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猪雌激素受体基因(ESR)点突变的PCR-SSCP检测 被引量:26
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作者 姜运良 李宁 +1 位作者 习欠云 吴常信 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2000年第4期214-216,共3页
雌激素受体基因(ESR)是控制猪高产仔数的主效基因之一,具有明显的基因效应:BB型比AA型母猪胎总产仔数和产活仔数分别高出1 40~3 37和0 63~3 58头,是目前商品猪育种和生产中重点检测的主要基因之一。常规采用PCR -RFLPs方法区分该基因... 雌激素受体基因(ESR)是控制猪高产仔数的主效基因之一,具有明显的基因效应:BB型比AA型母猪胎总产仔数和产活仔数分别高出1 40~3 37和0 63~3 58头,是目前商品猪育种和生产中重点检测的主要基因之一。常规采用PCR -RFLPs方法区分该基因由点突变造成的3种不同的基因型。本研究建立1种基于PCR的SSCP(single-strand edconformationpolymorphism)方法对猪ESR该位置的点突变进行检测,具有操作简便、灵敏度高和不需要酶切等优点 。 展开更多
关键词 ESR基因 点突变 pcr-sscp 雌激素受体基因
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FSHβ基因PCR-SSCP多态性及其与济宁青山羊高繁殖力关系的研究 被引量:33
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作者 梁琛 储明星 +3 位作者 张建海 刘文忠 方丽 叶素成 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2006年第9期1071-1077,共7页
采用PCR-SSCP技术检测促卵泡素β亚基(follicle-stimulatinghormoneβ,FSHβ)基因5′调控区、外显子1和外显子2在高繁殖力山羊品种(济宁青山羊)和低繁殖力山羊品种(辽宁绒山羊、波尔山羊、安哥拉山羊)中的单核苷酸多态性,同时研究该基... 采用PCR-SSCP技术检测促卵泡素β亚基(follicle-stimulatinghormoneβ,FSHβ)基因5′调控区、外显子1和外显子2在高繁殖力山羊品种(济宁青山羊)和低繁殖力山羊品种(辽宁绒山羊、波尔山羊、安哥拉山羊)中的单核苷酸多态性,同时研究该基因对济宁青山羊高繁殖力的影响。结果表明:山羊与绵羊的FSH基因该段核苷酸序列同源性为98%。9对引物中,只有P9的扩增片段存在多态性。P9的扩增片段在济宁青山羊和辽宁绒山羊中检测到AA、AB和AC3种基因型;在波尔山羊中检测到AA、CC和AC3种基因型;在安哥拉山羊中检测到AA、BB、CC、AB、AC和BC共6种基因型。测序分析发现BB型与AA型相比在外显子2的第94bp处有G→A突变,并引起氨基酸改变(丙氨酸→苏氨酸);CC型与AA型相比在外显子2的第174bp有一处C→T沉默突变。济宁青山羊AA、AB和AC基因型频率分别为0.686、0.137和0.177。AA基因型济宁青山羊产羔数最小二乘均值比AB基因型的多0.78只(P<0.05),比AC基因型的多0.64只(P<0.05)。 展开更多
关键词 山羊 高繁殖力 促卵泡素β亚基基因 pcr-sscp
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浓香型大曲真核微生物群落的PCR-SSCP解析 被引量:22
3
作者 罗惠波 黄治国 +2 位作者 李浩 张强 沈才萍 《中国酿造》 CAS 北大核心 2009年第8期42-45,共4页
通过PCR-SSCP分析了浓香型大曲发酵过程中7个曲样中真核微生物群落的变化情况,结果表明:在大曲发酵过程中,微生物群落结构复杂,变化多样,不同微生物群落具有协同和制约的复杂生态学效应,并与外界因素相互作用,共同对大曲发酵过程产生影... 通过PCR-SSCP分析了浓香型大曲发酵过程中7个曲样中真核微生物群落的变化情况,结果表明:在大曲发酵过程中,微生物群落结构复杂,变化多样,不同微生物群落具有协同和制约的复杂生态学效应,并与外界因素相互作用,共同对大曲发酵过程产生影响。大曲发酵过程中温度的升高,对真核微生物多样性的影响较大。 展开更多
