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粉蕉PAL家族基因的鉴定及其在逆境胁迫下的表达分析被引量：1: 1; 作者曾坚王舒婷 +2 位作者周洁薇胡伟曾力旺《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2023年第6期1286-1293,共8页; 苯丙氨酸解氨酶(PAL)在植物生长发育和对生物/非生物胁迫的响应中起着重要作用,因此有必要对香蕉中的PAL家族基因进行详细的研究。本研究从粉蕉基因组中鉴定出8个MaPAL基因,分别命名为MaPAL1~MaPAL8,在系统发育树中MaPAL6基因单独被分... 展开更多; 关键词粉蕉 pal家族基因非生物胁迫生物胁迫; 在线阅读下载PDF 职称材料

甘薯PAL基因家族的全基因组鉴定及生物信息学分析: 2; 作者王崇兰孟焦 +3 位作者肖满秋潘皓邓佳祺吴问胜《植物遗传资源学报》北大核心 2025年第6期1091-1105,共15页; 苯丙氨酸解氨酶(PAL,phenylalanin ammonia-lyase)是苯丙烷代谢途径中的关键酶和限速酶,在植物生长发育、抗逆等方面发挥重要作用。本研究在甘薯全基因组中筛选PAL基因家族成员,对甘薯PAL基因家族成员的理化性质、系统进化、保守结构域... 展开更多; 关键词甘薯 pal基因家族全基因组鉴定生物信息学分析; 在线阅读下载PDF 职称材料

茶树PAL、C4H与4CL基因家族的全基因组鉴定及表达分析被引量：1: 3; 作者张力岚杨军王让剑《茶叶学报》 2024年第3期34-46,共13页; 【目的】分析茶树PAL、C4H和4CL基因家族成员的基本特征,探索它们与苯乙醇樱草糖苷含量性状之间的因果关系,对于深入研究PAL、C4H和4CL基因家族在茶树上的生物学功能具有重要意义。【方法】基于生物信息学方法及转录组测序技术,分析PAL... 展开更多; 关键词茶树 pal基因家族 C4H基因家族 4CL基因家族表达分析; 在线阅读下载PDF 职称材料

苹果全基因组PAL基因家族成员的鉴定及表达分析被引量：13: 4; 作者张丽之樊胜 +4 位作者安娜左希亚高彩张东韩明玉《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2018年第12期2031-2043,共13页; 根据金冠苹果参考基因组,利用BLAST在线网站鉴定得到苹果基因组中共8个PAL基因,所有MdPAL蛋白都含有MIO保守结构域(Ala-Gly-Ser)。分组鉴定和进化树分析结果显示,MdPAL蛋白可以被分为3组,分子量在47. 713～81. 748 ku,等电点在5. 44～6.... 展开更多; 关键词苹果 pal基因家族生物信息学系统进化分析基因表达; 在线阅读下载PDF 职称材料

马铃薯PAL基因家族的全基因组鉴定及其在非生物胁迫下和块茎花色素苷合成中的表达分析被引量：2: 5; 作者朱金勇刘震 +7 位作者曾钰婷李志涛陈丽敏李泓阳史田斌张俊莲白江平刘玉汇《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第11期2978-2990,共13页; 苯丙氨酸解氨酶(phenylalanin ammonia-lyase,PAL)是苯丙烷代谢途径的限速酶和关键酶,在植物生长发育过程中发挥着重要作用。本研究在马铃薯(Solanum tuberosum L.)全基因组水平下,利用BlastP和HMM 3.1鉴定到8个PAL基因家族成员,利用ExP... 展开更多; 关键词马铃薯 pal基因家族非生物胁迫花色素苷生物合成表达分析; 在线阅读下载PDF 职称材料

谷子PAL基因家族全基因组的鉴定和表达分析被引量：3: 6; 作者孟亚轩孙颖琦 +3 位作者赵心月王凤霞瓮巧云刘颖慧《广西植物》 CAS CSCD 北大核心 2022年第9期1572-1581,共10页; 苯丙氨酸解氢酶(phenylalanine ammonia-lyase,PAL)基因家族参与苯丙烷类代谢过程,通过调控植物抗病次生物质的合成在植物抗逆反应中发挥重要作用。为明确谷子PAL基因家族在逆境胁迫下的表达规律,该研究利用生物信息学方法对谷子PAL基... 