猪OLR1基因克隆及其与生产性状的关联、表达分析 被引量：8

1

作者 郭咪咪 乔木 +3 位作者 吴俊静 李良华 梅书棋 李助南 《华中农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第3期82-88,共7页

为鉴定对猪生产性状有重要影响的新分子标记,采用电子克隆技术结合PCR方法获得了猪氧化型低密度脂蛋白受体1（oxidized low-density lipoprotein receptor 1,OLR1）基因编码区序列,在OLR1基因第4内含子246bp处发现了1个新SNP位点A246G,... 为鉴定对猪生产性状有重要影响的新分子标记,采用电子克隆技术结合PCR方法获得了猪氧化型低密度脂蛋白受体1（oxidized low-density lipoprotein receptor 1,OLR1）基因编码区序列,在OLR1基因第4内含子246bp处发现了1个新SNP位点A246G,并建立了PCR-Pag1-RFLP基因分型方法,分析了4个不同品种猪群中该等位基因频率,发现国外品种大白、长白猪群G等位基因频率高于A等位基因频率,而国内品种梅山、大梅群体A等位基因频率高于G等位基因频率。在大梅猪群体中的关联分析结果发现,A246G位点与胸腰椎间膘厚、平均背膘、背最长肌含水量、背最长肌肌内脂肪含量、屠宰率、板油质量、6-7腰椎间膘厚、背最长肌大理石纹、股二头肌大理石纹显著或极显著相关。通过RT-PCR分析发现,OLR1在恩施黑猪和大白猪群中心脏表达量最高,其次是背脂,同品种不同组织间表达量差异大,表明OLR1基因是脂肪相关的候选基因。 展开更多

关键词 猪 olr1 PCR-RFLP 关联分析 表达谱

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猪OLR1基因对肌内前脂肪细胞分化的影响 被引量：5

2

作者 乔木 黄藏宇 +6 位作者 吴俊静 武华玉 万绪玲 周佳伟 刘贵生 梅书棋 彭先文 《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2020年第12期2147-2153,共7页

研究氧化型低密度脂蛋白受体1(oxidized low-density lipoprotein receptor1,OLR1)基因在猪前脂肪细胞分化过程中的作用,为深入研究OLR1基因在脂肪沉积中的功能奠定基础。根据GenBank中猪OLR 1基因序列(登录号:NM_213805),构建OLR 1基... 研究氧化型低密度脂蛋白受体1(oxidized low-density lipoprotein receptor1,OLR1)基因在猪前脂肪细胞分化过程中的作用,为深入研究OLR1基因在脂肪沉积中的功能奠定基础。根据GenBank中猪OLR 1基因序列(登录号:NM_213805),构建OLR 1基因过表达载体OLR1-pcDNA3.1,同时合成干扰OLR 1表达的siRNA。从恩施黑猪背最长肌中分离前脂肪细胞,分别将OLR1-pcDNA3.1和OLR1-siRNA转染前脂肪细胞,并对细胞进行诱导分化,至第6天,通过油红O染色、甘油三酯含量测定和荧光定量PCR检测OLR 1基因对前脂肪细胞分化的影响。结果显示,OLR 1过表达组脂滴明显多于对照组,甘油三酯含量显著(P<0.05)增加,成脂分化标志基因PPARγ的表达量极显著(P<0.01)升高、C/EBPα和FAS的表达量显著(P<0.05)升高;干扰OLR 1后,细胞内脂滴减少,甘油三酯含量显著(P<0.05)下降,成脂分化标志基因PPARγ的表达量极显著(P<0.01)下降,C/EBPα和FAS的表达量显著(P<0.05)降低。综上表明,OLR 1基因具有促进前脂肪细胞成脂分化的作用。 展开更多

