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一株携带耐药基因blaCTX-M-27沙门菌P1-CTX噬菌体-质粒的分离及生物学特性分析
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作者 赵秋云 沈焕钧 +2 位作者 宋厚辉 蒋红霞 许成钢 《畜牧兽医学报》 北大核心 2025年第7期3519-3527,共9页
P1噬菌体-质粒作为肠杆菌科细菌抗生素耐药基因的载体受到人们的关注,本研究旨在探究携带抗生素耐药基因的P1噬菌体-质粒是否具有诱导和进一步转导等生物学特性问题。对沙门菌中携带耐第三代头孢菌素类耐药基因blaCTX-M-27的P1噬菌体-质... P1噬菌体-质粒作为肠杆菌科细菌抗生素耐药基因的载体受到人们的关注,本研究旨在探究携带抗生素耐药基因的P1噬菌体-质粒是否具有诱导和进一步转导等生物学特性问题。对沙门菌中携带耐第三代头孢菌素类耐药基因blaCTX-M-27的P1噬菌体-质粒(命名为P1-CTX)的生物学特性进行研究,包括噬菌体效价、最佳感染复数、一步生长曲线、温度和酸碱稳定性等。结果显示,P1-CTX噬菌体-质粒可诱导产生有裂解能力的完整噬菌体,效价为10~6 PFU·mL^(-1),最佳感染复数为0.01;P1-CTX噬菌体在低于50℃环境下活力较好,耐强碱而不耐强酸。可感染沙门菌和大肠埃希菌,且在宿主菌中不产生适应代价,稳定性较好。综上表明,P1-CTX噬菌体-质粒具有正常的噬菌体生物学特性,可携带耐药基因通过转导的方式水平传播,且稳定性好。 展开更多
关键词 沙门菌 p1噬菌体-质粒 抗生素耐药基因 生物学特性
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老年多重耐药菌感染肺炎患者miR-127-5p、miR-127、miR-155表达水平及其与免疫相关细胞因子的相关性 被引量：1
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作者 毛燕青 付婷 +2 位作者 王娟 王亚楠 李洁 《实用医学杂志》 北大核心 2025年第3期385-390,共6页
目的探究老年多重耐药菌感染肺炎患者微小核糖核酸(miR)-127-5p、miR-127、miR-155表达水平,并分析其与免疫相关细胞因子的相关性。方法选取2020年6月到2022年6月本院收治的65例老年多重耐药菌感染肺炎患者作为观察组,并选取同期健康体... 目的探究老年多重耐药菌感染肺炎患者微小核糖核酸(miR)-127-5p、miR-127、miR-155表达水平,并分析其与免疫相关细胞因子的相关性。方法选取2020年6月到2022年6月本院收治的65例老年多重耐药菌感染肺炎患者作为观察组,并选取同期健康体检人员80例作为对照A组和同期收治的老年普通肺炎患者80例作为对照B组。比较三组血清miR-127-5p、miR-127、miR-155表达水平和γ干扰素(IFN-γ)、白细胞介素(IL)-4、IL-17、转化生长因子-β(TGF-β)水平,采用Pearson相关分析血清miR-127-5p、miR-127和miR-155表达水平与免疫相关细胞因子的相关性,采用受试者工作特征曲线(ROC)分析三者单独及联合对老年多重耐药菌感染肺炎的诊断价值。结果对照B组和观察组血清miR-127-5p、IFN-γ水平低于对照A组,且观察组低于对照B组(P<0.05);而对照B组和观察组血清miR-127、miR-155、IL-4、IL-17、TGF-β水平高于对照A组,且观察组高于对照B组(P<0.05)。血清miR-127-5p表达水平与血清IFN-γ水平呈正相关(r=0.463,P<0.05),与血清IL-4、IL-17、TGF-β水平呈负相关(r=-0.378、-0.396、-0.408,P<0.05);而血清miR-127和miR-155表达水平与血清IFN-γ水平呈负相关(r=-0.267、-0.513,P<0.05),与血清IL-4、IL-17、TGF-β水平呈正相关(r=0.306、0.273、0.330和r=0.410、0.453、0.385,P<0.05)。血清miR-127-5p、miR-127和miR-155表达水平单独及联合诊断对老年多重耐药菌感染肺炎具有一定的诊断价值,其AUC值分别为0.811、0.733、0.817、0.906,敏感度为90.77%、60.00%、67.69%、84.62%,特异度为66.87%、80.62%、83.75%、83.18%。结论miR-127-5p、miR-127和miR-155在老年多重耐药菌感染肺炎患者中差异性表达,与免疫相关细胞因子具有一定的相关性,三者联合检测对老年多重耐药菌感染肺炎具有较好的诊断价值。 展开更多
关键词 老年 多重耐药菌 肺炎 微小RNA-127-5p 微小RNA-127 微小RNA-155 免疫因子 相关性
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基于CRISPR-Cas系统的多重耐药菌防治技术研究进展
3
作者 周倩 唐梦君 +4 位作者 张小燕 陆俊贤 唐修君 杨星星 高玉时 《生物技术通报》 北大核心 2025年第5期42-51,共10页