展开更多; 关键词谷子 pal基因家族生物信息学分析蛋白结构表达分析; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名粉蕉PAL家族基因的鉴定及其在逆境胁迫下的表达分析被引量：1: 1; 作者曾坚王舒婷周洁薇胡伟曾力旺; 机构韶关学院广东省粤北食药资源利用与保护重点实验室/韶关学院英东生物与农业学院中国热带农业科学院热带生物技术研究所中国热带农业科学院科技信息研究所; 出处《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2023年第6期1286-1293,共8页; 基金广东省基础与应用基础研究基金项目(2023A1515010336、2021A1515011236) 广东省普通高校重点领域专项(2022ZDZX4047) +3 种基金韶关学院重点项目(SZ2022KJ05) 国家级大学生创新创业训练计划项目(202310576009)。; 文摘苯丙氨酸解氨酶(PAL)在植物生长发育和对生物/非生物胁迫的响应中起着重要作用,因此有必要对香蕉中的PAL家族基因进行详细的研究。本研究从粉蕉基因组中鉴定出8个MaPAL基因,分别命名为MaPAL1~MaPAL8,在系统发育树中MaPAL6基因单独被分成一支。根据基因系统进化关系、蛋白质结构域和基因结构的分析,8个MaPAL基因属于PAL家族基因。转录组分析结果表明,MaPAL基因参与了粉蕉的发育、成熟以及对生物/非生物胁迫的响应。MaPAL4基因在所有果实发育和成熟阶段都表现出高表达。MaPAL1和MaPAL7基因可能对非生物胁迫有响应,MaPAL2和MaPAL8基因的表达在香蕉枯萎病菌4号生理小种(Foc4)侵染时被明显抑制,可能响应Foc4的侵染。和巴西蕉相比,MaPAL基因在粉蕉中被低温和渗透胁迫诱导的程度要高。本研究结果为进一步研究香蕉PAL家族基因的功能提供了基础,也为香蕉遗传改良提供了潜在基因资源。; 关键词粉蕉 pal家族基因非生物胁迫生物胁迫; Keywords Pisang Awak pal family genes abiotic stress biotic stress; 分类号 S668.1 [农业科学—果树学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名甘薯PAL基因家族的全基因组鉴定及生物信息学分析: 2; 作者王崇兰孟焦肖满秋潘皓邓佳祺吴问胜; 机构江西省农业科学院作物研究所; 出处《植物遗传资源学报》北大核心 2025年第6期1091-1105,共15页; 基金国家现代农业产业技术体系项目(CARS-10-C8) 江西省农作物良种联合攻关项目(9021109126) 江西省农业科学院基础研究与人才培养专项(JXSNKYJCRC202422)。; 文摘苯丙氨酸解氨酶(PAL,phenylalanin ammonia-lyase)是苯丙烷代谢途径中的关键酶和限速酶,在植物生长发育、抗逆等方面发挥重要作用。本研究在甘薯全基因组中筛选PAL基因家族成员,对甘薯PAL基因家族成员的理化性质、系统进化、保守结构域、染色体定位及基因表达进行了分析。结果表明:在甘薯全基因组中共鉴定出33个PAL成员,不均匀地分布于2、6、9和15号染色体上,PAL蛋白理化性质差异小,保守基序和基因结构相近。IbPAL启动子上存在多个逆境胁迫应答、激素响应和生长发育调控相关的顺式作用元件。甘薯IbPAL与拟南芥、三浅裂野牵牛和三裂叶薯PAL基因存在共线性关系。甘薯转录组数据显示,IbPAL基因在甘薯中的表达存在组织特异性,IbPAL19、IbPAL13、IbPAL7在储藏根的表达量明显高于未分化根和须根。qRT-PCR结果显示IbPAL基因受到干旱和盐胁迫的诱导,在不同胁迫处理下表达模式不同。本研究为进一步探明甘薯PAL家族基因的功能提供了参考,为甘薯遗传改良奠定了基础。; 关键词甘薯 pal基因家族全基因组鉴定生物信息学分析; Keywords sweetpotato pal gene family complete genome identification bioinformatics analysis; 分类号 S531 [农业科学—作物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名茶树PAL、C4H与4CL基因家族的全基因组鉴定及表达分析被引量：1: 3; 作者张力岚杨军王让剑; 机构福建省农业科学院茶叶研究所国家茶树改良中心福建分中心; 出处《茶叶学报》 2024年第3期34-46,共13页; 基金福建省属公益类科研院所基本科研专项——竞争性项目(2023R1090) 农业高质量发展超越“5511”协同创新工程(XTCXGC2021004)。; 文摘【目的】分析茶树PAL、C4H和4CL基因家族成员的基本特征,探索它们与苯乙醇樱草糖苷含量性状之间的因果关系,对于深入研究PAL、C4H和4CL基因家族在茶树上的生物学功能具有重要意义。【方法】基于生物信息学方法及转录组测序技术,分析PAL、C4H和4CL基因成员在茶树基因组中的分布、理化性质、基因结构、系统发育关系、启动子顺式作用元件与表达特性,以及探索茶树PAL、C4H和4CL基因成员在苯乙醇樱草糖苷含量差异显著的茶树新品系(高糖苷和低糖苷品系)新梢中的表达差异。