关键词 猪 olr1基因 过表达 RNA干扰 前脂肪细胞分化

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猪OLR1基因克隆及生物信息学分析 被引量：13

3

作者 刘春伟 孙超 《西北农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第5期51-55,共5页

设计猪氧化低密度脂蛋白受体1（OLR1）基因编码区全长引物,从猪脂肪组织中扩增OLR1基因编码区全长序列,对其蛋白质序列进行比对分析,预测蛋白质信号肽位点及结构域并研究该基因密码子使用偏好性。结果表明：猪OLR1基因编码区全长为825 ... 设计猪氧化低密度脂蛋白受体1（OLR1）基因编码区全长引物,从猪脂肪组织中扩增OLR1基因编码区全长序列,对其蛋白质序列进行比对分析,预测蛋白质信号肽位点及结构域并研究该基因密码子使用偏好性。结果表明：猪OLR1基因编码区全长为825 bp,共编码273个氨基酸,猪OLR1基因与牛同源性最高（84%）,其次是人（79%）、大鼠（51%）和小鼠（27%）。猪OLR1蛋白38～60位氨基酸为信号肽所在位置,144～256位氨基酸正是C型凝集素家族共有结构域;OLR1基因密码子A＋U含量（61.2%）远高于G＋C含量（38.8%）,而且偏向使用A/U结尾的密码子（占76.53%）,这可能影响到OLR1基因的表达水平。 展开更多

关键词 olr1 猪 克隆 生物信息学 密码子偏好性

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秦川牛OLR1基因多态性与肉质性状的关联分析 被引量：6

4

作者 李托 赵志东 +1 位作者 王婧 王昕 《西北农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第4期17-20,共4页

采用PCR-RFLP的方法对230头秦川肉牛基因组的氧化型低密度脂蛋白受体1(OLR1)基因进行研究,并对其基因型与部分肉质性状进行关联分析。结果发现,OLR1基因存在g.10497C>A突变,该突变位点能够被PstI限制性酶识别。群体中共存在3种基因型... 采用PCR-RFLP的方法对230头秦川肉牛基因组的氧化型低密度脂蛋白受体1(OLR1)基因进行研究,并对其基因型与部分肉质性状进行关联分析。结果发现,OLR1基因存在g.10497C>A突变,该突变位点能够被PstI限制性酶识别。群体中共存在3种基因型,分别命名为AA、AC和CC,基因型频率分别为0.287、0.217和0.496。等位基因A和C的基因频率分别为0.396和0.604。χ2检验表明,该基因座处于Hardy-Weinberg不平衡状态(P<0.05)。关联分析结果表明,CC基因型的眼肌面积显著高于AA基因型(P<0.05);同样,CC基因型与高眼肌深度相关(P<0.05)。而AC基因型与AA和CC基因型之间没有显著差异(P>0.05);在背膘厚和肌间脂肪含量这2个性状上,3种基因型之间差异不显著(P>0.05)。 展开更多

关键词 olr1基因 秦川牛 肉质性状 PCR-RFLP

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奶牛OLR1 3'UTR A223C多态的生物学信息分析 被引量：3

5

作者 张传生 耿立英 +3 位作者 尹春光 曹顶国 刘铮铸 付志新 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2011年第1期75-77,共3页

[目的]探索氧化型低密度脂蛋白受体OLR1 3'UTR A223C多态与奶牛乳脂率高低紧密关联的分子机制。[方法]用miRanda(1.0)软件装载牛microRNA数据库,预测OLR1 3'UTR潜在的microRNA。[结果]共预测16个microRNA靶标,OLR1 3'UTR A2... [目的]探索氧化型低密度脂蛋白受体OLR1 3'UTR A223C多态与奶牛乳脂率高低紧密关联的分子机制。[方法]用miRanda(1.0)软件装载牛microRNA数据库,预测OLR1 3'UTR潜在的microRNA。[结果]共预测16个microRNA靶标,OLR1 3'UTR A223C突变定位于bta-miR-370靶标种子序列的互补区。[结论]由于OLR1 3'UTR A→C突变导致bta-miR-370靶标的消失,为OLR1 3'UTR A223C多态与奶牛乳脂率高低紧密关联的分子机制深入研究提供依据。 展开更多