动物源细菌耐药性影响动物养殖安全,同时对人类公共卫生和食品安全产生重要威胁。抗生素的滥用加剧了耐药细菌的传播,而新型抗菌药物研发日益困难,动物源细菌耐药污染已成为全球范围内的公共危机,一旦耐药菌从动物向人类扩散,将极大地... 动物源细菌耐药性影响动物养殖安全,同时对人类公共卫生和食品安全产生重要威胁。抗生素的滥用加剧了耐药细菌的传播,而新型抗菌药物研发日益困难,动物源细菌耐药污染已成为全球范围内的公共危机,一旦耐药菌从动物向人类扩散,将极大地威胁人类健康,亟须新的方法和策略应对细菌耐药。CRISPR-Cas(clustered regularly interspaced short palindromic repeats,CRISPR-associated)是第三代“基因组定点编辑技术”,该技术能够靶向剪切外源性核酸,保护微生物遗传物质遗传稳定性。与传统的多重耐药菌防治策略相比,CRISPR-Cas系统具备独特的DNA序列的靶向性和灵敏度,通过精准、简便和高效的基因编辑技术,与核酸扩增技术、比色技术等相结合,可以提高灵敏度和检测时效性等性能指标。本文介绍了CRISPR-Cas系统的由来、系统分类、基因编辑的作用机理,在此基础之上,聚焦于该系统在多重耐药菌防治领域的研究进展和应用,在耐药致病菌消除、耐药基因消除以及致病菌诊断检测方面给出案例分析以及目前存在的挑战。总的来说,基于CRISPR-Cas系统的序列特异性抗菌剂能够降低细菌多重耐药性,结合核酸扩增技术和实时监控设备提升检测的精准性和效率,为动物源细菌耐药防控和监测研究提供了新思路。 展开更多
关键词 CRISpR-Cas系统 基因编辑 多重耐药菌 耐药基因 防治技术
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临床分离高黏液肺炎克雷伯菌耐药性及基因组特征分析
4
作者 李兵兵 陈大伟 +5 位作者 刘靓 孙敏 李双姝 李洁 杨鹏飞 邢亚东 《中国感染控制杂志》 北大核心 2025年第1期113-120,共8页
目的分析临床分离高黏液肺炎克雷伯菌(hmKp)的耐药情况及基因组特征。方法收集2019—2023年分离自淮安市国家致病菌识别网哨点医院临床标本的肺炎克雷伯菌,使用VITEK 2 Compact对菌株进行鉴定,拉丝试验判断黏液表型,微量肉汤稀释法测定h... 目的分析临床分离高黏液肺炎克雷伯菌(hmKp)的耐药情况及基因组特征。方法收集2019—2023年分离自淮安市国家致病菌识别网哨点医院临床标本的肺炎克雷伯菌,使用VITEK 2 Compact对菌株进行鉴定,拉丝试验判断黏液表型,微量肉汤稀释法测定hmKp的耐药性。应用全基因组测序技术进行分子分型,并对菌株携带的毒力和耐药基因进行注释。结果共收集hmKp 60株,主要分离自痰标本(33.33%)和血标本(28.33%)。60株菌株基因组平均大小为5.6 Mb,平均GC含量为57.09%。多位点序列分型(ST)显示,有28种ST型,优势ST型为ST11(11.67%)、ST15(11.67%)和ST412(10.00%)。核心基因组多位点序列分型(cgMLST)分析发现,部分菌株高度同源,未发现暴发菌株。多重耐药菌株占60.00%,耐亚胺培南菌株占28.33%。共携带64种耐药基因,其中84.38%的耐药基因位于可移动原件上,磷霉素相关耐药基因、超广谱β-内酰胺类抗生素相关耐药基因在菌株中携带率较高,分别为100%、98.33%。碳青霉烯类耐药基因blaKPC-2,21.67%由ST11、ST1和ST15菌株携带;blaNDM-5基因3.33%由ST76菌株携带。共携带101种毒力基因,其中Colibactin和Ⅵ型分泌系统相关毒力基因种类最多。所有菌株均携带荚膜合成调节相关基因(rcsA、rcsB)、外排泵相关基因(acrA、acrB)和肠杆菌素相关基因(entABCEF、fepABCDFG、fes)。结论淮安地区临床分离的hmKp呈现多重耐药,优势ST型为ST11、ST15和ST412,携带多种能够进行水平转移的耐药基因和毒力基因,应加强防控措施。 展开更多
关键词 高黏液肺炎克雷伯菌 耐药性 耐药基因 毒力基因 全基因组测序 高毒力
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鲍曼不动杆菌耐药基因与耐药表型的一致性分析
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作者 顾琳 高艳 +1 位作者 赵剑虹 张若曦 《中国人兽共患病学报》 北大核心 2025年第6期617-622,共6页
目的了解鲍曼不动杆菌耐药情况,探讨耐药基因与耐药表型一致性,为临床抗菌药物合理使用提供依据。方法收集2021至2023年辖区内三级以上医院分离的鲍曼不动杆菌88株,进行耐药试验、全基因组测序,用Microobench病原微生物分析工作站对原... 目的了解鲍曼不动杆菌耐药情况,探讨耐药基因与耐药表型一致性,为临床抗菌药物合理使用提供依据。方法收集2021至2023年辖区内三级以上医院分离的鲍曼不动杆菌88株,进行耐药试验、全基因组测序,用Microobench病原微生物分析工作站对原始数据进行基因组全流程分析(无参拼接),对耐药基因进行预测及注释,多位点序列分析、构建最小生成树。结果88株鲍曼不动杆菌中耐碳青霉烯株(CRAB)占72.73%,CRAB中98.44%表现为多重耐药;3年间,多种药物的耐药性表现出上升趋势;cgMLST分析结果ST2型占89.77%,发现一株新ST型,经cgMLST分析生成最小生成树,相同ST型的亲缘关系更近,同为ST2型可继续分成4个不同的簇。对耐药基因和耐药表型进行二元Logistic回归分析,耐药基因APH(3″)-Ib、armA、ADC-73、sul1、sul2与耐药表型呈正相关。结论鲍曼不动杆菌以ST2型为主,多重耐药率高,携带多种耐药基因,耐药形势非常严峻;常见耐药基因与耐药表型一致性较好。临床需加强鲍曼不动杆菌的院感管理,防止暴发传播。 展开更多
关键词 鲍曼不动杆菌 耐药性 耐药基因 一致性
