏菌,经过6h的富集培养后的活菌浓度分别为2.5×103CFU/mL和3.4×103CFU/mL。 展开更多
关键词 肉及肉制品 沙门氏菌 活细胞 PMA-PCR
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PMA-qPCR快速检测结核活菌方法的建立 被引量:4
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作者 温书香 王慧勤 +7 位作者 曹旭东 赵新霞 李亚 张亚丽 陈鹏博 纪太旺 陈创夫 袁莉 《石河子大学学报(自然科学版)》 CAS 2014年第2期143-147,共5页
为建立快速鉴别诊断结核活/死菌的方法,本研究应用PMA染料与实时定量PCR技术结合(PMA-qPCR),以结核标准株16 sRNA基因为靶基因,PMA对样品基因组提取物进行处理,PMA能够与死细胞DNA分子共价交联并抑制DNA分子扩增。结果显示:PMA浓度在3μ... 为建立快速鉴别诊断结核活/死菌的方法,本研究应用PMA染料与实时定量PCR技术结合(PMA-qPCR),以结核标准株16 sRNA基因为靶基因,PMA对样品基因组提取物进行处理,PMA能够与死细胞DNA分子共价交联并抑制DNA分子扩增。结果显示:PMA浓度在3μg/mL,曝光时间大于15 min时,PMA既不影响活菌的的扩增,又能有效抑制死菌的扩增;当PMA浓度大于20μg/mL时,PMA影响活菌DNA的扩增;PMA-qPCR技术能够定量不同比例的结核活/死菌悬液中的活菌。结论:PMA-qPCR技术能够快速准确检测出结核杆菌中的活细胞。 展开更多
关键词 叠氮溴化丙锭(PMA) PMA-qPCR技术 死菌
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