关键词 浓香型大曲 pcrsscp 18S RDNA 微生物群落
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瘢痕疙瘩Fas基因突变的银染PCR-SSCP检测 被引量:22
4
作者 鲁峰 高建华 +1 位作者 刘永波 黎小间 《解放军医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 1999年第5期358-360,共3页
以前的研究提示:瘢痕疙瘩成纤维细胞的Fas 受体可能处于无功能状态。进一步探讨导致无功能Fas分子的可能机制。取瘢痕疙瘩、增生性瘢痕患者的组织及外周血标本,PCR特异性扩增Fas 分子外显子9 的编码区,扩增产物经银染... 以前的研究提示:瘢痕疙瘩成纤维细胞的Fas 受体可能处于无功能状态。进一步探讨导致无功能Fas分子的可能机制。取瘢痕疙瘩、增生性瘢痕患者的组织及外周血标本,PCR特异性扩增Fas 分子外显子9 的编码区,扩增产物经银染SSCP筛选,最后可疑阳性的PCR样本进行DNA 测序。经PCR-SSCP检测,20% (2/10)的瘢痕疙瘩组织中发现异常电泳带,经DNA 测序证实,这2 例突变均为位于Fas cDNA的755bp 处的“A”缺失而导致的移码突变。结果提示:编码Fas分子死亡域结构基因的移码突变可能导致Fas受体功能丧失,从而导致成纤维细胞的凋亡异常;该研究从基因水平阐述了瘢痕疙瘩发生的分子机制。 展开更多
关键词 瘢痕疙瘩 FAS pcr-sscp DNA测序 基因突变
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绵羊催乳素受体基因PCR-SSCP分析 被引量:16
5
作者 牟玉莲 储明星 +2 位作者 孙少华 方丽 叶素成 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第10期956-960,共5页
采用PCR-SSCP技术分析了催乳素受体基因(PRLR)在小尾寒羊、萨福克羊、多赛特羊、多赛特公羊×小尾寒羊母羊F1代杂种羊4个绵羊群体中的多态性。结果表明:PRLR基因在3对引物扩增片段中均存在PCR-SS-CP多态性。对于引物1,4个绵羊群体... 采用PCR-SSCP技术分析了催乳素受体基因(PRLR)在小尾寒羊、萨福克羊、多赛特羊、多赛特公羊×小尾寒羊母羊F1代杂种羊4个绵羊群体中的多态性。结果表明:PRLR基因在3对引物扩增片段中均存在PCR-SS-CP多态性。对于引物1,4个绵羊群体均检测到AA基因型,AB基因型只出现在小尾寒羊、多赛特羊和萨福克羊中,仅在多赛特羊中检测到BB基因型。对于引物2,4个绵羊群体均检测到AA和AB基因型,只有萨福克羊没有BB型。对于引物3,4个绵羊群体均检测到AA、AB和BB基因型。在4个绵羊群体中,A等位基因频率均明显高于B等位基因频率。 展开更多
关键词 绵羊 催乳素受体基因 pcr-sscp
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中国人CTLA-4基因的PCR-SSCP和DNA序列分析 被引量:8
6
作者 朱乃硕 张玮 +6 位作者 段飞 陆琪 汤亭亭 朱琪泉 陈永青 于善谦 戴克戎 《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 1998年第5期349-352,共4页
CTLA4是主要表达于成熟T细胞表面的蛋白分子,与T细胞参与的免疫应答负调控有关,目前有关CTLA4的分子生物学资料多为外国提供,为了掌握中国人CTLA4基因的第一手资料,我们对50例中国人(其中25例为正常人... CTLA4是主要表达于成熟T细胞表面的蛋白分子,与T细胞参与的免疫应答负调控有关,目前有关CTLA4的分子生物学资料多为外国提供,为了掌握中国人CTLA4基因的第一手资料,我们对50例中国人(其中25例为正常人,25例为类风湿性关节炎患者)的CTLA4基因V区进行了PCR扩增,并对其中4例正常人进行了DNA序列分析,结果显示中国人CTLA4V区的DNA序列与国外报道有两个位点存在差异,其中第54位密码子处中国人为ATG(甲硫氨酸),第110位密码子处为ACC(苏氨酸),进一步对正常人和类风湿性关节炎病人进行PCRSSCP分析,结果显示在所分析的人群中不存在多态性,表明CTLA4分子具有高度保守性。 展开更多