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耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌全基因组测序及黏菌素耐药分析
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作者 储雯雯 刘周 +4 位作者 李昕 叶乃芳 龚真 曾晓娇 周强 《中国感染控制杂志》 北大核心 2025年第1期37-44,共8页
目的通过全基因组测序分析临床耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌(CRKP)的分子流行病学及黏菌素耐药基因,为临床诊疗提供参考。方法收集2021—2023年安徽省某三级甲等综合医院住院患者临床标本分离的57株CRKP,对所有菌株进行药敏试验。采用全基... 目的通过全基因组测序分析临床耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌(CRKP)的分子流行病学及黏菌素耐药基因,为临床诊疗提供参考。方法收集2021—2023年安徽省某三级甲等综合医院住院患者临床标本分离的57株CRKP,对所有菌株进行药敏试验。采用全基因测序技术分析CRKP菌株多位点序列分型、荚膜血清型、耐药基因和毒力基因,并对所有菌株序列进行单核苷酸多态性分析,采用聚合酶链式反应(PCR)方法扩增与黏菌素耐药相关基因。结果57株CRKP对除替加环素外的14种抗菌药物均为耐药。测序结果显示,93.0%(53/57)的CRKP携带bla KPC-2,ST11型CRKP菌株检出率最高(51/57,89.5%)。单核苷酸多态性聚类分析表明,57株CRKP分为11个克隆群,其中有4个克隆群均为ST11-KL64型CRKP。40株(70.2%)CRKP携带多种毒力基因。5株黏菌素耐药CRKP,其耐药机制是在mgr B基因70位点处插入一个ISKpn26元件。结论CRKP菌株以产KPC-2 ST11-KL64型为主要流行型,在重症监护病房有播散性流行。ISKpn26元件插入引起mgr B基因突变与该地区CRKP黏菌素耐药有关。 展开更多
关键词 耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌 全基因组测序 单核苷酸多态性分析 黏菌素 耐药 ISKpn26
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一株猪链球菌的分离鉴定与毒力和耐药基因分析
7
作者 张振 陈鑫 +5 位作者 刘淑华 梁樊鑫 马佰贺 侯梦哲 郭美亮 李莲瑞 《北京农学院学报》 2025年第1期48-53,共6页
【目的】为确定新疆阿克苏地区某规模化猪场产房仔猪出现运动失调、抽搐、昏迷、关节肿胀、疼痛和淋巴结化脓的发病原因,从疑似链球菌感染的病死仔猪的脑组织中进行猪链球菌的分离和鉴定。【方法】对该猪场病死仔猪脑组织进行无菌采样... 【目的】为确定新疆阿克苏地区某规模化猪场产房仔猪出现运动失调、抽搐、昏迷、关节肿胀、疼痛和淋巴结化脓的发病原因,从疑似链球菌感染的病死仔猪的脑组织中进行猪链球菌的分离和鉴定。【方法】对该猪场病死仔猪脑组织进行无菌采样及细菌分离鉴定,使用16S rRNA基因的细菌通用引物进行PCR扩增及测序分析,并进行药敏试验、毒力基因和耐药基因检测。【结果】从疑似患病仔猪猪脑组织中分离出1株猪链球菌。该菌株在BHI固体培养基上显现出了针尖般大小、呈现灰白色且略带透明的菌落,在光学显微镜下可观察到菌体成双或呈长短不一的链状排列。通过PCR方法扩增出16S rRNA 1 500 bp的条带;16S rRNA测序结果与猪链球菌参考菌株相似性位于99.64%~100%之间;药敏结果显示,该菌株对青霉素、氨苄西林、大观霉素等抗生素敏感,对链霉素等抗生素中介,对红霉素、庆大霉素、新霉素等抗生素耐药,毒力基因结果显示该菌株携带了purD、mrp,2种毒力基因;耐药基因结果显示该菌株携带了氨基糖苷类aph(3')Ia基因和大环内酯类ermb、mefA基因。【结论】从疑似患病猪猪脑组织中分离出1株猪链球菌,通过毒力基因和耐药基因的检测分析其致病力和耐药性。以期为该猪场提供科学合理的治疗方案。临床建议减少选用氨基糖苷类和大环内酯类药物治疗。为阿克苏及周边地区猪链球菌的防控和耐药机理研究提供了理论依据。 展开更多
关键词 猪链球菌 pCR 毒力基因 耐药基因
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奶牛场环境中耐药大肠杆菌的分离及耐药基因遗传环境分析 被引量：1
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作者 王灵舸 沈留红 +4 位作者 唐俊妮 韩新锋 朱成林 赵珂 邹立扣 《生态毒理学报》 北大核心 2025年第1期329-343,共15页
