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毕赤酵母表达系统外源基因表达序列优化的软件设计
被引量：
3
1
作者
黄义德
杨林骥
张彦定
《生物技术通报》
CAS
CSCD
2007年第5期14-17,共4页
作为真核生物表达系统,毕赤酵母已成功表达了包括病毒、细菌和真核生物在内的多种外源蛋白。但并非所有的外源序列在毕赤酵母中都能得以高表达,外源序列含有毕赤酵母中低频密码子或是序列中A+T含量不合理是限制高表达的重要原因。根据...
作为真核生物表达系统,毕赤酵母已成功表达了包括病毒、细菌和真核生物在内的多种外源蛋白。但并非所有的外源序列在毕赤酵母中都能得以高表达,外源序列含有毕赤酵母中低频密码子或是序列中A+T含量不合理是限制高表达的重要原因。根据毕赤酵母密码子使用的有关特性,利用遗传算法,建立外源基因表达序列优化的数学模型,并依此设计一套毕赤酵母外源基因表达序列的优化软件。
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关键词
毕赤酵母
密码子使用
序列优化
遗传算法
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题名
毕赤酵母表达系统外源基因表达序列优化的软件设计
被引量：
3
1
作者
黄义德
杨林骥
张彦定
机构
福建农林大学生命科学院
发育与神经生物学福建省高校重点实验室
农业部甘蔗生理生态与遗传改良重点开放实验室
上海交通大学
出处
《生物技术通报》
CAS
CSCD
2007年第5期14-17,共4页
基金
福建省教育厅资助项目(JA01015)
福建省发改委资助项目(省发改2004[686号])
福建省自然科学基金(C0410008)
文摘
作为真核生物表达系统,毕赤酵母已成功表达了包括病毒、细菌和真核生物在内的多种外源蛋白。但并非所有的外源序列在毕赤酵母中都能得以高表达,外源序列含有毕赤酵母中低频密码子或是序列中A+T含量不合理是限制高表达的重要原因。根据毕赤酵母密码子使用的有关特性,利用遗传算法,建立外源基因表达序列优化的数学模型,并依此设计一套毕赤酵母外源基因表达序列的优化软件。
关键词
毕赤酵母
密码子使用
序列优化
遗传算法
Keywords
pichia pastoris codon usage sequence optimization genetic algorithm
分类号
Q78 [生物学—分子生物学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
毕赤酵母表达系统外源基因表达序列优化的软件设计
黄义德
杨林骥
张彦定
《生物技术通报》
CAS
CSCD
2007
3
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