关键词 CTLA-4 pcr-sscp 多态性 序列测定 DNA
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PCR-SSCP技术的研究及应用进展 被引量:29
7
作者 李玉梅 姚纪元 +1 位作者 吴静 白秀娟 《生物技术通报》 CAS CSCD 2007年第6期71-74,共4页
阐述了SSCP技术的建立与发展过程;概述了PCR-SSCP技术的原理、方法、优缺点及突变技术研究进展;总结了PCR-SSCP技术在多个领域中(动物育种、基因突变、基因诊断、基因图谱和连锁分析等)的应用情况;分析了PCR-SSCP技术在分子生物学研究... 阐述了SSCP技术的建立与发展过程;概述了PCR-SSCP技术的原理、方法、优缺点及突变技术研究进展;总结了PCR-SSCP技术在多个领域中(动物育种、基因突变、基因诊断、基因图谱和连锁分析等)的应用情况;分析了PCR-SSCP技术在分子生物学研究领域中的作用。 展开更多
关键词 PCK-sscp 研究 应用进展
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采用UPPCR-SSCP技术快速鉴定水产养殖病原性弧菌的研究 被引量:10
8
作者 彭宣宪 周樱 +1 位作者 王三英 章跃陵 《台湾海峡》 CAS CSCD 2000年第4期460-463,T001,共5页
采用通用引物PCR配合SSCP分析即UPPCR SSCP技术 ,对弧菌科弧菌属中的副溶血弧菌、溶藻酸弧菌、费尼斯弧菌、鳗弧菌、哈维氏弧菌的 1 6S RNA基因进行检测。结果发现 ,UPPCR SSCP技术能较好地鉴别细菌的不同种 ,但对同种不同株细菌的区分... 采用通用引物PCR配合SSCP分析即UPPCR SSCP技术 ,对弧菌科弧菌属中的副溶血弧菌、溶藻酸弧菌、费尼斯弧菌、鳗弧菌、哈维氏弧菌的 1 6S RNA基因进行检测。结果发现 ,UPPCR SSCP技术能较好地鉴别细菌的不同种 ,但对同种不同株细菌的区分较困难。认为PCR SSCP是将病原菌判定至种的有力工具。此研究对水产养殖病原菌的快速诊断与及时防治有重要意义。 展开更多
关键词 pcr-sscp 病原菌 16S-DNA 水产养殖 副溶血弧菌 鳗弧菌
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奶牛乳铁蛋白基因5′侧翼区PCR-SSCP多态性分析 被引量:10
9
作者 李国华 张沅 +1 位作者 孙东晓 李宁 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2004年第6期827-830,共4页
采用PCR SSCP技术 ,对奶牛乳铁蛋白基因 5′侧翼区 112 2bp序列进行多态性分析。在该区所划分的 5个亚片段上 ,发现Blf5′ 1(2 2 7bp) ,Blf 5′ 3(175bp)和Blf5′ 5 (2 93bp) 3个DNA片段存在多态。进一步对这 3个片段进行测序分析 ,在Bl... 采用PCR SSCP技术 ,对奶牛乳铁蛋白基因 5′侧翼区 112 2bp序列进行多态性分析。在该区所划分的 5个亚片段上 ,发现Blf5′ 1(2 2 7bp) ,Blf 5′ 3(175bp)和Blf5′ 5 (2 93bp) 3个DNA片段存在多态。进一步对这 3个片段进行测序分析 ,在Blf 5′ 1序列中 ,发现位于转录起始位点上游 - 92 6和 - 915位分别有G→A及T→G点突变 ;在Blf5′ 3片段中 ,- 4 78位存在G的插入 ;Blf 5′ 5位点上 ,发生 - 2 8位的C颠换为A和 +33位的G颠换为C两处突变。利用TFSEARCH (ver.1 3)软件对乳铁蛋白基因 5′侧翼区潜在调控元件及蛋白质结合位点进行了预测 ,结果显示 展开更多