为了解四川某奶牛场环境中大肠杆菌的耐药情况及耐药基因(antibiotic resistance genes,ARGs)的遗传环境,对从养殖场采集的样品进行大肠杆菌的分离鉴定,进行最小抑菌浓度(the minimum inhibitory concentrations,MICs)测定,并选择多重... 为了解四川某奶牛场环境中大肠杆菌的耐药情况及耐药基因(antibiotic resistance genes,ARGs)的遗传环境,对从养殖场采集的样品进行大肠杆菌的分离鉴定,进行最小抑菌浓度(the minimum inhibitory concentrations,MICs)测定,并选择多重耐药大肠杆菌进行全基因组测序分析。共采集36份样品,分离得到18株大肠杆菌。药敏试验显示大肠杆菌对四环素、阿莫西林的耐药率较高,且大部分表现为多重耐药。耐药基因检测发现所有大肠杆菌均携带耐药基因blaTEM、ampC、tetA和qnrA,53.33%的大肠杆菌携带blaCTX-M基因,55.55%的大肠杆菌携带tetM基因。通过二代全基因组测序,8株多重耐药大肠杆菌均检测到大量耐药基因及毒力基因,对其耐药基因环境进行分析,发现大肠杆菌β-内酰胺类耐药基因、四环素类耐药基因上下游环境高度一致,并存在转座子、插入序列(insertion sequences,ISs)等可移动遗传元件(mobile genetic elements,MGEs),有助于耐药基因在环境中的传播。其中,发现bla_(CTX-M-15)基因上下游存在与WbuC家族杯状折叠金属蛋白基因关联的保守结构。该研究对奶牛场科学合理使用抗生素,以及对养殖环境中耐药菌(antibiotic resistant bacteria,ARB)和耐药基因的监测具有重要意义。 展开更多
关键词 奶牛场 大肠杆菌 耐药性 耐药基因环境
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中央山岛“动物-环境-人”微生物菌群组成及其耐药基因分布 被引量：1
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作者 王琳 赵格 +9 位作者 律娜 高玉斌 王娟 刘娜 黄秀梅 赵建梅 陆明哲 刘俊辉 曲志娜 王君玮 《中国动物检疫》 2025年第1期35-43,共9页
为了解自然状态下“动物-环境-人”微生物菌群结构及其耐药性,2022—2023年采集中央山岛动物、环境、人源样品共75份,应用宏基因组测序分析技术,分析3类样品的微生物菌群组成及其耐药基因分布情况。结果显示;环境和动物源样品中微生物... 为了解自然状态下“动物-环境-人”微生物菌群结构及其耐药性,2022—2023年采集中央山岛动物、环境、人源样品共75份,应用宏基因组测序分析技术,分析3类样品的微生物菌群组成及其耐药基因分布情况。结果显示;环境和动物源样品中微生物菌群物种数量较多,人源样品中菌群物种数量最少;环境源样品中微生物菌群多样性、均匀度均高于动物和人源样品。环境源样品(空气、水体、土壤和滩涂)中的菌群组成较相似,以变形菌门(Proteobacteria)和放线菌门(Actinobacteria)为优势菌;动物和人源样品中的菌群组成较相似,以拟杆菌门(Bacteroidetes)、厚壁菌门(Firmicutes)和变形菌门(Proteobacteria)为优势菌;各类样品的优势菌在冬夏两季占比不同。聚类分析发现,土壤和滩涂样品的微生物群落结构最为相近,与水体、空气样品微生物群落结构较为相近,而与动物和人源样品的微生物群落结构较远。空气样品中微生物菌群耐药基因数量最多,多样性和均匀度最高;动物和人源样品的耐药基因多样性和均匀度高于水体、土壤和滩涂等环境样品。聚类分析发现,人源、动物源和空气样品间微生物菌群耐药基因距离较近,它们与水体和土壤样品距离较远。结果表明;中央山岛“动物-环境-人”微生物菌群物种丰富,不同界面组成不同,耐药基因种类和丰度各异。本研究从“动物-环境-人”的角度明晰了自然状态下中央山岛微生物菌群组成及其耐药现状,为后期深入探究细菌耐药发生,研究野鸟携带耐药菌溯源遗传演化和传播生态学机制提供了宝贵的背景信息。 展开更多
关键词 细菌耐药 微生物菌群 宏基因组测序分析 中央山岛 One Health
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赛鸽源大肠杆菌耐药性检测及多重耐药菌株的全基因组测序分析 被引量：1
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作者 石金川 孙淼 +6 位作者 孟令浩 王永强 耿超 齐朝鲁蒙 陈亨利 王梓 刘锴 《畜牧兽医学报》 北大核心 2025年第5期2372-2382,共11页
赛鸽养殖中,普遍存在抗生素滥用现象,造成耐药菌株增加,多重耐药性加剧。本研究旨在了解通辽市赛鸽源大肠杆菌耐药性及耐药基因流行情况,为赛鸽源大肠杆菌病临床治疗提供参考。使用大肠杆菌鉴别培养基,16S rRNA测序等方法对通辽地区送... 赛鸽养殖中,普遍存在抗生素滥用现象,造成耐药菌株增加,多重耐药性加剧。本研究旨在了解通辽市赛鸽源大肠杆菌耐药性及耐药基因流行情况,为赛鸽源大肠杆菌病临床治疗提供参考。使用大肠杆菌鉴别培养基,16S rRNA测序等方法对通辽地区送检腹泻赛鸽粪便病原菌进行分离纯化。通过药敏试验及耐药基因的PCR检测了解分离菌株的耐药性及耐药基因分布情况。对两株耐药性较强的大肠杆菌进行全基因组测序分析。结果显示:分离得到8株赛鸽源大肠杆菌,均为多重耐药菌株,其中卡那霉素和链霉素耐药率均为100%,全部菌株对头孢哌酮/舒巴坦敏感。E-ge1,E-ge2耐药性严重,对两株菌进行全基因组测序分析,获得完整基因组序列,两株菌基因组长度分别为4680817 bp与4691799 bp,分别编码4888与5070个基因,两菌株均携带3个质粒。E-ge1共携带81个耐药基因,E-ge2携带74个耐药基因。通辽地区赛鸽源大肠杆菌耐药形势严峻,菌株携带大量耐药基因,应优化用药策略,控制耐药性的加剧和耐药基因的传播。 展开更多
关键词 赛鸽 大肠杆菌 耐药性 耐药基因 全基因组测序
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杭州市水产品中溶藻弧菌耐药表型及耐药基因分布特征
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作者 邓佩韦 郑双芝 +4 位作者 严晗 庞一 沈磊 朱军莉 陆海霞 《食品与发酵工业》 北大核心 2025年第9期319-326,共8页
