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粗枝云杉PaPR10-1基因的克隆表达及生物信息学分析
1
作者
李成松
刘利娟
+3 位作者
梁芳
赵炜栋
杨春琳
刘应高
《植物科学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第2期224-233,共10页
PR10是病程相关蛋白(PRs)家族的重要成员,能增强植物抵御外界胁迫侵扰的能力。为进一步研究PR10蛋白的生物学功能,在转录组测序的基础上,利用RT-PCR技术获得一个粗枝云杉(Picea asperata Mast.)基因PaPR10-1,利用生物信息学方法对其核...
PR10是病程相关蛋白(PRs)家族的重要成员,能增强植物抵御外界胁迫侵扰的能力。为进一步研究PR10蛋白的生物学功能,在转录组测序的基础上,利用RT-PCR技术获得一个粗枝云杉(Picea asperata Mast.)基因PaPR10-1,利用生物信息学方法对其核苷酸和氨基酸序列进行结构和功能分析,进一步构建PaPR10-1融合蛋白原核表达系统,获得高纯度PaPR10-1融合蛋白,并采用底物法体外分析其核糖核酸酶活性。结果显示:PaPR10-1基因ORF长486 bp,编码161个氨基酸。PaPR10-1蛋白无跨膜结构和信号肽,为胞内蛋白,含有“P-Loop”和Bet_v1-like保守结构域。系统进化分析结果表明,PaPR10-1蛋白与海岸松(Pinus pinaster Aiton)PR10蛋白归为一个分支,亲缘关系较近。目的蛋白在30℃下以0.2 mmol/L的IPTG诱导1 h表达量最佳,且具有核糖核酸酶活性。
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关键词
粗枝云杉
pr10基因
基因
克隆
生物信息学
原核表达
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题名
粗枝云杉PaPR10-1基因的克隆表达及生物信息学分析
1
作者
李成松
刘利娟
梁芳
赵炜栋
杨春琳
刘应高
机构
四川农业大学
出处
《植物科学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第2期224-233,共10页
基金
四川省教育厅重点项目(09ZA068)。
文摘
PR10是病程相关蛋白(PRs)家族的重要成员,能增强植物抵御外界胁迫侵扰的能力。为进一步研究PR10蛋白的生物学功能,在转录组测序的基础上,利用RT-PCR技术获得一个粗枝云杉(Picea asperata Mast.)基因PaPR10-1,利用生物信息学方法对其核苷酸和氨基酸序列进行结构和功能分析,进一步构建PaPR10-1融合蛋白原核表达系统,获得高纯度PaPR10-1融合蛋白,并采用底物法体外分析其核糖核酸酶活性。结果显示:PaPR10-1基因ORF长486 bp,编码161个氨基酸。PaPR10-1蛋白无跨膜结构和信号肽,为胞内蛋白,含有“P-Loop”和Bet_v1-like保守结构域。系统进化分析结果表明,PaPR10-1蛋白与海岸松(Pinus pinaster Aiton)PR10蛋白归为一个分支,亲缘关系较近。目的蛋白在30℃下以0.2 mmol/L的IPTG诱导1 h表达量最佳,且具有核糖核酸酶活性。
关键词
粗枝云杉
pr10基因
基因
克隆
生物信息学
原核表达
Keywords
Picea asperata
pr
10
gene
Gene cloning
Bioinformatics
pr
okaryotic ex
pr
ession
分类号
Q943.2 [生物学—植物学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
粗枝云杉PaPR10-1基因的克隆表达及生物信息学分析
李成松
刘利娟
梁芳
赵炜栋
杨春琳
刘应高
《植物科学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023
0
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