关键词 乳铁蛋白基因 pcrsscp 调控因子
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新疆细毛羊和陕北细毛羊羊毛细度候选基因的PCR-SSCP分析 被引量:13
10
作者 姚毅 雷承志 +2 位作者 尹君亮 刘福元 陈玉林 《西北农林科技大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2006年第12期6-10,共5页
选取60只新疆细毛羊和48只陕北细毛羊,利用PCR-SSCP分子标记对其羊毛细度候选基因的5个位点(S1,S2,S3,S4,S5)进行了多态性分析。结果表明,2个绵羊品种在5个位点上A等位基因的频率均高于B等位基因。在S1,S5位点上,新疆细毛羊和陕北细毛... 选取60只新疆细毛羊和48只陕北细毛羊,利用PCR-SSCP分子标记对其羊毛细度候选基因的5个位点(S1,S2,S3,S4,S5)进行了多态性分析。结果表明,2个绵羊品种在5个位点上A等位基因的频率均高于B等位基因。在S1,S5位点上,新疆细毛羊和陕北细毛羊均检测到AA,AB,BB 3种基因型;在S2位点上,新疆细毛羊检测到AA,BB,CC,DD 4种基因型,陕北细毛羊检测到AA,AB,BB 3种基因型;在S3位点上,新疆细毛羊检测到AA,AB 2种基因型,陕北细毛羊检测到AA,AB,BB 3种基因型;在S4位点上,新疆细毛羊和陕北细毛羊均检测到AA,BB 2种基因型。新疆细毛羊和陕北细毛羊的平均杂合度分别为0.445 0和0.399 7。新疆细毛羊P IC平均值为0.366 6,S1,S3,S4和S5位点均处于中度多态,而S2(P IC=0.555 1)处于高度多态;陕北细毛羊P IC平均值为0.318 9,5个位点均处于中度多态。以上结果表明,S1,S2,S3,S4和S55个位点可以作为有效的遗传标记用于优质细毛羊的遗传多样性分析,2个绵羊品种群体内的遗传变异程度高,遗传多样性丰富,选择潜力大。 展开更多
关键词 细毛羊 羊毛细度 pcrsscp
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牦牛GH基因多态性的PCR-SSCP分析 被引量:10
11
作者 白晶晶 胡江 +2 位作者 成述儒 王继卿 罗玉柱 《甘肃农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第1期1-5,共5页
采用PCR-SSCP技术对天祝白牦牛和青海高原牦牛的生长激素基因(GH基因)5个外显子及部分内含子序列进行遗传变异分析,以探讨牦牛GH基因的遗传特性.结果表明:2个牦牛群体GH基因第1、第2和第4外显子无多态性,第3内含子1694bp处均发生T→C转... 采用PCR-SSCP技术对天祝白牦牛和青海高原牦牛的生长激素基因(GH基因)5个外显子及部分内含子序列进行遗传变异分析,以探讨牦牛GH基因的遗传特性.结果表明:2个牦牛群体GH基因第1、第2和第4外显子无多态性,第3内含子1694bp处均发生T→C转换,形成A、B2个等位基因,并检测到AA、AB和BB共3种基因型;天祝白牦牛第5外显子2373bp处发生G→T碱基颠换,形成C、D2个等位基因,检测到CC和CD2种基因型,但碱基改变并未引起氨基酸变化,因此这种碱基转换为沉默突变;天祝白牦牛和青海高原牦牛均为低度多态,经Hardy-Weinberg平衡检验2个牦牛群体均处于非平衡状态. 展开更多
关键词 牦牛 GH基因 pcr-sscp 多态性
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弗氏柠檬酸杆菌的分离鉴定与PCR-SSCP分析 被引量:15
12
作者 胡秀彩 王艺 吕爱军 《微生物学杂志》 CAS CSCD 2011年第4期12-18,共7页