该文旨在了解杭州市水产品中溶藻弧菌的耐药性及耐药基因的携带情况,为水产品中溶藻弧菌污染防控、水产品安全性提高提供参考。通过药敏纸片扩散法对从市售水产品中分离出的14株溶藻弧菌进行了8类22种常见抗菌药物的耐药性检测,并计算... 该文旨在了解杭州市水产品中溶藻弧菌的耐药性及耐药基因的携带情况,为水产品中溶藻弧菌污染防控、水产品安全性提高提供参考。通过药敏纸片扩散法对从市售水产品中分离出的14株溶藻弧菌进行了8类22种常见抗菌药物的耐药性检测,并计算多重耐药指数;采用PCR扩增法对分离株进行了8类21个耐药基因和1类整合子基因携带情况的检测,分析溶藻弧菌耐药表型与耐药基因的相关性。结果显示,14株溶藻弧菌表现出14种耐药型,全部分离株对青霉素和阿莫西林耐药,其次是头孢唑林和氨苄西林,分别有13个分离株对其耐药;共有13个分离株对氯霉素和氟苯尼考敏感,全部菌株对美罗培南敏感。11个分离株的多重耐药指数超过0.2,占总数的78.57%;所有分离株均检出同时携带3个及以上的耐药基因,磺胺类耐药基因sul1和氨基糖苷类耐药基因strB的检出率最高,分别在13个分离株中检出,其次是四环素类耐药基因tetA,在12个分离株中检出,耐药基因与耐药表型不完全相符。研究表明该次采集的杭州市水产品中溶藻弧菌的检出率为13.3%,分离获得的菌株大多数具备多重耐药性,且所有分离株均携带2类及以上抗生素的耐药基因,与其生长环境受到抗生素污染有关,有必要更加重视和规范抗生素的合理使用,以防止或减少食品安全事件的发生。 展开更多
关键词 溶藻弧菌 耐药基因 耐药性 多重耐药 水产品
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福建省多黏菌素耐药基因mcr-1阳性鸡源大肠杆菌的流行性及耐药性分析
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作者 戴婷婷 陈海玉 +11 位作者 段楚楚 庄丽云 刘荣昌 陈慧慧 余小珍 杨欣 陈梦诗 包银莉 程艳青 华宝玉 黄翠琴 郑新添 《中国预防兽医学报》 北大核心 2025年第1期9-16,共8页
为了解福建省多黏菌素耐药基因mcr-1阳性大肠杆菌的流行情况和耐药性,本研究于2022年~2024年从福建省4个不同地区养殖场、屠宰场、菜市场的肉鸡和蛋鸡中分离到786株鸡源大肠杆菌,采用PCR鉴定mcr-1阳性大肠杆菌,统计不同地区、不同来源... 为了解福建省多黏菌素耐药基因mcr-1阳性大肠杆菌的流行情况和耐药性,本研究于2022年~2024年从福建省4个不同地区养殖场、屠宰场、菜市场的肉鸡和蛋鸡中分离到786株鸡源大肠杆菌,采用PCR鉴定mcr-1阳性大肠杆菌,统计不同地区、不同来源及不同种类鸡源mcr-1阳性大肠杆菌的检出率;采用微量肉汤稀释法测定mcr-1阳性大肠杆菌对7大类12种抗菌药物的敏感性;通过PCR检测mcr-1阳性菌的6大类12种耐药基因,利用卡方检验分析分离菌耐药表型和耐药基因之间的相关性;通过PCR鉴定分离菌中质粒的类型。结果显示,786株鸡源大肠杆菌中mcr-1基因的检出率为21.25%(167/786),以闽东地区(24.28%,42/173)、菜市场(25.41%,47/185)和蛋鸡(27.95%,64/229)中分离的mcr-1阳性大肠杆菌的检出率最高。药敏试验结果显示,分离菌对四环素类的多西环素(DOX)和四环素(TE)耐药的mcr-1基因阳性菌占比最高,分别为92.22%(154/167)和89.82%(150/167);对氨基糖苷类的庆大霉素(GEN)和氟喹诺酮类的环丙沙星(CIP)耐药的菌株最少,分别占44.91%(75/167)和56.29%(94/167);对氨基糖苷类、磺胺类、酰胺醇类、氟喹诺酮类、多黏菌素类、β-内酰胺类耐药的菌株占57.49%~73.65%。85.63%(143/167)的菌株为多重耐药菌(MDR)。不同地区、不同来源和不同种类鸡中分离的mcr-1阳性大肠杆菌的耐药性有差异;所测12种耐药基因均在mcr-1阳性菌中检出,其中四环素类的tet(A)(97.6%,163/167)、氨基糖苷类的aadA1(87.43%,146/167)、磺胺类的sul2(84.43%,141/167)、β-内酰胺类的blaTEM(81.44%,136/167)、氟喹诺酮类的qnrS(72.46%,121/167)及酰胺醇类的floK(67.66%,113/167)耐药基因的检出率均在50%以上;相关性分析显示,分离菌对氧氟沙星与其耐药基因qnrA、对环丙沙星与其耐药基因qnrS、对氨曲南和头孢他啶与其耐药基因blaTEM等均显著和极显著相关。分离菌主要携带IncI2型质粒(50.30%,84/167)、IncHI2型质粒(25.15%,42/167)和IncX4型质粒(19.76%,33/167)。目前福建省mcr-1阳性鸡源大肠杆菌的检出率较高,且多为多重耐药菌株,耐药现象非常严重。本研究为深入了解福建省mcr-1阳性鸡源大肠杆菌的耐药性以及抗菌药物的合理使用提供科学参考依据。 展开更多
关键词 大肠杆菌 多黏菌素 耐药基因 mcr-1 福建 鸡
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3类健康人群抗生素耐药基因分布特征及影响因素分析
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作者 吴梦 郭玉梅 +3 位作者 王可 高伟利 董新燕 田会方 《中国抗生素杂志》 北大核心 2025年第2期216-224,共9页