关键词 olr1 3'UTR mir-370 生物信息 MICRORNA

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猪OLR1基因多态性与肉质性状的关联分析 被引量：8

6

作者 郭咪咪 梅书棋 +4 位作者 乔木 吴俊静 赵康 程尧 李助南 《湖北农业科学》 2015年第11期2686-2689,共4页

为鉴定与猪的肉质性状有重要影响的分子标记,经克隆测序,鉴定出OLR1基因第5内含子存在C52T突变,通过PCR-PstⅠ-RFLP方法进行了基因型检测,分别计算了该SNP在大白猪、长白猪、梅山猪、大白×梅山F2代猪中的基因型频率和基因频率,并... 为鉴定与猪的肉质性状有重要影响的分子标记,经克隆测序,鉴定出OLR1基因第5内含子存在C52T突变,通过PCR-PstⅠ-RFLP方法进行了基因型检测,分别计算了该SNP在大白猪、长白猪、梅山猪、大白×梅山F2代猪中的基因型频率和基因频率,并且对大白×梅山F2代猪的基因型与肉质相关性状进行了关联分析。结果表明,CC基因型的肩部膘厚、胸腰椎间膘厚、平均背膘极显著高于CT基因型个体(P<0.01);CC基因型的皮率、瘦肉率、6-7腰椎间膘厚、花油重、臀部膘厚、背最长肌大理石纹、股二头肌大理石纹显著高于CT基因型(P<0.05),C等位基因对猪的脂肪沉积具有正效应。 展开更多

关键词 猪 olr1 PCR-PstⅠ-RFLP 肉质性状 关联分析

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脂肪酸对小鼠前体脂肪细胞增殖分化及OLR1基因转录表达的作用 被引量：7

7

作者 孙超 刘春伟 《西北农林科技大学学报（自然科学版）》 CSCD 北大核心 2009年第3期1-6,共6页

【目的】研究短链和长链饱和脂肪酸,对小鼠前体脂肪细胞增殖分化及脂代谢新因子氧化型低密度脂蛋白受体1(OLR1)转录表达的影响。【方法】分离培养小鼠前体脂肪细胞,用适宜浓度乙酸钠、硬脂酸钠和p38MAPK通路抑制剂处理,通过细胞计数检... 【目的】研究短链和长链饱和脂肪酸,对小鼠前体脂肪细胞增殖分化及脂代谢新因子氧化型低密度脂蛋白受体1(OLR1)转录表达的影响。【方法】分离培养小鼠前体脂肪细胞,用适宜浓度乙酸钠、硬脂酸钠和p38MAPK通路抑制剂处理,通过细胞计数检测处理24和48 h时相关基因mRNA的表达量。【结果】乙酸钠处理组小鼠脂肪细胞数量随处理时间延长显著下降(P<0.05),硬脂酸钠处理组对小鼠细胞数量无显著影响(P>0.05);乙酸钠和硬脂酸钠均显著上调PPARγ2、C/EBPα和OLR1 mRNA的表达(P<0.05);p38MAPK抑制剂能显著抑制PPARγ2和OLR1 mRNA的表达(P<0.05),但对C/EBPαmRNA表达无显著影响。【结论】乙酸钠可抑制前体脂肪细胞的增殖,但乙酸钠和硬脂酸钠均能促进前体脂肪细胞的分化;OLR1基因在前体脂肪细胞分化过程中通过p38MAPK通路发挥作用,且脂肪酸对前体脂肪细胞分化及OLR1转录表达的影响与p38MAPK通路密切相关。 展开更多

关键词 脂肪酸 前体脂肪细胞 olr1 P38MAPK

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硒都黑猪OLR1基因多态性及其与产仔数的相关性分析 被引量：1