利用营养琼脂、MaC培养基从草鱼肠道中分离到3株细菌,暂时编号为TC-1、TC-2和TC-3,通过形态学观察、生理生化特征、药敏试验、动物试验、构建系统发育进化树及PCR-SSCP分析等系统鉴定,结果表明3株菌株均为弗氏柠檬酸杆菌(Citrobacter fr... 利用营养琼脂、MaC培养基从草鱼肠道中分离到3株细菌,暂时编号为TC-1、TC-2和TC-3,通过形态学观察、生理生化特征、药敏试验、动物试验、构建系统发育进化树及PCR-SSCP分析等系统鉴定,结果表明3株菌株均为弗氏柠檬酸杆菌(Citrobacter freundii),其中TC-2菌株对小鼠、斑马鱼有致病性;3株杆菌均对头孢噻肟、头孢曲松、洛美沙星、诺氟沙星等多种药物敏感;系统发育分析表明,3株弗氏柠檬酸杆菌16S rDNA序列与DSM30039模式株同源性分别为99.59%、99.47%和99.53%,且位于系统发育树的同一分支;进一步采用V3区PCR-SSCP分析结果显示弗氏柠檬酸杆菌SSCP图谱中菌株间带型存在差异。 展开更多
关键词 弗氏柠檬酸杆菌 鉴定 16S RDNA pcr-sscp
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PCR-SSCP分析条件的优化 被引量:21
13
作者 魏太云 林含新 谢联辉 《福建农林大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2002年第1期22-25,共4页
聚合酶链式反应及单链构象多态性 (PCR-SSCP)技术作为一种区分检测基因组之间微小差异的有效方法 ,具有快速、简便、灵敏和适用于大样品量筛选的特点 .本研究从变性剂类型、电泳缓冲液的离子强度、交联度、电泳温度、甘油浓度及变性剂... 聚合酶链式反应及单链构象多态性 (PCR-SSCP)技术作为一种区分检测基因组之间微小差异的有效方法 ,具有快速、简便、灵敏和适用于大样品量筛选的特点 .本研究从变性剂类型、电泳缓冲液的离子强度、交联度、电泳温度、甘油浓度及变性剂类型等方面对影响 PCR-SSCP的电泳条件进行分析 。 展开更多
关键词 pcr-sscp 优化 电泳条件
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中国荷斯坦奶牛BLF基因5′侧翼区PCR-SSCP多态性及其与乳房炎的相关性分析 被引量:6
14
作者 方平 昝林森 +2 位作者 张佳兰 申光磊 刘新武 《西北农林科技大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2007年第11期11-14,共4页
采用PCR-SSCP技术,对中国荷斯坦奶牛乳铁蛋白基因(Bovine lactoferrin,BLF)5′侧翼区的多态性进行了分析,并用最小二乘法拟合线性模型分析各种基因型与奶牛乳房炎的相关性。结果发现,中国荷斯坦奶牛BLF基因5′侧翼区存在AA、BB和AB 3种... 采用PCR-SSCP技术,对中国荷斯坦奶牛乳铁蛋白基因(Bovine lactoferrin,BLF)5′侧翼区的多态性进行了分析,并用最小二乘法拟合线性模型分析各种基因型与奶牛乳房炎的相关性。结果发现,中国荷斯坦奶牛BLF基因5′侧翼区存在AA、BB和AB 3种基因型,其基因型频率分别为0.8805,0.0299和0.0896;AA基因型在-148位缺失G;与AA基因型相比,BB基因型在-149位发生C→T变异,-135位发生G→A变异;BLF基因5′侧翼区的χ2值为7.992 4(P<0.01),说明BLF基因5′侧翼区的突变处于Hardy-Weinberg非平衡状态,样本群体中AA基因型的SCSLAW最大,BB基因型的SCSLAW最小,两者差异极显著(P<0.01)。表明BLF基因5′侧翼区BB基因型可能与乳房炎的抗性有关,AA基因型可能与乳房炎的易感性有关。 展开更多
关键词 中国荷斯坦奶牛 乳铁蛋白基因 pcr-sscp 乳房炎
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PCR-SSCP技术在微生物检测中的应用 被引量:7
15
作者 顾真庆 冯志新 +4 位作者 王占伟 刘茂军 王海燕 白昀 邵国青 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第2期70-74,共5页