目的 本研究旨在了解健康人群肠道中抗生素耐药基因(antimicrobial resistance genes,ARGs)分布特征及影响因素,为耐药防控工作提供数据支撑。方法 应用基于qPCR的TaqMan阵列卡技术检测孕妇、药厂工人和儿童3类人群中常见ARGs的携带情况... 目的 本研究旨在了解健康人群肠道中抗生素耐药基因(antimicrobial resistance genes,ARGs)分布特征及影响因素,为耐药防控工作提供数据支撑。方法 应用基于qPCR的TaqMan阵列卡技术检测孕妇、药厂工人和儿童3类人群中常见ARGs的携带情况,并采用多元线性回归模型分析ARGs检出数量的影响因素。结果 儿童与孕妇和药厂工人中ARGs检出数量存在统计学差异(P=0.005、P=0.004),儿童ARGs平均检出数量最低为19种,其余两组人群为22种。研究共检测到12大类45种ARGs亚型,其中β-内酰胺类、大环内酯类、四环素类、磺胺类、喹诺酮类、大环内酯类-林可酰胺类-链阳性菌素B类(MLSB)、万古霉素类ARGs是肠道ARGs中占比最丰富的类型,硝基咪唑类、多重耐药类和黏菌素类ARGs检出率最低(11.46%,19.79%,20.83%)。tetM、tetS、qnrS、blaTEM和mefA等5种亚型检出率高达100%,未检出nimE。多元线性回归分析中,年龄(β=0.365,P<0.001)与ARGs检出数量呈正相关,食用水产品(β=0.247,P=0.009)的ARGs检出数量高于未食用者。结论 健康人群肠道中ARGs普遍存在且检出率较高,需要加强孕妇、药厂工人和儿童3类人群的ARGs监测及成因研究,制定更有针对性的防控策略,以降低耐药性发展的风险。 展开更多
关键词 TaqMan阵列卡 健康人群 耐药基因 影响因素
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基于吉西他滨耐药相关基因的胰腺癌预后预测模型的构建
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作者 王维嘉 田秀云 +3 位作者 吴剑挥 关晓雅 郝纯毅 崔培林 《郑州大学学报(医学版)》 北大核心 2025年第4期499-503,共5页
目的:构建基于吉西他滨耐药(GRS)相关基因的胰腺癌预后预测模型。方法:收集TCGA数据库中179例胰腺癌病例,按照7∶3的比例随机分为训练集126例和验证集53例。收集GEO数据库中吉西他滨耐药和非耐药PANC-1、CFPAC-1和Bxpc-3细胞系的测序数... 目的:构建基于吉西他滨耐药(GRS)相关基因的胰腺癌预后预测模型。方法:收集TCGA数据库中179例胰腺癌病例,按照7∶3的比例随机分为训练集126例和验证集53例。收集GEO数据库中吉西他滨耐药和非耐药PANC-1、CFPAC-1和Bxpc-3细胞系的测序数据取交集;利用GTEx数据库中165份正常胰腺组织和训练集基因测序数据筛选差异基因;两者再取交集,得胰腺癌GRS相关基因。采用LASSO回归和Cox回归构建基于GRS相关基因的胰腺癌预后预测模型,计算风险评分,绘制ROC曲线评价风险评分对胰腺癌3 a死亡风险的预测性能。根据风险评分中位数将179例胰腺癌患者分为高风险组和低风险组,比较两组免疫检查点(CD28、CD80、CD86、ICOS、ICOS LG、PD-1、PD-L1、PD-L2、B7-H3、B7-H4、HHLA2、TMIGD2、TIM-3、galectin-9、LAG-3、FGL-1、CD39、CD73、TIGIT、VISTA)表达水平。结果:共筛选出14个胰腺癌GRS相关基因。对14个基因进行LASSO回归,筛选出4个基因,采用Cox回归构建预测模型,该模型在训练集和验证集中ROC曲线的AUC(95%CI)分别为0.718(0.627~0.802)和0.796(0.607~0.985)。高风险组PD-L1、CD73和HHLA2表达水平高于低风险组(P<0.05)。结论:成功构建了基于GRS相关基因的胰腺癌预后预测模型。 展开更多
关键词 胰腺癌 吉西他滨 耐药基因 预后预测模型
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猪场废水与周边水环境中细菌和耐药基因的特征
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作者 赵嘉豪 徐杏 +3 位作者 周卫东 杨华 赵喜红 汪雯 《浙江农业学报》 北大核心 2025年第3期621-632,共12页
生猪养殖废水中含有大量可能的致病菌和抗生素耐药基因(ARGs)。为此,从某生猪养殖场废水生化出水口、猪场附近农田沟渠、猪场内地下水储水罐和池塘中采集样本(分别简记为MW、IW、UW、PW),分析猪场废水和周边水环境中水质、细菌群落和代... 生猪养殖废水中含有大量可能的致病菌和抗生素耐药基因(ARGs)。为此,从某生猪养殖场废水生化出水口、猪场附近农田沟渠、猪场内地下水储水罐和池塘中采集样本(分别简记为MW、IW、UW、PW),分析猪场废水和周边水环境中水质、细菌群落和代表性ARGs的特征,并利用16S rRNA测序和实时荧光定量PCR分析了细菌群落和代表性ARGs的丰度。结果表明,MW的化学需氧量、氨氮含量、总磷含量显著(P<0.05)高于其他样本,ARGs总丰度最高;UW的水质最好,菌群的多样性和丰富度最低。从4种水体中均检出不动杆菌属(Acinetobacter)、梭状芽孢杆菌属(Clostridium_sensu_stricto_1)和假单胞菌属(Pseudomonas)等致病菌,且MW和IW中的主要ARGs均为四环素类(tetQ和tetW)和大环内酯类(ermB)耐药基因。典型相关分析的结果表明,猪废水菌群中的菌属为主要的ARGs宿主,其相对丰度与多种检测的ARGs的丰度呈显著正相关。综上所述,MW的高污染指数、多样致病菌和高丰度的ARGs可能对周边水环境构成严重威胁。因此,猪场废水处理需严格执行相关排放标准,且废水最终的深度消毒也必不可少。 展开更多
