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海洋细菌胞外蛋白酶PPC结构域序列特性与系统进化分析
被引量：
1
1
作者
黄嘉丰
刘丹
+3 位作者
杨兴昊
吴日帮
武翠玲
何海伦
《海洋科学》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第1期13-23,共11页
PPC(Pre-Peptidase C-terminal)结构域广泛分布于分泌型海洋细菌蛋白酶的C末端,对蛋白酶的分泌,锚定及与底物相互吸附起到重要作用。对PPC结构域序列分析发现,PPC结构域存在两个较为保守序列区,且这两个保守区空间结构为β-折叠。尽管有...
PPC(Pre-Peptidase C-terminal)结构域广泛分布于分泌型海洋细菌蛋白酶的C末端,对蛋白酶的分泌,锚定及与底物相互吸附起到重要作用。对PPC结构域序列分析发现,PPC结构域存在两个较为保守序列区,且这两个保守区空间结构为β-折叠。尽管有的PPC结构域序列一致性较低,但不同结构域间存在相同的保守序列,且其三维结构相似。为了进一步对不同来源的PPC结构域的进化关系进行系统研究,本研究选取公开发表的PPC结构域,通过在NCBI数据库中搜索得到61条来自于39个细菌所分泌的不同蛋白酶的PPC的氨基酸序列进行系统发育分析。发现PPC结构域在生物进化过程中序列变异性大,保守性弱。其中,有些细菌PPC结构域可能来源于自身基因重复产生,有些细菌PPC结构域则可能由水平基因转移产生。
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关键词
蛋白酶
ppc结构域
保守区
系统进化树
基因水平转移
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职称材料
题名
海洋细菌胞外蛋白酶PPC结构域序列特性与系统进化分析
被引量：
1
1
作者
黄嘉丰
刘丹
杨兴昊
吴日帮
武翠玲
何海伦
机构
中南大学生命科学学院医学遗传学国家重点实验室
出处
《海洋科学》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第1期13-23,共11页
基金
国家自然科学基金项目(31370104
31070061)
+2 种基金
湖南省自然基金联合基金项目(13JJ9001)
国家星火计划项目(2013GA770009)
中南大学大学生创新创业训练计划项目(国家级)(201310533050)
文摘
PPC(Pre-Peptidase C-terminal)结构域广泛分布于分泌型海洋细菌蛋白酶的C末端,对蛋白酶的分泌,锚定及与底物相互吸附起到重要作用。对PPC结构域序列分析发现,PPC结构域存在两个较为保守序列区,且这两个保守区空间结构为β-折叠。尽管有的PPC结构域序列一致性较低,但不同结构域间存在相同的保守序列,且其三维结构相似。为了进一步对不同来源的PPC结构域的进化关系进行系统研究,本研究选取公开发表的PPC结构域,通过在NCBI数据库中搜索得到61条来自于39个细菌所分泌的不同蛋白酶的PPC的氨基酸序列进行系统发育分析。发现PPC结构域在生物进化过程中序列变异性大,保守性弱。其中,有些细菌PPC结构域可能来源于自身基因重复产生,有些细菌PPC结构域则可能由水平基因转移产生。
关键词
蛋白酶
ppc结构域
保守区
系统进化树
基因水平转移
Keywords
Protease
ppc
domain
Conservative region
Phylogenetic analysis
Horizonal gene transfer
分类号
Q93 [生物学—微生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
海洋细菌胞外蛋白酶PPC结构域序列特性与系统进化分析
黄嘉丰
刘丹
杨兴昊
吴日帮
武翠玲
何海伦
《海洋科学》
CAS
CSCD
北大核心
2015
1
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