聚合酶链式反应-单链构象多态性(PCR-SSCP)是一种能够检测DNA突变的分子生物学分析技术,具有快速、简便、灵敏与适于大样本筛选的特点,近年来被广泛应用于生命科学领域的研究。对PCR-SSCP技术在微生物检测研究领域的应用和发展作简要的... 聚合酶链式反应-单链构象多态性(PCR-SSCP)是一种能够检测DNA突变的分子生物学分析技术,具有快速、简便、灵敏与适于大样本筛选的特点,近年来被广泛应用于生命科学领域的研究。对PCR-SSCP技术在微生物检测研究领域的应用和发展作简要的介绍。 展开更多
关键词 pcr-sscp 微生物 检测
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DNA序列分析与PCR-SSCP分析结核分支杆菌利福平敏感性的比较 被引量:5
16
作者 黄海荣 何秀云 +3 位作者 张宗德 张小刚 庄玉辉 马玙 《中国防痨杂志》 CAS 北大核心 2003年第4期260-263,共4页
目的 了解DNA序列分析与PCR -SSCP法分析利福平敏感性的价值。方法 应用DNA序列分析与PCR -SSCP法检测利福平敏感的结核分支杆菌临床分离株 2 5株、耐药株 4 1株的利福平耐药相关基因rpoB基因核心区域的突变情况。 结果  2 5株利福... 目的 了解DNA序列分析与PCR -SSCP法分析利福平敏感性的价值。方法 应用DNA序列分析与PCR -SSCP法检测利福平敏感的结核分支杆菌临床分离株 2 5株、耐药株 4 1株的利福平耐药相关基因rpoB基因核心区域的突变情况。 结果  2 5株利福平敏感株DNA序列分析未检测到rpoB基因突变 ,4 1株耐利福平株中 38株发生突变 ,突变率为 92 .7% (38/ 4 1) ;2 5株利福平敏感的结核分支杆菌菌株PCR -SSCP带型与对照H37Rv株相同 ,4 1株耐利福平结核分支杆菌菌株中38株SSCP带型不同于对照株 ,提示有突变存在。与DNA序列分析相比 ,PCR -SSCP检测准确率为 93.9% (6 2 / 6 6 ) ,敏感度为 92 .1% (35 / 38) ;特异度是 96 .4 % (2 7/ 2 8)。结论 DNA序列分析对判断结核分支杆菌耐利福平非常有价值 ;PCR -SSCP可用于利福平耐药结核分支杆菌的初步筛选。 展开更多
关键词 DNA序列分析 pcrsscp 结核分支杆菌 利福平 敏感性 比较
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西藏牦牛ADD1基因第2外显子的PCR-SSCP检测及序列分析 被引量:11
17
作者 柴志欣 罗晓林 +4 位作者 赵尚娟 姬秋梅 张成福 信金伟 钟金城 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第1期124-129,共6页
利用PCR-SSCP和DNA测序方法对帕里牦牛、工布江达牦牛、类乌齐牦牛、康布牦牛、桑日牦牛、巴青牦牛、江达牦牛、斯布牦牛、嘉黎牦牛、桑桑牦牛、丁青牦牛等西藏11个牦牛类群共483头牦牛的ADD1基因(被认为是极可能影响肉质的候选基因)第... 利用PCR-SSCP和DNA测序方法对帕里牦牛、工布江达牦牛、类乌齐牦牛、康布牦牛、桑日牦牛、巴青牦牛、江达牦牛、斯布牦牛、嘉黎牦牛、桑桑牦牛、丁青牦牛等西藏11个牦牛类群共483头牦牛的ADD1基因(被认为是极可能影响肉质的候选基因)第2外显子序列进行遗传多态性分析。结果表明,66 bp处碱基T缺失和256 bp处A→G突变,共有AA、AB、BB 3种基因型;其中帕里牦牛只有AA基因型,江达牦牛只有AB基因型,康布牦牛、嘉黎牦牛、巴青牦牛、桑日牦牛、斯布牦牛均缺少BB基因型,丁青牦牛、类乌齐牦牛缺少AB型,均存在严重偏态;桑桑牦牛、工布江达牦牛中存在AA、AB、BB 3种基因型。除江达牦牛外,其它10个牦牛类群中AA为优势基因型,A基因为优势等位基因,分布较高。除帕里牦牛、巴青牦牛外,其它9个牦牛类群均处于中度多态(0.25<PIC<0.50),遗传变异较大。 展开更多
关键词 西藏牦牛 ADD1基因 pcr-sscp
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家兔MITF基因部分外显子多态性的PCR-SSCP分析 被引量:5
18