关键词 猪场废水 细菌群落 耐药基因 水质参数 水环境
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上海地区乳源金黄色葡萄球菌耐药特性及耐药基因分型研究 被引量：1
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作者 邓波 王晓旭 +4 位作者 江春铃 张玉杰 杨长丽 杨晓君 张维谊 《中国奶牛》 2025年第2期21-26,共6页
为了解上海地区奶牛乳房炎金黄色葡萄球菌的分布及耐药特性,收集本市8月、11月两批次共60份患乳房炎奶牛的生乳样本,进行金黄色葡萄球菌的分离鉴定。采用高通量测序方法对8株分离菌株进行分子分型及耐药基因研究,并开展7大类23种抗菌药... 为了解上海地区奶牛乳房炎金黄色葡萄球菌的分布及耐药特性,收集本市8月、11月两批次共60份患乳房炎奶牛的生乳样本,进行金黄色葡萄球菌的分离鉴定。采用高通量测序方法对8株分离菌株进行分子分型及耐药基因研究,并开展7大类23种抗菌药物的耐药性检测,与耐药基因检测结果进行比较。结果显示,60份患乳房炎奶牛的生乳样本分离到8株金黄色葡萄球菌,分离率13.33%,其中8月分离率为20.00%,高于11月分离率。根据全基因组测序及MLST分子分型研究,8株金黄色葡萄球菌中有5株为ST398型,2株为ST15型,1株为新ST型。CARD耐药基因注释结果表明,8株菌主要携带7大类16种耐药基因。药敏结果显示,8株乳源金黄色葡萄球菌多重耐药现象严重,耐药率青霉素G、氨苄西林≥环丙沙星、氧氟沙星≥头孢克洛、头孢唑肟、洛美沙星、诺氟沙星、磺胺甲唑、四环素、庆大霉素、红霉素、克林霉素、氯霉素。2株菌株对头孢西丁呈中介。上海奶牛乳房炎金黄色葡萄球菌感染及菌株多重耐药情况普遍;ST398型占比较高,且携带MRSA(耐甲氧西林金黄色葡萄球菌)相关耐药基因,需加强日常监测和用药指导。 展开更多
关键词 奶牛乳房炎 金黄色葡萄球菌 多重耐药 耐药基因
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上海某三甲医院耐碳青霉烯类铜绿假单胞菌的临床分布与耐药基因分析
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作者 邓嫦姿 孙毓锴 +3 位作者 黄晓春 万玉香 林佳 马炜 《海军军医大学学报》 北大核心 2025年第7期881-888,共8页
目的了解上海某三甲医院耐碳青霉烯类铜绿假单胞菌(CRPA)的临床分布特点及耐药基因型,为指导临床抗菌药物的合理使用、降低细菌耐药性和控制院内感染提供科学依据。方法 收集2019年1月1日至12月31日海军军医大学第一附属医院临床标本中... 目的了解上海某三甲医院耐碳青霉烯类铜绿假单胞菌(CRPA)的临床分布特点及耐药基因型,为指导临床抗菌药物的合理使用、降低细菌耐药性和控制院内感染提供科学依据。方法 收集2019年1月1日至12月31日海军军医大学第一附属医院临床标本中分离出的连续不重复CRPA菌株(共94株),统计分析CRPA的科室分布、样本来源等。采用 VITEK 2 Compact 全自动微生物分析仪和纸片扩散法(Kirby-Bauer 法)检测铜绿假单胞菌对13种抗菌药物的敏感性,采用PCR法扩增超广谱 β-内酰胺酶耐药基因、碳青霉烯酶耐药基因、膜孔蛋白基因。采用基于k-mer算法的kSNP3软件对筛选菌株进行单核苷酸多态性(SNP)分析并构建进化树,基于PubMLST数据库中铜绿假单胞菌的分型方案进行多位点序列分型(MLST)分析。结果 94株CRPA对碳青霉烯类抗生素亚胺培南(92.6%,87株)、美罗培南(87.2%,82株)的抗生素耐药率较高,对氨基糖苷类抗生素阿米卡星(10.6%,10株)、庆大霉素(20.2%,19株)、妥布霉素(20.2%,19株)的耐药率较低。科室分布排名前3位的是急救监护室(9.6%,9株)、脑血管外科(8.5%,8株)和呼吸科(8.5%,8株)。PCR检出外膜蛋白D2(OprD2)基因缺失菌株47株(50.0%),13株(13.8%)blaKPC阳性菌,4株(4.3%)blaVIM阳性菌,2株(2.1%)blaIMP阳性菌,1株(1.1%)blaNDM阳性菌,12株(12.8%)blaTEM阳性菌,4株(4.3%)blaPER阳性菌,2株(2.1%)blaGES阳性菌,blaOXA-48、blaBIC、blaSIM、blaVEB、blaSHV等基因未检出。MLST分析鉴定出36种不同的序列类型(ST),其中最常见的是ST463和ST274,并首次发现了2种新的ST(ST4023和ST4024)。结论 临床分离的CRPA携带多种耐药基因,对多种临床常用抗菌药物同时耐药,其耐药主要与细菌携带blaKPC、blaVIM、blaTEM基因和缺失OprD2基因有关。临床应加强对CRPA的监测,合理使用抗菌药物,控制其在院内的传播。 展开更多
关键词 耐碳青霉烯类铜绿假单胞菌 耐药基因 耐药率 分子流行病学
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畜禽肠道菌群耐药基因的研究进展
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作者 赵树生 和世春 +5 位作者 戴思凡 王梓蓓 吴东旺 余催 李清 毛华明 《饲料工业》 北大核心 2025年第4期154-160,共7页