8

作者 乔木 周佳伟 +3 位作者 吴俊静 武华玉 梅书棋 彭先文 《河南农业科学》 北大核心 2021年第5期137-141,共5页

为研究OLR1基因遗传多态性对硒都黑猪产仔数的影响,利用PCR扩增和直接测序法检测OLR1基因在硒都黑猪中的单核苷酸多态性(SNP),并与母猪第一胎的产仔数性状进行相关性分析。结果显示,在基因的g.61808357处发现3种类型的碱基突变A>C、A... 为研究OLR1基因遗传多态性对硒都黑猪产仔数的影响,利用PCR扩增和直接测序法检测OLR1基因在硒都黑猪中的单核苷酸多态性(SNP),并与母猪第一胎的产仔数性状进行相关性分析。结果显示,在基因的g.61808357处发现3种类型的碱基突变A>C、A>T和C>T,存在AA、AC、CC、AT和TC 5种基因型,AC、AA和CC基因型个体的总产仔数和产活仔数均极显著(P<0.01)高于TC和AT基因型个体。综上,OLR1基因g.61808357处SNP位点可作为影响硒都黑猪产仔数性状的分子标记。 展开更多

关键词 硒都黑猪 olr1基因 多态性 产仔数 关联分析 分子标记

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OLR1基因多态性及其与硒都黑猪产仔数性状的关联分析 被引量：2

9

作者 乔木 李康驰 +4 位作者 吴俊静 武华玉 周佳伟 梅书棋 彭先文 《湖北农业科学》 2020年第24期141-143,共3页

为探索OLR1基因遗传多态性对硒都黑猪产仔数的影响,利用直接测序法检测OLR1基因在硒都黑猪中的遗传多态性,并与产仔性状进行了关联分析。结果表明,在第四内含子7 bp处发现一个T/C突变,存在3种基因型TT、TC和CC;TT基因型个体的总产仔数... 为探索OLR1基因遗传多态性对硒都黑猪产仔数的影响,利用直接测序法检测OLR1基因在硒都黑猪中的遗传多态性,并与产仔性状进行了关联分析。结果表明,在第四内含子7 bp处发现一个T/C突变,存在3种基因型TT、TC和CC;TT基因型个体的总产仔数和产活仔数都极显著高于TC和CC基因型个体(P<0.01),说明该突变对硒都黑猪产仔数性状有极显著的影响。 展开更多

关键词 olr1基因 硒都黑猪 产仔数 关联分析

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苏姜猪OLR1基因多态性及其与肉质性状的关联分析 被引量：1

10

作者 任善茂 王温慧 陶勇 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第5期145-149,共5页

探讨OLR1基因在苏姜猪群内的遗传多态性,以及该基因多态对苏姜猪猪肉质性状的影响。采用PCR-RFLP技术检测OLR1基因在苏姜猪试验群体中的PstⅠ酶切遗传多态性,运用单因素方差分析方法分析了该多态位点对苏姜猪肉质性状的影响。结果发现,... 探讨OLR1基因在苏姜猪群内的遗传多态性,以及该基因多态对苏姜猪猪肉质性状的影响。采用PCR-RFLP技术检测OLR1基因在苏姜猪试验群体中的PstⅠ酶切遗传多态性,运用单因素方差分析方法分析了该多态位点对苏姜猪肉质性状的影响。结果发现,苏姜猪试验群体OLR1基因内含子5区域内发现一个PstⅠ酶切多态性,检测到CC、CD和DD三种基因型,多态信息含量呈现中度多态性。CC型与DD型个体的肌肉失水率、大理石纹间的差异达到显著水平(P<0.05),CD型个体用色差仪测得的b值显著高于DD型(P<0.05)。因此,检测到的OLR1基因PCR-RFLP-PstⅠ多态性与大理石纹等肉质性状存在着显著的相关关系,可以作为肉质性状候选基因在苏姜猪的持续选育中加以应用。 展开更多

关键词 苏姜猪 olr1基因 PCR-RFLP-PstⅠ 肉质性状 关联分析

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OLR1基因生信分析及其在贵州黑山羊和黔北麻羊性腺轴中的表达 被引量：1