【结果】7个CsPAL、4个CsC4H与4个Cs4CL基因分布在9条染色体上。所有CsPAL均只有1个内含子;除CsC4H4外,其他CsC4H成员均含有2个内含子;Cs4CL成员均含有多个内含子。系统进化分析表明,它们与杨树PAL、C4H和4CL蛋白的亲缘关系较近。基因结构和保守基序分析显示,亲缘关系较近的基因,其基因结构和保守基序的组成也较为相似。启动子顺式作用元件预测发现,CsPAL、CsC4H与Cs4CL基因成员的启动子区域内含有多种顺式元件,包括逆境胁迫响应、生长发育相关以及激素响应等多种顺式元件。转录组分析发现,大多数CsPAL、CsC4H与Cs4CL的成员表现为组织特异性表达,且会受到激素、低温、干旱及高盐的诱导。CsPAL7、CsC4H4与Cs4CL3在苯乙醇樱草糖苷含量明显差异的品系中存在表达差异,CsPAL7在高糖苷品系中的表达量要大于低糖苷品系,CsC4H4与Cs4CL3在低糖苷品系中的表达量均显著高于高糖苷品系,推测这3个家族基因的表达可能对茶树新梢中苯乙醇樱草糖苷的形成起不同的作用。【结论】本研究为PAL、C4H和4CL基因的功能分析提供了有用的信息,其家族成员可作为茶树分子育种的候选基因。; 关键词茶树 pal基因家族 C4H基因家族 4CL基因家族表达分析; Keywords Tea pals C4Hs 4CLs expression analysis; 分类号 S571.1 [农业科学—茶叶生产加工]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名苹果全基因组PAL基因家族成员的鉴定及表达分析被引量：13: 4; 作者张丽之樊胜安娜左希亚高彩张东韩明玉; 机构西北农林科技大学园艺学院; 出处《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2018年第12期2031-2043,共13页; 基金国家现代农业产业技术体系(CARS-27) 陕西省科技厅项目(2016KTZDNY01-10 2017NY0055); 文摘根据金冠苹果参考基因组,利用BLAST在线网站鉴定得到苹果基因组中共8个PAL基因,所有MdPAL蛋白都含有MIO保守结构域(Ala-Gly-Ser)。分组鉴定和进化树分析结果显示,MdPAL蛋白可以被分为3组,分子量在47. 713～81. 748 ku,等电点在5. 44～6. 39,进化关系较近的成员拥有相似的基因结构和蛋白保守基序分布。利用GEO数据库和实时荧光定量PCR的方法检测苹果长富2号品种中PAL基因在不同组织器官及5个不同果实发育阶段的表达情况。不同组织器官表达结果表明,MdPAL2、MdPAL3/4/6/7、MdPAL8在叶中表达最高,而MdPAL1和MdPAL5在花中表达最高,表达模式存在多样性。不同果实发育阶段表达结果发现,MdPAL表达规律不同,所有MdPAL在幼果发育期或果实成熟期显著升高(除MdPAL1外),暗示其在果实发育和成熟过程具有重要作用。; 关键词苹果 pal基因家族生物信息学系统进化分析基因表达; Keywords apple pal gene family bioinformatics phylogenetic analysis gene expression; 分类号 S661.1 [农业科学—果树学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名马铃薯PAL基因家族的全基因组鉴定及其在非生物胁迫下和块茎花色素苷合成中的表达分析被引量：2: 5; 作者朱金勇刘震曾钰婷李志涛陈丽敏李泓阳史田斌张俊莲白江平刘玉汇; 机构甘肃农业大学农学院/省部共建干旱生境作物学国家重点实验室(甘肃农业大学)/甘肃省作物遗传改良与种质创新重点实验室西藏自治区农牧科学院蔬菜研究所甘肃农业大学园艺学院; 出处《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第11期2978-2990,共13页; 基金国家自然科学基金项目(31860398) 甘肃省科技计划资助项目(22JR5RA834) +3 种基金甘肃农业大学公招博士科研启动基金项目(GAU-KYQD-2020-11)资助。; 文摘苯丙氨酸解氨酶(phenylalanin ammonia-lyase,PAL)是苯丙烷代谢途径的限速酶和关键酶,在植物生长发育过程中发挥着重要作用。本研究在马铃薯(Solanum tuberosum L.)全基因组水平下,利用BlastP和HMM 3.1鉴定到8个PAL基因家族成员,利用ExPASy、CELLO、PlantCARE等在线工具,对PAL基因家族成员的进行生物信息学分析。