作者 何孟颉 李挺 +2 位作者 王晓明 潘雨来 吴信生 《江西农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第3期575-579,共5页
小眼畸形相关转录因子MITF是色素细胞的发育成熟中的重要因子,可调控酪氨酸基因家族的表达,参与黑素生成的调控,从而影响动物的毛色。本实验采用PCR-SSCP技术,检测白色獭兔、海狸色獭兔和闽西南黑兔群体中家兔MITF基因的5个外显子和部... 小眼畸形相关转录因子MITF是色素细胞的发育成熟中的重要因子,可调控酪氨酸基因家族的表达,参与黑素生成的调控,从而影响动物的毛色。本实验采用PCR-SSCP技术,检测白色獭兔、海狸色獭兔和闽西南黑兔群体中家兔MITF基因的5个外显子和部分内含子区域的多态性,结果发现,引物1、2、5、7的扩增片段均未表现出多态,在获得的大小为255 bp的引物4扩增片段中发现一个SNP(C43T)位点,在各群体中表现为3种等位基因型AA、BB、AB。测序结果表明第4外显子扩增片段的突变位于5′端的内含子区域,不影响氨基酸序列。统计结果显示,白色獭兔群体不处在哈代温伯格平衡状态(P<0.05),其余群体则均处于平衡状态。闽西南黑兔群体表现出中度多态(0.5>PIC>0.25),其余群体为低度多态。 展开更多
关键词 家兔 MITF 毛色 多态性 pcr-sscp
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PCR-SSCP技术应用研究进展 被引量:7
19
作者 周铭涛 高洪 +1 位作者 肖鹏 周辉 《动物医学进展》 CSCD 北大核心 2009年第6期90-93,共4页
聚合酶链反应-单链构象多态性(PCR-SSCP)是基于PCR的单链构象多态性分子标记技术。PCR-SSCP作为检测基因突变的方法,自创立以来,经历了自身发展和完善的过程。刚建立时是将同位素掺入PCR扩增物中,通过放射自显影来显示结果,这给该技术... 聚合酶链反应-单链构象多态性(PCR-SSCP)是基于PCR的单链构象多态性分子标记技术。PCR-SSCP作为检测基因突变的方法,自创立以来,经历了自身发展和完善的过程。刚建立时是将同位素掺入PCR扩增物中,通过放射自显影来显示结果,这给该技术的推广造成一定的困难。随着DNA银染方法与PCR-SSCP结合,尤其是直接溴乙锭染色方法的应用,使得该方法大大简化,操作更为简单,局限性较小,实验条件要求不高,适合一般临床实验室使用,具有简便、快速、灵敏的特点。不但被用于检测基因点突变和短序列的缺失和插入,而且还可用于动物育种,微生物,寄生虫研究的多个领域。由于SSCP的突出的优点,近几年被大量地应用。 展开更多
关键词 聚合酶链反应-单链构象多态性 微生物 寄生虫 基因突变
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柑桔黄龙病亚洲种病原(Candidatus Liberobacter asiaticus)16S rDNA的PCR-SSCP分析 被引量:6
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作者 姚锦爱 谢荔岩 +1 位作者 郑璐平 胡奇勇 《福建农业学报》 CAS 2008年第3期331-333,共3页
应用PCR-SSCP技术对我国柑桔主要产区、泰国和法国留尼湾等地收集到的柑桔黄龙病亚洲种病原(Candidatus Liberobacter asiaticus)16S rDNA进行了分析。PCR结果表明,不同的地区的柑桔黄龙病亚洲种16S rDNA在长度上没有明显区别。进一步的... 应用PCR-SSCP技术对我国柑桔主要产区、泰国和法国留尼湾等地收集到的柑桔黄龙病亚洲种病原(Candidatus Liberobacter asiaticus)16S rDNA进行了分析。PCR结果表明,不同的地区的柑桔黄龙病亚洲种16S rDNA在长度上没有明显区别。进一步的SSCP结果显示,不同地区柑桔黄龙病亚洲种16S rDNA序列在组成上也没有差异。显示来自不同地区、不同寄主品种的柑桔黄龙病亚洲种种内没有存在明显差异。 展开更多
关键词 柑桔黄龙病 pcrsscp 16S RDNA
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