当前,抗生素耐药性的出现和传播威胁着人类和动物的健康。动物微生物群中的耐药性细菌是抗生素抗性基因的重要贮存库,且这些病原菌可以通过水平基因转移或质粒交换将抗生素抗性基因转移到肠道菌群中,从而使肠道菌群携带抗生素抗性基因,... 当前,抗生素耐药性的出现和传播威胁着人类和动物的健康。动物微生物群中的耐药性细菌是抗生素抗性基因的重要贮存库,且这些病原菌可以通过水平基因转移或质粒交换将抗生素抗性基因转移到肠道菌群中,从而使肠道菌群携带抗生素抗性基因,严重威胁畜禽健康养殖。文章主要对影响肠道菌群抗生素耐药基因的因素及抗生素耐药基因的作用机制进行综述,以期推进畜禽肠道微生物耐药基因的相关研究。 展开更多
关键词 畜禽养殖业 抗生素 耐药基因 肠道菌群 耐药性
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肉鸡屠宰环节多重耐药ST314肯塔基沙门菌的全基因组序列分析
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作者 李佳芮 孙瑞源 +7 位作者 何沛杰 刘淏天 旷如意 夏静 崔敏 黄勇 邹立扣 韩新锋 《中国人兽共患病学报》 北大核心 2025年第5期537-543,共7页
目的分析肉鸡源多重耐药ST314肯塔基沙门菌的耐药特征、毒力基因和遗传进化背景。方法测定肉鸡屠宰环节中分离得到的ST314肯塔基沙门菌对临床常见抗菌药物的敏感性。通过全基因组测序(WGS)和生物信息学方法分析其耐药基因、毒力因子和... 目的分析肉鸡源多重耐药ST314肯塔基沙门菌的耐药特征、毒力基因和遗传进化背景。方法测定肉鸡屠宰环节中分离得到的ST314肯塔基沙门菌对临床常见抗菌药物的敏感性。通过全基因组测序(WGS)和生物信息学方法分析其耐药基因、毒力因子和水平移动元件(MGEs)等相关信息。结果三株ST314克隆均表现出高度耐药性。F4-2S对7类14种药物、F4T对7类13种药物以及Y23对6类9种药物耐药。F4-2S与F4T具有高度同源性,均携带9类13种耐药基因,以及分泌系统和效应蛋白等一系列毒力因子。含有的IncR和IncX1型质粒增强了其耐药性和致病性。Y23基因组完成图包含一条染色体和两个质粒。染色体上仅有一种耐药基因,但携带与细菌入侵有关的Ⅲ型分泌系统(T3SS)等众多毒力因子,而质粒pY23-1上携带8类19种耐药基因。相似质粒的比对结果显示,pY23-1与pZ1323SSL0055、pSAL-045同源关系较近,均携带多种耐药基因,提示其在细菌耐药进化中可能扮演重要角色。结论ST314肯塔基沙门菌具有复杂的耐药机制及致病潜力,质粒上的耐药基因及其MGEs有助于细菌耐药性的产生和传播。染色体含有的多种毒力因子,可能是导致ST314克隆毒力增强的重要原因。 展开更多
关键词 肯塔基沙门菌 多重耐药 超广谱Β-内酰胺酶 全基因组测序
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福建省两地区百日咳鲍特菌抗原基因型特征及耐药性分析
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作者 石小松 傅世杰 +4 位作者 何小花 吕辉 陈厚杨 陈茂琳 陈捷 《临床儿科杂志》 北大核心 2025年第8期575-582,共8页
目的 分析中国福建省福州市及尤溪县百日咳鲍特菌(BP)抗原基因多态性特征与耐药表型,为优化疫苗策略和抗菌药物使用提供科学依据。方法 于2024年收集两地区336份百日咳临床疑似病例的咽拭子标本,经细菌培养、分离与鉴定后,对7个抗原基因... 目的 分析中国福建省福州市及尤溪县百日咳鲍特菌(BP)抗原基因多态性特征与耐药表型,为优化疫苗策略和抗菌药物使用提供科学依据。方法 于2024年收集两地区336份百日咳临床疑似病例的咽拭子标本,经细菌培养、分离与鉴定后,对7个抗原基因(ptxP、ptxA、ptxC、prn、fim3、fim2、tcfA)以及23S rRNA A2047位点进行分析,以确定其多态性和变异情况。基于核心基因组单核苷酸多态性(cgSNPs)构建最大似然法系统发育树。采用E-test法检测大环内酯类、磺胺类及β-内酰胺类最低抑菌浓度(MIC)。结果 336份疑似病例咽拭子标本中成功分离出29株BP临床株(8.6%,29/336),抗原基因谱分析显示,主要流行型别为ptxP3/prn2/ptxC1/ptxA1/fim2-1/fim3-1/tcfA2(55.2%,16/29),ptxP3/prn2/ptxA1型菌株比例达72.4%(21/29),检出prn150突变株4株(13.8%)。系统发育分析表明,疫苗株CS形成了独立的进化分支(A簇),2024年福建分离株与2020年前国内菌株存在显著遗传差异,形成B(ptxP3/prn2/ptxA1,含多数福建株)和C(ptxP1/prn1/ptxA1,含既往分离株)两大进化簇。所有分离株均检测到23S rRNA A2047G突变,对大环内酯类药物的MIC>90 mg/L,呈现高度耐药;复方磺胺甲噁唑(TMP-SMX)的MIC为0.005~0.45 mg/L;β-内酰胺类(头孢曲松、头孢噻肟、头孢哌酮/舒巴坦)的MIC为0.004~0.64 mg/L。结论 福建地区BP流行株呈现独特的抗原基因进化特征且存在普遍的大环内酯类耐药现象。后续需强化基于分子分型的疫苗组分监测,并结合药敏结果精准优化抗菌治疗方案。 展开更多
关键词 百日咳 百日咳鲍特菌 抗原基因型 全基因组测序 大环内酯类耐药 儿童
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