利用PGSC数据库下载的RNA-seq数据,分析了StPALs在双单倍体(DM)马铃薯不同组织部位和非生物胁迫下的表达模式。对3个不同颜色马铃薯块茎组织(皮和肉)进行RNA-seq,以及利用3个不同颜色块茎杂交子代的薯肉进行qPCR分析。结果表明,8个StPALs分布在3、5、9和10号染色体上,它们与烟草(Nicotiana tabacum)PAL的亲缘关系较近。StPAL基因成员的启动子区域内含有多个顺式元件,包括光响应、逆境胁迫响应、激素响应、生长发育相关和转录因子调控的多种顺式元件。StPAL2在匍匐茎中特异表达,StPAL3/5/8在块茎和匍匐茎中特异表达,StPAL3在甘露醇处理下下调表达,StPAL3和StPAL8在热胁迫中上调表达。它们可能参与了马铃薯块茎的发育和非生物胁迫响应。5个StPALs(StPAL3/4/5/6/8)基因在彩色薯肉中均上调表达,可能参与马铃薯薯肉中花色素苷的生物合成。这些结果为进一步了解StPAL基因家族特征,深入分析StPALs基因在马铃薯中的功能提供了理论依据。; 关键词马铃薯 pal基因家族非生物胁迫花色素苷生物合成表达分析; Keywords potato pal genes family abiotic stress anthocyanin biosynthesis expression analysis; 分类号 S532 [农业科学—作物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名谷子PAL基因家族全基因组的鉴定和表达分析被引量：3: 6; 作者孟亚轩孙颖琦赵心月王凤霞瓮巧云刘颖慧; 机构河北北方学院农林科技学院; 出处《广西植物》 CAS CSCD 北大核心 2022年第9期1572-1581,共10页; 基金国家重点研发计划项目“十三五”国家粮食丰产增效科技创新专项(2017YFD0300305) 河北省科技厅项目(19226420D)。; 文摘苯丙氨酸解氢酶(phenylalanine ammonia-lyase,PAL)基因家族参与苯丙烷类代谢过程,通过调控植物抗病次生物质的合成在植物抗逆反应中发挥重要作用。为明确谷子PAL基因家族在逆境胁迫下的表达规律,该研究利用生物信息学方法对谷子PAL基因家族进行鉴定和表达分析。结果表明:谷子具有11个PAL基因,在进化树中可分为3个亚家族,SiPAL7独自进化为一支。通过构建蛋白结构域发现PAL基因家族成员均含有保守的PAL结构域。启动子分析显示,PAL基因含有应答激素、逆境胁迫等多种因子的顺式作用元件,说明PAL基因广泛参与不同生物学调控过程。RT-qPCR结果显示,谷子PAL基因家族多为诱导型表达,不同光照条件下PAL基因表达量变化明显,不同基因具有不同响应模式,说明谷子PAL基因家族在参与光调节反应中发挥重要作用。谷子PAL基因高度保守,广泛响应不同非生物胁迫,具有表达特异性。该研究结果为揭示PAL基因家族在调节谷子抗性及胁迫应答过程中的作用提供了参考。; 关键词谷子 pal基因家族生物信息学分析蛋白结构表达分析; Keywords millet(Setaria italica) pal gene family bioinformatics analysis protein structure expression analysis; 分类号 Q943 [生物学—植物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

	题名	作者	出处	发文年	被引量	操作
1	粉蕉PAL家族基因的鉴定及其在逆境胁迫下的表达分析	曾坚王舒婷周洁薇胡伟曾力旺	《江苏农业学报》 CSCD 北大核心	2023	1	在线阅读下载PDF 职称材料
2	甘薯PAL基因家族的全基因组鉴定及生物信息学分析	王崇兰孟焦肖满秋潘皓邓佳祺吴问胜	《植物遗传资源学报》北大核心	2025	0	在线阅读下载PDF 职称材料
3	茶树PAL、C4H与4CL基因家族的全基因组鉴定及表达分析	张力岚杨军王让剑	《茶叶学报》	2024	1	在线阅读下载PDF 职称材料
4	苹果全基因组PAL基因家族成员的鉴定及表达分析	张丽之樊胜安娜左希亚高彩张东韩明玉	《浙江农业学报》 CSCD 北大核心	2018	13	在线阅读下载PDF 职称材料
5	马铃薯PAL基因家族的全基因组鉴定及其在非生物胁迫下和块茎花色素苷合成中的表达分析	朱金勇刘震曾钰婷李志涛陈丽敏李泓阳史田斌张俊莲白江平刘玉汇	《作物学报》 CAS CSCD 北大核心	2023	2	在线阅读下载PDF 职称材料
6	谷子PAL基因家族全基因组的鉴定和表达分析	孟亚轩孙颖琦赵心月王凤霞瓮巧云刘颖慧	《广西植物》 CAS CSCD 北大核心	2022	3	在线阅读下载PDF 职称材料