11

作者 杨红 杨远青 +4 位作者 周明帅 廖朝美 王正刚 袁超 杨洋 《安徽农业科学》 CAS 2024年第22期88-92,共5页

[目的]研究OLR1基因与贵州黑山羊和黔北麻羊繁殖率之间的关系,为研究OLR1基因调控山羊卵泡发育的分子机制提供参考。[方法]通过生物信息学的手段对OLR1蛋白理化性质、亚细胞定位、信号肽位点、蛋白高级结构等进行预测,并通过对不同物种O... [目的]研究OLR1基因与贵州黑山羊和黔北麻羊繁殖率之间的关系,为研究OLR1基因调控山羊卵泡发育的分子机制提供参考。[方法]通过生物信息学的手段对OLR1蛋白理化性质、亚细胞定位、信号肽位点、蛋白高级结构等进行预测,并通过对不同物种OLR1氨基酸序列进行同源性分析,构建系统发育进化树;采用RT-qPCR的方法检测OLR1基因在单羔和多羔贵州黑山羊和黔北麻羊性腺轴各组织中的表达量。[结果]OLR1基因编码275个氨基酸,理论pi值为6.37,OLR1是一种主要由α-螺旋卷曲构成的不具有信号肽的不稳定亲水性蛋白;与其他动物相比,山羊OLR1与反刍动物绵羊和牛的遗传距离最近。qPCR结果显示:OLR1基因在贵州黑山羊及黔北麻羊下丘脑、输卵管、垂体、子宫和卵巢组织中均有表达。在单羔组贵州黑山羊下丘脑、子宫、卵巢、垂体中的表达量均极显著高于多羔组(P<0.01),在输卵管中的表达量高于多羔组,但二者间差异不显著(P>0.05)。在单羔组黔北麻羊下丘脑、垂体、卵巢中的表达量均极显著高于多羔组(P<0.01);在输卵管中的表达量高于多羔组,在子宫中的表达量低于多羔组,但二者间差异不显著(P>0.05)。[结论]OLR1基因表达量与贵州黑山羊和黔北麻羊的繁殖性状呈负相关,可作为影响贵州本地山羊繁殖性能的重要候选基因。 展开更多

关键词 贵州黑山羊 黔北麻羊 性腺轴 olr1基因 生物信息学 繁殖性状

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基于共表达网络对氧化低密度脂蛋白受体1在头颈肿瘤发生发展及预后判断的生物信息学分析

12

作者 李曼 张志敏 +6 位作者 余滋中 付艳乔 朱俊 肖远俊 庹华为 王青云 李国义 《科学技术与工程》 北大核心 2018年第27期20-28,共9页

mRNA基因芯片表达谱为头颈肿瘤(head and neck cancer,HNC)的分子生物学诊断及研究HNC的生物过程提供了诸多重要生物学信息。通过生物信息学技术研究HNC基因表达谱,从而发掘头颈癌新的分子标志物。对4个GSE数据集和癌症基因组图谱(cance... mRNA基因芯片表达谱为头颈肿瘤(head and neck cancer,HNC)的分子生物学诊断及研究HNC的生物过程提供了诸多重要生物学信息。通过生物信息学技术研究HNC基因表达谱,从而发掘头颈癌新的分子标志物。对4个GSE数据集和癌症基因组图谱(cancer genome atlas,TCGA)头颈癌数据库进行了综合分析,鉴定出HNC和相邻正常组织(adjacent normal tissue,ANT)样本中3 639个差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),然后应用加权基因共表达网络分析相关差异表达基因DEGs和HNC临床特征之间的关系。鉴定出15个共表达基因模块。其中蓝绿色基因模块所对应HNC患者的风险比(hazard ratio,HR)最高。通过对该模块的进一步研究,发现氧化低密度脂蛋白1(oxidized low density lipoprotein receptor 1,OLR1)的表达量与HNC患者的总体生存率呈显著负相关性。OLR1在mRNA水平的表达水平可作为判断HNC患者生存预后的潜在分子标志物。 展开更多

关键词 头颈癌 olr1 生物信息学分析

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